MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_022118	T	6	6	861214	861219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_022118	TTA	2	6	861226	861231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_022118	AGC	2	6	861311	861316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422535
19004	NC_022118	TG	3	6	861359	861364	0 %	50 %	50 %	0 %	532422535
19005	NC_022118	CTTTTT	2	12	861432	861443	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532422535
19006	NC_022118	GAC	2	6	861454	861459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422535
19007	NC_022118	GAG	2	6	861547	861552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422535
19008	NC_022118	A	6	6	861605	861610	100 %	0 %	0 %	0 %	532422535
19009	NC_022118	TTA	2	6	861637	861642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422535
19010	NC_022118	T	7	7	861882	861888	0 %	100 %	0 %	0 %	532422536
19011	NC_022118	GAG	2	6	861939	861944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422536
19012	NC_022118	GAAG	2	8	861968	861975	50 %	0 %	50 %	0 %	532422536
19013	NC_022118	AAT	2	6	862093	862098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422536
19014	NC_022118	T	8	8	862098	862105	0 %	100 %	0 %	0 %	532422536
19015	NC_022118	AG	3	6	862158	862163	50 %	0 %	50 %	0 %	532422536
19016	NC_022118	TCT	2	6	862166	862171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422536
19017	NC_022118	T	6	6	862209	862214	0 %	100 %	0 %	0 %	532422536
19018	NC_022118	CTT	2	6	862244	862249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422536
19019	NC_022118	TTG	2	6	862291	862296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422536
19020	NC_022118	TTC	2	6	862366	862371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422536
19021	NC_022118	TAA	2	6	862405	862410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422536
19022	NC_022118	TTG	2	6	862414	862419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422536
19023	NC_022118	TTC	2	6	862453	862458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422536
19024	NC_022118	AAT	2	6	862477	862482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422536
19025	NC_022118	TTTA	2	8	862537	862544	25 %	75 %	0 %	0 %	532422536
19026	NC_022118	TGG	2	6	862546	862551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422536
19027	NC_022118	CCA	2	6	862582	862587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422536
19028	NC_022118	TCA	2	6	862622	862627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422536
19029	NC_022118	T	6	6	862657	862662	0 %	100 %	0 %	0 %	532422536
19030	NC_022118	T	6	6	862692	862697	0 %	100 %	0 %	0 %	532422536
19031	NC_022118	TTC	2	6	862737	862742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422536
19032	NC_022118	GAA	2	6	862746	862751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422536
19033	NC_022118	GAG	2	6	862752	862757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422536
19034	NC_022118	TGGGA	2	10	862784	862793	20 %	20 %	60 %	0 %	532422536
19035	NC_022118	AAAT	2	8	862804	862811	75 %	25 %	0 %	0 %	532422536
19036	NC_022118	GAG	2	6	862860	862865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422536
19037	NC_022118	AAAG	2	8	862931	862938	75 %	0 %	25 %	0 %	532422536
19038	NC_022118	TCC	2	6	862950	862955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422536
19039	NC_022118	AGG	2	6	862958	862963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_022118	A	8	8	863021	863028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_022118	A	6	6	863085	863090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19042	NC_022118	ATT	2	6	863107	863112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_022118	T	7	7	863111	863117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_022118	T	7	7	863128	863134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_022118	T	7	7	863165	863171	0 %	100 %	0 %	0 %	532422537
19046	NC_022118	TAG	2	6	863191	863196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422537
19047	NC_022118	T	6	6	863219	863224	0 %	100 %	0 %	0 %	532422537
19048	NC_022118	CTT	2	6	863252	863257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422537
19049	NC_022118	AGC	3	9	863258	863266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422537
19050	NC_022118	T	6	6	863273	863278	0 %	100 %	0 %	0 %	532422537
19051	NC_022118	AGC	2	6	863279	863284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422537
19052	NC_022118	GCTTT	2	10	863286	863295	0 %	60 %	20 %	20 %	532422537
19053	NC_022118	T	7	7	863293	863299	0 %	100 %	0 %	0 %	532422537
19054	NC_022118	T	6	6	863311	863316	0 %	100 %	0 %	0 %	532422537
19055	NC_022118	TGC	2	6	863390	863395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422537
19056	NC_022118	TTG	2	6	863429	863434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422537
19057	NC_022118	CAA	2	6	863444	863449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422537
19058	NC_022118	GTCA	2	8	863450	863457	25 %	25 %	25 %	25 %	532422537
19059	NC_022118	T	8	8	863458	863465	0 %	100 %	0 %	0 %	532422537
19060	NC_022118	A	6	6	863487	863492	100 %	0 %	0 %	0 %	532422537
19061	NC_022118	GTT	3	9	863502	863510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422537
