MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_022109	AAT	2	6	860871	860876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352992
19003	NC_022109	T	8	8	860876	860883	0 %	100 %	0 %	0 %	532352992
19004	NC_022109	AG	3	6	860936	860941	50 %	0 %	50 %	0 %	532352992
19005	NC_022109	TCT	2	6	860944	860949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352992
19006	NC_022109	T	6	6	860987	860992	0 %	100 %	0 %	0 %	532352992
19007	NC_022109	CTT	2	6	861022	861027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352992
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19011	NC_022109	TTG	2	6	861192	861197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352992
19012	NC_022109	TTC	2	6	861231	861236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352992
19013	NC_022109	AAT	2	6	861255	861260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352992
19014	NC_022109	TTTA	2	8	861315	861322	25 %	75 %	0 %	0 %	532352992
19015	NC_022109	TGG	2	6	861324	861329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352992
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19018	NC_022109	T	6	6	861435	861440	0 %	100 %	0 %	0 %	532352992
19019	NC_022109	T	6	6	861470	861475	0 %	100 %	0 %	0 %	532352992
19020	NC_022109	TTC	2	6	861515	861520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352992
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19025	NC_022109	GAG	2	6	861638	861643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352992
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19031	NC_022109	ATT	2	6	861885	861890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_022109	T	7	7	861889	861895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19034	NC_022109	T	7	7	861943	861949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_022109	TAG	2	6	861969	861974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352993
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19055	NC_022109	TGC	2	6	862468	862473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19057	NC_022109	AGA	2	6	862555	862560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_022109	TTC	2	6	862561	862566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19059	NC_022109	ATT	2	6	862586	862591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19062	NC_022109	T	6	6	862650	862655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19096	NC_022109	CT	3	6	864156	864161	0 %	50 %	0 %	50 %	532352994
19097	NC_022109	GA	3	6	864202	864207	50 %	0 %	50 %	0 %	532352994
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19108	NC_022109	TAT	2	6	864780	864785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352994
19109	NC_022109	ACCT	2	8	864810	864817	25 %	25 %	0 %	50 %	532352994
19110	NC_022109	AAG	2	6	864865	864870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352994
19111	NC_022109	CCG	2	6	864912	864917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352994
19112	NC_022109	GT	3	6	864925	864930	0 %	50 %	50 %	0 %	532352994
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19115	NC_022109	AT	3	6	865058	865063	50 %	50 %	0 %	0 %	532352994
19116	NC_022109	AAG	2	6	865130	865135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352994
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19118	NC_022109	TAGA	2	8	865223	865230	50 %	25 %	25 %	0 %	532352995
19119	NC_022109	GAG	2	6	865283	865288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352995
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19124	NC_022109	GA	3	6	865397	865402	50 %	0 %	50 %	0 %	532352995
19125	NC_022109	TAA	2	6	865458	865463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352995
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19187	NC_022109	TTTG	2	8	868850	868857	0 %	75 %	25 %	0 %	532352998
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19233	NC_022109	AAT	2	6	871292	871297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352998
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19235	NC_022109	AG	3	6	871377	871382	50 %	0 %	50 %	0 %	532352998
19236	NC_022109	C	6	6	871424	871429	0 %	0 %	0 %	100 %	532352998
19237	NC_022109	CAA	2	6	871475	871480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352998
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19240	NC_022109	TTC	2	6	871578	871583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352998
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19243	NC_022109	ATC	2	6	871821	871826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352998
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