MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022118	GAA	2	6	721995	722000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422429
16002	NC_022118	AGG	2	6	722050	722055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422429
16003	NC_022118	TGT	2	6	722084	722089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422429
16004	NC_022118	ACA	2	6	722156	722161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422429
16005	NC_022118	TTTCG	2	10	722166	722175	0 %	60 %	20 %	20 %	532422429
16006	NC_022118	TGA	2	6	722189	722194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422429
16007	NC_022118	TG	3	6	722236	722241	0 %	50 %	50 %	0 %	532422429
16008	NC_022118	GTCT	2	8	722283	722290	0 %	50 %	25 %	25 %	532422429
16009	NC_022118	CAA	2	6	722346	722351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422429
16010	NC_022118	TAA	2	6	722357	722362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422429
16011	NC_022118	TCT	2	6	722366	722371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422429
16012	NC_022118	GAA	2	6	722375	722380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422429
16013	NC_022118	A	6	6	722379	722384	100 %	0 %	0 %	0 %	532422429
16014	NC_022118	TAA	2	6	722436	722441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422429
16015	NC_022118	GAG	2	6	722451	722456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422429
16016	NC_022118	TTTG	2	8	722490	722497	0 %	75 %	25 %	0 %	532422429
16017	NC_022118	CCTT	2	8	722513	722520	0 %	50 %	0 %	50 %	532422429
16018	NC_022118	CTT	3	9	722596	722604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422429
16019	NC_022118	GTTT	2	8	722628	722635	0 %	75 %	25 %	0 %	532422429
16020	NC_022118	TAA	2	6	722676	722681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422429
16021	NC_022118	A	6	6	722691	722696	100 %	0 %	0 %	0 %	532422429
16022	NC_022118	CAG	2	6	722721	722726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422429
16023	NC_022118	AAGG	2	8	722760	722767	50 %	0 %	50 %	0 %	532422429
16024	NC_022118	AAC	2	6	722872	722877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422429
16025	NC_022118	T	8	8	722924	722931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_022118	T	7	7	722937	722943	0 %	100 %	0 %	0 %	532422430
16027	NC_022118	GAG	2	6	722948	722953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422430
16028	NC_022118	T	6	6	722963	722968	0 %	100 %	0 %	0 %	532422430
16029	NC_022118	CTT	2	6	723012	723017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422430
16030	NC_022118	T	6	6	723037	723042	0 %	100 %	0 %	0 %	532422430
16031	NC_022118	ATT	2	6	723109	723114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422430
16032	NC_022118	T	6	6	723192	723197	0 %	100 %	0 %	0 %	532422430
16033	NC_022118	T	6	6	723204	723209	0 %	100 %	0 %	0 %	532422430
16034	NC_022118	GTC	2	6	723238	723243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422430
16035	NC_022118	AGG	2	6	723261	723266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422430
16036	NC_022118	AG	3	6	723289	723294	50 %	0 %	50 %	0 %	532422430
16037	NC_022118	T	6	6	723318	723323	0 %	100 %	0 %	0 %	532422430
16038	NC_022118	ATT	2	6	723331	723336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422430
16039	NC_022118	TAA	3	9	723366	723374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422430
16040	NC_022118	T	6	6	723386	723391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_022118	T	6	6	723409	723414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_022118	ATC	2	6	723493	723498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422431
16043	NC_022118	T	7	7	723505	723511	0 %	100 %	0 %	0 %	532422431
16044	NC_022118	ATG	2	6	723537	723542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422431
16045	NC_022118	A	6	6	723576	723581	100 %	0 %	0 %	0 %	532422431
16046	NC_022118	AAC	2	6	723645	723650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422431
16047	NC_022118	GAGAA	2	10	723660	723669	60 %	0 %	40 %	0 %	532422431
16048	NC_022118	CT	4	8	723680	723687	0 %	50 %	0 %	50 %	532422431
16049	NC_022118	ACA	2	6	723704	723709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422431
16050	NC_022118	A	7	7	723748	723754	100 %	0 %	0 %	0 %	532422431
16051	NC_022118	TGCTT	2	10	723841	723850	0 %	60 %	20 %	20 %	532422431
16052	NC_022118	TCA	2	6	723880	723885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422431
16053	NC_022118	GGT	2	6	723887	723892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422431
16054	NC_022118	TTG	2	6	723942	723947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422431
16055	NC_022118	AAG	2	6	724036	724041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16056	NC_022118	AGC	2	6	724090	724095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422431
