MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_022109	AAT	2	6	954387	954392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353196
21003	NC_022109	TGT	2	6	954512	954517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353058
21004	NC_022109	CTT	2	6	954534	954539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353058
21005	NC_022109	AGG	2	6	954551	954556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353058
21006	NC_022109	GGATTA	2	12	954573	954584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353058
21007	NC_022109	TGC	2	6	954599	954604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353058
21008	NC_022109	TGC	2	6	954627	954632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353058
21009	NC_022109	TGG	2	6	954672	954677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353058
21010	NC_022109	GAT	2	6	954798	954803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353058
21011	NC_022109	GTT	2	6	954843	954848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353058
21012	NC_022109	GAA	2	6	954849	954854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353058
21013	NC_022109	A	6	6	954907	954912	100 %	0 %	0 %	0 %	532353058
21014	NC_022109	A	6	6	954930	954935	100 %	0 %	0 %	0 %	532353058
21015	NC_022109	AAC	2	6	954974	954979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353058
21016	NC_022109	GCA	2	6	954996	955001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353058
21017	NC_022109	ACA	2	6	955004	955009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353058
21018	NC_022109	AGA	2	6	955013	955018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353058
21019	NC_022109	GAA	2	6	955059	955064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353058
21020	NC_022109	TGA	2	6	955088	955093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353058
21021	NC_022109	GAAAAA	2	12	955119	955130	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532353058
21022	NC_022109	AGA	3	9	955165	955173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353058
21023	NC_022109	GTT	2	6	955188	955193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353058
21024	NC_022109	T	7	7	955192	955198	0 %	100 %	0 %	0 %	532353058
21025	NC_022109	GTA	2	6	955215	955220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353058
21026	NC_022109	T	8	8	955235	955242	0 %	100 %	0 %	0 %	532353058
21027	NC_022109	CGA	2	6	955257	955262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21028	NC_022109	TCA	2	6	955266	955271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21029	NC_022109	CAG	2	6	955319	955324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21030	NC_022109	GT	3	6	955348	955353	0 %	50 %	50 %	0 %	532353059
21031	NC_022109	TTC	2	6	955386	955391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353059
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21033	NC_022109	GGA	2	6	955447	955452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353059
21034	NC_022109	AGTA	2	8	955460	955467	50 %	25 %	25 %	0 %	532353059
21035	NC_022109	ATTT	2	8	955516	955523	25 %	75 %	0 %	0 %	532353059
21036	NC_022109	T	8	8	955521	955528	0 %	100 %	0 %	0 %	532353059
21037	NC_022109	T	7	7	955576	955582	0 %	100 %	0 %	0 %	532353059
21038	NC_022109	GGC	2	6	955638	955643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21039	NC_022109	TGC	2	6	955644	955649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353060
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21042	NC_022109	CAAT	2	8	955752	955759	50 %	25 %	0 %	25 %	532353060
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21045	NC_022109	A	8	8	955939	955946	100 %	0 %	0 %	0 %	532353060
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21048	NC_022109	TTTG	2	8	956014	956021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_022109	AAG	2	6	956074	956079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_022109	AGTT	2	8	956138	956145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21051	NC_022109	TTA	2	6	956292	956297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353061
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21054	NC_022109	AT	3	6	956354	956359	50 %	50 %	0 %	0 %	532353061
21055	NC_022109	TTA	2	6	956446	956451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353061
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21057	NC_022109	TGA	2	6	956615	956620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353061
21058	NC_022109	AT	3	6	956666	956671	50 %	50 %	0 %	0 %	532353061
21059	NC_022109	GAA	2	6	956778	956783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353061
21060	NC_022109	TGA	2	6	956945	956950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353061
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21062	NC_022109	TGA	2	6	957049	957054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353061
21063	NC_022109	GCA	2	6	957134	957139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353061
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21065	NC_022109	TACAA	2	10	957201	957210	60 %	20 %	0 %	20 %	532353061
21066	NC_022109	GGGAT	2	10	957214	957223	20 %	20 %	60 %	0 %	532353061
21067	NC_022109	TAT	2	6	957248	957253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353061
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21072	NC_022109	TTG	2	6	957674	957679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353062
21073	NC_022109	TTGT	2	8	957688	957695	0 %	75 %	25 %	0 %	532353062
21074	NC_022109	CTG	2	6	957731	957736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353062
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21091	NC_022109	AT	3	6	958566	958571	50 %	50 %	0 %	0 %	532353062
21092	NC_022109	GCTA	2	8	958584	958591	25 %	25 %	25 %	25 %	532353062
21093	NC_022109	TCA	2	6	958595	958600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353062
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21096	NC_022109	GCAA	2	8	958856	958863	50 %	0 %	25 %	25 %	532353062
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21101	NC_022109	GCT	2	6	959220	959225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353062
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21105	NC_022109	TAGA	2	8	959341	959348	50 %	25 %	25 %	0 %	532353062
21106	NC_022109	T	6	6	959394	959399	0 %	100 %	0 %	0 %	532353062
21107	NC_022109	CT	3	6	959400	959405	0 %	50 %	0 %	50 %	532353062
21108	NC_022109	TGA	2	6	959406	959411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353062
21109	NC_022109	CT	3	6	959466	959471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21110	NC_022109	A	6	6	959472	959477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21111	NC_022109	CTTG	2	8	959513	959520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21112	NC_022109	AAC	2	6	959528	959533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21113	NC_022109	ACG	2	6	959592	959597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353063
21114	NC_022109	AAGA	2	8	959675	959682	75 %	0 %	25 %	0 %	532353063
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21118	NC_022109	GTA	2	6	959868	959873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353063
21119	NC_022109	T	6	6	959874	959879	0 %	100 %	0 %	0 %	532353063
21120	NC_022109	ATT	2	6	959894	959899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353063
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21491	NC_022109	TTGG	2	8	976822	976829	0 %	50 %	50 %	0 %	532353074
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