MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_022118	T	6	6	365422	365427	0 %	100 %	0 %	0 %	532422128
8003	NC_022118	GGA	2	6	365467	365472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422128
8004	NC_022118	TCC	2	6	365563	365568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_022118	ACT	2	6	365579	365584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_022118	CGA	2	6	365594	365599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_022118	GC	3	6	365683	365688	0 %	0 %	50 %	50 %	532422695
8008	NC_022118	TGT	2	6	365695	365700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422695
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8010	NC_022118	TAT	2	6	365778	365783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422695
8011	NC_022118	ACG	2	6	365787	365792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422695
8012	NC_022118	TTG	2	6	365837	365842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422695
8013	NC_022118	GCA	2	6	365960	365965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422695
8014	NC_022118	TGT	2	6	365966	365971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422695
8015	NC_022118	TC	3	6	365987	365992	0 %	50 %	0 %	50 %	532422695
8016	NC_022118	ATC	2	6	365995	366000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422695
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8018	NC_022118	TA	3	6	366057	366062	50 %	50 %	0 %	0 %	532422695
8019	NC_022118	CAA	2	6	366093	366098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422695
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8021	NC_022118	TCCA	2	8	366167	366174	25 %	25 %	0 %	50 %	532422695
8022	NC_022118	A	7	7	366174	366180	100 %	0 %	0 %	0 %	532422695
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8039	NC_022118	A	6	6	366870	366875	100 %	0 %	0 %	0 %	532422696
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8057	NC_022118	GT	3	6	367501	367506	0 %	50 %	50 %	0 %	532422697
8058	NC_022118	TAT	2	6	367513	367518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422697
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8062	NC_022118	A	8	8	367647	367654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_022118	ATC	2	6	367692	367697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8096	NC_022118	GAATA	2	10	368987	368996	60 %	20 %	20 %	0 %	532422130
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8104	NC_022118	CCTT	2	8	369374	369381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8105	NC_022118	ATCT	2	8	369407	369414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8107	NC_022118	TCC	2	6	369645	369650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422131
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8109	NC_022118	CAA	2	6	369673	369678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422131
8110	NC_022118	TCTT	2	8	369698	369705	0 %	75 %	0 %	25 %	532422131
8111	NC_022118	GCT	2	6	369859	369864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422131
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8122	NC_022118	T	7	7	370468	370474	0 %	100 %	0 %	0 %	532422132
8123	NC_022118	TTC	2	6	370527	370532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422132
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8126	NC_022118	AAC	2	6	370638	370643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422132
8127	NC_022118	GCT	2	6	370649	370654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422132
8128	NC_022118	CTTC	2	8	370688	370695	0 %	50 %	0 %	50 %	532422132
8129	NC_022118	TTCT	2	8	370761	370768	0 %	75 %	0 %	25 %	532422132
8130	NC_022118	TCAA	2	8	370860	370867	50 %	25 %	0 %	25 %	532422132
8131	NC_022118	ATC	2	6	370892	370897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422132
8132	NC_022118	GAA	2	6	370940	370945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422132
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8134	NC_022118	CTG	2	6	370989	370994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422132
8135	NC_022118	CT	3	6	371016	371021	0 %	50 %	0 %	50 %	532422132
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8145	NC_022118	A	8	8	371410	371417	100 %	0 %	0 %	0 %	532422132
8146	NC_022118	CT	3	6	371419	371424	0 %	50 %	0 %	50 %	532422132
8147	NC_022118	CTT	2	6	371439	371444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422132
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8156	NC_022118	A	6	6	371671	371676	100 %	0 %	0 %	0 %	532422132
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8161	NC_022118	CAAC	2	8	371910	371917	50 %	0 %	0 %	50 %	532422133
8162	NC_022118	AAG	2	6	371992	371997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422133
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8169	NC_022118	ATT	2	6	372419	372424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422135
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8182	NC_022118	AAG	3	9	372974	372982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422135
