MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022118	GGATGG	2	12	611731	611742	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	532422340
13502	NC_022118	AG	4	8	611784	611791	50 %	0 %	50 %	0 %	532422340
13503	NC_022118	TGG	2	6	611797	611802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422340
13504	NC_022118	ATA	2	6	611822	611827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422340
13505	NC_022118	GGCGC	2	10	611882	611891	0 %	0 %	60 %	40 %	532422340
13506	NC_022118	ATT	2	6	611908	611913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422340
13507	NC_022118	TAT	2	6	611916	611921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422340
13508	NC_022118	ATCG	2	8	611938	611945	25 %	25 %	25 %	25 %	532422340
13509	NC_022118	AGA	2	6	612000	612005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422340
13510	NC_022118	GAA	2	6	612022	612027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422340
13511	NC_022118	AG	3	6	612061	612066	50 %	0 %	50 %	0 %	532422340
13512	NC_022118	CT	3	6	612067	612072	0 %	50 %	0 %	50 %	532422340
13513	NC_022118	TTAC	2	8	612089	612096	25 %	50 %	0 %	25 %	532422340
13514	NC_022118	TAA	2	6	612105	612110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422340
13515	NC_022118	CCT	2	6	612134	612139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422340
13516	NC_022118	TTTA	2	8	612142	612149	25 %	75 %	0 %	0 %	532422340
13517	NC_022118	CT	3	6	612182	612187	0 %	50 %	0 %	50 %	532422340
13518	NC_022118	ATT	2	6	612206	612211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422340
13519	NC_022118	TTTG	2	8	612240	612247	0 %	75 %	25 %	0 %	532422340
13520	NC_022118	ATT	2	6	612258	612263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422340
13521	NC_022118	GGCT	2	8	612280	612287	0 %	25 %	50 %	25 %	532422340
13522	NC_022118	TCT	2	6	612332	612337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422340
13523	NC_022118	ATT	2	6	612345	612350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422340
13524	NC_022118	TGG	2	6	612394	612399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422340
13525	NC_022118	T	6	6	612429	612434	0 %	100 %	0 %	0 %	532422340
13526	NC_022118	ATG	2	6	612451	612456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422340
13527	NC_022118	ATTGG	2	10	612457	612466	20 %	40 %	40 %	0 %	532422340
13528	NC_022118	A	6	6	612487	612492	100 %	0 %	0 %	0 %	532422340
13529	NC_022118	AGC	2	6	612540	612545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422340
13530	NC_022118	TTG	2	6	612602	612607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422340
13531	NC_022118	TCAA	2	8	612767	612774	50 %	25 %	0 %	25 %	532422341
13532	NC_022118	TTG	2	6	612780	612785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422341
13533	NC_022118	CGCT	2	8	612813	612820	0 %	25 %	25 %	50 %	532422341
13534	NC_022118	TTTG	2	8	612838	612845	0 %	75 %	25 %	0 %	532422341
13535	NC_022118	ATC	2	6	612893	612898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422341
13536	NC_022118	A	9	9	612938	612946	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13537	NC_022118	CTT	2	6	612980	612985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422341
13538	NC_022118	GAA	2	6	612995	613000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
13539	NC_022118	TTTG	2	8	613014	613021	0 %	75 %	25 %	0 %	532422341
13540	NC_022118	CTCTC	2	10	613022	613031	0 %	40 %	0 %	60 %	532422341
13541	NC_022118	ATAG	2	8	613067	613074	50 %	25 %	25 %	0 %	532422341
13542	NC_022118	GAA	2	6	613160	613165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
13543	NC_022118	AAG	2	6	613206	613211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
13544	NC_022118	AGA	2	6	613246	613251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
13545	NC_022118	GAA	2	6	613268	613273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
13546	NC_022118	AAAAC	2	10	613282	613291	80 %	0 %	0 %	20 %	532422341
13547	NC_022118	AAC	2	6	613311	613316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422341
13548	NC_022118	GCTC	2	8	613411	613418	0 %	25 %	25 %	50 %	532422341
13549	NC_022118	AG	3	6	613445	613450	50 %	0 %	50 %	0 %	532422341
13550	NC_022118	TAG	2	6	613510	613515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422341
13551	NC_022118	ATTTT	2	10	613519	613528	20 %	80 %	0 %	0 %	532422341
13552	NC_022118	GCA	2	6	613559	613564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422341
13553	NC_022118	CTATC	2	10	613639	613648	20 %	40 %	0 %	40 %	532422341
13554	NC_022118	A	8	8	613668	613675	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13555	NC_022118	AGA	2	6	613687	613692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
13556	NC_022118	CTT	2	6	613717	613722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422341
13557	NC_022118	AGA	2	6	613723	613728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
13558	NC_022118	AC	3	6	613758	613763	50 %	0 %	0 %	50 %	532422341
13559	NC_022118	TAT	3	9	613849	613857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422341
