MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022109	T	6	6	633445	633450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_022109	A	6	6	633512	633517	100 %	0 %	0 %	0 %	532353169
14003	NC_022109	CCTG	2	8	633603	633610	0 %	25 %	25 %	50 %	532353169
14004	NC_022109	AT	3	6	633665	633670	50 %	50 %	0 %	0 %	532353169
14005	NC_022109	GTC	2	6	633683	633688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353169
14006	NC_022109	TAA	2	6	633691	633696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353169
14007	NC_022109	A	6	6	633695	633700	100 %	0 %	0 %	0 %	532353169
14008	NC_022109	TC	3	6	633703	633708	0 %	50 %	0 %	50 %	532352815
14009	NC_022109	AAG	2	6	633762	633767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352815
14010	NC_022109	GAA	2	6	633797	633802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352815
14011	NC_022109	AGGA	2	8	633843	633850	50 %	0 %	50 %	0 %	532352815
14012	NC_022109	TTA	2	6	633882	633887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352815
14013	NC_022109	CCTC	2	8	633921	633928	0 %	25 %	0 %	75 %	532352815
14014	NC_022109	ATC	2	6	633959	633964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352815
14015	NC_022109	AAC	2	6	634086	634091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352815
14016	NC_022109	A	7	7	634105	634111	100 %	0 %	0 %	0 %	532352815
14017	NC_022109	CT	3	6	634139	634144	0 %	50 %	0 %	50 %	532352815
14018	NC_022109	A	6	6	634265	634270	100 %	0 %	0 %	0 %	532352815
14019	NC_022109	AAGA	2	8	634307	634314	75 %	0 %	25 %	0 %	532352815
14020	NC_022109	GATT	2	8	634335	634342	25 %	50 %	25 %	0 %	532352815
14021	NC_022109	TCT	2	6	634353	634358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352815
14022	NC_022109	GCA	2	6	634406	634411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352816
14023	NC_022109	CTT	2	6	634422	634427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352816
14024	NC_022109	CTC	2	6	634446	634451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352816
14025	NC_022109	A	6	6	634476	634481	100 %	0 %	0 %	0 %	532352816
14026	NC_022109	CCT	2	6	634541	634546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352816
14027	NC_022109	AAG	2	6	634548	634553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352816
14028	NC_022109	TCC	2	6	634559	634564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352816
14029	NC_022109	CCT	2	6	634656	634661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352816
14030	NC_022109	ATT	2	6	634673	634678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352816
14031	NC_022109	ACA	2	6	634711	634716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352816
14032	NC_022109	CCT	2	6	634721	634726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352816
14033	NC_022109	A	6	6	634808	634813	100 %	0 %	0 %	0 %	532352816
14034	NC_022109	TCGAG	2	10	634818	634827	20 %	20 %	40 %	20 %	532352816
14035	NC_022109	T	6	6	634845	634850	0 %	100 %	0 %	0 %	532352816
14036	NC_022109	TTG	2	6	634875	634880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352816
14037	NC_022109	TTA	2	6	634917	634922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352816
14038	NC_022109	CAA	2	6	634994	634999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352816
14039	NC_022109	ATC	2	6	635021	635026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352816
14040	NC_022109	TCA	2	6	635037	635042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352816
14041	NC_022109	CTTT	2	8	635091	635098	0 %	75 %	0 %	25 %	532352816
14042	NC_022109	ATG	3	9	635141	635149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352816
14043	NC_022109	TC	4	8	635166	635173	0 %	50 %	0 %	50 %	532352816
14044	NC_022109	CTA	2	6	635219	635224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352816
14045	NC_022109	TGA	2	6	635232	635237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352816
14046	NC_022109	CAA	2	6	635276	635281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352816
14047	NC_022109	TTTG	2	8	635295	635302	0 %	75 %	25 %	0 %	532352816
14048	NC_022109	TTA	2	6	635323	635328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352817
14049	NC_022109	CTC	2	6	635345	635350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352817
14050	NC_022109	TAT	2	6	635352	635357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352817
14051	NC_022109	TGG	2	6	635381	635386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352817
14052	NC_022109	AGC	2	6	635397	635402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352817
14053	NC_022109	TTG	2	6	635444	635449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352817
14054	NC_022109	GGCT	2	8	635479	635486	0 %	25 %	50 %	25 %	532352817
14055	NC_022109	TGC	2	6	635508	635513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352817
14056	NC_022109	GGCTC	2	10	635582	635591	0 %	20 %	40 %	40 %	532352817
14057	NC_022109	TA	3	6	635605	635610	50 %	50 %	0 %	0 %	532352818
14058	NC_022109	AGCC	2	8	635618	635625	25 %	0 %	25 %	50 %	532352818
14059	NC_022109	TCTT	2	8	635642	635649	0 %	75 %	0 %	25 %	532352818
14060	NC_022109	ATC	2	6	635683	635688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352818
14061	NC_022109	CT	3	6	635740	635745	0 %	50 %	0 %	50 %	532352818
14062	NC_022109	TGC	2	6	635756	635761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352818
