MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022118	CGC	2	6	813148	813153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422501
18002	NC_022118	CAA	2	6	813166	813171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422501
18003	NC_022118	TG	3	6	813192	813197	0 %	50 %	50 %	0 %	532422501
18004	NC_022118	AGAAA	2	10	813255	813264	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_022118	ATG	2	6	813301	813306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_022118	AAG	2	6	813359	813364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_022118	AAC	2	6	813366	813371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_022118	T	6	6	813381	813386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_022118	CAA	2	6	813437	813442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422502
18010	NC_022118	AACT	2	8	813444	813451	50 %	25 %	0 %	25 %	532422502
18011	NC_022118	ATC	2	6	813457	813462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422502
18012	NC_022118	TCA	2	6	813518	813523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422502
18013	NC_022118	TTC	2	6	813534	813539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18014	NC_022118	CCTT	2	8	813602	813609	0 %	50 %	0 %	50 %	532422502
18015	NC_022118	CTT	2	6	813623	813628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18016	NC_022118	AG	3	6	813708	813713	50 %	0 %	50 %	0 %	532422502
18017	NC_022118	TTC	2	6	813717	813722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18018	NC_022118	CT	3	6	813739	813744	0 %	50 %	0 %	50 %	532422502
18019	NC_022118	CTT	2	6	813812	813817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18020	NC_022118	TTC	2	6	813850	813855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18021	NC_022118	AAG	2	6	813948	813953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422502
18022	NC_022118	AGGA	2	8	813964	813971	50 %	0 %	50 %	0 %	532422502
18023	NC_022118	ATTT	2	8	814079	814086	25 %	75 %	0 %	0 %	532422502
18024	NC_022118	TCA	2	6	814114	814119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422502
18025	NC_022118	A	6	6	814197	814202	100 %	0 %	0 %	0 %	532422502
18026	NC_022118	T	6	6	814213	814218	0 %	100 %	0 %	0 %	532422502
18027	NC_022118	TCT	2	6	814234	814239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18028	NC_022118	GAAA	2	8	814326	814333	75 %	0 %	25 %	0 %	532422502
18029	NC_022118	GAG	2	6	814372	814377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422502
18030	NC_022118	CA	3	6	814409	814414	50 %	0 %	0 %	50 %	532422502
18031	NC_022118	CAA	2	6	814493	814498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422502
18032	NC_022118	TAT	2	6	814499	814504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422502
18033	NC_022118	ACA	2	6	814537	814542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422502
18034	NC_022118	T	8	8	814543	814550	0 %	100 %	0 %	0 %	532422502
18035	NC_022118	CTT	2	6	814565	814570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18036	NC_022118	TG	3	6	814582	814587	0 %	50 %	50 %	0 %	532422502
18037	NC_022118	ACACA	2	10	814616	814625	60 %	0 %	0 %	40 %	532422502
18038	NC_022118	TCT	2	6	814636	814641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422502
18039	NC_022118	TGA	2	6	814726	814731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_022118	GAA	2	6	814794	814799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_022118	A	8	8	814855	814862	100 %	0 %	0 %	0 %	532422729
18042	NC_022118	T	6	6	814876	814881	0 %	100 %	0 %	0 %	532422729
18043	NC_022118	GGT	2	6	814895	814900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422729
18044	NC_022118	A	7	7	814901	814907	100 %	0 %	0 %	0 %	532422729
18045	NC_022118	GAA	2	6	814952	814957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422729
18046	NC_022118	AAG	2	6	815063	815068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_022118	GT	3	6	815163	815168	0 %	50 %	50 %	0 %	532422503
18048	NC_022118	TCTT	2	8	815363	815370	0 %	75 %	0 %	25 %	532422503
18049	NC_022118	GAG	2	6	815376	815381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422503
18050	NC_022118	GAG	2	6	815427	815432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422503
18051	NC_022118	TGC	2	6	815483	815488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422503
18052	NC_022118	CTT	3	9	815510	815518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18053	NC_022118	TGTTT	2	10	815558	815567	0 %	80 %	20 %	0 %	532422503
18054	NC_022118	A	7	7	815575	815581	100 %	0 %	0 %	0 %	532422503
18055	NC_022118	TCT	2	6	815593	815598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18056	NC_022118	GAA	2	6	815725	815730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18057	NC_022118	ATT	2	6	815831	815836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422503
18058	NC_022118	GAT	2	6	815870	815875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422503
18059	NC_022118	GA	5	10	815929	815938	50 %	0 %	50 %	0 %	532422503
18060	NC_022118	AGA	2	6	815969	815974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18061	NC_022118	CTTTG	2	10	815977	815986	0 %	60 %	20 %	20 %	532422503
18062	NC_022118	TTA	2	6	816048	816053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422503
18063	NC_022118	TTG	2	6	816067	816072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422503
18064	NC_022118	AGCA	2	8	816097	816104	50 %	0 %	25 %	25 %	532422503
18065	NC_022118	TTC	2	6	816106	816111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18066	NC_022118	ATT	2	6	816132	816137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422503
18067	NC_022118	TGGA	2	8	816367	816374	25 %	25 %	50 %	0 %	532422503
18068	NC_022118	ACG	2	6	816403	816408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422503
18069	NC_022118	CTT	2	6	816427	816432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18070	NC_022118	AAG	2	6	816448	816453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18071	NC_022118	AG	3	6	816503	816508	50 %	0 %	50 %	0 %	532422503
18072	NC_022118	AGA	2	6	816518	816523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18073	NC_022118	GAA	2	6	816581	816586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18074	NC_022118	TAA	2	6	816617	816622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422503
18075	NC_022118	GCATC	2	10	816626	816635	20 %	20 %	20 %	40 %	532422503
18076	NC_022118	TTTA	2	8	816669	816676	25 %	75 %	0 %	0 %	532422503