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8184	NC_022118	CAGCCT	2	12	373121	373132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532422135
8185	NC_022118	TG	3	6	373144	373149	0 %	50 %	50 %	0 %	532422135
8186	NC_022118	AGCTGA	2	12	373171	373182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532422135
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8188	NC_022118	A	8	8	373237	373244	100 %	0 %	0 %	0 %	532422135
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8202	NC_022118	TCT	2	6	373897	373902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422135
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8236	NC_022118	CAA	2	6	375730	375735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422136
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8239	NC_022118	TCT	2	6	375822	375827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8240	NC_022118	A	6	6	375863	375868	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
8241	NC_022118	GA	3	6	375892	375897	50 %	0 %	50 %	0 %	532422137
8242	NC_022118	TCT	2	6	375933	375938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422137
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8245	NC_022118	ACA	2	6	376005	376010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422137
8246	NC_022118	A	6	6	376040	376045	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
8247	NC_022118	AAC	2	6	376093	376098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422137
8248	NC_022118	ACAT	2	8	376099	376106	50 %	25 %	0 %	25 %	532422137
8249	NC_022118	GTA	2	6	376117	376122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422137
8250	NC_022118	TACAC	2	10	376187	376196	40 %	20 %	0 %	40 %	532422137
8251	NC_022118	A	6	6	376219	376224	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
8252	NC_022118	GCTC	2	8	376271	376278	0 %	25 %	25 %	50 %	532422137
8253	NC_022118	TGA	2	6	376346	376351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422137
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8290	NC_022118	TCA	2	6	378383	378388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422137
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8346	NC_022118	A	8	8	380813	380820	100 %	0 %	0 %	0 %	532422137
8347	NC_022118	AC	3	6	380834	380839	50 %	0 %	0 %	50 %	532422137
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8351	NC_022118	CT	3	6	380987	380992	0 %	50 %	0 %	50 %	532422137
8352	NC_022118	CAA	3	9	381000	381008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422137
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8354	NC_022118	ACC	2	6	381073	381078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422137
8355	NC_022118	TC	3	6	381085	381090	0 %	50 %	0 %	50 %	532422137
8356	NC_022118	ATCT	2	8	381163	381170	25 %	50 %	0 %	25 %	532422137
8357	NC_022118	TAAA	2	8	381190	381197	75 %	25 %	0 %	0 %	532422137
8358	NC_022118	A	6	6	381261	381266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8359	NC_022118	CT	4	8	381271	381278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8360	NC_022118	TCA	2	6	381364	381369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8362	NC_022118	GCA	2	6	381508	381513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422138
8363	NC_022118	AAC	2	6	381552	381557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422138
8364	NC_022118	TC	3	6	381647	381652	0 %	50 %	0 %	50 %	532422138
8365	NC_022118	TAT	2	6	381771	381776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422138
8366	NC_022118	TGA	2	6	381777	381782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422138
8367	NC_022118	CTAA	2	8	381793	381800	50 %	25 %	0 %	25 %	532422138
8368	NC_022118	CTA	2	6	381817	381822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
8369	NC_022118	CCT	2	6	381838	381843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422138
8370	NC_022118	CAT	2	6	381948	381953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
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8372	NC_022118	GCT	2	6	382027	382032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422138
8373	NC_022118	GTA	2	6	382072	382077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422138
8374	NC_022118	ACAGC	2	10	382106	382115	40 %	0 %	20 %	40 %	532422138
8375	NC_022118	TAC	2	6	382170	382175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
8376	NC_022118	TTC	2	6	382244	382249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422138
8377	NC_022118	CTC	2	6	382326	382331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422138
8378	NC_022118	A	6	6	382400	382405	100 %	0 %	0 %	0 %	532422138
8379	NC_022118	ATT	2	6	382423	382428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422138
8380	NC_022118	TCT	2	6	382431	382436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422138
8381	NC_022118	TC	3	6	382460	382465	0 %	50 %	0 %	50 %	532422138
8382	NC_022118	CAC	2	6	382544	382549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422138
