MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_022118	A	6	6	678378	678383	100 %	0 %	0 %	0 %	532422392
15003	NC_022118	CAAA	2	8	678433	678440	75 %	0 %	0 %	25 %	532422392
15004	NC_022118	CGC	2	6	678451	678456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422392
15005	NC_022118	A	6	6	678474	678479	100 %	0 %	0 %	0 %	532422392
15006	NC_022118	A	6	6	678492	678497	100 %	0 %	0 %	0 %	532422392
15007	NC_022118	CAG	2	6	678636	678641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422392
15008	NC_022118	TCT	2	6	678704	678709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422392
15009	NC_022118	CTA	2	6	678727	678732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422392
15010	NC_022118	ACA	2	6	678749	678754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422392
15011	NC_022118	TCTT	2	8	678789	678796	0 %	75 %	0 %	25 %	532422392
15012	NC_022118	TGA	2	6	678858	678863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422392
15013	NC_022118	TTCTC	2	10	678886	678895	0 %	60 %	0 %	40 %	532422392
15014	NC_022118	TCT	2	6	678907	678912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422393
15015	NC_022118	CT	3	6	678911	678916	0 %	50 %	0 %	50 %	532422393
15016	NC_022118	CT	3	6	678964	678969	0 %	50 %	0 %	50 %	532422393
15017	NC_022118	TCA	2	6	678995	679000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422393
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15019	NC_022118	CTG	2	6	679076	679081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422393
15020	NC_022118	T	6	6	679143	679148	0 %	100 %	0 %	0 %	532422393
15021	NC_022118	A	7	7	679153	679159	100 %	0 %	0 %	0 %	532422393
15022	NC_022118	A	6	6	679176	679181	100 %	0 %	0 %	0 %	532422393
15023	NC_022118	TC	3	6	679185	679190	0 %	50 %	0 %	50 %	532422393
15024	NC_022118	CT	3	6	679196	679201	0 %	50 %	0 %	50 %	532422393
15025	NC_022118	ATC	2	6	679218	679223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422393
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15031	NC_022118	A	7	7	679520	679526	100 %	0 %	0 %	0 %	532422393
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15035	NC_022118	CCTT	2	8	679706	679713	0 %	50 %	0 %	50 %	532422393
15036	NC_022118	TC	3	6	679785	679790	0 %	50 %	0 %	50 %	532422393
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15041	NC_022118	TG	3	6	679910	679915	0 %	50 %	50 %	0 %	532422393
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15096	NC_022118	TTTC	2	8	682285	682292	0 %	75 %	0 %	25 %	532422397
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15102	NC_022118	AG	3	6	682388	682393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_022118	ACC	2	6	682408	682413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15104	NC_022118	GAA	2	6	682470	682475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_022118	A	6	6	682524	682529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_022118	TTC	2	6	682569	682574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_022118	AAC	2	6	682630	682635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422398
15108	NC_022118	GTC	2	6	682642	682647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422398
15109	NC_022118	GA	3	6	682763	682768	50 %	0 %	50 %	0 %	532422398
15110	NC_022118	CCT	3	9	682784	682792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422398
15111	NC_022118	GCG	2	6	682837	682842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422398
15112	NC_022118	GAAT	2	8	682916	682923	50 %	25 %	25 %	0 %	532422398
15113	NC_022118	CACC	2	8	682927	682934	25 %	0 %	0 %	75 %	532422398
15114	NC_022118	AGA	2	6	682980	682985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422398
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15116	NC_022118	GCA	2	6	683023	683028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422398
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15118	NC_022118	GAA	2	6	683050	683055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422398
15119	NC_022118	CTT	2	6	683093	683098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422398
15120	NC_022118	A	6	6	683125	683130	100 %	0 %	0 %	0 %	532422398
15121	NC_022118	CT	3	6	683147	683152	0 %	50 %	0 %	50 %	532422398
15122	NC_022118	AGA	2	6	683190	683195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422398
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15248	NC_022118	AGA	2	6	688844	688849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422403
15249	NC_022118	GAA	2	6	688965	688970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422403
15250	NC_022118	CTT	2	6	688974	688979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422403
15251	NC_022118	GAACG	2	10	689104	689113	40 %	0 %	40 %	20 %	532422403
15252	NC_022118	CAG	2	6	689126	689131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422403
15253	NC_022118	TTA	2	6	689134	689139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422403
15254	NC_022118	GCATCA	2	12	689183	689194	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532422403
15255	NC_022118	TCC	2	6	689336	689341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422404
15256	NC_022118	CTT	2	6	689406	689411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422404
15257	NC_022118	CAA	2	6	689574	689579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422404