18077	NC_022118	TGA	2	6	816677	816682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422503
18078	NC_022118	ACT	2	6	816724	816729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422503
18079	NC_022118	ACTT	2	8	816778	816785	25 %	50 %	0 %	25 %	532422503
18080	NC_022118	GAA	2	6	816803	816808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18081	NC_022118	CTT	2	6	816812	816817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18082	NC_022118	A	6	6	816846	816851	100 %	0 %	0 %	0 %	532422503
18083	NC_022118	GCG	2	6	816854	816859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422503
18084	NC_022118	A	6	6	816910	816915	100 %	0 %	0 %	0 %	532422503
18085	NC_022118	GAT	2	6	816963	816968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422503
18086	NC_022118	TTG	2	6	816970	816975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422503
18087	NC_022118	AGA	2	6	817052	817057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18088	NC_022118	AGAA	2	8	817150	817157	75 %	0 %	25 %	0 %	532422503
18089	NC_022118	ATT	2	6	817245	817250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422503
18090	NC_022118	GGC	2	6	817278	817283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422503
18091	NC_022118	AGA	2	6	817331	817336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18092	NC_022118	AGA	2	6	817418	817423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18093	NC_022118	ATG	2	6	817426	817431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422503
18094	NC_022118	CTT	2	6	817441	817446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18095	NC_022118	GTT	2	6	817500	817505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422503
18096	NC_022118	AGC	2	6	817665	817670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422503
18097	NC_022118	AAG	2	6	817745	817750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18098	NC_022118	TTC	2	6	817768	817773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18099	NC_022118	AGA	2	6	817796	817801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18100	NC_022118	CCT	2	6	817806	817811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422503
18101	NC_022118	AAG	2	6	817915	817920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18102	NC_022118	GA	3	6	817926	817931	50 %	0 %	50 %	0 %	532422503
18103	NC_022118	TGT	2	6	817977	817982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422503
18104	NC_022118	TAT	2	6	818120	818125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422503
18105	NC_022118	CCA	2	6	818176	818181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422503
18106	NC_022118	TCT	2	6	818225	818230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422503
18107	NC_022118	GGA	2	6	818256	818261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422503
18108	NC_022118	TTGG	2	8	818274	818281	0 %	50 %	50 %	0 %	532422503
18109	NC_022118	TGG	2	6	818310	818315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422503
18110	NC_022118	CTG	2	6	818320	818325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422503
18111	NC_022118	GAA	2	6	818412	818417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18112	NC_022118	A	6	6	818416	818421	100 %	0 %	0 %	0 %	532422503
18113	NC_022118	AAAG	2	8	818456	818463	75 %	0 %	25 %	0 %	532422503
18114	NC_022118	TGA	3	9	818474	818482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422503
18115	NC_022118	GAA	2	6	818505	818510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422503
18116	NC_022118	TA	3	6	818558	818563	50 %	50 %	0 %	0 %	532422503
18117	NC_022118	T	8	8	818628	818635	0 %	100 %	0 %	0 %	532422504
18118	NC_022118	GTA	2	6	818900	818905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422504
18119	NC_022118	GCA	2	6	819028	819033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422504
18120	NC_022118	GCA	2	6	819067	819072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422504
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18244	NC_022118	ATT	2	6	824594	824599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422507
18245	NC_022118	AAT	2	6	824615	824620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422507
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18250	NC_022118	TA	3	6	825024	825029	50 %	50 %	0 %	0 %	532422507
18251	NC_022118	CTAG	2	8	825042	825049	25 %	25 %	25 %	25 %	532422507
18252	NC_022118	TCT	2	6	825063	825068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422507
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18255	NC_022118	TCC	2	6	825127	825132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18256	NC_022118	GC	3	6	825146	825151	0 %	0 %	50 %	50 %	532422508
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18282	NC_022118	TC	3	6	826222	826227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18366	NC_022118	ATTG	2	8	829756	829763	25 %	50 %	25 %	0 %	532422512
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18477	NC_022118	CTT	2	6	834891	834896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18481	NC_022118	AG	3	6	834960	834965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18482	NC_022118	GTT	2	6	834974	834979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18483	NC_022118	GA	3	6	834983	834988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18484	NC_022118	TTA	2	6	835008	835013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18485	NC_022118	TGGCA	2	10	835054	835063	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18486	NC_022118	CAG	2	6	835092	835097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422517
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18489	NC_022118	TGA	2	6	835189	835194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422517
18490	NC_022118	A	6	6	835241	835246	100 %	0 %	0 %	0 %	532422517
18491	NC_022118	TGT	2	6	835329	835334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422517
18492	NC_022118	GTT	2	6	835351	835356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422517
18493	NC_022118	ATG	2	6	835407	835412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422517
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18495	NC_022118	TGAT	2	8	835527	835534	25 %	50 %	25 %	0 %	532422517
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18499	NC_022118	A	6	6	835607	835612	100 %	0 %	0 %	0 %	532422517
18500	NC_022118	TCG	2	6	835773	835778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422517

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