MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

< Previous12...34353637383940414243444546Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022118	TTAGA	2	10	835780	835789	40 %	40 %	20 %	0 %	532422517
18502	NC_022118	T	8	8	835837	835844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_022118	T	6	6	835906	835911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_022118	AGG	2	6	835934	835939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422518
18505	NC_022118	A	8	8	836021	836028	100 %	0 %	0 %	0 %	532422518
18506	NC_022118	AGA	2	6	836081	836086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422518
18507	NC_022118	T	6	6	836184	836189	0 %	100 %	0 %	0 %	532422518
18508	NC_022118	GAA	2	6	836262	836267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422518
18509	NC_022118	GAAA	2	8	836455	836462	75 %	0 %	25 %	0 %	532422518
18510	NC_022118	TAT	2	6	836465	836470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_022118	CTTT	2	8	836516	836523	0 %	75 %	0 %	25 %	532422519
18512	NC_022118	CGG	2	6	836568	836573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422519
18513	NC_022118	AAT	2	6	836651	836656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422519
18514	NC_022118	AAG	2	6	836727	836732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422519
18515	NC_022118	ACG	2	6	836751	836756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422519
18516	NC_022118	A	6	6	836771	836776	100 %	0 %	0 %	0 %	532422519
18517	NC_022118	TG	3	6	836790	836795	0 %	50 %	50 %	0 %	532422519
18518	NC_022118	GT	3	6	836821	836826	0 %	50 %	50 %	0 %	532422519
18519	NC_022118	ATT	2	6	836828	836833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422519
18520	NC_022118	TGA	2	6	836863	836868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422519
18521	NC_022118	TC	3	6	836897	836902	0 %	50 %	0 %	50 %	532422519
18522	NC_022118	GAA	2	6	836933	836938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422519
18523	NC_022118	GAAA	2	8	836956	836963	75 %	0 %	25 %	0 %	532422519
18524	NC_022118	TAGT	2	8	837011	837018	25 %	50 %	25 %	0 %	532422519
18525	NC_022118	AAG	2	6	837061	837066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422520
18526	NC_022118	TAG	2	6	837070	837075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422520
18527	NC_022118	AGA	2	6	837083	837088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422520
18528	NC_022118	TCA	2	6	837142	837147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422520
18529	NC_022118	CTC	2	6	837190	837195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422520
18530	NC_022118	ATC	2	6	837215	837220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422520
18531	NC_022118	ATA	2	6	837274	837279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422520
18532	NC_022118	TTC	2	6	837305	837310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422520
18533	NC_022118	AGCC	2	8	837351	837358	25 %	0 %	25 %	50 %	532422520
18534	NC_022118	CCT	2	6	837402	837407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422520
18535	NC_022118	AG	3	6	837423	837428	50 %	0 %	50 %	0 %	532422520
18536	NC_022118	AGA	2	6	837529	837534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422520
18537	NC_022118	TAG	2	6	837536	837541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422520
18538	NC_022118	AG	3	6	837540	837545	50 %	0 %	50 %	0 %	532422520
18539	NC_022118	GGA	2	6	837591	837596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422520
18540	NC_022118	A	6	6	837613	837618	100 %	0 %	0 %	0 %	532422520
18541	NC_022118	AAT	2	6	837698	837703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422520
18542	NC_022118	AGA	2	6	837728	837733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422520
18543	NC_022118	TAA	2	6	837820	837825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422520
18544	NC_022118	TACA	2	8	837944	837951	50 %	25 %	0 %	25 %	532422520
18545	NC_022118	T	6	6	837998	838003	0 %	100 %	0 %	0 %	532422520
18546	NC_022118	AGA	2	6	838046	838051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422520
18547	NC_022118	ATCACA	2	12	838068	838079	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532422520
18548	NC_022118	ATG	2	6	838098	838103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422520
18549	NC_022118	T	7	7	838144	838150	0 %	100 %	0 %	0 %	532422520
18550	NC_022118	GAAG	2	8	838187	838194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_022118	T	6	6	838252	838257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_022118	AAAT	2	8	838355	838362	75 %	25 %	0 %	0 %	532422521
18553	NC_022118	AAT	2	6	838365	838370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422521
18554	NC_022118	CGA	2	6	838405	838410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422521
18555	NC_022118	GA	3	6	838440	838445	50 %	0 %	50 %	0 %	532422521
18556	NC_022118	CAC	2	6	838467	838472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422521
18557	NC_022118	ATC	2	6	838570	838575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422521
18558	NC_022118	CATA	2	8	838707	838714	50 %	25 %	0 %	25 %	532422521
18559	NC_022118	GCA	2	6	838753	838758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422521
18560	NC_022118	CGTGG	2	10	838760	838769	0 %	20 %	60 %	20 %	532422521
18561	NC_022118	AAGC	2	8	838807	838814	50 %	0 %	25 %	25 %	532422521
18562	NC_022118	CGC	2	6	838829	838834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422521
18563	NC_022118	TTC	2	6	838878	838883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422521
18564	NC_022118	AACGT	2	10	838887	838896	40 %	20 %	20 %	20 %	532422521
18565	NC_022118	GAC	2	6	839050	839055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422521
18566	NC_022118	GTA	2	6	839137	839142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422521
18567	NC_022118	CGC	2	6	839201	839206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422521
18568	NC_022118	AG	3	6	839362	839367	50 %	0 %	50 %	0 %	532422521
18569	NC_022118	CCT	2	6	839368	839373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422521
18570	NC_022118	TGA	2	6	839418	839423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422521
