MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 22962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022118	CAC	2	6	251890	251895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422028
5502	NC_022118	CAG	2	6	251896	251901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422028
5503	NC_022118	T	8	8	251965	251972	0 %	100 %	0 %	0 %	532422028
5504	NC_022118	TCC	2	6	252056	252061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422028
5505	NC_022118	GAAA	2	8	252077	252084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_022118	T	7	7	252098	252104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_022118	GCAG	2	8	252126	252133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_022118	AGAA	2	8	252159	252166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_022118	AG	3	6	252201	252206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_022118	TAT	2	6	252224	252229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_022118	ACA	2	6	252265	252270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_022118	A	6	6	252314	252319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_022118	TTG	2	6	252494	252499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422029
5514	NC_022118	TCT	2	6	252516	252521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422029
5515	NC_022118	TC	3	6	252563	252568	0 %	50 %	0 %	50 %	532422029
5516	NC_022118	T	7	7	252599	252605	0 %	100 %	0 %	0 %	532422029
5517	NC_022118	CCA	2	6	252612	252617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422029
5518	NC_022118	AAC	2	6	252665	252670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422029
5519	NC_022118	AATA	2	8	252719	252726	75 %	25 %	0 %	0 %	532422029
5520	NC_022118	GCT	2	6	252729	252734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422029
5521	NC_022118	ACA	2	6	252794	252799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422029
5522	NC_022118	CCA	2	6	252826	252831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422029
5523	NC_022118	CAA	2	6	252874	252879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422029
5524	NC_022118	CCCA	2	8	252982	252989	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5525	NC_022118	CTT	2	6	253111	253116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422030
5526	NC_022118	AAT	2	6	253190	253195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422030
5527	NC_022118	CTC	2	6	253201	253206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422030
5528	NC_022118	ACT	2	6	253209	253214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422030
5529	NC_022118	GAA	2	6	253227	253232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422030
5530	NC_022118	CTC	2	6	253258	253263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422030
5531	NC_022118	GCAA	2	8	253272	253279	50 %	0 %	25 %	25 %	532422030
5532	NC_022118	AAC	2	6	253289	253294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422030
5533	NC_022118	GTT	2	6	253334	253339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422030
5534	NC_022118	AAC	2	6	253373	253378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_022118	A	6	6	253387	253392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_022118	TAA	2	6	253438	253443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_022118	TTC	2	6	253456	253461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422031
5538	NC_022118	GCT	2	6	253488	253493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422031
5539	NC_022118	T	7	7	253497	253503	0 %	100 %	0 %	0 %	532422031
5540	NC_022118	AGCA	2	8	253534	253541	50 %	0 %	25 %	25 %	532422031
5541	NC_022118	CTT	2	6	253551	253556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422031
5542	NC_022118	TCT	3	9	253562	253570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422031
5543	NC_022118	GATAA	2	10	253590	253599	60 %	20 %	20 %	0 %	532422031
5544	NC_022118	TCG	2	6	253656	253661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422031
5545	NC_022118	CATA	2	8	253677	253684	50 %	25 %	0 %	25 %	532422031
5546	NC_022118	TCC	2	6	253696	253701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422031
5547	NC_022118	TAA	2	6	253729	253734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422031
5548	NC_022118	AG	3	6	253754	253759	50 %	0 %	50 %	0 %	532422031
5549	NC_022118	A	6	6	253773	253778	100 %	0 %	0 %	0 %	532422031
5550	NC_022118	AGA	2	6	253784	253789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422031
5551	NC_022118	CAC	2	6	253791	253796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422031
5552	NC_022118	CAA	2	6	253837	253842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422031
5553	NC_022118	GTA	2	6	253859	253864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422031
5554	NC_022118	ACA	2	6	253918	253923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422031
5555	NC_022118	A	8	8	253958	253965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_022118	TA	3	6	254007	254012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_022118	CCAA	2	8	254042	254049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_022118	A	7	7	254066	254072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_022118	TAT	2	6	254085	254090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_022118	TTCA	2	8	254117	254124	25 %	50 %	0 %	25 %	532422032
5561	NC_022118	AGA	2	6	254153	254158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422032
5562	NC_022118	TGTT	2	8	254191	254198	0 %	75 %	25 %	0 %	532422032
5563	NC_022118	CGA	2	6	254312	254317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422032
5564	NC_022118	GCAAA	2	10	254324	254333	60 %	0 %	20 %	20 %	532422032
5565	NC_022118	AATA	2	8	254410	254417	75 %	25 %	0 %	0 %	532422032
5566	NC_022118	A	6	6	254476	254481	100 %	0 %	0 %	0 %	532422032
5567	NC_022118	A	7	7	254507	254513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_022118	ATA	2	6	254520	254525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_022118	AACCCT	2	12	254566	254577	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_022118	AAAC	2	8	254649	254656	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_022118	AAG	2	6	254773	254778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_022118	AGC	2	6	254807	254812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422033
5573	NC_022118	CAAT	2	8	254913	254920	50 %	25 %	0 %	25 %	532422033
5574	NC_022118	TTA	2	6	254985	254990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422033
5575	NC_022118	CTTCT	2	10	255017	255026	0 %	60 %	0 %	40 %	532422033
5576	NC_022118	T	6	6	255060	255065	0 %	100 %	0 %	0 %	532422033
5577	NC_022118	CA	3	6	255119	255124	50 %	0 %	0 %	50 %	532422033
5578	NC_022118	AAT	2	6	255134	255139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532422033