13560	NC_022118	ATT	2	6	613898	613903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422341
13561	NC_022118	TTC	2	6	614018	614023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422341
13562	NC_022118	TCA	2	6	614031	614036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422341
13563	NC_022118	CGATAT	3	18	614059	614076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532422341
13564	NC_022118	AG	3	6	614090	614095	50 %	0 %	50 %	0 %	532422341
13565	NC_022118	TTA	2	6	614100	614105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422341
13566	NC_022118	ATT	2	6	614147	614152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422341
13567	NC_022118	TGTA	2	8	614307	614314	25 %	50 %	25 %	0 %	532422341
13568	NC_022118	A	6	6	614351	614356	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13569	NC_022118	TGC	2	6	614389	614394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422341
13570	NC_022118	T	6	6	614521	614526	0 %	100 %	0 %	0 %	532422341
13571	NC_022118	CA	3	6	614560	614565	50 %	0 %	0 %	50 %	532422341
13572	NC_022118	A	7	7	614576	614582	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13573	NC_022118	TC	3	6	614634	614639	0 %	50 %	0 %	50 %	532422341
13574	NC_022118	TTC	2	6	614640	614645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422341
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13576	NC_022118	CAT	2	6	614784	614789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422341
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13579	NC_022118	TAA	2	6	615091	615096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422341
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13582	NC_022118	AAG	2	6	615228	615233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
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13586	NC_022118	A	7	7	615381	615387	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13587	NC_022118	A	6	6	615434	615439	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13588	NC_022118	TGG	2	6	615465	615470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422341
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13590	NC_022118	A	8	8	615555	615562	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13591	NC_022118	GCT	2	6	615566	615571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422341
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13593	NC_022118	TC	3	6	615633	615638	0 %	50 %	0 %	50 %	532422341
13594	NC_022118	GTT	2	6	615670	615675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422341
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13598	NC_022118	A	6	6	615860	615865	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13599	NC_022118	GAA	2	6	615953	615958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422341
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13601	NC_022118	CGA	2	6	616072	616077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422341
13602	NC_022118	A	6	6	616121	616126	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13603	NC_022118	A	7	7	616156	616162	100 %	0 %	0 %	0 %	532422341
13604	NC_022118	AG	3	6	616172	616177	50 %	0 %	50 %	0 %	532422341
13605	NC_022118	TC	3	6	616179	616184	0 %	50 %	0 %	50 %	532422341
13606	NC_022118	TAAA	2	8	616206	616213	75 %	25 %	0 %	0 %	532422341
13607	NC_022118	TTAT	2	8	616229	616236	25 %	75 %	0 %	0 %	532422341
13608	NC_022118	CT	4	8	616277	616284	0 %	50 %	0 %	50 %	532422341
13609	NC_022118	TC	3	6	616320	616325	0 %	50 %	0 %	50 %	532422341
13610	NC_022118	T	6	6	616336	616341	0 %	100 %	0 %	0 %	532422341
13611	NC_022118	GAT	2	6	616349	616354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422341
13612	NC_022118	TCTCT	2	10	616356	616365	0 %	60 %	0 %	40 %	532422341
13613	NC_022118	CTC	2	6	616442	616447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422341
13614	NC_022118	A	6	6	616541	616546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_022118	CT	3	6	616555	616560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_022118	AG	3	6	616597	616602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_022118	A	6	6	616610	616615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_022118	GGAA	2	8	616625	616632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_022118	A	7	7	616637	616643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13620	NC_022118	ACT	2	6	616723	616728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422342
13621	NC_022118	TA	3	6	616752	616757	50 %	50 %	0 %	0 %	532422342
13622	NC_022118	TGAAT	2	10	616897	616906	40 %	40 %	20 %	0 %	532422342
13623	NC_022118	GCT	2	6	616935	616940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422342
13624	NC_022118	TCT	3	9	616983	616991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422342
13625	NC_022118	TC	3	6	617054	617059	0 %	50 %	0 %	50 %	532422342
13626	NC_022118	TCC	2	6	617068	617073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422342
13627	NC_022118	TC	3	6	617181	617186	0 %	50 %	0 %	50 %	532422342
13628	NC_022118	TCT	2	6	617237	617242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422342
