MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022118	ACT	2	6	520333	520338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422249
11502	NC_022118	AAG	2	6	520372	520377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422249
11503	NC_022118	TCA	2	6	520403	520408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422249
11504	NC_022118	TC	4	8	520421	520428	0 %	50 %	0 %	50 %	532422249
11505	NC_022118	GAT	2	6	520500	520505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422249
11506	NC_022118	CAG	2	6	520548	520553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422249
11507	NC_022118	TAG	2	6	520571	520576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422249
11508	NC_022118	ATA	2	6	520720	520725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422249
11509	NC_022118	CAG	2	6	520794	520799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422249
11510	NC_022118	GTA	2	6	520833	520838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422249
11511	NC_022118	CAACA	2	10	520872	520881	60 %	0 %	0 %	40 %	532422249
11512	NC_022118	GA	3	6	520882	520887	50 %	0 %	50 %	0 %	532422249
11513	NC_022118	CTT	2	6	520931	520936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422249
11514	NC_022118	ACA	2	6	521089	521094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422249
11515	NC_022118	CTCC	2	8	521110	521117	0 %	25 %	0 %	75 %	532422249
11516	NC_022118	T	6	6	521131	521136	0 %	100 %	0 %	0 %	532422249
11517	NC_022118	CTT	2	6	521150	521155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422249
11518	NC_022118	TTG	2	6	521184	521189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422249
11519	NC_022118	CT	3	6	521346	521351	0 %	50 %	0 %	50 %	532422249
11520	NC_022118	AAG	2	6	521393	521398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422249
11521	NC_022118	GAG	2	6	521531	521536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422249
11522	NC_022118	CTT	2	6	521608	521613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422249
11523	NC_022118	AGA	2	6	521673	521678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422249
11524	NC_022118	CTG	2	6	521684	521689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422249
11525	NC_022118	TCA	2	6	521776	521781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422249
11526	NC_022118	TAA	2	6	521811	521816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422249
11527	NC_022118	CCT	2	6	521857	521862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422249
11528	NC_022118	TCT	2	6	522044	522049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422249
11529	NC_022118	TAC	2	6	522060	522065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422249
11530	NC_022118	TGT	2	6	522250	522255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422249
11531	NC_022118	AGC	2	6	522261	522266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422249
11532	NC_022118	TTC	2	6	522267	522272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422249
11533	NC_022118	GCC	2	6	522544	522549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422249
11534	NC_022118	AACT	2	8	522669	522676	50 %	25 %	0 %	25 %	532422249
11535	NC_022118	AGC	2	6	522687	522692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422249
11536	NC_022118	AAC	2	6	522715	522720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422249
11537	NC_022118	GA	3	6	522758	522763	50 %	0 %	50 %	0 %	532422249
11538	NC_022118	CAA	2	6	522776	522781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422249
11539	NC_022118	AAG	2	6	522842	522847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422249
11540	NC_022118	CTC	2	6	522858	522863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422249
11541	NC_022118	TTC	2	6	522871	522876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422249
11542	NC_022118	TGT	2	6	522886	522891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422249
11543	NC_022118	ATAA	2	8	523090	523097	75 %	25 %	0 %	0 %	532422249
11544	NC_022118	TTG	2	6	523100	523105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422249
11545	NC_022118	AAAG	2	8	523159	523166	75 %	0 %	25 %	0 %	532422249
11546	NC_022118	AAG	2	6	523181	523186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422249
11547	NC_022118	AAC	2	6	523209	523214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422249
11548	NC_022118	TC	3	6	523217	523222	0 %	50 %	0 %	50 %	532422249
11549	NC_022118	ACA	2	6	523243	523248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422249
11550	NC_022118	AATA	2	8	523302	523309	75 %	25 %	0 %	0 %	532422249
11551	NC_022118	TCT	2	6	523318	523323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422249
11552	NC_022118	TGC	2	6	523366	523371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422249
11553	NC_022118	GTAG	2	8	523531	523538	25 %	25 %	50 %	0 %	532422249
11554	NC_022118	CAAAGC	2	12	523548	523559	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532422249