5579	NC_022118	GCA	2	6	255144	255149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422033
5580	NC_022118	ACA	2	6	255210	255215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422033
5581	NC_022118	TTG	2	6	255274	255279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422033
5582	NC_022118	AGA	2	6	255329	255334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422033
5583	NC_022118	TAG	2	6	255349	255354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422033
5584	NC_022118	ATTTTT	2	12	255370	255381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	532422033
5585	NC_022118	GAG	2	6	255498	255503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_022118	ATT	2	6	255510	255515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_022118	T	6	6	255514	255519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_022118	ACG	2	6	255520	255525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_022118	CCTGCA	2	12	255531	255542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532422034
5590	NC_022118	CTG	2	6	255588	255593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422034
5591	NC_022118	TTG	2	6	255619	255624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532422034
5592	NC_022118	TCTG	2	8	255644	255651	0 %	50 %	25 %	25 %	532422034
5593	NC_022118	TCC	2	6	255674	255679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532422034
5594	NC_022118	TTC	2	6	255730	255735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422034
5595	NC_022118	CGA	2	6	255764	255769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422034
5596	NC_022118	TTC	2	6	255811	255816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422034
5597	NC_022118	ACG	2	6	255871	255876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422034
5598	NC_022118	AACC	2	8	255915	255922	50 %	0 %	0 %	50 %	532422034
5599	NC_022118	AAG	2	6	255948	255953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422034
5600	NC_022118	CTG	2	6	255972	255977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422034
5601	NC_022118	GCT	2	6	256100	256105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422034
5602	NC_022118	ATTT	2	8	256157	256164	25 %	75 %	0 %	0 %	532422034
5603	NC_022118	TAT	2	6	256202	256207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_022118	ATA	2	6	256211	256216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_022118	AAT	2	6	256235	256240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_022118	A	8	8	256315	256322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_022118	TC	3	6	256323	256328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_022118	TC	3	6	256409	256414	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035
5609	NC_022118	A	6	6	256418	256423	100 %	0 %	0 %	0 %	532422035
5610	NC_022118	ATG	2	6	256429	256434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532422035
5611	NC_022118	ATCT	2	8	256478	256485	25 %	50 %	0 %	25 %	532422035
5612	NC_022118	T	7	7	256520	256526	0 %	100 %	0 %	0 %	532422035
5613	NC_022118	GCT	2	6	256530	256535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422035
5614	NC_022118	CTT	2	6	256540	256545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5615	NC_022118	T	6	6	256561	256566	0 %	100 %	0 %	0 %	532422035
5616	NC_022118	CT	4	8	256629	256636	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035
5617	NC_022118	TTA	2	6	256694	256699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422035
5618	NC_022118	GCC	2	6	256828	256833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532422035
5619	NC_022118	TTCG	2	8	256891	256898	0 %	50 %	25 %	25 %	532422035
5620	NC_022118	CTT	2	6	256927	256932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5621	NC_022118	CTA	2	6	256963	256968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422035
5622	NC_022118	TC	3	6	256982	256987	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035
5623	NC_022118	TTC	2	6	257090	257095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5624	NC_022118	CTT	2	6	257098	257103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5625	NC_022118	TC	3	6	257120	257125	0 %	50 %	0 %	50 %	532422035
5626	NC_022118	TCT	2	6	257182	257187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
5627	NC_022118	CAA	2	6	257243	257248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532422035
5628	NC_022118	GTTTT	2	10	257255	257264	0 %	80 %	20 %	0 %	532422035
5629	NC_022118	TTA	2	6	257279	257284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422035
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5631	NC_022118	CAC	2	6	257313	257318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532422035
5632	NC_022118	GCT	2	6	257398	257403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422035
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5635	NC_022118	TTC	2	6	257495	257500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532422035
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5642	NC_022118	TTG	2	6	257761	257766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5643	NC_022118	ACT	2	6	257792	257797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5645	NC_022118	A	8	8	257821	257828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5646	NC_022118	TCA	2	6	257839	257844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532422036
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5732	NC_022118	TC	4	8	261690	261697	0 %	50 %	0 %	50 %	532422039
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5734	NC_022118	A	6	6	261795	261800	100 %	0 %	0 %	0 %	532422039
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5737	NC_022118	A	6	6	261933	261938	100 %	0 %	0 %	0 %	532422039
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5747	NC_022118	GTTC	2	8	262467	262474	0 %	50 %	25 %	25 %	532422039
5748	NC_022118	CT	3	6	262530	262535	0 %	50 %	0 %	50 %	532422039
5749	NC_022118	GCA	2	6	262609	262614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532422039
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5751	NC_022118	GCT	2	6	262681	262686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422039
5752	NC_022118	TCG	2	6	262820	262825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532422039
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5782	NC_022118	A	6	6	264259	264264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5857	NC_022118	A	7	7	268097	268103	100 %	0 %	0 %	0 %	532422046
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5867	NC_022118	TCATAA	2	12	268570	268581	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	532422046
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6000	NC_022118	TAT	2	6	274310	274315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422050

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