MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022118	ACA	2	6	475969	475974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10502	NC_022118	AGA	2	6	476027	476032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422213
10503	NC_022118	TAAT	2	8	476101	476108	50 %	50 %	0 %	0 %	532422213
10504	NC_022118	TGG	3	9	476126	476134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422213
10505	NC_022118	TC	3	6	476155	476160	0 %	50 %	0 %	50 %	532422213
10506	NC_022118	AGG	2	6	476243	476248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422213
10507	NC_022118	TGG	2	6	476252	476257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422213
10508	NC_022118	GT	3	6	476262	476267	0 %	50 %	50 %	0 %	532422213
10509	NC_022118	GCA	2	6	476322	476327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10510	NC_022118	TGG	3	9	476333	476341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422213
10511	NC_022118	CA	3	6	476346	476351	50 %	0 %	0 %	50 %	532422213
10512	NC_022118	CGG	2	6	476371	476376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532422213
10513	NC_022118	GCA	2	6	476394	476399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10514	NC_022118	TCT	2	6	476463	476468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10515	NC_022118	AGC	2	6	476492	476497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10516	NC_022118	TAA	2	6	476525	476530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
10517	NC_022118	A	6	6	476634	476639	100 %	0 %	0 %	0 %	532422213
10518	NC_022118	CTG	2	6	476708	476713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10519	NC_022118	TTG	2	6	476767	476772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422213
10520	NC_022118	AAG	2	6	476776	476781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422213
10521	NC_022118	AAC	2	6	476844	476849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10522	NC_022118	CTC	2	6	476858	476863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
10523	NC_022118	CAA	2	6	476878	476883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10524	NC_022118	CTG	2	6	476896	476901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10525	NC_022118	GCT	3	9	476904	476912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10526	NC_022118	AGC	2	6	476921	476926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10527	NC_022118	GCA	2	6	476928	476933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10528	NC_022118	CAT	2	6	476941	476946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422213
10529	NC_022118	GTA	2	6	476973	476978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422213
10530	NC_022118	GGA	2	6	476979	476984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422213
10531	NC_022118	CTAT	2	8	476986	476993	25 %	50 %	0 %	25 %	532422213
10532	NC_022118	TC	3	6	477010	477015	0 %	50 %	0 %	50 %	532422213
10533	NC_022118	TCCC	2	8	477065	477072	0 %	25 %	0 %	75 %	532422213
10534	NC_022118	ATC	2	6	477074	477079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422213
10535	NC_022118	AGG	2	6	477092	477097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422213
10536	NC_022118	CCT	2	6	477148	477153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
10537	NC_022118	ACA	2	6	477195	477200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10538	NC_022118	GAG	2	6	477214	477219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422213
10539	NC_022118	CTT	2	6	477298	477303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10540	NC_022118	GGA	2	6	477345	477350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422213
10541	NC_022118	TC	3	6	477385	477390	0 %	50 %	0 %	50 %	532422213
10542	NC_022118	A	6	6	477490	477495	100 %	0 %	0 %	0 %	532422213
10543	NC_022118	GAAA	2	8	477525	477532	75 %	0 %	25 %	0 %	532422213
10544	NC_022118	TAA	2	6	477539	477544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
10545	NC_022118	AAT	2	6	477585	477590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
10546	NC_022118	TCAA	2	8	477598	477605	50 %	25 %	0 %	25 %	532422213
10547	NC_022118	ATG	2	6	477619	477624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422213
10548	NC_022118	AAATAC	2	12	477734	477745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532422213
10549	NC_022118	CTT	2	6	477819	477824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10550	NC_022118	CTT	2	6	477826	477831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10551	NC_022118	CAA	2	6	477851	477856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10552	NC_022118	GTA	2	6	477901	477906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422213
10553	NC_022118	CT	4	8	477924	477931	0 %	50 %	0 %	50 %	532422213
10554	NC_022118	TG	3	6	477969	477974	0 %	50 %	50 %	0 %	532422213
10555	NC_022118	A	7	7	477987	477993	100 %	0 %	0 %	0 %	532422213
10556	NC_022118	TAA	2	6	478031	478036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
10557	NC_022118	AGA	2	6	478037	478042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422213
10558	NC_022118	TCT	2	6	478077	478082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10559	NC_022118	AGAA	2	8	478186	478193	75 %	0 %	25 %	0 %	532422213
10560	NC_022118	ATTA	2	8	478202	478209	50 %	50 %	0 %	0 %	532422213
10561	NC_022118	CTC	2	6	478300	478305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
10562	NC_022118	TCT	2	6	478318	478323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10563	NC_022118	CTC	2	6	478324	478329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
10564	NC_022118	GGA	2	6	478368	478373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422213
10565	NC_022118	CAG	2	6	478382	478387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10566	NC_022118	CAA	2	6	478396	478401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10567	NC_022118	GCA	2	6	478419	478424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10568	NC_022118	ACT	2	6	478446	478451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422213
10569	NC_022118	TCG	2	6	478715	478720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422213
10570	NC_022118	TTG	2	6	478789	478794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422213
10571	NC_022118	CAA	2	6	478811	478816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10572	NC_022118	AAT	2	6	478824	478829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
10573	NC_022118	GAT	2	6	478839	478844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422213
10574	NC_022118	CAA	2	6	478893	478898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10575	NC_022118	CTC	2	6	478903	478908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422213