14063	NC_022109	CTT	2	6	635824	635829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352818
14064	NC_022109	TGC	2	6	635886	635891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352818
14065	NC_022109	ACCA	2	8	635914	635921	50 %	0 %	0 %	50 %	532352818
14066	NC_022109	CT	3	6	635952	635957	0 %	50 %	0 %	50 %	532352818
14067	NC_022109	ATT	2	6	635999	636004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352818
14068	NC_022109	AGG	2	6	636030	636035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352818
14069	NC_022109	ATC	2	6	636076	636081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352818
14070	NC_022109	ATG	2	6	636109	636114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352818
14071	NC_022109	CAG	2	6	636194	636199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352818
14072	NC_022109	ATC	2	6	636235	636240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352818
14073	NC_022109	CTC	2	6	636251	636256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352818
14074	NC_022109	CTAC	2	8	636270	636277	25 %	25 %	0 %	50 %	532352818
14075	NC_022109	TGG	2	6	636325	636330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352818
14076	NC_022109	ATT	2	6	636350	636355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352818
14077	NC_022109	CTA	2	6	636383	636388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352818
14078	NC_022109	TCC	2	6	636405	636410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352818
14079	NC_022109	A	8	8	636427	636434	100 %	0 %	0 %	0 %	532352818
14080	NC_022109	CTCC	2	8	636438	636445	0 %	25 %	0 %	75 %	532352818
14081	NC_022109	A	6	6	636446	636451	100 %	0 %	0 %	0 %	532352818
14082	NC_022109	TTC	2	6	636459	636464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352818
14083	NC_022109	TTG	2	6	636485	636490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_022109	TGC	2	6	636529	636534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14085	NC_022109	AAT	2	6	636555	636560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352819
14086	NC_022109	CAA	2	6	636728	636733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352819
14087	NC_022109	CAC	2	6	636788	636793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352819
14088	NC_022109	C	6	6	636834	636839	0 %	0 %	0 %	100 %	532352819
14089	NC_022109	TG	3	6	636852	636857	0 %	50 %	50 %	0 %	532352819
14090	NC_022109	GAG	2	6	636913	636918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352819
14091	NC_022109	CT	3	6	636919	636924	0 %	50 %	0 %	50 %	532352819
14092	NC_022109	T	7	7	636958	636964	0 %	100 %	0 %	0 %	532352819
14093	NC_022109	ATTAA	2	10	636971	636980	60 %	40 %	0 %	0 %	532352819
14094	NC_022109	A	6	6	637025	637030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_022109	TCT	2	6	637047	637052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_022109	CAG	2	6	637115	637120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352820
14097	NC_022109	CTT	2	6	637143	637148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352820
14098	NC_022109	AAAG	2	8	637156	637163	75 %	0 %	25 %	0 %	532352820
14099	NC_022109	GCA	2	6	637246	637251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352820
14100	NC_022109	CTG	2	6	637281	637286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352820
14101	NC_022109	CG	3	6	637288	637293	0 %	0 %	50 %	50 %	532352820
14102	NC_022109	GAA	2	6	637361	637366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352820
14103	NC_022109	CAAC	2	8	637479	637486	50 %	0 %	0 %	50 %	532352820
14104	NC_022109	GGA	2	6	637502	637507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352820
14105	NC_022109	AAT	2	6	637551	637556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352820
14106	NC_022109	AGCA	2	8	637569	637576	50 %	0 %	25 %	25 %	532352820
14107	NC_022109	GAA	2	6	637669	637674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352820
14108	NC_022109	ATT	2	6	637731	637736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352820
14109	NC_022109	GGC	2	6	637738	637743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352820
14110	NC_022109	AAC	2	6	637785	637790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352820
14111	NC_022109	GCTCT	2	10	637823	637832	0 %	40 %	20 %	40 %	532352820
14112	NC_022109	TCGTT	2	10	637851	637860	0 %	60 %	20 %	20 %	532352820
14113	NC_022109	TTG	2	6	637893	637898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352820
14114	NC_022109	CTT	2	6	637913	637918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352820
14115	NC_022109	GCA	2	6	637963	637968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352820
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14117	NC_022109	AAAAT	2	10	638014	638023	80 %	20 %	0 %	0 %	532352820
14118	NC_022109	TGG	2	6	638069	638074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352820
14119	NC_022109	CCTT	2	8	638086	638093	0 %	50 %	0 %	50 %	532352821
14120	NC_022109	TCCAT	2	10	638152	638161	20 %	40 %	0 %	40 %	532352821
14121	NC_022109	AGAA	2	8	638162	638169	75 %	0 %	25 %	0 %	532352821
14122	NC_022109	CCT	2	6	638203	638208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352821
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14124	NC_022109	CTA	2	6	638221	638226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352821
