MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_022118	TA	3	6	341561	341566	50 %	50 %	0 %	0 %	532422108
7503	NC_022118	CTA	2	6	341578	341583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422108
7504	NC_022118	AGA	2	6	341596	341601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422108
7505	NC_022118	TCT	2	6	341618	341623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422108
7506	NC_022118	ATA	2	6	341682	341687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422108
7507	NC_022118	TTC	2	6	341695	341700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422108
7508	NC_022118	A	6	6	341763	341768	100 %	0 %	0 %	0 %	532422108
7509	NC_022118	TGT	2	6	341772	341777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422108
7510	NC_022118	CTC	2	6	341780	341785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422108
7511	NC_022118	AC	4	8	341790	341797	50 %	0 %	0 %	50 %	532422108
7512	NC_022118	ATG	2	6	341888	341893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422108
7513	NC_022118	A	7	7	341899	341905	100 %	0 %	0 %	0 %	532422108
7514	NC_022118	TAA	2	6	341927	341932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422108
7515	NC_022118	A	7	7	341941	341947	100 %	0 %	0 %	0 %	532422108
7516	NC_022118	CTTCA	2	10	342129	342138	20 %	40 %	0 %	40 %	532422108
7517	NC_022118	ATC	2	6	342183	342188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422108
7518	NC_022118	TCT	2	6	342196	342201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422108
7519	NC_022118	CATTG	2	10	342233	342242	20 %	40 %	20 %	20 %	532422108
7520	NC_022118	CTT	2	6	342300	342305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422108
7521	NC_022118	TCC	2	6	342334	342339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422108
7522	NC_022118	TCT	2	6	342463	342468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422108
7523	NC_022118	A	7	7	342506	342512	100 %	0 %	0 %	0 %	532422108
7524	NC_022118	TTC	2	6	342552	342557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422108
7525	NC_022118	CTG	2	6	342710	342715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422108
7526	NC_022118	TTAG	2	8	342727	342734	25 %	50 %	25 %	0 %	532422108
7527	NC_022118	TC	3	6	342824	342829	0 %	50 %	0 %	50 %	532422108
7528	NC_022118	CTT	2	6	342852	342857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422108
7529	NC_022118	AATA	2	8	342864	342871	75 %	25 %	0 %	0 %	532422108
7530	NC_022118	ACT	2	6	342901	342906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422108
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7533	NC_022118	T	6	6	343022	343027	0 %	100 %	0 %	0 %	532422109
7534	NC_022118	TTC	3	9	343064	343072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422109
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7538	NC_022118	TAA	2	6	343172	343177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422109
7539	NC_022118	AAGT	2	8	343192	343199	50 %	25 %	25 %	0 %	532422109
7540	NC_022118	CGT	2	6	343327	343332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422109
7541	NC_022118	CTTT	2	8	343417	343424	0 %	75 %	0 %	25 %	532422109
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7546	NC_022118	AG	3	6	343696	343701	50 %	0 %	50 %	0 %	532422110
7547	NC_022118	TCT	2	6	343794	343799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422110
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7552	NC_022118	ATGA	2	8	344209	344216	50 %	25 %	25 %	0 %	532422110
7553	NC_022118	GAA	2	6	344263	344268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422110
7554	NC_022118	CAA	2	6	344277	344282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422110
7555	NC_022118	ATCCC	2	10	344289	344298	20 %	20 %	0 %	60 %	532422110
7556	NC_022118	C	6	6	344296	344301	0 %	0 %	0 %	100 %	532422110
7557	NC_022118	AAT	2	6	344302	344307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422110
7558	NC_022118	AGC	2	6	344329	344334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422110
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7562	NC_022118	GTTC	2	8	344434	344441	0 %	50 %	25 %	25 %	532422110
7563	NC_022118	ACC	2	6	344644	344649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422110
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7572	NC_022118	TCT	2	6	345300	345305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422111
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7575	NC_022118	TCT	2	6	345526	345531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422111
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7582	NC_022118	CAG	2	6	345815	345820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422111
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7587	NC_022118	CAA	2	6	346049	346054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422111
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7603	NC_022118	CAA	2	6	347150	347155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422112
7604	NC_022118	AAAAG	2	10	347186	347195	80 %	0 %	20 %	0 %	532422112
7605	NC_022118	A	6	6	347217	347222	100 %	0 %	0 %	0 %	532422112
7606	NC_022118	A	7	7	347240	347246	100 %	0 %	0 %	0 %	532422112
7607	NC_022118	CGC	2	6	347247	347252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422112
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7609	NC_022118	AG	3	6	347326	347331	50 %	0 %	50 %	0 %	532422112
7610	NC_022118	GAG	3	9	347329	347337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422112
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7612	NC_022118	GAG	2	6	347350	347355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532422112
7613	NC_022118	AGGA	2	8	347358	347365	50 %	0 %	50 %	0 %	532422112
7614	NC_022118	A	6	6	347370	347375	100 %	0 %	0 %	0 %	532422112
7615	NC_022118	CT	3	6	347419	347424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7616	NC_022118	TTC	2	6	347445	347450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_022118	A	8	8	347467	347474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_022118	TA	3	6	347778	347783	50 %	50 %	0 %	0 %	532422113