11555	NC_022118	AAT	3	9	523569	523577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422249
11556	NC_022118	AGC	2	6	523666	523671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_022118	GAAG	2	8	523674	523681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_022118	AT	3	6	523700	523705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_022118	AAAG	2	8	523713	523720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_022118	T	6	6	523761	523766	0 %	100 %	0 %	0 %	532422708
11561	NC_022118	TTGGA	2	10	523784	523793	20 %	40 %	40 %	0 %	532422708
11562	NC_022118	T	6	6	523807	523812	0 %	100 %	0 %	0 %	532422708
11563	NC_022118	ACA	2	6	523815	523820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422708
11564	NC_022118	A	7	7	523918	523924	100 %	0 %	0 %	0 %	532422708
11565	NC_022118	T	6	6	523940	523945	0 %	100 %	0 %	0 %	532422708
11566	NC_022118	A	7	7	523991	523997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_022118	AGA	2	6	524044	524049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422250
11568	NC_022118	AAAG	2	8	524057	524064	75 %	0 %	25 %	0 %	532422250
11569	NC_022118	CAA	2	6	524113	524118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422250
11570	NC_022118	GAACT	2	10	524270	524279	40 %	20 %	20 %	20 %	532422250
11571	NC_022118	TTG	2	6	524301	524306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422250
11572	NC_022118	TCA	2	6	524374	524379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422250
11573	NC_022118	A	7	7	524384	524390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_022118	CTAA	2	8	524405	524412	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11575	NC_022118	AAT	2	6	524429	524434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_022118	ACTT	2	8	524439	524446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11577	NC_022118	GCT	2	6	524540	524545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_022118	CAAAA	2	10	524559	524568	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11579	NC_022118	AGA	2	6	524617	524622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_022118	ATA	2	6	524651	524656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_022118	CTA	2	6	524725	524730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_022118	TCCC	2	8	524888	524895	0 %	25 %	0 %	75 %	532422251
11583	NC_022118	CAT	3	9	524908	524916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422251
11584	NC_022118	TCG	2	6	524926	524931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422251
11585	NC_022118	TTG	2	6	525012	525017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422251
11586	NC_022118	ATT	2	6	525106	525111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422251
11587	NC_022118	GCA	2	6	525135	525140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422251
11588	NC_022118	CT	3	6	525143	525148	0 %	50 %	0 %	50 %	532422251
11589	NC_022118	ACA	2	6	525219	525224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422251
11590	NC_022118	CCT	2	6	525234	525239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422251
11591	NC_022118	ATTA	2	8	525281	525288	50 %	50 %	0 %	0 %	532422251
11592	NC_022118	A	7	7	525347	525353	100 %	0 %	0 %	0 %	532422251
11593	NC_022118	CAA	2	6	525563	525568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422251
11594	NC_022118	TAAA	2	8	525586	525593	75 %	25 %	0 %	0 %	532422251
11595	NC_022118	GTC	2	6	525652	525657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422252
11596	NC_022118	TTC	2	6	525665	525670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422252
11597	NC_022118	TTC	2	6	525686	525691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422252
11598	NC_022118	CTT	2	6	525733	525738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422252
11599	NC_022118	TCC	2	6	525739	525744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422252
11600	NC_022118	TTTC	2	8	525803	525810	0 %	75 %	0 %	25 %	532422252
11601	NC_022118	TTCT	2	8	525913	525920	0 %	75 %	0 %	25 %	532422252
11602	NC_022118	CTT	2	6	525921	525926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422252
11603	NC_022118	GTT	2	6	525996	526001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422252
11604	NC_022118	TCC	2	6	526037	526042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422252
11605	NC_022118	TGG	2	6	526090	526095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422252
11606	NC_022118	ACA	2	6	526114	526119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422252
11607	NC_022118	CTT	2	6	526143	526148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422252
11608	NC_022118	A	6	6	526165	526170	100 %	0 %	0 %	0 %	532422252
11609	NC_022118	AGT	2	6	526203	526208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422252
11610	NC_022118	ATCT	2	8	526233	526240	25 %	50 %	0 %	25 %	532422252
11611	NC_022118	CTT	2	6	526249	526254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422252
11612	NC_022118	CAG	2	6	526398	526403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422252