10576	NC_022118	GAA	2	6	478914	478919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422213
10577	NC_022118	TAC	2	6	478926	478931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422213
10578	NC_022118	A	7	7	479028	479034	100 %	0 %	0 %	0 %	532422213
10579	NC_022118	TTCCT	2	10	479137	479146	0 %	60 %	0 %	40 %	532422213
10580	NC_022118	ACA	3	9	479187	479195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422213
10581	NC_022118	GAAA	2	8	479214	479221	75 %	0 %	25 %	0 %	532422213
10582	NC_022118	TTC	2	6	479297	479302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10583	NC_022118	GAT	2	6	479391	479396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422213
10584	NC_022118	TAA	2	6	479474	479479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422213
10585	NC_022118	TCTA	2	8	479502	479509	25 %	50 %	0 %	25 %	532422213
10586	NC_022118	CTGT	2	8	479521	479528	0 %	50 %	25 %	25 %	532422213
10587	NC_022118	CT	3	6	479641	479646	0 %	50 %	0 %	50 %	532422213
10588	NC_022118	ACTAT	2	10	479653	479662	40 %	40 %	0 %	20 %	532422213
10589	NC_022118	TCT	2	6	479716	479721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422213
10590	NC_022118	T	9	9	479833	479841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_022118	CAT	2	6	479864	479869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_022118	GTT	2	6	479875	479880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_022118	CTG	2	6	479919	479924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
10594	NC_022118	TGC	2	6	479929	479934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
10595	NC_022118	CTC	2	6	479941	479946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
10596	NC_022118	ATG	2	6	480041	480046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422214
10597	NC_022118	GCT	2	6	480071	480076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
10598	NC_022118	TAG	4	12	480133	480144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422214
10599	NC_022118	TCTTCA	2	12	480173	480184	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532422214
10600	NC_022118	TGA	2	6	480238	480243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422214
10601	NC_022118	AGA	3	9	480250	480258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
10602	NC_022118	AG	3	6	480287	480292	50 %	0 %	50 %	0 %	532422214
10603	NC_022118	ACTA	2	8	480295	480302	50 %	25 %	0 %	25 %	532422214
10604	NC_022118	CT	5	10	480319	480328	0 %	50 %	0 %	50 %	532422214
10605	NC_022118	TTC	2	6	480362	480367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422214
10606	NC_022118	GGA	2	6	480413	480418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
10607	NC_022118	GA	3	6	480429	480434	50 %	0 %	50 %	0 %	532422214
10608	NC_022118	CTA	2	6	480464	480469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
10609	NC_022118	TCC	2	6	480557	480562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422214
10610	NC_022118	TGG	2	6	480565	480570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
10611	NC_022118	GGT	3	9	480578	480586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
10612	NC_022118	CAA	2	6	480625	480630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422214
10613	NC_022118	TGC	2	6	480649	480654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422214
10614	NC_022118	CAG	2	6	480663	480668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422214
10615	NC_022118	GAA	2	6	480686	480691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
10616	NC_022118	AGA	2	6	480805	480810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422214
10617	NC_022118	CGA	2	6	480850	480855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422214
10618	NC_022118	GGT	3	9	480869	480877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
10619	NC_022118	GGA	3	9	481040	481048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
10620	NC_022118	ACT	2	6	481100	481105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422214
10621	NC_022118	GGT	3	9	481157	481165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532422214
10622	NC_022118	CTTT	2	8	481181	481188	0 %	75 %	0 %	25 %	532422214
10623	NC_022118	GGA	2	6	481238	481243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422214
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10629	NC_022118	ATCA	2	8	481493	481500	50 %	25 %	0 %	25 %	532422214
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10631	NC_022118	A	6	6	481538	481543	100 %	0 %	0 %	0 %	532422214
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10739	NC_022118	CTC	2	6	485825	485830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422215
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10743	NC_022118	ATT	2	6	486077	486082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422215
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10852	NC_022118	CACCT	2	10	491053	491062	20 %	20 %	0 %	60 %	532422220
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10855	NC_022118	A	9	9	491153	491161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10863	NC_022118	CTT	2	6	491581	491586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422222
10864	NC_022118	AAGT	2	8	491602	491609	50 %	25 %	25 %	0 %	532422222
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10866	NC_022118	GATC	2	8	491632	491639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10880	NC_022118	CTG	2	6	492250	492255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10987	NC_022118	TCTT	2	8	497522	497529	0 %	75 %	0 %	25 %	532422228
10988	NC_022118	TGC	2	6	497536	497541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422228
10989	NC_022118	ATG	2	6	497632	497637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422228
10990	NC_022118	TAT	2	6	497641	497646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422228
10991	NC_022118	AGC	2	6	497705	497710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422228
10992	NC_022118	TTC	2	6	497765	497770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422228
10993	NC_022118	ATTTC	2	10	497775	497784	20 %	60 %	0 %	20 %	532422228
10994	NC_022118	ATT	2	6	497815	497820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422228
10995	NC_022118	AGA	2	6	497834	497839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422228
10996	NC_022118	AGC	2	6	497852	497857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422228
10997	NC_022118	ATACT	2	10	497894	497903	40 %	40 %	0 %	20 %	532422228
10998	NC_022118	TAT	2	6	497961	497966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422228
10999	NC_022118	CCTA	2	8	498019	498026	25 %	25 %	0 %	50 %	532422228
11000	NC_022118	TC	3	6	498088	498093	0 %	50 %	0 %	50 %	532422705

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