8383	NC_022118	AAATC	2	10	382550	382559	60 %	20 %	0 %	20 %	532422138
8384	NC_022118	ATC	3	9	382581	382589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
8385	NC_022118	CAAC	2	8	382591	382598	50 %	0 %	0 %	50 %	532422138
8386	NC_022118	TCA	2	6	382642	382647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422138
8387	NC_022118	AAGA	2	8	382654	382661	75 %	0 %	25 %	0 %	532422138
8388	NC_022118	ACC	2	6	382680	382685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422138
8389	NC_022118	C	6	6	382684	382689	0 %	0 %	0 %	100 %	532422138
8390	NC_022118	TC	3	6	382690	382695	0 %	50 %	0 %	50 %	532422138
8391	NC_022118	TGT	2	6	382749	382754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422138
8392	NC_022118	A	6	6	382814	382819	100 %	0 %	0 %	0 %	532422138
8393	NC_022118	CT	3	6	382861	382866	0 %	50 %	0 %	50 %	532422139
8394	NC_022118	AGT	2	6	382987	382992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422139
8395	NC_022118	GCA	2	6	383009	383014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422139
8396	NC_022118	AGC	2	6	383020	383025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422139
8397	NC_022118	AGC	2	6	383029	383034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422139
8398	NC_022118	T	6	6	383081	383086	0 %	100 %	0 %	0 %	532422139
8399	NC_022118	TGA	2	6	383106	383111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
8400	NC_022118	TAA	2	6	383180	383185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422140
8401	NC_022118	AGA	2	6	383259	383264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422140
8402	NC_022118	TC	3	6	383281	383286	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
8403	NC_022118	TTC	2	6	383307	383312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
8404	NC_022118	ACA	2	6	383328	383333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422140
8405	NC_022118	TGA	2	6	383334	383339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
8406	NC_022118	TAA	2	6	383347	383352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422140
8407	NC_022118	CT	3	6	383396	383401	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
8408	NC_022118	CT	3	6	383457	383462	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
8409	NC_022118	ATC	2	6	383478	383483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422140
8410	NC_022118	TCT	2	6	383556	383561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
8411	NC_022118	GTC	2	6	383626	383631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422140
8412	NC_022118	CAATAG	2	12	383644	383655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532422140
8413	NC_022118	TAA	2	6	383690	383695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422140
8414	NC_022118	CAAA	2	8	383755	383762	75 %	0 %	0 %	25 %	532422140
8415	NC_022118	ACTGAA	2	12	383785	383796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532422140
8416	NC_022118	TTC	2	6	383822	383827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
8417	NC_022118	TTC	2	6	383921	383926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
8418	NC_022118	TACT	2	8	383929	383936	25 %	50 %	0 %	25 %	532422140
8419	NC_022118	GA	5	10	383946	383955	50 %	0 %	50 %	0 %	532422140
8420	NC_022118	CTGCAC	2	12	383978	383989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532422140
8421	NC_022118	GCTT	2	8	384012	384019	0 %	50 %	25 %	25 %	532422140
8422	NC_022118	ATA	2	6	384023	384028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422140
8423	NC_022118	TC	3	6	384064	384069	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
8424	NC_022118	GTA	2	6	384132	384137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
8425	NC_022118	ACA	2	6	384323	384328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422140
8426	NC_022118	GTC	2	6	384393	384398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422140
8427	NC_022118	TC	3	6	384427	384432	0 %	50 %	0 %	50 %	532422140
8428	NC_022118	AGA	2	6	384440	384445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422140
8429	NC_022118	A	6	6	384445	384450	100 %	0 %	0 %	0 %	532422140
8430	NC_022118	ACC	2	6	384489	384494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422140
8431	NC_022118	CTT	2	6	384580	384585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
8432	NC_022118	AGC	2	6	384593	384598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422140
8433	NC_022118	GTA	2	6	384629	384634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422140
8434	NC_022118	CTT	3	9	384655	384663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422140
8435	NC_022118	AGA	2	6	384692	384697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422140
8436	NC_022118	CAA	2	6	384704	384709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422140
8437	NC_022118	TTA	2	6	384780	384785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422140
8438	NC_022118	AGC	2	6	384862	384867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422141
