MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022109	CG	3	6	158551	158556	0 %	0 %	50 %	50 %	532352418
3502	NC_022109	AGA	2	6	158577	158582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352418
3503	NC_022109	CAT	2	6	158586	158591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352418
3504	NC_022109	TTC	2	6	158681	158686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352418
3505	NC_022109	AGA	3	9	158691	158699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352418
3506	NC_022109	T	6	6	158750	158755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_022109	T	7	7	158874	158880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_022109	ATT	2	6	158993	158998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_022109	T	7	7	159023	159029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_022109	A	7	7	159057	159063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_022109	TAAT	2	8	159081	159088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_022109	ATT	2	6	159148	159153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352419
3513	NC_022109	CAT	2	6	159300	159305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352419
3514	NC_022109	TCAA	2	8	159361	159368	50 %	25 %	0 %	25 %	532352419
3515	NC_022109	TGA	2	6	159558	159563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352419
3516	NC_022109	GAA	2	6	159586	159591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352419
3517	NC_022109	TC	3	6	159621	159626	0 %	50 %	0 %	50 %	532352419
3518	NC_022109	GT	3	6	159659	159664	0 %	50 %	50 %	0 %	532352419
3519	NC_022109	AAT	2	6	159703	159708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352419
3520	NC_022109	GGA	2	6	159715	159720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352419
3521	NC_022109	AGGAA	2	10	159744	159753	60 %	0 %	40 %	0 %	532352419
3522	NC_022109	TAG	2	6	159774	159779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352419
3523	NC_022109	AGG	2	6	159780	159785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352419
3524	NC_022109	CTG	2	6	159800	159805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352419
3525	NC_022109	AG	3	6	159831	159836	50 %	0 %	50 %	0 %	532352419
3526	NC_022109	TCT	2	6	159859	159864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352419
3527	NC_022109	AGG	2	6	159978	159983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352419
3528	NC_022109	GAA	2	6	159991	159996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352419
3529	NC_022109	AGA	2	6	160039	160044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352420
3530	NC_022109	ATAC	2	8	160163	160170	50 %	25 %	0 %	25 %	532352420
3531	NC_022109	AGG	2	6	160189	160194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352420
3532	NC_022109	AGG	2	6	160204	160209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352420
3533	NC_022109	CT	3	6	160302	160307	0 %	50 %	0 %	50 %	532352420
3534	NC_022109	GA	3	6	160312	160317	50 %	0 %	50 %	0 %	532352420
3535	NC_022109	ATT	2	6	160332	160337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352420
3536	NC_022109	ATA	2	6	160428	160433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352420
3537	NC_022109	AC	3	6	160452	160457	50 %	0 %	0 %	50 %	532352420
3538	NC_022109	A	8	8	160497	160504	100 %	0 %	0 %	0 %	532352420
3539	NC_022109	ATG	2	6	160578	160583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352420
3540	NC_022109	TCT	2	6	160593	160598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352420
3541	NC_022109	TTC	2	6	160807	160812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352420
3542	NC_022109	AGG	2	6	160818	160823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352420
3543	NC_022109	ATA	3	9	160844	160852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352420
3544	NC_022109	AACAGC	2	12	160947	160958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532352421
3545	NC_022109	AGT	2	6	160990	160995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352421
3546	NC_022109	TGG	2	6	161076	161081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352421
3547	NC_022109	TC	3	6	161403	161408	0 %	50 %	0 %	50 %	532352421
3548	NC_022109	A	6	6	161421	161426	100 %	0 %	0 %	0 %	532352421
3549	NC_022109	CTG	2	6	161489	161494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352421
3550	NC_022109	GCG	2	6	161505	161510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352421
3551	NC_022109	ACA	2	6	161551	161556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352421
3552	NC_022109	GCA	2	6	161575	161580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352421
3553	NC_022109	CTT	2	6	161594	161599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352421
3554	NC_022109	ATTG	2	8	161613	161620	25 %	50 %	25 %	0 %	532352421
3555	NC_022109	TCT	2	6	161644	161649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352421
3556	NC_022109	CT	4	8	161648	161655	0 %	50 %	0 %	50 %	532352421
3557	NC_022109	TGT	2	6	161676	161681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352421
3558	NC_022109	GCTT	2	8	161717	161724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_022109	CAAAA	2	10	161747	161756	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3560	NC_022109	TGT	2	6	161769	161774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_022109	GAG	2	6	161868	161873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_022109	TGG	2	6	162091	162096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352422
3563	NC_022109	TGT	2	6	162134	162139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3564	NC_022109	GAA	2	6	162144	162149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3565	NC_022109	GGAA	2	8	162186	162193	50 %	0 %	50 %	0 %	532352422
