MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022109	GAA	2	6	699735	699740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352872
15502	NC_022109	GTA	2	6	699746	699751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352872
15503	NC_022109	TTA	2	6	699771	699776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352872
15504	NC_022109	AGG	2	6	699786	699791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352872
15505	NC_022109	AGC	2	6	699806	699811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352872
15506	NC_022109	TTG	2	6	699816	699821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352872
15507	NC_022109	CTT	2	6	699829	699834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352872
15508	NC_022109	AAG	2	6	699952	699957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352872
15509	NC_022109	AAG	2	6	699982	699987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352872
15510	NC_022109	TTG	2	6	700037	700042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352872
15511	NC_022109	T	8	8	700200	700207	0 %	100 %	0 %	0 %	532352872
15512	NC_022109	TTC	3	9	700211	700219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352872
15513	NC_022109	A	7	7	700246	700252	100 %	0 %	0 %	0 %	532352872
15514	NC_022109	TTTTG	2	10	700254	700263	0 %	80 %	20 %	0 %	532352872
15515	NC_022109	ATTT	2	8	700276	700283	25 %	75 %	0 %	0 %	532352872
15516	NC_022109	TCA	2	6	700308	700313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352872
15517	NC_022109	CCA	2	6	700357	700362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352872
15518	NC_022109	TCC	2	6	700458	700463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352872
15519	NC_022109	CT	3	6	700581	700586	0 %	50 %	0 %	50 %	532352872
15520	NC_022109	ACG	2	6	700588	700593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352872
15521	NC_022109	AAG	2	6	700605	700610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352872
15522	NC_022109	TTGC	2	8	700681	700688	0 %	50 %	25 %	25 %	532352872
15523	NC_022109	ACC	2	6	700701	700706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352872
15524	NC_022109	TG	3	6	700779	700784	0 %	50 %	50 %	0 %	532352872
15525	NC_022109	TAC	2	6	700789	700794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352872
15526	NC_022109	TCC	2	6	700800	700805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352872
15527	NC_022109	CTT	2	6	700864	700869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352872
15528	NC_022109	ATT	2	6	700904	700909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352872
15529	NC_022109	TCCA	2	8	700917	700924	25 %	25 %	0 %	50 %	532352872
15530	NC_022109	TGCT	2	8	701041	701048	0 %	50 %	25 %	25 %	532352872
15531	NC_022109	CTTC	2	8	701065	701072	0 %	50 %	0 %	50 %	532352872
15532	NC_022109	ATA	2	6	701099	701104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352872
15533	NC_022109	CTT	2	6	701188	701193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352872
15534	NC_022109	TTCT	2	8	701210	701217	0 %	75 %	0 %	25 %	532352872
15535	NC_022109	CAG	2	6	701242	701247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352872
15536	NC_022109	TCA	2	6	701286	701291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352872
15537	NC_022109	GGTA	2	8	701308	701315	25 %	25 %	50 %	0 %	532352872
15538	NC_022109	CGA	2	6	701333	701338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352872
15539	NC_022109	TCT	2	6	701376	701381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352872
15540	NC_022109	TAC	2	6	701455	701460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352872
15541	NC_022109	ATA	2	6	701466	701471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352872
15542	NC_022109	CTG	2	6	701473	701478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352872
15543	NC_022109	CCT	2	6	701490	701495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352872
15544	NC_022109	CTT	2	6	701502	701507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352872
15545	NC_022109	C	6	6	701509	701514	0 %	0 %	0 %	100 %	532352872
15546	NC_022109	TCC	2	6	701519	701524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352872
15547	NC_022109	CTC	2	6	701627	701632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352872
15548	NC_022109	TGGC	2	8	701641	701648	0 %	25 %	50 %	25 %	532352872
15549	NC_022109	TAAA	2	8	701695	701702	75 %	25 %	0 %	0 %	532352872
15550	NC_022109	AGT	2	6	701717	701722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352872
15551	NC_022109	AAG	2	6	701743	701748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352872
15552	NC_022109	AAAAC	2	10	701754	701763	80 %	0 %	0 %	20 %	532352872
15553	NC_022109	A	6	6	701795	701800	100 %	0 %	0 %	0 %	532352872
15554	NC_022109	T	7	7	701802	701808	0 %	100 %	0 %	0 %	532352872
15555	NC_022109	TGTT	2	8	701812	701819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_022109	TAA	2	6	701887	701892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_022109	AGA	2	6	701926	701931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352873