13629	NC_022118	TTC	2	6	617332	617337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422342
13630	NC_022118	T	6	6	617403	617408	0 %	100 %	0 %	0 %	532422342
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13632	NC_022118	TTC	2	6	617516	617521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422342
13633	NC_022118	TATT	2	8	617537	617544	25 %	75 %	0 %	0 %	532422342
13634	NC_022118	TAA	2	6	617546	617551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422342
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13636	NC_022118	T	7	7	617576	617582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13637	NC_022118	TCTTTT	2	12	617623	617634	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13638	NC_022118	T	6	6	617631	617636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13639	NC_022118	ATG	2	6	617637	617642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422343
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13643	NC_022118	TCT	2	6	617860	617865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422343
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13650	NC_022118	CT	3	6	618286	618291	0 %	50 %	0 %	50 %	532422343
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13657	NC_022118	CCT	2	6	618573	618578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422343
13658	NC_022118	CT	3	6	618611	618616	0 %	50 %	0 %	50 %	532422343
13659	NC_022118	CTT	2	6	618648	618653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422343
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13663	NC_022118	AGAAA	2	10	618745	618754	80 %	0 %	20 %	0 %	532422344
13664	NC_022118	CT	3	6	618820	618825	0 %	50 %	0 %	50 %	532422344
13665	NC_022118	CTC	2	6	618851	618856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422344
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13670	NC_022118	TCA	2	6	619120	619125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422344
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13672	NC_022118	ACA	2	6	619213	619218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422344
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13679	NC_022118	CAT	2	6	619514	619519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422345
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13683	NC_022118	TGT	2	6	619625	619630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422345
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13689	NC_022118	ACCA	2	8	619882	619889	50 %	0 %	0 %	50 %	532422346
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13692	NC_022118	AT	3	6	620015	620020	50 %	50 %	0 %	0 %	532422346
13693	NC_022118	TGT	2	6	620045	620050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422346
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13695	NC_022118	A	6	6	620083	620088	100 %	0 %	0 %	0 %	532422346
13696	NC_022118	T	6	6	620153	620158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13697	NC_022118	CAG	2	6	620196	620201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13698	NC_022118	T	6	6	620215	620220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13699	NC_022118	TTG	2	6	620222	620227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13700	NC_022118	T	6	6	620255	620260	0 %	100 %	0 %	0 %	532422347
13701	NC_022118	GAAA	2	8	620350	620357	75 %	0 %	25 %	0 %	532422347
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13729	NC_022118	T	6	6	621508	621513	0 %	100 %	0 %	0 %	532422347
13730	NC_022118	CT	3	6	621521	621526	0 %	50 %	0 %	50 %	532422347
13731	NC_022118	T	7	7	621549	621555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13732	NC_022118	T	6	6	621560	621565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13733	NC_022118	GTT	2	6	621579	621584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13734	NC_022118	T	6	6	621595	621600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13735	NC_022118	TTCT	2	8	621610	621617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13736	NC_022118	CTG	2	6	621718	621723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422348
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13744	NC_022118	ATA	2	6	621972	621977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422348
13745	NC_022118	A	6	6	621979	621984	100 %	0 %	0 %	0 %	532422348
13746	NC_022118	TAT	2	6	621997	622002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422348
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13748	NC_022118	AG	3	6	622151	622156	50 %	0 %	50 %	0 %	532422349
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13989	NC_022118	TCT	2	6	633450	633455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422356
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13993	NC_022118	A	6	6	633583	633588	100 %	0 %	0 %	0 %	532422718
13994	NC_022118	CCTG	2	8	633674	633681	0 %	25 %	25 %	50 %	532422718
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13997	NC_022118	A	6	6	633766	633771	100 %	0 %	0 %	0 %	532422357
13998	NC_022118	TC	3	6	633774	633779	0 %	50 %	0 %	50 %	532422357
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