7619	NC_022118	CT	3	6	347898	347903	0 %	50 %	0 %	50 %	532422113
7620	NC_022118	CTGC	2	8	347921	347928	0 %	25 %	25 %	50 %	532422113
7621	NC_022118	CCTG	2	8	347953	347960	0 %	25 %	25 %	50 %	532422113
7622	NC_022118	GCC	2	6	347968	347973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422113
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7624	NC_022118	AAT	2	6	348018	348023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422113
7625	NC_022118	CCT	2	6	348044	348049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422113
7626	NC_022118	CAA	2	6	348050	348055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422113
7627	NC_022118	TGCT	2	8	348063	348070	0 %	50 %	25 %	25 %	532422113
7628	NC_022118	CT	3	6	348069	348074	0 %	50 %	0 %	50 %	532422113
7629	NC_022118	AAC	2	6	348199	348204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7630	NC_022118	A	7	7	348214	348220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7631	NC_022118	AAC	2	6	348261	348266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7632	NC_022118	CT	3	6	348311	348316	0 %	50 %	0 %	50 %	532422114
7633	NC_022118	GCT	2	6	348378	348383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422114
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7635	NC_022118	CTC	2	6	348430	348435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422114
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7637	NC_022118	A	8	8	348468	348475	100 %	0 %	0 %	0 %	532422114
7638	NC_022118	GAT	2	6	348552	348557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422114
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7641	NC_022118	ATC	2	6	348645	348650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422114
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7645	NC_022118	TCT	2	6	348720	348725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422114
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7654	NC_022118	AGC	2	6	349118	349123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422115
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7657	NC_022118	CA	3	6	349239	349244	50 %	0 %	0 %	50 %	532422115
7658	NC_022118	CAA	2	6	349334	349339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422115
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7662	NC_022118	AGCT	2	8	349515	349522	25 %	25 %	25 %	25 %	532422116
7663	NC_022118	TTCA	2	8	349542	349549	25 %	50 %	0 %	25 %	532422116
7664	NC_022118	CT	3	6	349567	349572	0 %	50 %	0 %	50 %	532422116
7665	NC_022118	T	6	6	349599	349604	0 %	100 %	0 %	0 %	532422116
7666	NC_022118	CTT	2	6	349607	349612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422116
7667	NC_022118	CTTT	2	8	349623	349630	0 %	75 %	0 %	25 %	532422116
7668	NC_022118	TCTT	2	8	349645	349652	0 %	75 %	0 %	25 %	532422116
7669	NC_022118	TTC	2	6	349656	349661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422116
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7672	NC_022118	AGCA	2	8	349704	349711	50 %	0 %	25 %	25 %	532422116
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7682	NC_022118	TCGC	2	8	350072	350079	0 %	25 %	25 %	50 %	532422116
7683	NC_022118	AAAG	2	8	350101	350108	75 %	0 %	25 %	0 %	532422116
7684	NC_022118	CAT	2	6	350210	350215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422116
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7688	NC_022118	A	8	8	350448	350455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7689	NC_022118	CT	3	6	350490	350495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7690	NC_022118	TGC	2	6	350587	350592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422117
7691	NC_022118	GTCT	2	8	350676	350683	0 %	50 %	25 %	25 %	532422117
7692	NC_022118	TAC	2	6	350684	350689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422117
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7699	NC_022118	CT	3	6	351018	351023	0 %	50 %	0 %	50 %	532422117
7700	NC_022118	AAC	2	6	351054	351059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422117
7701	NC_022118	CTG	2	6	351075	351080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422117
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7730	NC_022118	TAA	2	6	352661	352666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422117
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7732	NC_022118	T	6	6	352727	352732	0 %	100 %	0 %	0 %	532422117
7733	NC_022118	GTT	2	6	352956	352961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422117
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7735	NC_022118	CGA	2	6	353031	353036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422117
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7740	NC_022118	CAT	2	6	353246	353251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422117
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7742	NC_022118	CCTTC	2	10	353365	353374	0 %	40 %	0 %	60 %	532422117
7743	NC_022118	ATT	2	6	353454	353459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422117
7744	NC_022118	ATC	2	6	353499	353504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422117
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7746	NC_022118	ATA	2	6	353556	353561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422117
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7981	NC_022118	AGTAG	2	10	364161	364170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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7995	NC_022118	AT	3	6	364875	364880	50 %	50 %	0 %	0 %	532422127
7996	NC_022118	GAA	2	6	364958	364963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422127
7997	NC_022118	AGT	2	6	364996	365001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422127
7998	NC_022118	GCTCA	2	10	365027	365036	20 %	20 %	20 %	40 %	532422127
7999	NC_022118	CTCTT	2	10	365147	365156	0 %	60 %	0 %	40 %	532422128
8000	NC_022118	ACAA	2	8	365186	365193	75 %	0 %	0 %	25 %	532422128

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