15258	NC_022118	CTA	2	6	689631	689636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422404
15259	NC_022118	AGG	2	6	689653	689658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422404
15260	NC_022118	TAT	2	6	689666	689671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422404
15261	NC_022118	ACT	2	6	689709	689714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422404
15262	NC_022118	ATGC	2	8	689727	689734	25 %	25 %	25 %	25 %	532422404
15263	NC_022118	CAG	3	9	689794	689802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422404
15264	NC_022118	C	6	6	689822	689827	0 %	0 %	0 %	100 %	532422404
15265	NC_022118	TAA	2	6	689891	689896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422404
15266	NC_022118	ACC	2	6	689971	689976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422404
15267	NC_022118	CAA	2	6	689982	689987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422404
15268	NC_022118	AGC	2	6	689993	689998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422404
15269	NC_022118	A	7	7	690020	690026	100 %	0 %	0 %	0 %	532422404
15270	NC_022118	GAA	2	6	690030	690035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422404
15271	NC_022118	AAG	2	6	690073	690078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422404
15272	NC_022118	CTT	2	6	690084	690089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422404
15273	NC_022118	A	6	6	690090	690095	100 %	0 %	0 %	0 %	532422404
15274	NC_022118	CT	4	8	690141	690148	0 %	50 %	0 %	50 %	532422404
15275	NC_022118	ATA	2	6	690178	690183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422404
15276	NC_022118	CCA	2	6	690287	690292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422404
15277	NC_022118	A	6	6	690340	690345	100 %	0 %	0 %	0 %	532422404
15278	NC_022118	ACG	2	6	690371	690376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422404
15279	NC_022118	AAC	3	9	690449	690457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422404
15280	NC_022118	GCT	2	6	690502	690507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422404
15281	NC_022118	GTT	2	6	690562	690567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15282	NC_022118	TAA	2	6	690597	690602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15283	NC_022118	TGA	2	6	690606	690611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15284	NC_022118	A	6	6	690636	690641	100 %	0 %	0 %	0 %	532422405
15285	NC_022118	CTT	2	6	690673	690678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422405
15286	NC_022118	TCT	2	6	690738	690743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422405
15287	NC_022118	CTT	2	6	690763	690768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422405
15288	NC_022118	TC	3	6	690838	690843	0 %	50 %	0 %	50 %	532422405
15289	NC_022118	AGC	2	6	690881	690886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422405
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15293	NC_022118	ATC	2	6	691091	691096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422405
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15297	NC_022118	A	6	6	691266	691271	100 %	0 %	0 %	0 %	532422405
15298	NC_022118	CAT	2	6	691286	691291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422405
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15300	NC_022118	A	6	6	691322	691327	100 %	0 %	0 %	0 %	532422406
15301	NC_022118	ACAA	2	8	691462	691469	75 %	0 %	0 %	25 %	532422406
15302	NC_022118	GAC	2	6	691521	691526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422406
15303	NC_022118	TA	3	6	691546	691551	50 %	50 %	0 %	0 %	532422406
15304	NC_022118	CGC	2	6	691604	691609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422406
15305	NC_022118	AGT	2	6	691615	691620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422406
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15308	NC_022118	CTT	2	6	691779	691784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422406
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15310	NC_022118	AT	3	6	691795	691800	50 %	50 %	0 %	0 %	532422406
15311	NC_022118	ACAAA	2	10	691813	691822	80 %	0 %	0 %	20 %	532422406
15312	NC_022118	CTT	2	6	691833	691838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422406
15313	NC_022118	T	7	7	691837	691843	0 %	100 %	0 %	0 %	532422406
15314	NC_022118	GGC	2	6	691940	691945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422406
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15316	NC_022118	CTT	2	6	692060	692065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422407
15317	NC_022118	GAA	2	6	692090	692095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422407
15318	NC_022118	TG	3	6	692124	692129	0 %	50 %	50 %	0 %	532422407
15319	NC_022118	A	6	6	692160	692165	100 %	0 %	0 %	0 %	532422407
15320	NC_022118	GCTCC	2	10	692176	692185	0 %	20 %	20 %	60 %	532422407
15321	NC_022118	GAT	2	6	692200	692205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422407
15322	NC_022118	GAA	2	6	692235	692240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422407
15323	NC_022118	TGG	2	6	692255	692260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422407
15324	NC_022118	ATG	2	6	692343	692348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422407
