MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_022109	AG	3	6	885512	885517	50 %	0 %	50 %	0 %	532353005
19503	NC_022109	CAA	2	6	885531	885536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353005
19504	NC_022109	TCCA	2	8	885541	885548	25 %	25 %	0 %	50 %	532353005
19505	NC_022109	GTT	2	6	885567	885572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353005
19506	NC_022109	AG	3	6	885576	885581	50 %	0 %	50 %	0 %	532353005
19507	NC_022109	CAG	2	6	885609	885614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353005
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19510	NC_022109	AGA	2	6	885668	885673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353005
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19512	NC_022109	TCT	2	6	885833	885838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353005
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19533	NC_022109	T	8	8	887078	887085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19535	NC_022109	A	6	6	887101	887106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_022109	T	6	6	887120	887125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_022109	AAT	2	6	887175	887180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_022109	TAG	2	6	887193	887198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_022109	GAAA	2	8	887201	887208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19541	NC_022109	T	6	6	887268	887273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19542	NC_022109	GTT	2	6	887275	887280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19543	NC_022109	GAA	2	6	887329	887334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19544	NC_022109	TCT	2	6	887338	887343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19545	NC_022109	TTA	2	6	887347	887352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_022109	CTCG	2	8	887366	887373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19547	NC_022109	GAA	2	6	887376	887381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19548	NC_022109	T	6	6	887431	887436	0 %	100 %	0 %	0 %	532353006
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19554	NC_022109	TAA	2	6	887814	887819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353006
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19610	NC_022109	CAT	2	6	889711	889716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353007
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19620	NC_022109	TATG	2	8	890428	890435	25 %	50 %	25 %	0 %	532353008
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19988	NC_022109	GCTT	2	8	908332	908339	0 %	50 %	25 %	25 %	532353024
19989	NC_022109	AGA	2	6	908375	908380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353024
19990	NC_022109	CAG	2	6	908391	908396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353024
19991	NC_022109	TTG	2	6	908541	908546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353024
19992	NC_022109	TTC	2	6	908559	908564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353024
19993	NC_022109	AGGG	2	8	908677	908684	25 %	0 %	75 %	0 %	532353024
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19996	NC_022109	T	6	6	908793	908798	0 %	100 %	0 %	0 %	532353025
19997	NC_022109	T	6	6	908831	908836	0 %	100 %	0 %	0 %	532353025
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20000	NC_022109	CTT	2	6	908983	908988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353025

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