11613	NC_022118	GGA	2	6	526420	526425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422252
11614	NC_022118	CTT	2	6	526450	526455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422252
11615	NC_022118	TCC	2	6	526478	526483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422252
11616	NC_022118	GAT	2	6	526511	526516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422252
11617	NC_022118	CAGGAA	2	12	526537	526548	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532422252
11618	NC_022118	AAG	2	6	526654	526659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422253
11619	NC_022118	AGA	2	6	526667	526672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422253
11620	NC_022118	CCT	2	6	526686	526691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422253
11621	NC_022118	TTTC	2	8	526693	526700	0 %	75 %	0 %	25 %	532422253
11622	NC_022118	AAG	2	6	526771	526776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422253
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11744	NC_022118	ACA	2	6	532011	532016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422709
11745	NC_022118	CTTC	2	8	532074	532081	0 %	50 %	0 %	50 %	532422709
11746	NC_022118	AGT	2	6	532191	532196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422709
11747	NC_022118	AGA	2	6	532265	532270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422709
11748	NC_022118	TG	3	6	532297	532302	0 %	50 %	50 %	0 %	532422709
11749	NC_022118	AAT	2	6	532422	532427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422709
11750	NC_022118	GGA	2	6	532527	532532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422709
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11752	NC_022118	TAG	2	6	532589	532594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422709
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11754	NC_022118	ATC	2	6	532680	532685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422709
11755	NC_022118	AATGTC	2	12	532686	532697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532422709
11756	NC_022118	ACACC	2	10	532750	532759	40 %	0 %	0 %	60 %	532422709
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11763	NC_022118	GAT	2	6	532914	532919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422709
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11770	NC_022118	CGTA	2	8	533369	533376	25 %	25 %	25 %	25 %	532422709
11771	NC_022118	TGG	2	6	533408	533413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422709
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11812	NC_022118	A	6	6	534989	534994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11814	NC_022118	CT	3	6	535083	535088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11815	NC_022118	TCT	2	6	535134	535139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422258
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11844	NC_022118	TTTTC	2	10	536360	536369	0 %	80 %	0 %	20 %	532422259
11845	NC_022118	A	6	6	536372	536377	100 %	0 %	0 %	0 %	532422259
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11849	NC_022118	TGT	2	6	536491	536496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422259
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11851	NC_022118	TTTTC	2	10	536593	536602	0 %	80 %	0 %	20 %	532422259
11852	NC_022118	CTT	2	6	536722	536727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11853	NC_022118	TCT	2	6	536809	536814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11854	NC_022118	CT	3	6	536877	536882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11855	NC_022118	T	6	6	536905	536910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11856	NC_022118	GAAG	2	8	536950	536957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11857	NC_022118	ATC	2	6	536975	536980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11858	NC_022118	AAG	2	6	537125	537130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422260
11859	NC_022118	ACAA	2	8	537149	537156	75 %	0 %	0 %	25 %	532422260
11860	NC_022118	GAT	2	6	537173	537178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422260
11861	NC_022118	CAT	2	6	537250	537255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422260
11862	NC_022118	TAAA	2	8	537256	537263	75 %	25 %	0 %	0 %	532422260
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11989	NC_022118	TAC	2	6	542755	542760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422266
11990	NC_022118	TTA	2	6	542850	542855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422267
11991	NC_022118	GAT	2	6	542861	542866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422267
11992	NC_022118	CTT	2	6	542882	542887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422267
11993	NC_022118	TCT	2	6	542921	542926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422267
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11999	NC_022118	GAAAA	2	10	543354	543363	80 %	0 %	20 %	0 %	532422267
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