19062	NC_022118	T	7	7	863519	863525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_022118	GTTT	2	8	863545	863552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_022118	AGC	2	6	863600	863605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_022118	T	6	6	863672	863677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19066	NC_022118	TGC	2	6	863689	863694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19067	NC_022118	AGAAA	2	10	863744	863753	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_022118	AGA	2	6	863776	863781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_022118	TTC	2	6	863782	863787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19070	NC_022118	ATT	2	6	863807	863812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19071	NC_022118	ATG	2	6	863824	863829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19072	NC_022118	TCT	2	6	863844	863849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19073	NC_022118	T	6	6	863871	863876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19074	NC_022118	CTTT	2	8	863961	863968	0 %	75 %	0 %	25 %	532422538
19075	NC_022118	TCG	2	6	864044	864049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422538
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19077	NC_022118	CTT	2	6	864255	864260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422538
19078	NC_022118	CTC	2	6	864298	864303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422538
19079	NC_022118	ATC	2	6	864315	864320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422538
19080	NC_022118	CTTT	2	8	864326	864333	0 %	75 %	0 %	25 %	532422538
19081	NC_022118	ATA	2	6	864336	864341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422538
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19083	NC_022118	GAG	2	6	864431	864436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422538
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19086	NC_022118	A	7	7	864635	864641	100 %	0 %	0 %	0 %	532422538
19087	NC_022118	AAG	2	6	864669	864674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422538
19088	NC_022118	A	6	6	864827	864832	100 %	0 %	0 %	0 %	532422538
19089	NC_022118	TTA	2	6	864857	864862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422538
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19091	NC_022118	TC	3	6	864954	864959	0 %	50 %	0 %	50 %	532422538
19092	NC_022118	AGA	2	6	864964	864969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422538
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19094	NC_022118	TTCT	2	8	865085	865092	0 %	75 %	0 %	25 %	532422538
19095	NC_022118	GA	3	6	865114	865119	50 %	0 %	50 %	0 %	532422538
19096	NC_022118	CAG	2	6	865178	865183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422538
19097	NC_022118	ATGG	2	8	865231	865238	25 %	25 %	50 %	0 %	532422538
19098	NC_022118	AAG	2	6	865266	865271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422538
19099	NC_022118	CTT	2	6	865275	865280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422538
19100	NC_022118	T	7	7	865279	865285	0 %	100 %	0 %	0 %	532422538
19101	NC_022118	GAA	2	6	865316	865321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422538
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19104	NC_022118	AG	3	6	865367	865372	50 %	0 %	50 %	0 %	532422538
19105	NC_022118	CT	3	6	865376	865381	0 %	50 %	0 %	50 %	532422538
19106	NC_022118	GA	3	6	865422	865427	50 %	0 %	50 %	0 %	532422538
19107	NC_022118	AGA	2	6	865462	865467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422538
19108	NC_022118	TCT	2	6	865468	865473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422538
19109	NC_022118	CT	3	6	865487	865492	0 %	50 %	0 %	50 %	532422538
19110	NC_022118	TCA	2	6	865540	865545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422538
19111	NC_022118	GCA	2	6	865597	865602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422538
19112	NC_022118	TTC	2	6	865639	865644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422538
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19114	NC_022118	ATT	2	6	865843	865848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422538
19115	NC_022118	TTG	2	6	865862	865867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422538
19116	NC_022118	TAT	2	6	865877	865882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422538
19117	NC_022118	TAT	2	6	866000	866005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422538
19118	NC_022118	ACCT	2	8	866030	866037	25 %	25 %	0 %	50 %	532422538
19119	NC_022118	AAG	2	6	866085	866090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422538
19120	NC_022118	CCG	2	6	866132	866137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422538
19121	NC_022118	GT	3	6	866145	866150	0 %	50 %	50 %	0 %	532422538
19122	NC_022118	TTA	2	6	866225	866230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422538
19123	NC_022118	TTTC	2	8	866251	866258	0 %	75 %	0 %	25 %	532422538
19124	NC_022118	AT	3	6	866278	866283	50 %	50 %	0 %	0 %	532422538
19125	NC_022118	GTA	2	6	866344	866349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422538
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19229	NC_022118	TCG	2	6	871695	871700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422542
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19243	NC_022118	GGA	2	6	872245	872250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422542
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