MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022118	CAG	3	9	700184	700192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422414
15502	NC_022118	T	6	6	700202	700207	0 %	100 %	0 %	0 %	532422414
15503	NC_022118	TTG	2	6	700255	700260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422414
15504	NC_022118	TAGT	2	8	700273	700280	25 %	50 %	25 %	0 %	532422414
15505	NC_022118	ATC	2	6	700293	700298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422414
15506	NC_022118	A	6	6	700317	700322	100 %	0 %	0 %	0 %	532422414
15507	NC_022118	T	6	6	700329	700334	0 %	100 %	0 %	0 %	532422414
15508	NC_022118	GTTC	2	8	700337	700344	0 %	50 %	25 %	25 %	532422414
15509	NC_022118	CT	3	6	700651	700656	0 %	50 %	0 %	50 %	532422414
15510	NC_022118	TGCTTG	2	12	700662	700673	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532422414
15511	NC_022118	AAG	2	6	700675	700680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422414
15512	NC_022118	ACC	2	6	700771	700776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422414
15513	NC_022118	TG	3	6	700849	700854	0 %	50 %	50 %	0 %	532422414
15514	NC_022118	TAC	2	6	700859	700864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422414
15515	NC_022118	TCC	2	6	700870	700875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422414
15516	NC_022118	CTT	2	6	700934	700939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422414
15517	NC_022118	ATT	2	6	700974	700979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422414
15518	NC_022118	TCCA	2	8	700987	700994	25 %	25 %	0 %	50 %	532422414
15519	NC_022118	TGCT	2	8	701111	701118	0 %	50 %	25 %	25 %	532422414
15520	NC_022118	TG	3	6	701146	701151	0 %	50 %	50 %	0 %	532422414
15521	NC_022118	TCA	2	6	701161	701166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422414
15522	NC_022118	ATA	2	6	701169	701174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422414
15523	NC_022118	AGCTG	2	10	701233	701242	20 %	20 %	40 %	20 %	532422414
15524	NC_022118	CTT	2	6	701258	701263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422414
15525	NC_022118	TTCT	2	8	701280	701287	0 %	75 %	0 %	25 %	532422414
15526	NC_022118	CTG	2	6	701373	701378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422414
15527	NC_022118	TGC	2	6	701400	701405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422414
15528	NC_022118	TCT	2	6	701446	701451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422414
15529	NC_022118	TAC	2	6	701525	701530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422414
15530	NC_022118	CTG	2	6	701543	701548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422414
15531	NC_022118	TGC	2	6	701555	701560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422414
15532	NC_022118	CTT	2	6	701572	701577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422414
15533	NC_022118	C	6	6	701579	701584	0 %	0 %	0 %	100 %	532422414
15534	NC_022118	TCC	2	6	701589	701594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422414
15535	NC_022118	CTC	2	6	701697	701702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422414
15536	NC_022118	TGGC	2	8	701711	701718	0 %	25 %	50 %	25 %	532422414
15537	NC_022118	TAAA	2	8	701765	701772	75 %	25 %	0 %	0 %	532422414
15538	NC_022118	AGT	2	6	701787	701792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422414
15539	NC_022118	AAG	2	6	701813	701818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422414
15540	NC_022118	AAAAC	2	10	701824	701833	80 %	0 %	0 %	20 %	532422414
15541	NC_022118	A	6	6	701865	701870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_022118	T	7	7	701872	701878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_022118	TGTT	2	8	701882	701889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_022118	TAA	2	6	701958	701963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_022118	AGA	2	6	701997	702002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422415
15546	NC_022118	ATT	2	6	702003	702008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422415
15547	NC_022118	A	6	6	702062	702067	100 %	0 %	0 %	0 %	532422415
15548	NC_022118	ATG	2	6	702122	702127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
15549	NC_022118	AGTT	2	8	702146	702153	25 %	50 %	25 %	0 %	532422415
15550	NC_022118	TCT	2	6	702163	702168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422415
15551	NC_022118	TTGG	2	8	702283	702290	0 %	50 %	50 %	0 %	532422415
15552	NC_022118	TC	3	6	702294	702299	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
15553	NC_022118	CAA	2	6	702343	702348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422415
15554	NC_022118	TCC	2	6	702351	702356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422415
15555	NC_022118	TTTG	2	8	702384	702391	0 %	75 %	25 %	0 %	532422415
15556	NC_022118	ACT	2	6	702400	702405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
15557	NC_022118	TAG	2	6	702407	702412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
15558	NC_022118	TCCT	2	8	702464	702471	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
15559	NC_022118	CAAT	2	8	702534	702541	50 %	25 %	0 %	25 %	532422415
15560	NC_022118	GAT	2	6	702678	702683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
15561	NC_022118	ATCT	2	8	702758	702765	25 %	50 %	0 %	25 %	532422415
15562	NC_022118	ATC	2	6	702772	702777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
15563	NC_022118	TTC	2	6	702780	702785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422415
15564	NC_022118	TC	4	8	702784	702791	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
15565	NC_022118	TATC	2	8	702851	702858	25 %	50 %	0 %	25 %	532422415
15566	NC_022118	TA	3	6	702892	702897	50 %	50 %	0 %	0 %	532422415
15567	NC_022118	CT	3	6	702912	702917	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
15568	NC_022118	TCA	2	6	702947	702952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
15569	NC_022118	ACT	2	6	702985	702990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
15570	NC_022118	AACG	2	8	702999	703006	50 %	0 %	25 %	25 %	532422415
15571	NC_022118	GC	3	6	703035	703040	0 %	0 %	50 %	50 %	532422415
15572	NC_022118	AACT	2	8	703061	703068	50 %	25 %	0 %	25 %	532422415
15573	NC_022118	TGA	2	6	703110	703115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
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15575	NC_022118	GAC	2	6	703194	703199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422415