18571	NC_022118	GTT	2	6	839438	839443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422521
18572	NC_022118	AAC	2	6	839472	839477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422521
18573	NC_022118	TGA	2	6	839483	839488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422521
18574	NC_022118	GGA	2	6	839519	839524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422521
18575	NC_022118	AGA	2	6	839631	839636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422521
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18577	NC_022118	AAC	2	6	839667	839672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422521
18578	NC_022118	A	6	6	839992	839997	100 %	0 %	0 %	0 %	532422521
18579	NC_022118	GA	3	6	840019	840024	50 %	0 %	50 %	0 %	532422521
18580	NC_022118	AAG	2	6	840048	840053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422521
18581	NC_022118	ACG	2	6	840114	840119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422521
18582	NC_022118	T	7	7	840121	840127	0 %	100 %	0 %	0 %	532422521
18583	NC_022118	GA	3	6	840128	840133	50 %	0 %	50 %	0 %	532422521
18584	NC_022118	A	7	7	840168	840174	100 %	0 %	0 %	0 %	532422521
18585	NC_022118	A	6	6	840206	840211	100 %	0 %	0 %	0 %	532422521
18586	NC_022118	CTA	2	6	840232	840237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422521
18587	NC_022118	AAT	2	6	840252	840257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422521
18588	NC_022118	AGC	2	6	840268	840273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18589	NC_022118	TAA	2	6	840289	840294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422522
18590	NC_022118	T	6	6	840333	840338	0 %	100 %	0 %	0 %	532422522
18591	NC_022118	GAAG	2	8	840377	840384	50 %	0 %	50 %	0 %	532422522
18592	NC_022118	CTTG	2	8	840475	840482	0 %	50 %	25 %	25 %	532422522
18593	NC_022118	TCT	2	6	840498	840503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422522
18594	NC_022118	AAGAG	2	10	840540	840549	60 %	0 %	40 %	0 %	532422522
18595	NC_022118	AC	3	6	840560	840565	50 %	0 %	0 %	50 %	532422522
18596	NC_022118	TCTT	2	8	840663	840670	0 %	75 %	0 %	25 %	532422522
18597	NC_022118	TGC	2	6	840713	840718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422522
18598	NC_022118	A	6	6	840742	840747	100 %	0 %	0 %	0 %	532422522
18599	NC_022118	AGAA	2	8	840810	840817	75 %	0 %	25 %	0 %	532422522
18600	NC_022118	A	6	6	840830	840835	100 %	0 %	0 %	0 %	532422522
18601	NC_022118	CAAT	2	8	840849	840856	50 %	25 %	0 %	25 %	532422522
18602	NC_022118	T	7	7	840887	840893	0 %	100 %	0 %	0 %	532422522
18603	NC_022118	TGA	2	6	840897	840902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422522
18604	NC_022118	CTT	2	6	840937	840942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422522
18605	NC_022118	TCC	2	6	840951	840956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422522
18606	NC_022118	CTC	2	6	841002	841007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422522
18607	NC_022118	GAA	2	6	841081	841086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422523
18608	NC_022118	GAC	2	6	841097	841102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422523
18609	NC_022118	CAA	2	6	841142	841147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422523
18610	NC_022118	TCG	2	6	841229	841234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422523
18611	NC_022118	ATCG	2	8	841310	841317	25 %	25 %	25 %	25 %	532422523
18612	NC_022118	CAGA	2	8	841384	841391	50 %	0 %	25 %	25 %	532422523
18613	NC_022118	TTC	2	6	841394	841399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422523
18614	NC_022118	T	6	6	841414	841419	0 %	100 %	0 %	0 %	532422523
18615	NC_022118	CTT	3	9	841429	841437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422523
18616	NC_022118	AGT	2	6	841445	841450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422523
18617	NC_022118	TGG	2	6	841479	841484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422523
18618	NC_022118	TCGT	2	8	841499	841506	0 %	50 %	25 %	25 %	532422523
18619	NC_022118	CTC	2	6	841510	841515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422523
18620	NC_022118	CT	3	6	841526	841531	0 %	50 %	0 %	50 %	532422523
18621	NC_022118	GCA	2	6	841551	841556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422523
18622	NC_022118	AG	3	6	841561	841566	50 %	0 %	50 %	0 %	532422523
18623	NC_022118	GAC	2	6	841613	841618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422523
18624	NC_022118	CTG	2	6	841621	841626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422523
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18626	NC_022118	TGCT	2	8	841760	841767	0 %	50 %	25 %	25 %	532422523
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18628	NC_022118	TAAG	2	8	841782	841789	50 %	25 %	25 %	0 %	532422523
18629	NC_022118	AGA	2	6	841803	841808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422523
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18632	NC_022118	TCT	2	6	842025	842030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422523
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18640	NC_022118	TGGG	2	8	842449	842456	0 %	25 %	75 %	0 %	532422524
18641	NC_022118	TG	3	6	842458	842463	0 %	50 %	50 %	0 %	532422524
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18723	NC_022118	T	6	6	846920	846925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18724	NC_022118	AG	3	6	846968	846973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18725	NC_022118	AG	3	6	846977	846982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18726	NC_022118	TAA	2	6	847041	847046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18743	NC_022118	T	6	6	847602	847607	0 %	100 %	0 %	0 %	532422528
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18998	NC_022118	TAA	2	6	861030	861035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422534
18999	NC_022118	TGC	2	6	861091	861096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422534
19000	NC_022118	A	6	6	861199	861204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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