16057	NC_022118	TGG	2	6	724155	724160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422431
16058	NC_022118	GAA	2	6	724175	724180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16059	NC_022118	TGG	2	6	724193	724198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422431
16060	NC_022118	A	6	6	724220	724225	100 %	0 %	0 %	0 %	532422431
16061	NC_022118	TCT	2	6	724250	724255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422431
16062	NC_022118	ATG	2	6	724329	724334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422431
16063	NC_022118	AAG	2	6	724340	724345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16064	NC_022118	CTT	2	6	724350	724355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422431
16065	NC_022118	TCA	2	6	724416	724421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422431
16066	NC_022118	TTG	2	6	724460	724465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422431
16067	NC_022118	TGT	2	6	724479	724484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422431
16068	NC_022118	CT	3	6	724541	724546	0 %	50 %	0 %	50 %	532422431
16069	NC_022118	TC	3	6	724585	724590	0 %	50 %	0 %	50 %	532422431
16070	NC_022118	AGA	2	6	724596	724601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16071	NC_022118	CAA	2	6	724668	724673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422431
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16073	NC_022118	A	7	7	724744	724750	100 %	0 %	0 %	0 %	532422431
16074	NC_022118	AGC	2	6	724767	724772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422431
16075	NC_022118	TTTG	2	8	724793	724800	0 %	75 %	25 %	0 %	532422431
16076	NC_022118	AAG	2	6	724853	724858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16077	NC_022118	TGCT	2	8	724875	724882	0 %	50 %	25 %	25 %	532422431
16078	NC_022118	A	6	6	724937	724942	100 %	0 %	0 %	0 %	532422431
16079	NC_022118	GTT	2	6	724976	724981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422431
16080	NC_022118	GTTT	2	8	725023	725030	0 %	75 %	25 %	0 %	532422431
16081	NC_022118	TAT	2	6	725031	725036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422431
16082	NC_022118	AAG	2	6	725080	725085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16083	NC_022118	CAGC	2	8	725102	725109	25 %	0 %	25 %	50 %	532422431
16084	NC_022118	AGA	2	6	725128	725133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
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16086	NC_022118	ACT	2	6	725153	725158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422431
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16088	NC_022118	AGA	2	6	725236	725241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16089	NC_022118	AG	3	6	725293	725298	50 %	0 %	50 %	0 %	532422431
16090	NC_022118	AATC	2	8	725341	725348	50 %	25 %	0 %	25 %	532422431
16091	NC_022118	ACTGT	2	10	725543	725552	20 %	40 %	20 %	20 %	532422431
16092	NC_022118	AAG	2	6	725561	725566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422431
16093	NC_022118	TCT	2	6	725585	725590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422431
16094	NC_022118	CAA	2	6	725641	725646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_022118	TTG	2	6	725652	725657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_022118	GAA	2	6	725688	725693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_022118	ACA	2	6	725723	725728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_022118	A	7	7	725746	725752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_022118	AGC	2	6	725760	725765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_022118	AG	3	6	725776	725781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_022118	CCTT	2	8	725811	725818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16102	NC_022118	ATTCT	2	10	725827	725836	20 %	60 %	0 %	20 %	532422432
16103	NC_022118	TTA	2	6	725886	725891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422432
16104	NC_022118	TGG	2	6	725924	725929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422432
16105	NC_022118	T	8	8	725959	725966	0 %	100 %	0 %	0 %	532422432
16106	NC_022118	AGA	2	6	726020	726025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422432
16107	NC_022118	GT	3	6	726150	726155	0 %	50 %	50 %	0 %	532422432
16108	NC_022118	T	6	6	726190	726195	0 %	100 %	0 %	0 %	532422432
16109	NC_022118	TCA	2	6	726197	726202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422432
16110	NC_022118	TAT	2	6	726219	726224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422432
16111	NC_022118	TTG	2	6	726317	726322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422432
16112	NC_022118	ATT	2	6	726381	726386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422432
16113	NC_022118	CTTT	2	8	726406	726413	0 %	75 %	0 %	25 %	532422432