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15578	NC_022118	CTT	2	6	703408	703413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422415
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15580	NC_022118	CTT	2	6	703560	703565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422415
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15582	NC_022118	T	6	6	703595	703600	0 %	100 %	0 %	0 %	532422415
15583	NC_022118	CT	3	6	703635	703640	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
15584	NC_022118	CTTC	2	8	703645	703652	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
15585	NC_022118	GATT	2	8	703695	703702	25 %	50 %	25 %	0 %	532422415
15586	NC_022118	CTAC	2	8	703799	703806	25 %	25 %	0 %	50 %	532422415
15587	NC_022118	ACA	2	6	703830	703835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422415
15588	NC_022118	ACA	2	6	703911	703916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422415
15589	NC_022118	ATG	2	6	704123	704128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
15590	NC_022118	GGA	2	6	704185	704190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422415
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15592	NC_022118	CTTC	2	8	704245	704252	0 %	50 %	0 %	50 %	532422415
15593	NC_022118	ATC	2	6	704257	704262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422415
15594	NC_022118	GGA	2	6	704266	704271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422415
15595	NC_022118	CAAG	2	8	704284	704291	50 %	0 %	25 %	25 %	532422415
15596	NC_022118	CAA	2	6	704305	704310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422415
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15598	NC_022118	GCA	2	6	704370	704375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422415
15599	NC_022118	GTA	2	6	704386	704391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422415
15600	NC_022118	ATCT	2	8	704419	704426	25 %	50 %	0 %	25 %	532422415
15601	NC_022118	CTAG	2	8	704443	704450	25 %	25 %	25 %	25 %	532422415
15602	NC_022118	AGC	2	6	704463	704468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422415
15603	NC_022118	GCT	2	6	704489	704494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15604	NC_022118	ATT	2	6	704505	704510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_022118	AAAT	2	8	704546	704553	75 %	25 %	0 %	0 %	532422416
15606	NC_022118	ACC	2	6	704582	704587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422416
15607	NC_022118	CTG	2	6	704662	704667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422416
15608	NC_022118	ATG	2	6	704871	704876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422416
15609	NC_022118	TCA	2	6	704963	704968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422416
15610	NC_022118	TTG	2	6	704983	704988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422416
15611	NC_022118	GCT	2	6	705008	705013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422416
15612	NC_022118	TTTCT	2	10	705043	705052	0 %	80 %	0 %	20 %	532422416
15613	NC_022118	ACA	2	6	705116	705121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422416
15614	NC_022118	TACA	2	8	705169	705176	50 %	25 %	0 %	25 %	532422416
15615	NC_022118	AGACG	2	10	705233	705242	40 %	0 %	40 %	20 %	532422416
15616	NC_022118	TCAA	2	8	705284	705291	50 %	25 %	0 %	25 %	532422416
15617	NC_022118	TTC	2	6	705434	705439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422416
15618	NC_022118	GAAT	2	8	705456	705463	50 %	25 %	25 %	0 %	532422416
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15620	NC_022118	TTA	2	6	705686	705691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422416
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15746	NC_022118	CTT	2	6	711336	711341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422419
15747	NC_022118	ATAGA	2	10	711344	711353	60 %	20 %	20 %	0 %	532422419
15748	NC_022118	GAG	2	6	711364	711369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422419
15749	NC_022118	ATA	2	6	711384	711389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422419
15750	NC_022118	TGT	2	6	711434	711439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422419
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15754	NC_022118	TCTTGA	2	12	711573	711584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532422419
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15764	NC_022118	AGCC	2	8	712313	712320	25 %	0 %	25 %	50 %	532422419
15765	NC_022118	CTA	2	6	712330	712335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422419
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15768	NC_022118	TCA	2	6	712446	712451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422419
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15772	NC_022118	ATGA	2	8	712609	712616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15773	NC_022118	TAGA	2	8	712618	712625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15774	NC_022118	TCC	3	9	712646	712654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15775	NC_022118	GCT	2	6	712686	712691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422420
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15813	NC_022118	GTT	2	6	714286	714291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15817	NC_022118	A	6	6	714412	714417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15818	NC_022118	TGTT	2	8	714434	714441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15847	NC_022118	TCT	2	6	715632	715637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15848	NC_022118	TATT	2	8	715660	715667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15849	NC_022118	TCCA	2	8	715668	715675	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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15992	NC_022118	CATG	2	8	721740	721747	25 %	25 %	25 %	25 %	532422429
15993	NC_022118	TATCCA	2	12	721752	721763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422429
15994	NC_022118	A	6	6	721784	721789	100 %	0 %	0 %	0 %	532422429
15995	NC_022118	AGAT	2	8	721792	721799	50 %	25 %	25 %	0 %	532422429
15996	NC_022118	GAA	2	6	721872	721877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422429
15997	NC_022118	TATGG	2	10	721882	721891	20 %	40 %	40 %	0 %	532422429
15998	NC_022118	TC	3	6	721892	721897	0 %	50 %	0 %	50 %	532422429
15999	NC_022118	TCT	2	6	721916	721921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422429
16000	NC_022118	T	6	6	721921	721926	0 %	100 %	0 %	0 %	532422429

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