MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_022109	T	6	6	789846	789851	0 %	100 %	0 %	0 %	532352939
17503	NC_022109	AAC	2	6	789893	789898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352939
17504	NC_022109	TCT	3	9	789900	789908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352939
17505	NC_022109	CTTAA	2	10	789917	789926	40 %	40 %	0 %	20 %	532352939
17506	NC_022109	CGG	2	6	789943	789948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352939
17507	NC_022109	AGC	2	6	789979	789984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352939
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17509	NC_022109	TGC	2	6	790000	790005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352940
17510	NC_022109	TCT	2	6	790021	790026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352940
17511	NC_022109	GAC	2	6	790089	790094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352940
17512	NC_022109	AAAT	2	8	790109	790116	75 %	25 %	0 %	0 %	532352940
17513	NC_022109	TTG	2	6	790134	790139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352940
17514	NC_022109	ATAG	2	8	790177	790184	50 %	25 %	25 %	0 %	532352940
17515	NC_022109	TCA	2	6	790204	790209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352940
17516	NC_022109	AG	3	6	790311	790316	50 %	0 %	50 %	0 %	532352940
17517	NC_022109	CCA	2	6	790319	790324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352940
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17519	NC_022109	GAT	2	6	790376	790381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352940
17520	NC_022109	CCTT	2	8	790482	790489	0 %	50 %	0 %	50 %	532352940
17521	NC_022109	T	6	6	790488	790493	0 %	100 %	0 %	0 %	532352940
17522	NC_022109	AGT	2	6	790575	790580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352940
17523	NC_022109	GTA	2	6	790657	790662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352940
17524	NC_022109	T	6	6	790668	790673	0 %	100 %	0 %	0 %	532352940
17525	NC_022109	TAA	2	6	790699	790704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352940
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17536	NC_022109	ACAAA	2	10	791016	791025	80 %	0 %	0 %	20 %	532352941
17537	NC_022109	T	9	9	791091	791099	0 %	100 %	0 %	0 %	532352941
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17541	NC_022109	TTG	2	6	791365	791370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352941
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17547	NC_022109	CTA	2	6	791720	791725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352941
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17549	NC_022109	A	6	6	791767	791772	100 %	0 %	0 %	0 %	532352941
17550	NC_022109	AT	5	10	791803	791812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_022109	AGG	2	6	791815	791820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_022109	A	6	6	791854	791859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17553	NC_022109	TTC	2	6	791935	791940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352942
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17556	NC_022109	AAG	2	6	792064	792069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352942
17557	NC_022109	TTC	2	6	792090	792095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352942
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17596	NC_022109	A	7	7	793555	793561	100 %	0 %	0 %	0 %	532352943
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17603	NC_022109	T	8	8	793792	793799	0 %	100 %	0 %	0 %	532352943
17604	NC_022109	GC	3	6	793806	793811	0 %	0 %	50 %	50 %	532352943
17605	NC_022109	CT	3	6	793831	793836	0 %	50 %	0 %	50 %	532352943
17606	NC_022109	TTC	2	6	793869	793874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352943
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17610	NC_022109	CG	3	6	794248	794253	0 %	0 %	50 %	50 %	532352944
17611	NC_022109	TTC	2	6	794286	794291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352944
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17988	NC_022109	AT	3	6	811808	811813	50 %	50 %	0 %	0 %	532352957
17989	NC_022109	TGA	2	6	811827	811832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352957
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17999	NC_022109	T	6	6	812210	812215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18000	NC_022109	CAA	2	6	812266	812271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352958

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