MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022109	GAAG	2	8	766040	766047	50 %	0 %	50 %	0 %	532352923
17002	NC_022109	GAA	2	6	766086	766091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352923
17003	NC_022109	CGTCA	2	10	766095	766104	20 %	20 %	20 %	40 %	532352923
17004	NC_022109	TCT	2	6	766109	766114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352923
17005	NC_022109	CAG	2	6	766149	766154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352923
17006	NC_022109	TCT	2	6	766160	766165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352923
17007	NC_022109	AGA	4	12	766168	766179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352923
17008	NC_022109	TTC	2	6	766196	766201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352923
17009	NC_022109	TGG	2	6	766204	766209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352923
17010	NC_022109	TGG	2	6	766269	766274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352923
17011	NC_022109	TAG	2	6	766380	766385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352923
17012	NC_022109	ATA	2	6	766398	766403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352923
17013	NC_022109	GAA	2	6	766460	766465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352923
17014	NC_022109	CAG	2	6	766529	766534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352923
17015	NC_022109	AGC	2	6	766542	766547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352923
17016	NC_022109	TGG	2	6	766557	766562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352923
17017	NC_022109	GTTG	2	8	766597	766604	0 %	50 %	50 %	0 %	532352923
17018	NC_022109	A	6	6	766638	766643	100 %	0 %	0 %	0 %	532352923
17019	NC_022109	TGC	2	6	766666	766671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352923
17020	NC_022109	CAT	2	6	766682	766687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352923
17021	NC_022109	AAG	2	6	766692	766697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352923
17022	NC_022109	AAG	2	6	766704	766709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352923
17023	NC_022109	GTC	2	6	766716	766721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352923
17024	NC_022109	AGA	2	6	766749	766754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352923
17025	NC_022109	AGA	2	6	766759	766764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352923
17026	NC_022109	AT	3	6	766770	766775	50 %	50 %	0 %	0 %	532352923
17027	NC_022109	GCA	2	6	766796	766801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352923
17028	NC_022109	TAG	2	6	766807	766812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352923
17029	NC_022109	GAAG	2	8	766861	766868	50 %	0 %	50 %	0 %	532352924
17030	NC_022109	TTTTC	2	10	766874	766883	0 %	80 %	0 %	20 %	532352924
17031	NC_022109	GAA	2	6	766937	766942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352924
17032	NC_022109	TCTG	2	8	766972	766979	0 %	50 %	25 %	25 %	532352924
17033	NC_022109	GCT	2	6	766985	766990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352924
17034	NC_022109	GAA	2	6	767075	767080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352924
17035	NC_022109	TAA	2	6	767094	767099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352924
17036	NC_022109	CTT	2	6	767127	767132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352924
17037	NC_022109	TTA	2	6	767153	767158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352924
17038	NC_022109	ATT	3	9	767166	767174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352924
17039	NC_022109	TTG	2	6	767175	767180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352924
17040	NC_022109	GCT	2	6	767194	767199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352924
17041	NC_022109	GGAG	2	8	767272	767279	25 %	0 %	75 %	0 %	532352924
17042	NC_022109	AGA	2	6	767380	767385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352924
17043	NC_022109	AGA	3	9	767470	767478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352924
17044	NC_022109	GTT	2	6	767489	767494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352924
17045	NC_022109	T	6	6	767582	767587	0 %	100 %	0 %	0 %	532352924
17046	NC_022109	AGA	2	6	767653	767658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352924
17047	NC_022109	GAA	2	6	767666	767671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352924
17048	NC_022109	AGG	2	6	767680	767685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352924
17049	NC_022109	CAA	2	6	767709	767714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352924
17050	NC_022109	ATT	2	6	767825	767830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352924
17051	NC_022109	CAT	2	6	767860	767865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352924
17052	NC_022109	TTGC	2	8	767955	767962	0 %	50 %	25 %	25 %	532352924
17053	NC_022109	TCC	2	6	768067	768072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17054	NC_022109	TGT	2	6	768162	768167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352925
17055	NC_022109	TTC	2	6	768209	768214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352925
17056	NC_022109	GAA	3	9	768223	768231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352925
17057	NC_022109	GGA	2	6	768276	768281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352925
17058	NC_022109	AT	3	6	768552	768557	50 %	50 %	0 %	0 %	532352925
17059	NC_022109	GAGCA	2	10	768565	768574	40 %	0 %	40 %	20 %	532352925
17060	NC_022109	TTG	2	6	768619	768624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352925
17061	NC_022109	GCA	2	6	768730	768735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352925