15558	NC_022109	ATT	2	6	701932	701937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352873
15559	NC_022109	A	6	6	701991	701996	100 %	0 %	0 %	0 %	532352873
15560	NC_022109	ATG	2	6	702051	702056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352873
15561	NC_022109	AGTT	2	8	702075	702082	25 %	50 %	25 %	0 %	532352873
15562	NC_022109	TCT	2	6	702092	702097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352873
15563	NC_022109	TTGG	2	8	702212	702219	0 %	50 %	50 %	0 %	532352873
15564	NC_022109	TC	3	6	702223	702228	0 %	50 %	0 %	50 %	532352873
15565	NC_022109	CAA	2	6	702272	702277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352873
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15568	NC_022109	ACT	2	6	702329	702334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352873
15569	NC_022109	TAG	2	6	702336	702341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352873
15570	NC_022109	TCCT	2	8	702393	702400	0 %	50 %	0 %	50 %	532352873
15571	NC_022109	CAAT	2	8	702463	702470	50 %	25 %	0 %	25 %	532352873
15572	NC_022109	GAT	2	6	702607	702612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352873
15573	NC_022109	ATCT	2	8	702687	702694	25 %	50 %	0 %	25 %	532352873
15574	NC_022109	ATC	2	6	702701	702706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352873
15575	NC_022109	TTC	2	6	702709	702714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352873
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15577	NC_022109	TATC	2	8	702780	702787	25 %	50 %	0 %	25 %	532352873
15578	NC_022109	TA	3	6	702821	702826	50 %	50 %	0 %	0 %	532352873
15579	NC_022109	CT	3	6	702841	702846	0 %	50 %	0 %	50 %	532352873
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15583	NC_022109	GC	3	6	702964	702969	0 %	0 %	50 %	50 %	532352873
15584	NC_022109	AACT	2	8	702990	702997	50 %	25 %	0 %	25 %	532352873
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15589	NC_022109	AG	3	6	703264	703269	50 %	0 %	50 %	0 %	532352873
15590	NC_022109	CTT	2	6	703337	703342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352873
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15592	NC_022109	CTT	2	6	703489	703494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352873
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15594	NC_022109	T	6	6	703524	703529	0 %	100 %	0 %	0 %	532352873
15595	NC_022109	CT	3	6	703564	703569	0 %	50 %	0 %	50 %	532352873
15596	NC_022109	CTTC	2	8	703574	703581	0 %	50 %	0 %	50 %	532352873
15597	NC_022109	GATT	2	8	703624	703631	25 %	50 %	25 %	0 %	532352873
15598	NC_022109	CTAC	2	8	703728	703735	25 %	25 %	0 %	50 %	532352873
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15604	NC_022109	CTTC	2	8	704174	704181	0 %	50 %	0 %	50 %	532352873
15605	NC_022109	ATC	2	6	704186	704191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352873
15606	NC_022109	GGA	2	6	704195	704200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352873
15607	NC_022109	CAAG	2	8	704213	704220	50 %	0 %	25 %	25 %	532352873
15608	NC_022109	CAA	2	6	704234	704239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352873
15609	NC_022109	AAATGC	2	12	704274	704285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532352873
15610	NC_022109	GCA	2	6	704299	704304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352873
15611	NC_022109	GTA	2	6	704315	704320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352873
15612	NC_022109	ATCT	2	8	704348	704355	25 %	50 %	0 %	25 %	532352873
15613	NC_022109	CTGG	2	8	704372	704379	0 %	25 %	50 %	25 %	532352873
15614	NC_022109	AGC	2	6	704392	704397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352873
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15616	NC_022109	ATT	2	6	704434	704439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352873
15617	NC_022109	AAAT	2	8	704475	704482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_022109	ACC	2	6	704511	704516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352874
15619	NC_022109	CTG	2	6	704591	704596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352874
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15622	NC_022109	TTG	2	6	704912	704917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352874
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15992	NC_022109	CAA	2	6	721188	721193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352886
15993	NC_022109	TAA	2	6	721199	721204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352886
15994	NC_022109	TCT	2	6	721208	721213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352886
15995	NC_022109	GAA	2	6	721217	721222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352886
15996	NC_022109	A	6	6	721221	721226	100 %	0 %	0 %	0 %	532352886
15997	NC_022109	TAA	2	6	721278	721283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352886
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