MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022109	ATGA	2	8	835234	835241	50 %	25 %	25 %	0 %	532352974
18502	NC_022109	TAT	2	6	835250	835255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352974
18503	NC_022109	CTTT	2	8	835301	835308	0 %	75 %	0 %	25 %	532352975
18504	NC_022109	CGG	2	6	835353	835358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352975
18505	NC_022109	AAT	2	6	835435	835440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352975
18506	NC_022109	AAG	2	6	835511	835516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352975
18507	NC_022109	ACG	2	6	835535	835540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352975
18508	NC_022109	A	6	6	835555	835560	100 %	0 %	0 %	0 %	532352975
18509	NC_022109	TG	3	6	835574	835579	0 %	50 %	50 %	0 %	532352975
18510	NC_022109	GT	3	6	835605	835610	0 %	50 %	50 %	0 %	532352975
18511	NC_022109	ATT	2	6	835612	835617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352975
18512	NC_022109	TGA	2	6	835647	835652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352975
18513	NC_022109	TC	3	6	835681	835686	0 %	50 %	0 %	50 %	532352975
18514	NC_022109	GAA	2	6	835717	835722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352975
18515	NC_022109	GAAA	2	8	835740	835747	75 %	0 %	25 %	0 %	532352975
18516	NC_022109	TAGT	2	8	835795	835802	25 %	50 %	25 %	0 %	532352975
18517	NC_022109	AAG	2	6	835845	835850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352975
18518	NC_022109	TAG	2	6	835854	835859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352975
18519	NC_022109	AGA	2	6	835867	835872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352976
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18522	NC_022109	ATC	2	6	835999	836004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352976
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18529	NC_022109	TAG	2	6	836320	836325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352976
18530	NC_022109	AG	3	6	836324	836329	50 %	0 %	50 %	0 %	532352976
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18533	NC_022109	AAT	2	6	836482	836487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352976
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18535	NC_022109	TAA	2	6	836604	836609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352976
18536	NC_022109	TACA	2	8	836728	836735	50 %	25 %	0 %	25 %	532352976
18537	NC_022109	T	6	6	836782	836787	0 %	100 %	0 %	0 %	532352976
18538	NC_022109	AGA	2	6	836830	836835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352976
18539	NC_022109	ATCACA	2	12	836852	836863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352976
18540	NC_022109	ATG	2	6	836882	836887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352976
18541	NC_022109	T	7	7	836928	836934	0 %	100 %	0 %	0 %	532352976
18542	NC_022109	GAAG	2	8	836971	836978	50 %	0 %	50 %	0 %	532352976
18543	NC_022109	T	6	6	837036	837041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18544	NC_022109	AAAT	2	8	837139	837146	75 %	25 %	0 %	0 %	532352977
18545	NC_022109	AAT	2	6	837149	837154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352977
18546	NC_022109	CGA	2	6	837189	837194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352977
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18548	NC_022109	CAC	2	6	837251	837256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352977
18549	NC_022109	ATC	2	6	837354	837359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352977
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18551	NC_022109	GCA	2	6	837537	837542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352977
18552	NC_022109	CGTGG	2	10	837544	837553	0 %	20 %	60 %	20 %	532352977
18553	NC_022109	AAGC	2	8	837591	837598	50 %	0 %	25 %	25 %	532352977
18554	NC_022109	CGC	2	6	837613	837618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352977
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18583	NC_022109	GAAG	2	8	839161	839168	50 %	0 %	50 %	0 %	532352978
18584	NC_022109	CTTG	2	8	839259	839266	0 %	50 %	25 %	25 %	532352978
18585	NC_022109	AAGAG	2	10	839324	839333	60 %	0 %	40 %	0 %	532352978
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18591	NC_022109	A	6	6	839614	839619	100 %	0 %	0 %	0 %	532352978
18592	NC_022109	CAAT	2	8	839633	839640	50 %	25 %	0 %	25 %	532352978
18593	NC_022109	T	7	7	839671	839677	0 %	100 %	0 %	0 %	532352978
18594	NC_022109	TGA	2	6	839681	839686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352978
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18599	NC_022109	GAC	2	6	839881	839886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352979
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18603	NC_022109	CAGA	2	8	840168	840175	50 %	0 %	25 %	25 %	532352979
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18606	NC_022109	CTT	3	9	840213	840221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352979
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18609	NC_022109	CTC	2	6	840294	840299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352979
18610	NC_022109	CT	3	6	840310	840315	0 %	50 %	0 %	50 %	532352979
18611	NC_022109	GCA	2	6	840335	840340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352979
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18616	NC_022109	TGCT	2	8	840544	840551	0 %	50 %	25 %	25 %	532352979
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18620	NC_022109	GCCA	2	8	840615	840622	25 %	0 %	25 %	50 %	532352979
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18998	NC_022109	TTA	2	6	860415	860420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352991
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19000	NC_022109	GAG	2	6	860717	860722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352992

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