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14233	NC_022109	T	7	7	642923	642929	0 %	100 %	0 %	0 %	532352826
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14244	NC_022109	TCT	2	6	643411	643416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352826
14245	NC_022109	GCT	2	6	643423	643428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352826
14246	NC_022109	TGT	2	6	643496	643501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352826
14247	NC_022109	C	6	6	643572	643577	0 %	0 %	0 %	100 %	532352826
14248	NC_022109	AGA	2	6	643656	643661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352826
14249	NC_022109	CTT	2	6	643841	643846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352826
14250	NC_022109	GAT	2	6	643964	643969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352826
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14252	NC_022109	GTT	2	6	644048	644053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352826
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14254	NC_022109	GA	3	6	644118	644123	50 %	0 %	50 %	0 %	532352826
14255	NC_022109	CTT	2	6	644129	644134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352826
14256	NC_022109	CAT	2	6	644153	644158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352826
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14258	NC_022109	TCC	2	6	644337	644342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352826
14259	NC_022109	CAA	2	6	644435	644440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352827
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14263	NC_022109	CTG	2	6	644639	644644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352827
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14266	NC_022109	CTG	2	6	644745	644750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352827
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14272	NC_022109	GCT	2	6	645029	645034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352827
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14281	NC_022109	TTA	2	6	645364	645369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352827
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14289	NC_022109	A	8	8	645607	645614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14291	NC_022109	A	6	6	645657	645662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14292	NC_022109	A	7	7	645664	645670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14312	NC_022109	CAAGC	2	10	646855	646864	40 %	0 %	20 %	40 %	532352829
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14347	NC_022109	CAA	2	6	648319	648324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352829
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14351	NC_022109	GA	3	6	648552	648557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14354	NC_022109	A	8	8	648607	648614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14355	NC_022109	AC	3	6	648628	648633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14356	NC_022109	GCT	2	6	648634	648639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14360	NC_022109	TAG	2	6	648752	648757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14363	NC_022109	TCT	2	6	648806	648811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14364	NC_022109	AAT	2	6	648812	648817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14366	NC_022109	TAA	2	6	648841	648846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352830
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14470	NC_022109	ATA	2	6	653563	653568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352834
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14473	NC_022109	AAC	2	6	653757	653762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352834
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14478	NC_022109	A	7	7	653880	653886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_022109	A	6	6	653896	653901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14482	NC_022109	AAG	2	6	654106	654111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14487	NC_022109	CTA	2	6	654380	654385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352835
14488	NC_022109	GAA	2	6	654411	654416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352835
14489	NC_022109	AGA	2	6	654455	654460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352835
14490	NC_022109	GCT	2	6	654501	654506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352835
14491	NC_022109	GAA	2	6	654561	654566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352835
14492	NC_022109	CCTT	2	8	654623	654630	0 %	50 %	0 %	50 %	532352835
14493	NC_022109	TCT	2	6	654669	654674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352835
14494	NC_022109	AT	3	6	654717	654722	50 %	50 %	0 %	0 %	532352835
14495	NC_022109	TCA	2	6	654764	654769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352835
14496	NC_022109	AGA	2	6	654773	654778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352835
14497	NC_022109	A	7	7	654782	654788	100 %	0 %	0 %	0 %	532352835
14498	NC_022109	TC	3	6	654826	654831	0 %	50 %	0 %	50 %	532352835
14499	NC_022109	CTG	2	6	654844	654849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352835
14500	NC_022109	T	6	6	654857	654862	0 %	100 %	0 %	0 %	532352835

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