MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_022109	TAA	2	6	721518	721523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352886
16003	NC_022109	A	6	6	721533	721538	100 %	0 %	0 %	0 %	532352886
16004	NC_022109	CAG	2	6	721563	721568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352886
16005	NC_022109	TCT	2	6	721577	721582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352886
16006	NC_022109	AAGG	2	8	721602	721609	50 %	0 %	50 %	0 %	532352886
16007	NC_022109	AAC	2	6	721714	721719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352886
16008	NC_022109	T	8	8	721766	721773	0 %	100 %	0 %	0 %	532352886
16009	NC_022109	T	7	7	721779	721785	0 %	100 %	0 %	0 %	532352886
16010	NC_022109	GAG	2	6	721790	721795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_022109	T	6	6	721805	721810	0 %	100 %	0 %	0 %	532352887
16012	NC_022109	CTT	2	6	721854	721859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352887
16013	NC_022109	T	6	6	721879	721884	0 %	100 %	0 %	0 %	532352887
16014	NC_022109	ATT	2	6	721951	721956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352887
16015	NC_022109	T	6	6	722034	722039	0 %	100 %	0 %	0 %	532352887
16016	NC_022109	T	6	6	722046	722051	0 %	100 %	0 %	0 %	532352887
16017	NC_022109	GTC	2	6	722080	722085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352887
16018	NC_022109	AGG	2	6	722103	722108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352887
16019	NC_022109	AG	3	6	722131	722136	50 %	0 %	50 %	0 %	532352887
16020	NC_022109	T	6	6	722160	722165	0 %	100 %	0 %	0 %	532352887
16021	NC_022109	ATT	2	6	722173	722178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352887
16022	NC_022109	TAA	3	9	722208	722216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352887
16023	NC_022109	T	6	6	722228	722233	0 %	100 %	0 %	0 %	532352887
16024	NC_022109	T	6	6	722251	722256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_022109	ATC	2	6	722335	722340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_022109	T	7	7	722348	722354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_022109	ATG	2	6	722380	722385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352888
16028	NC_022109	A	6	6	722419	722424	100 %	0 %	0 %	0 %	532352888
16029	NC_022109	AAC	2	6	722488	722493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352888
16030	NC_022109	GAGAA	2	10	722503	722512	60 %	0 %	40 %	0 %	532352888
16031	NC_022109	CT	4	8	722523	722530	0 %	50 %	0 %	50 %	532352888
16032	NC_022109	ACA	2	6	722547	722552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352888
16033	NC_022109	A	7	7	722591	722597	100 %	0 %	0 %	0 %	532352888
16034	NC_022109	TGCTT	2	10	722684	722693	0 %	60 %	20 %	20 %	532352888
16035	NC_022109	TCA	2	6	722723	722728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352888
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16037	NC_022109	TTG	2	6	722785	722790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352888
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16042	NC_022109	TGG	2	6	723036	723041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352888
16043	NC_022109	A	6	6	723063	723068	100 %	0 %	0 %	0 %	532352888
16044	NC_022109	TCT	2	6	723093	723098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352888
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16052	NC_022109	TC	3	6	723428	723433	0 %	50 %	0 %	50 %	532352888
16053	NC_022109	AGA	2	6	723439	723444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352888
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16056	NC_022109	A	7	7	723587	723593	100 %	0 %	0 %	0 %	532352888
16057	NC_022109	AGC	2	6	723610	723615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352888
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16059	NC_022109	TTTG	2	8	723636	723643	0 %	75 %	25 %	0 %	532352888
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16062	NC_022109	A	6	6	723780	723785	100 %	0 %	0 %	0 %	532352888
16063	NC_022109	GTT	2	6	723819	723824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352888
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16065	NC_022109	TAT	2	6	723874	723879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352888
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16075	NC_022109	AATC	2	8	724184	724191	50 %	25 %	0 %	25 %	532352888
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16084	NC_022109	A	7	7	724589	724595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16087	NC_022109	CCTT	2	8	724654	724661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16088	NC_022109	ATTCT	2	10	724670	724679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16089	NC_022109	TTA	2	6	724729	724734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352889
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16096	NC_022109	ATT	2	6	725224	725229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352889
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16103	NC_022109	T	6	6	725395	725400	0 %	100 %	0 %	0 %	532352889
16104	NC_022109	AGA	2	6	725451	725456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352889
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16106	NC_022109	TTGAA	2	10	725552	725561	40 %	40 %	20 %	0 %	532352889
16107	NC_022109	TTCG	2	8	725588	725595	0 %	50 %	25 %	25 %	532352889
16108	NC_022109	T	6	6	725662	725667	0 %	100 %	0 %	0 %	532352889
16109	NC_022109	AGA	2	6	725709	725714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352889
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16111	NC_022109	ATT	2	6	725876	725881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352889
16112	NC_022109	TTCG	2	8	725930	725937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16113	NC_022109	GT	3	6	725939	725944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16115	NC_022109	TTG	2	6	725988	725993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16118	NC_022109	TTCT	2	8	726048	726055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16119	NC_022109	TTG	2	6	726169	726174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_022109	TGT	2	6	726217	726222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16122	NC_022109	TGG	2	6	726246	726251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_022109	TTG	2	6	726255	726260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16352	NC_022109	TTC	2	6	735801	735806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16353	NC_022109	CGG	2	6	735820	735825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16355	NC_022109	GC	3	6	735945	735950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16356	NC_022109	TTC	2	6	735951	735956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16357	NC_022109	GAAGA	2	10	735966	735975	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16358	NC_022109	TCA	2	6	735986	735991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16359	NC_022109	GAAA	2	8	736117	736124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16360	NC_022109	TTC	2	6	736130	736135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16361	NC_022109	TGC	2	6	736144	736149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16362	NC_022109	GAA	2	6	736176	736181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16363	NC_022109	T	6	6	736188	736193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16364	NC_022109	A	6	6	736194	736199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16365	NC_022109	T	10	10	736290	736299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16366	NC_022109	A	8	8	736300	736307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16367	NC_022109	GA	3	6	736318	736323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16368	NC_022109	A	6	6	736354	736359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16369	NC_022109	ATC	2	6	736366	736371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16370	NC_022109	GTT	2	6	736407	736412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352894
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