3566	NC_022109	GAA	3	9	162201	162209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3567	NC_022109	TTTC	2	8	162304	162311	0 %	75 %	0 %	25 %	532352422
3568	NC_022109	ATCT	2	8	162330	162337	25 %	50 %	0 %	25 %	532352422
3569	NC_022109	CTT	2	6	162355	162360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352422
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3571	NC_022109	GA	3	6	162409	162414	50 %	0 %	50 %	0 %	532352422
3572	NC_022109	TTG	2	6	162435	162440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3573	NC_022109	GAA	2	6	162456	162461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3574	NC_022109	TTA	2	6	162512	162517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352422
3575	NC_022109	TAG	2	6	162523	162528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352422
3576	NC_022109	GTT	2	6	162610	162615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3577	NC_022109	ACA	3	9	162617	162625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352422
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3579	NC_022109	TG	3	6	162796	162801	0 %	50 %	50 %	0 %	532352422
3580	NC_022109	AGC	2	6	162814	162819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352422
3581	NC_022109	TAG	2	6	162832	162837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352422
3582	NC_022109	TCGA	2	8	162846	162853	25 %	25 %	25 %	25 %	532352422
3583	NC_022109	AGAGA	2	10	162975	162984	60 %	0 %	40 %	0 %	532352422
3584	NC_022109	ATT	2	6	162998	163003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352422
3585	NC_022109	GAGG	2	8	163023	163030	25 %	0 %	75 %	0 %	532352422
3586	NC_022109	TC	3	6	163036	163041	0 %	50 %	0 %	50 %	532352422
3587	NC_022109	TGT	2	6	163268	163273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3588	NC_022109	CTT	3	9	163294	163302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352422
3589	NC_022109	TTG	2	6	163307	163312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3590	NC_022109	AGC	2	6	163352	163357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352422
3591	NC_022109	AGG	2	6	163361	163366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352422
3592	NC_022109	GAA	2	6	163395	163400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3593	NC_022109	AGCAA	2	10	163410	163419	60 %	0 %	20 %	20 %	532352422
3594	NC_022109	TAC	2	6	163436	163441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352422
3595	NC_022109	TGGC	2	8	163486	163493	0 %	25 %	50 %	25 %	532352422
3596	NC_022109	CCT	2	6	163575	163580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352422
3597	NC_022109	GT	3	6	163594	163599	0 %	50 %	50 %	0 %	532352422
3598	NC_022109	GAG	2	6	163603	163608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352422
3599	NC_022109	GAT	2	6	163629	163634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352422
3600	NC_022109	AAT	2	6	163659	163664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352422
3601	NC_022109	GAT	2	6	163747	163752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352423
3602	NC_022109	TAT	2	6	163795	163800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352423
3603	NC_022109	TCAA	2	8	163805	163812	50 %	25 %	0 %	25 %	532352423
3604	NC_022109	CGA	2	6	163814	163819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352423
3605	NC_022109	ATG	2	6	163835	163840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352423
3606	NC_022109	TGT	2	6	163967	163972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352423
3607	NC_022109	T	7	7	164011	164017	0 %	100 %	0 %	0 %	532352423
3608	NC_022109	ATT	2	6	164031	164036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352423
3609	NC_022109	GAG	2	6	164234	164239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
3610	NC_022109	TTTC	2	8	164245	164252	0 %	75 %	0 %	25 %	532352423
3611	NC_022109	GGA	2	6	164332	164337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
3612	NC_022109	TCT	2	6	164353	164358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352423
3613	NC_022109	GCT	2	6	164365	164370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352423
3614	NC_022109	A	8	8	164414	164421	100 %	0 %	0 %	0 %	532352423
3615	NC_022109	GA	3	6	164525	164530	50 %	0 %	50 %	0 %	532352423
3616	NC_022109	GC	3	6	164541	164546	0 %	0 %	50 %	50 %	532352423
3617	NC_022109	GTC	2	6	164572	164577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352423
3618	NC_022109	GGA	2	6	164685	164690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
3619	NC_022109	T	7	7	164750	164756	0 %	100 %	0 %	0 %	532352423
3620	NC_022109	A	8	8	164807	164814	100 %	0 %	0 %	0 %	532352423
3621	NC_022109	AGG	2	6	164850	164855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
3622	NC_022109	TTG	2	6	164873	164878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352423
3623	NC_022109	AG	3	6	164904	164909	50 %	0 %	50 %	0 %	532352423
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3625	NC_022109	G	6	6	165004	165009	0 %	0 %	100 %	0 %	532352423
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3875	NC_022109	GCA	2	6	176464	176469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352430
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3992	NC_022109	T	8	8	182153	182160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3995	NC_022109	TCG	2	6	182220	182225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3999	NC_022109	AAG	2	6	182310	182315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353132
4000	NC_022109	GATG	2	8	182341	182348	25 %	25 %	50 %	0 %	532353132

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