8439	NC_022118	AAG	2	6	384903	384908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422141
8440	NC_022118	TTC	2	6	384982	384987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422141
8441	NC_022118	AGA	2	6	385036	385041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422141
8442	NC_022118	CTG	2	6	385059	385064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422141
8443	NC_022118	GAA	2	6	385107	385112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422141
8444	NC_022118	C	6	6	385123	385128	0 %	0 %	0 %	100 %	532422141
8445	NC_022118	TTC	2	6	385139	385144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422141
8446	NC_022118	ATG	2	6	385165	385170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422141
8447	NC_022118	ATA	2	6	385199	385204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422141
8448	NC_022118	CTT	2	6	385216	385221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8449	NC_022118	AGA	2	6	385235	385240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8450	NC_022118	T	8	8	385250	385257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8451	NC_022118	CCAG	2	8	385301	385308	25 %	0 %	25 %	50 %	532422142
8452	NC_022118	GAT	2	6	385434	385439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422142
8453	NC_022118	AAC	2	6	385442	385447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422142
8454	NC_022118	TAA	2	6	385533	385538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422142
8455	NC_022118	TCT	2	6	385540	385545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422142
8456	NC_022118	AAG	2	6	385548	385553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422142
8457	NC_022118	A	8	8	385628	385635	100 %	0 %	0 %	0 %	532422142
8458	NC_022118	AAC	2	6	385668	385673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422142
8459	NC_022118	AGG	2	6	385689	385694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422142
8460	NC_022118	CAT	2	6	385739	385744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422142
8461	NC_022118	A	7	7	385799	385805	100 %	0 %	0 %	0 %	532422142
8462	NC_022118	CTT	2	6	385945	385950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422698
8463	NC_022118	GA	3	6	385979	385984	50 %	0 %	50 %	0 %	532422698
8464	NC_022118	GTT	2	6	385999	386004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422698
8465	NC_022118	ACA	2	6	386115	386120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422143
8466	NC_022118	GGCA	2	8	386151	386158	25 %	0 %	50 %	25 %	532422143
8467	NC_022118	TGCT	2	8	386159	386166	0 %	50 %	25 %	25 %	532422143
8468	NC_022118	CTG	2	6	386181	386186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422143
8469	NC_022118	CTA	2	6	386275	386280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422143
8470	NC_022118	TC	3	6	386282	386287	0 %	50 %	0 %	50 %	532422143
8471	NC_022118	TTAA	2	8	386371	386378	50 %	50 %	0 %	0 %	532422143
8472	NC_022118	A	9	9	386377	386385	100 %	0 %	0 %	0 %	532422143
8473	NC_022118	CTCA	2	8	386386	386393	25 %	25 %	0 %	50 %	532422143
8474	NC_022118	CAT	2	6	386463	386468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422143
8475	NC_022118	CTA	2	6	386471	386476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422143
8476	NC_022118	TCA	2	6	386551	386556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422143
8477	NC_022118	TTC	2	6	386601	386606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422143
8478	NC_022118	TTCT	2	8	386644	386651	0 %	75 %	0 %	25 %	532422143
8479	NC_022118	TCA	2	6	386652	386657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422143
8480	NC_022118	CT	3	6	386728	386733	0 %	50 %	0 %	50 %	532422143
8481	NC_022118	T	6	6	386777	386782	0 %	100 %	0 %	0 %	532422143
8482	NC_022118	CTT	3	9	386820	386828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422143
8483	NC_022118	TTA	2	6	386830	386835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422143
8484	NC_022118	CT	4	8	386881	386888	0 %	50 %	0 %	50 %	532422143
8485	NC_022118	TATTC	2	10	386943	386952	20 %	60 %	0 %	20 %	532422143
8486	NC_022118	T	6	6	387014	387019	0 %	100 %	0 %	0 %	532422143
8487	NC_022118	GCTC	2	8	387020	387027	0 %	25 %	25 %	50 %	532422143
8488	NC_022118	ATC	2	6	387039	387044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422143
8489	NC_022118	T	6	6	387063	387068	0 %	100 %	0 %	0 %	532422143
8490	NC_022118	ATTTT	2	10	387082	387091	20 %	80 %	0 %	0 %	532422143
8491	NC_022118	ATT	2	6	387135	387140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422143
8492	NC_022118	TC	3	6	387194	387199	0 %	50 %	0 %	50 %	532422143
8493	NC_022118	TGC	2	6	387201	387206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422143
8494	NC_022118	CT	3	6	387352	387357	0 %	50 %	0 %	50 %	532422143
8495	NC_022118	TAT	2	6	387465	387470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422143
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8497	NC_022118	A	9	9	387556	387564	100 %	0 %	0 %	0 %	532422143
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