MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_022109	AAAC	2	8	742888	742895	75 %	0 %	0 %	25 %	532352899
16503	NC_022109	TTG	2	6	742954	742959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352899
16504	NC_022109	AGA	3	9	742962	742970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352899
16505	NC_022109	GAA	2	6	743023	743028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352899
16506	NC_022109	TGA	2	6	743139	743144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352899
16507	NC_022109	GAA	2	6	743200	743205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352899
16508	NC_022109	TTA	2	6	743242	743247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352899
16509	NC_022109	TCT	2	6	743406	743411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352899
16510	NC_022109	AGG	2	6	743502	743507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352899
16511	NC_022109	AAAG	2	8	743514	743521	75 %	0 %	25 %	0 %	532352899
16512	NC_022109	GTT	2	6	743584	743589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352899
16513	NC_022109	CGA	2	6	743592	743597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352899
16514	NC_022109	AGC	2	6	743617	743622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352900
16515	NC_022109	AGC	2	6	743645	743650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352900
16516	NC_022109	CTC	2	6	743772	743777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352900
16517	NC_022109	GGAT	2	8	743794	743801	25 %	25 %	50 %	0 %	532352900
16518	NC_022109	AG	3	6	743834	743839	50 %	0 %	50 %	0 %	532352900
16519	NC_022109	CTA	2	6	743966	743971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352900
16520	NC_022109	T	6	6	743978	743983	0 %	100 %	0 %	0 %	532352900
16521	NC_022109	AGC	2	6	744028	744033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352900
16522	NC_022109	ATG	2	6	744061	744066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352900
16523	NC_022109	CTCC	2	8	744119	744126	0 %	25 %	0 %	75 %	532352900
16524	NC_022109	TCTGCA	2	12	744132	744143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532352900
16525	NC_022109	T	8	8	744147	744154	0 %	100 %	0 %	0 %	532352900
16526	NC_022109	A	6	6	744156	744161	100 %	0 %	0 %	0 %	532353176
16527	NC_022109	TCTT	2	8	744168	744175	0 %	75 %	0 %	25 %	532353176
16528	NC_022109	AG	3	6	744188	744193	50 %	0 %	50 %	0 %	532353176
16529	NC_022109	A	8	8	744211	744218	100 %	0 %	0 %	0 %	532353176
16530	NC_022109	T	7	7	744227	744233	0 %	100 %	0 %	0 %	532353176
16531	NC_022109	TGT	2	6	744252	744257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353176
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16533	NC_022109	CAA	2	6	744340	744345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353176
16534	NC_022109	CCGA	2	8	744366	744373	25 %	0 %	25 %	50 %	532353176
16535	NC_022109	TTC	2	6	744451	744456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352901
16536	NC_022109	GAA	2	6	744533	744538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352901
16537	NC_022109	AAC	2	6	744573	744578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352901
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16540	NC_022109	TGTGAT	2	12	744774	744785	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532352901
16541	NC_022109	AGC	2	6	744795	744800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352901
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16543	NC_022109	GGA	2	6	744988	744993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352901
16544	NC_022109	TTC	2	6	745011	745016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352901
16545	NC_022109	TCG	2	6	745032	745037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352901
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16549	NC_022109	TAT	2	6	745179	745184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352901
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16551	NC_022109	GAG	2	6	745279	745284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352901
16552	NC_022109	GTT	2	6	745302	745307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352901
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16556	NC_022109	TCT	2	6	745457	745462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352901
16557	NC_022109	TCT	2	6	745479	745484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16558	NC_022109	T	6	6	745575	745580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_022109	CTT	2	6	745612	745617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_022109	A	6	6	745637	745642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_022109	CGAG	2	8	745683	745690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16562	NC_022109	T	7	7	745768	745774	0 %	100 %	0 %	0 %	532352902
16563	NC_022109	GA	3	6	745779	745784	50 %	0 %	50 %	0 %	532352902
16564	NC_022109	AG	3	6	745834	745839	50 %	0 %	50 %	0 %	532352902
16565	NC_022109	TGT	2	6	745894	745899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352902
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16572	NC_022109	AACAA	2	10	746139	746148	80 %	0 %	0 %	20 %	532352902
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16593	NC_022109	T	6	6	747198	747203	0 %	100 %	0 %	0 %	532352902
16594	NC_022109	CTAG	2	8	747229	747236	25 %	25 %	25 %	25 %	532352902
16595	NC_022109	TGGC	2	8	747322	747329	0 %	25 %	50 %	25 %	532352902
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16606	NC_022109	ATT	2	6	747836	747841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352903
16607	NC_022109	CACG	2	8	747895	747902	25 %	0 %	25 %	50 %	532352903
16608	NC_022109	TC	4	8	747979	747986	0 %	50 %	0 %	50 %	532352903
16609	NC_022109	GGA	2	6	747993	747998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352903
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16611	NC_022109	GAT	2	6	748031	748036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352903
16612	NC_022109	GTA	2	6	748074	748079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352903
16613	NC_022109	CTA	2	6	748215	748220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352903
16614	NC_022109	TGA	2	6	748226	748231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352903
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16617	NC_022109	AGT	2	6	748388	748393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352903
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16619	NC_022109	AAG	2	6	748522	748527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352903
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16991	NC_022109	A	6	6	765780	765785	100 %	0 %	0 %	0 %	532352922
16992	NC_022109	AGA	2	6	765799	765804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352922
16993	NC_022109	AAG	2	6	765813	765818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352922
16994	NC_022109	AGA	2	6	765826	765831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352922
16995	NC_022109	GAA	2	6	765842	765847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352922
16996	NC_022109	AGATG	2	10	765856	765865	40 %	20 %	40 %	0 %	532352922
16997	NC_022109	TCA	2	6	765877	765882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352922
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16999	NC_022109	TAAA	2	8	765933	765940	75 %	25 %	0 %	0 %	532352922
17000	NC_022109	ATC	2	6	765978	765983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352922

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