MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022109	ATC	2	6	812286	812291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352958
18002	NC_022109	CATC	2	8	812344	812351	25 %	25 %	0 %	50 %	532352958
18003	NC_022109	AT	3	6	812352	812357	50 %	50 %	0 %	0 %	532352958
18004	NC_022109	TTC	2	6	812363	812368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18005	NC_022109	CCTT	2	8	812431	812438	0 %	50 %	0 %	50 %	532352958
18006	NC_022109	CTT	2	6	812452	812457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18007	NC_022109	AG	3	6	812537	812542	50 %	0 %	50 %	0 %	532352958
18008	NC_022109	TTC	2	6	812546	812551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18009	NC_022109	CT	3	6	812568	812573	0 %	50 %	0 %	50 %	532352958
18010	NC_022109	CTT	2	6	812641	812646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18011	NC_022109	TTC	2	6	812679	812684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18012	NC_022109	AAG	2	6	812777	812782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352958
18013	NC_022109	AGGA	2	8	812793	812800	50 %	0 %	50 %	0 %	532352958
18014	NC_022109	ATTT	2	8	812908	812915	25 %	75 %	0 %	0 %	532352958
18015	NC_022109	TCA	2	6	812943	812948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352958
18016	NC_022109	A	6	6	813026	813031	100 %	0 %	0 %	0 %	532352958
18017	NC_022109	T	6	6	813042	813047	0 %	100 %	0 %	0 %	532352958
18018	NC_022109	TCT	2	6	813063	813068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18019	NC_022109	GAAA	2	8	813155	813162	75 %	0 %	25 %	0 %	532352958
18020	NC_022109	GAG	2	6	813201	813206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352958
18021	NC_022109	CA	3	6	813238	813243	50 %	0 %	0 %	50 %	532352958
18022	NC_022109	AAAC	2	8	813275	813282	75 %	0 %	0 %	25 %	532352958
18023	NC_022109	CAA	2	6	813322	813327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352958
18024	NC_022109	TAT	2	6	813328	813333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352958
18025	NC_022109	ACA	2	6	813366	813371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352958
18026	NC_022109	T	8	8	813372	813379	0 %	100 %	0 %	0 %	532352958
18027	NC_022109	CTT	2	6	813394	813399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18028	NC_022109	TG	3	6	813411	813416	0 %	50 %	50 %	0 %	532352958
18029	NC_022109	ACACA	2	10	813445	813454	60 %	0 %	0 %	40 %	532352958
18030	NC_022109	TCT	2	6	813465	813470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352958
18031	NC_022109	TGA	2	6	813555	813560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352958
18032	NC_022109	GAA	2	6	813623	813628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_022109	A	7	7	813684	813690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_022109	T	6	6	813704	813709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_022109	GGT	2	6	813723	813728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_022109	A	7	7	813729	813735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_022109	GAA	2	6	813780	813785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353181
18038	NC_022109	AAG	2	6	813891	813896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353181
18039	NC_022109	GT	3	6	813991	813996	0 %	50 %	50 %	0 %	532352959
18040	NC_022109	TCTT	2	8	814191	814198	0 %	75 %	0 %	25 %	532352959
18041	NC_022109	GAG	2	6	814204	814209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352959
18042	NC_022109	GAG	2	6	814255	814260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352959
18043	NC_022109	TGC	2	6	814311	814316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352959
18044	NC_022109	CTT	3	9	814338	814346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352959
18045	NC_022109	TGTTT	2	10	814386	814395	0 %	80 %	20 %	0 %	532352959
18046	NC_022109	A	7	7	814403	814409	100 %	0 %	0 %	0 %	532352959
18047	NC_022109	TCT	2	6	814421	814426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352959
18048	NC_022109	GAA	2	6	814553	814558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352959
18049	NC_022109	ATT	2	6	814659	814664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352959
18050	NC_022109	GAT	2	6	814698	814703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352959
18051	NC_022109	GA	5	10	814757	814766	50 %	0 %	50 %	0 %	532352959
18052	NC_022109	AGA	2	6	814797	814802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352959
18053	NC_022109	CTTTG	2	10	814805	814814	0 %	60 %	20 %	20 %	532352959
18054	NC_022109	TTA	2	6	814876	814881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352959
18055	NC_022109	TTG	2	6	814895	814900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352959
18056	NC_022109	AGCA	2	8	814925	814932	50 %	0 %	25 %	25 %	532352959
18057	NC_022109	TTC	2	6	814934	814939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352959
18058	NC_022109	ATT	2	6	814960	814965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352959
18059	NC_022109	TGGA	2	8	815195	815202	25 %	25 %	50 %	0 %	532352959
18060	NC_022109	ACG	2	6	815231	815236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352959
18061	NC_022109	CTT	2	6	815255	815260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352959
18062	NC_022109	AAG	2	6	815276	815281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352959
18063	NC_022109	AG	3	6	815331	815336	50 %	0 %	50 %	0 %	532352959
18064	NC_022109	AGA	2	6	815346	815351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352959
18065	NC_022109	GAA	2	6	815409	815414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352959
18066	NC_022109	TAA	2	6	815445	815450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352959
18067	NC_022109	GCATC	2	10	815454	815463	20 %	20 %	20 %	40 %	532352959
18068	NC_022109	TTTA	2	8	815497	815504	25 %	75 %	0 %	0 %	532352959
18069	NC_022109	TGA	2	6	815505	815510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352959
18070	NC_022109	ACT	2	6	815552	815557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352959
18071	NC_022109	ACTT	2	8	815606	815613	25 %	50 %	0 %	25 %	532352959
18072	NC_022109	GAA	2	6	815631	815636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352959
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18074	NC_022109	A	6	6	815674	815679	100 %	0 %	0 %	0 %	532352959
18075	NC_022109	GCG	2	6	815682	815687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352959
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18077	NC_022109	GAT	2	6	815791	815796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352959
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18081	NC_022109	ATT	2	6	816073	816078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352959
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18094	NC_022109	GA	3	6	816754	816759	50 %	0 %	50 %	0 %	532352959
18095	NC_022109	TGT	2	6	816805	816810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352959
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18101	NC_022109	TGG	2	6	817138	817143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352959
18102	NC_022109	CTG	2	6	817148	817153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352959
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18105	NC_022109	AAAG	2	8	817284	817291	75 %	0 %	25 %	0 %	532352959
18106	NC_022109	TGA	3	9	817302	817310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352959
18107	NC_022109	GAA	2	6	817333	817338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352959
18108	NC_022109	TA	3	6	817386	817391	50 %	50 %	0 %	0 %	532352959
18109	NC_022109	T	8	8	817456	817463	0 %	100 %	0 %	0 %	532352960
18110	NC_022109	GTA	2	6	817728	817733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352960
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18112	NC_022109	GCA	2	6	817895	817900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352960
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18477	NC_022109	TTA	2	6	833793	833798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18493	NC_022109	TCG	2	6	834558	834563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352973
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