16114	NC_022118	AGA	3	9	726446	726454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422432
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16116	NC_022118	TAC	2	6	726491	726496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422432
16117	NC_022118	T	6	6	726552	726557	0 %	100 %	0 %	0 %	532422432
16118	NC_022118	AGA	2	6	726608	726613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422432
16119	NC_022118	CTTA	2	8	726685	726692	25 %	50 %	0 %	25 %	532422432
16120	NC_022118	TTGAA	2	10	726709	726718	40 %	40 %	20 %	0 %	532422432
16121	NC_022118	TTCG	2	8	726745	726752	0 %	50 %	25 %	25 %	532422432
16122	NC_022118	T	6	6	726819	726824	0 %	100 %	0 %	0 %	532422432
16123	NC_022118	AGA	2	6	726866	726871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422432
16124	NC_022118	TTG	2	6	727019	727024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422432
16125	NC_022118	ATT	2	6	727033	727038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422433
16126	NC_022118	TTCG	2	8	727087	727094	0 %	50 %	25 %	25 %	532422433
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16128	NC_022118	TTC	2	6	727109	727114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422433
16129	NC_022118	TTG	2	6	727145	727150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422433
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16132	NC_022118	TTCT	2	8	727205	727212	0 %	75 %	0 %	25 %	532422433
16133	NC_022118	TTG	2	6	727326	727331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422433
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16137	NC_022118	TTG	2	6	727412	727417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422433
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16141	NC_022118	TTC	2	6	727829	727834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422433
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16146	NC_022118	GCT	2	6	728102	728107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422434
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16148	NC_022118	TCTA	2	8	728128	728135	25 %	50 %	0 %	25 %	532422434
16149	NC_022118	AAGA	2	8	728198	728205	75 %	0 %	25 %	0 %	532422434
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16152	NC_022118	A	6	6	728245	728250	100 %	0 %	0 %	0 %	532422434
16153	NC_022118	CGA	2	6	728256	728261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422434
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16163	NC_022118	AG	3	6	728552	728557	50 %	0 %	50 %	0 %	532422434
16164	NC_022118	AGA	2	6	728605	728610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422434
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16171	NC_022118	AATA	2	8	728857	728864	75 %	25 %	0 %	0 %	532422434
16172	NC_022118	T	6	6	728869	728874	0 %	100 %	0 %	0 %	532422434
16173	NC_022118	ACAT	2	8	728891	728898	50 %	25 %	0 %	25 %	532422434
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16231	NC_022118	TAGG	2	8	731453	731460	25 %	25 %	50 %	0 %	532422435
16232	NC_022118	T	6	6	731604	731609	0 %	100 %	0 %	0 %	532422435
16233	NC_022118	GA	3	6	731615	731620	50 %	0 %	50 %	0 %	532422435
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16242	NC_022118	GTA	2	6	732065	732070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422435
16243	NC_022118	AGA	2	6	732098	732103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422435
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16369	NC_022118	TCA	2	6	737152	737157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16371	NC_022118	TTC	2	6	737296	737301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16372	NC_022118	TGC	2	6	737310	737315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16374	NC_022118	T	6	6	737354	737359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16375	NC_022118	A	6	6	737360	737365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16376	NC_022118	T	13	13	737456	737468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16377	NC_022118	A	7	7	737469	737475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16378	NC_022118	GA	3	6	737486	737491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16492	NC_022118	TTCT	2	8	742821	742828	0 %	75 %	0 %	25 %	532422441
16493	NC_022118	AGGG	2	8	742873	742880	25 %	0 %	75 %	0 %	532422441
16494	NC_022118	GCT	2	6	742930	742935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422442
16495	NC_022118	CAG	2	6	742976	742981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422442
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16497	NC_022118	TCT	2	6	743038	743043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422442
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16500	NC_022118	GTG	2	6	743182	743187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422442

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