17062	NC_022109	AAGA	2	8	768811	768818	75 %	0 %	25 %	0 %	532352925
17063	NC_022109	TGT	2	6	768822	768827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352925
17064	NC_022109	AG	3	6	768854	768859	50 %	0 %	50 %	0 %	532352925
17065	NC_022109	ATA	2	6	768941	768946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352925
17066	NC_022109	ATG	2	6	769030	769035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352925
17067	NC_022109	GAG	2	6	769057	769062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352925
17068	NC_022109	GAA	2	6	769135	769140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352925
17069	NC_022109	TTG	2	6	769149	769154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352925
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17071	NC_022109	A	6	6	769218	769223	100 %	0 %	0 %	0 %	532352925
17072	NC_022109	G	9	9	769230	769238	0 %	0 %	100 %	0 %	532352925
17073	NC_022109	GGA	2	6	769271	769276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352925
17074	NC_022109	AC	3	6	769337	769342	50 %	0 %	0 %	50 %	532352925
17075	NC_022109	TATATT	2	12	769363	769374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352925
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17078	NC_022109	GTT	2	6	769595	769600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352926
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17080	NC_022109	CTT	2	6	769662	769667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352926
17081	NC_022109	CAG	2	6	769691	769696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352926
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17084	NC_022109	TAA	2	6	769906	769911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352926
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17086	NC_022109	GCAG	2	8	769966	769973	25 %	0 %	50 %	25 %	532352926
17087	NC_022109	CTG	2	6	769974	769979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352926
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17089	NC_022109	AAG	3	9	770019	770027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352926
17090	NC_022109	TCG	2	6	770065	770070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352926
17091	NC_022109	AGA	2	6	770110	770115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352926
17092	NC_022109	GAA	2	6	770164	770169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352926
17093	NC_022109	AAG	3	9	770229	770237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352926
17094	NC_022109	A	6	6	770240	770245	100 %	0 %	0 %	0 %	532352926
17095	NC_022109	TAAA	2	8	770259	770266	75 %	25 %	0 %	0 %	532352926
17096	NC_022109	AAG	2	6	770292	770297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352926
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17100	NC_022109	GTA	2	6	770594	770599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352926
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17102	NC_022109	GCT	2	6	770662	770667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352926
17103	NC_022109	CT	3	6	770666	770671	0 %	50 %	0 %	50 %	532352926
17104	NC_022109	ATG	2	6	770673	770678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352926
17105	NC_022109	ATT	2	6	770681	770686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352926
17106	NC_022109	ATG	2	6	770805	770810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352926
17107	NC_022109	GCT	2	6	770828	770833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352926
17108	NC_022109	CAATT	2	10	770955	770964	40 %	40 %	0 %	20 %	532352926
17109	NC_022109	CTG	3	9	771021	771029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352926
17110	NC_022109	GCT	2	6	771047	771052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352926
17111	NC_022109	CTT	2	6	771070	771075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352926
17112	NC_022109	ACA	2	6	771152	771157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352926
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17118	NC_022109	AATC	2	8	771446	771453	50 %	25 %	0 %	25 %	532352926
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17120	NC_022109	ATT	2	6	771557	771562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352926
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17133	NC_022109	AAT	2	6	772598	772603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17134	NC_022109	TTG	2	6	772624	772629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17162	NC_022109	TGA	2	6	774242	774247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17227	NC_022109	AGTG	2	8	777497	777504	25 %	25 %	50 %	0 %	532352931
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17229	NC_022109	TCT	2	6	777719	777724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17230	NC_022109	ATTTT	2	10	777734	777743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17231	NC_022109	AGGA	2	8	777759	777766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17232	NC_022109	A	7	7	777789	777795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17233	NC_022109	CCGA	2	8	777802	777809	25 %	0 %	25 %	50 %	532353178
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17237	NC_022109	CT	3	6	777922	777927	0 %	50 %	0 %	50 %	532353178
17238	NC_022109	GTT	2	6	777981	777986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352932
17239	NC_022109	GTA	2	6	778122	778127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352932
17240	NC_022109	TAGCTG	2	12	778135	778146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532352932
17241	NC_022109	AG	4	8	778238	778245	50 %	0 %	50 %	0 %	532352932
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