15325	NC_022118	GAT	2	6	692350	692355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422407
15326	NC_022118	A	7	7	692372	692378	100 %	0 %	0 %	0 %	532422407
15327	NC_022118	CTC	2	6	692428	692433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422407
15328	NC_022118	AGC	3	9	692488	692496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422407
15329	NC_022118	CTC	2	6	692547	692552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422408
15330	NC_022118	TCCA	2	8	692692	692699	25 %	25 %	0 %	50 %	532422408
15331	NC_022118	AAC	2	6	692752	692757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422408
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15333	NC_022118	TTA	2	6	692892	692897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422408
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15335	NC_022118	TCG	2	6	692992	692997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422408
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15337	NC_022118	GATA	2	8	693022	693029	50 %	25 %	25 %	0 %	532422408
15338	NC_022118	TTG	2	6	693040	693045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422408
15339	NC_022118	AGC	2	6	693046	693051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422408
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15341	NC_022118	CCGCT	2	10	693058	693067	0 %	20 %	20 %	60 %	532422408
15342	NC_022118	TTGC	2	8	693141	693148	0 %	50 %	25 %	25 %	532422408
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15348	NC_022118	ACG	2	6	693385	693390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422408
15349	NC_022118	CAT	2	6	693409	693414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422408
15350	NC_022118	AGAA	2	8	693415	693422	75 %	0 %	25 %	0 %	532422408
15351	NC_022118	ATCAAT	2	12	693508	693519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532422408
15352	NC_022118	AAG	2	6	693540	693545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422408
15353	NC_022118	AAC	2	6	693558	693563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422408
15354	NC_022118	ATC	2	6	693569	693574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422408
15355	NC_022118	TCAA	2	8	693584	693591	50 %	25 %	0 %	25 %	532422408
15356	NC_022118	AAC	2	6	693671	693676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422408
15357	NC_022118	CTT	2	6	693727	693732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422408
15358	NC_022118	AAAC	2	8	693794	693801	75 %	0 %	0 %	25 %	532422408
15359	NC_022118	CT	3	6	693825	693830	0 %	50 %	0 %	50 %	532422408
15360	NC_022118	GGA	2	6	693871	693876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422409
15361	NC_022118	TACT	2	8	693884	693891	25 %	50 %	0 %	25 %	532422409
15362	NC_022118	T	6	6	693935	693940	0 %	100 %	0 %	0 %	532422409
15363	NC_022118	ATT	2	6	693981	693986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422409
15364	NC_022118	CTT	2	6	693995	694000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422409
15365	NC_022118	AC	3	6	694026	694031	50 %	0 %	0 %	50 %	532422409
15366	NC_022118	CTT	2	6	694070	694075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422409
15367	NC_022118	A	8	8	694077	694084	100 %	0 %	0 %	0 %	532422409
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15369	NC_022118	GCA	2	6	694200	694205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422409
15370	NC_022118	T	6	6	694244	694249	0 %	100 %	0 %	0 %	532422410
15371	NC_022118	CTT	2	6	694250	694255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422410
15372	NC_022118	GAC	2	6	694391	694396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422410
15373	NC_022118	AAG	2	6	694401	694406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422410
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15388	NC_022118	TCCA	2	8	694990	694997	25 %	25 %	0 %	50 %	532422410
15389	NC_022118	T	6	6	695019	695024	0 %	100 %	0 %	0 %	532422410
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15477	NC_022118	T	8	8	699189	699196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15478	NC_022118	GCT	2	6	699214	699219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15487	NC_022118	CTAG	2	8	699661	699668	25 %	25 %	25 %	25 %	532422414
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15490	NC_022118	TCCT	2	8	699786	699793	0 %	50 %	0 %	50 %	532422414
15491	NC_022118	GAA	2	6	699811	699816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422414
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15493	NC_022118	TTA	2	6	699847	699852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422414
15494	NC_022118	AGG	2	6	699862	699867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422414
15495	NC_022118	AGC	2	6	699882	699887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422414
15496	NC_022118	TTG	2	6	699892	699897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422414
15497	NC_022118	CTT	2	6	699905	699910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422414
15498	NC_022118	AAG	2	6	700028	700033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422414
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15500	NC_022118	TTG	2	6	700113	700118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422414

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