MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_022109	TCCTT	2	10	977162	977171	0 %	60 %	0 %	40 %	532353074
21503	NC_022109	GAT	2	6	977187	977192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353074
21504	NC_022109	TTGAT	2	10	977255	977264	20 %	60 %	20 %	0 %	532353074
21505	NC_022109	AGA	2	6	977277	977282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353074
21506	NC_022109	AATT	2	8	977327	977334	50 %	50 %	0 %	0 %	532353074
21507	NC_022109	GCA	2	6	977427	977432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353074
21508	NC_022109	CGT	2	6	977443	977448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353074
21509	NC_022109	TAA	2	6	977523	977528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353074
21510	NC_022109	CTT	2	6	977538	977543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353074
21511	NC_022109	GCA	2	6	977572	977577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353074
21512	NC_022109	T	8	8	977638	977645	0 %	100 %	0 %	0 %	532353074
21513	NC_022109	T	8	8	977712	977719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21514	NC_022109	ATA	2	6	977729	977734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21515	NC_022109	TTA	2	6	977748	977753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21516	NC_022109	ACT	2	6	977784	977789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21517	NC_022109	GTG	2	6	977796	977801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21518	NC_022109	GAA	2	6	977888	977893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21519	NC_022109	CTC	2	6	977898	977903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21520	NC_022109	TAA	2	6	977989	977994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353198
21521	NC_022109	TGT	2	6	978005	978010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353198
21522	NC_022109	AAT	2	6	978143	978148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353198
21523	NC_022109	T	7	7	978179	978185	0 %	100 %	0 %	0 %	532353198
21524	NC_022109	A	6	6	978213	978218	100 %	0 %	0 %	0 %	532353198
21525	NC_022109	ATG	2	6	978299	978304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353198
21526	NC_022109	TAG	2	6	978312	978317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353198
21527	NC_022109	TGG	2	6	978319	978324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353198
21528	NC_022109	GGA	2	6	978443	978448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353198
21529	NC_022109	TCA	2	6	978504	978509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353198
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21531	NC_022109	ATG	2	6	978613	978618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21532	NC_022109	T	6	6	978626	978631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21533	NC_022109	ATG	2	6	978642	978647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21534	NC_022109	GATA	2	8	978656	978663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21535	NC_022109	GGT	2	6	978710	978715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21536	NC_022109	TTG	2	6	978733	978738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353075
21537	NC_022109	TTA	2	6	978783	978788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353075
21538	NC_022109	GTT	2	6	978807	978812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353075
21539	NC_022109	CAA	2	6	978822	978827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353075
21540	NC_022109	TTA	2	6	978867	978872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353075
21541	NC_022109	ATT	2	6	978888	978893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353075
21542	NC_022109	TAC	2	6	978989	978994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353075
21543	NC_022109	GTT	2	6	979065	979070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353075
21544	NC_022109	AAG	2	6	979087	979092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353075
21545	NC_022109	TGT	2	6	979107	979112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353075
21546	NC_022109	GAC	2	6	979213	979218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353075
21547	NC_022109	GAT	2	6	979238	979243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353075
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21550	NC_022109	T	6	6	979285	979290	0 %	100 %	0 %	0 %	532353075
21551	NC_022109	TAA	2	6	979342	979347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353076
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21553	NC_022109	GTT	2	6	979483	979488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353076
21554	NC_022109	TTC	2	6	979499	979504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353076
21555	NC_022109	AGC	2	6	979526	979531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353076
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21557	NC_022109	T	8	8	979580	979587	0 %	100 %	0 %	0 %	532353076
21558	NC_022109	A	6	6	979609	979614	100 %	0 %	0 %	0 %	532353076
21559	NC_022109	AAT	2	6	979658	979663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353076
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21562	NC_022109	AGT	2	6	979700	979705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353076
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21565	NC_022109	ATT	2	6	979868	979873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353076
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21569	NC_022109	GGGT	2	8	979950	979957	0 %	25 %	75 %	0 %	532353076
21570	NC_022109	CTCA	2	8	979985	979992	25 %	25 %	0 %	50 %	532353076
21571	NC_022109	CA	3	6	980236	980241	50 %	0 %	0 %	50 %	532353199
21572	NC_022109	GAG	2	6	980257	980262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353199
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21582	NC_022109	TCA	2	6	980587	980592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353077
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21584	NC_022109	CG	3	6	980693	980698	0 %	0 %	50 %	50 %	532353077
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21586	NC_022109	TCC	2	6	980796	980801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353077
21587	NC_022109	GGAA	2	8	980821	980828	50 %	0 %	50 %	0 %	532353077
21588	NC_022109	TA	3	6	980837	980842	50 %	50 %	0 %	0 %	532353077
21589	NC_022109	ATT	2	6	980849	980854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21590	NC_022109	T	7	7	980896	980902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21591	NC_022109	A	7	7	980908	980914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21592	NC_022109	TCT	2	6	980949	980954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21593	NC_022109	GAA	2	6	980959	980964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21594	NC_022109	ATA	2	6	980992	980997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21595	NC_022109	CTT	2	6	981095	981100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21596	NC_022109	T	8	8	981120	981127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21597	NC_022109	AATA	2	8	981185	981192	75 %	25 %	0 %	0 %	532353078
21598	NC_022109	AGC	2	6	981238	981243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353078
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21602	NC_022109	AGCAC	2	10	981401	981410	40 %	0 %	20 %	40 %	532353078
21603	NC_022109	TTAAGC	2	12	981430	981441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532353078
21604	NC_022109	GAT	2	6	981450	981455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353078
21605	NC_022109	AAAGC	2	10	981471	981480	60 %	0 %	20 %	20 %	532353078
21606	NC_022109	TAAAG	2	10	981509	981518	60 %	20 %	20 %	0 %	532353078
21607	NC_022109	TTG	2	6	981613	981618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353078
21608	NC_022109	A	6	6	981687	981692	100 %	0 %	0 %	0 %	532353078
21609	NC_022109	GCG	2	6	981736	981741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353078
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21611	NC_022109	CGT	2	6	981955	981960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353079
21612	NC_022109	TGT	2	6	982199	982204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353080
21613	NC_022109	GTA	2	6	982240	982245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353080
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21618	NC_022109	GGA	2	6	982506	982511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353081
21619	NC_022109	GA	3	6	982522	982527	50 %	0 %	50 %	0 %	532353081
21620	NC_022109	AGA	2	6	982548	982553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353081
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