MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_022109	ACT	2	6	654901	654906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352835
14503	NC_022109	TCA	2	6	654917	654922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352835
14504	NC_022109	AG	3	6	654966	654971	50 %	0 %	50 %	0 %	532352835
14505	NC_022109	GAA	2	6	655035	655040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352835
14506	NC_022109	GAT	2	6	655356	655361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352835
14507	NC_022109	CAA	2	6	655375	655380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352835
14508	NC_022109	GA	3	6	655570	655575	50 %	0 %	50 %	0 %	532352835
14509	NC_022109	TAT	2	6	655586	655591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352835
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14511	NC_022109	ATT	2	6	655695	655700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352835
14512	NC_022109	GT	3	6	655906	655911	0 %	50 %	50 %	0 %	532352835
14513	NC_022109	TC	3	6	655936	655941	0 %	50 %	0 %	50 %	532352835
14514	NC_022109	TCCT	2	8	655979	655986	0 %	50 %	0 %	50 %	532352835
14515	NC_022109	ATT	2	6	656029	656034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352835
14516	NC_022109	CA	3	6	656041	656046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14517	NC_022109	A	6	6	656119	656124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_022109	CAGG	2	8	656143	656150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14519	NC_022109	TTC	2	6	656191	656196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_022109	AAT	2	6	656284	656289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_022109	TCC	2	6	656408	656413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14522	NC_022109	GGC	2	6	656472	656477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_022109	TGT	2	6	656621	656626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352836
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14541	NC_022109	TTA	2	6	657600	657605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352837
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14545	NC_022109	CTTTT	2	10	657828	657837	0 %	80 %	0 %	20 %	532352837
14546	NC_022109	T	7	7	657834	657840	0 %	100 %	0 %	0 %	532352837
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14555	NC_022109	GTT	2	6	658162	658167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352838
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14582	NC_022109	A	6	6	659760	659765	100 %	0 %	0 %	0 %	532352839
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14615	NC_022109	A	7	7	661159	661165	100 %	0 %	0 %	0 %	532352840
14616	NC_022109	TGC	2	6	661207	661212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352840
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14622	NC_022109	CT	3	6	661393	661398	0 %	50 %	0 %	50 %	532352840
14623	NC_022109	ACG	2	6	661501	661506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352840
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14627	NC_022109	AAG	2	6	661605	661610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352840
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14641	NC_022109	GCT	2	6	662320	662325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352841
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14662	NC_022109	CTC	2	6	663332	663337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14663	NC_022109	A	7	7	663343	663349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14677	NC_022109	CT	3	6	663971	663976	0 %	50 %	0 %	50 %	532352842
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14732	NC_022109	CTT	2	6	666141	666146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352843
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14869	NC_022109	TCC	2	6	672089	672094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353170
14870	NC_022109	CAC	2	6	672097	672102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353170
14871	NC_022109	AAT	2	6	672201	672206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353170
14872	NC_022109	ACC	2	6	672269	672274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353170
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14874	NC_022109	GAC	2	6	672335	672340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353170
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14876	NC_022109	AATC	2	8	672371	672378	50 %	25 %	0 %	25 %	532353170
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14881	NC_022109	CGC	2	6	672519	672524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353170
14882	NC_022109	AAT	2	6	672584	672589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353170
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14885	NC_022109	TATCG	2	10	672653	672662	20 %	40 %	20 %	20 %	532353170
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14908	NC_022109	CA	3	6	673624	673629	50 %	0 %	0 %	50 %	532353172
14909	NC_022109	AC	3	6	673642	673647	50 %	0 %	0 %	50 %	532353172
14910	NC_022109	GAAT	2	8	673659	673666	50 %	25 %	25 %	0 %	532353172
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14913	NC_022109	CCT	2	6	673728	673733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14914	NC_022109	CTC	2	6	673776	673781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14915	NC_022109	CAT	2	6	673785	673790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14935	NC_022109	A	6	6	674751	674756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14936	NC_022109	GAA	2	6	674793	674798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14937	NC_022109	AAG	2	6	674835	674840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352847
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14949	NC_022109	AGCA	2	8	675322	675329	50 %	0 %	25 %	25 %	532352847
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14980	NC_022109	AGCA	2	8	676784	676791	50 %	0 %	25 %	25 %	532352847
14981	NC_022109	A	6	6	676795	676800	100 %	0 %	0 %	0 %	532352847
14982	NC_022109	ACA	2	6	676826	676831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352847
14983	NC_022109	CT	3	6	676832	676837	0 %	50 %	0 %	50 %	532352847
14984	NC_022109	ATC	2	6	676850	676855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352847
14985	NC_022109	ACA	2	6	676858	676863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352847
14986	NC_022109	GTT	2	6	676869	676874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352847
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14988	NC_022109	AAG	2	6	677014	677019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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