MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_022109	CGT	2	6	565469	565474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352746
12503	NC_022109	ATC	2	6	565533	565538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352746
12504	NC_022109	TCT	2	6	565546	565551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352746
12505	NC_022109	T	6	6	565638	565643	0 %	100 %	0 %	0 %	532352746
12506	NC_022109	ATCA	2	8	565707	565714	50 %	25 %	0 %	25 %	532352746
12507	NC_022109	CTA	2	6	565820	565825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352746
12508	NC_022109	A	6	6	565870	565875	100 %	0 %	0 %	0 %	532352746
12509	NC_022109	AGA	2	6	565903	565908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352746
12510	NC_022109	AGGTA	2	10	566045	566054	40 %	20 %	40 %	0 %	532352746
12511	NC_022109	CAA	2	6	566161	566166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352746
12512	NC_022109	CTC	2	6	566192	566197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352746
12513	NC_022109	CTT	2	6	566261	566266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352746
12514	NC_022109	CGTC	2	8	566268	566275	0 %	25 %	25 %	50 %	532352746
12515	NC_022109	CCA	2	6	566295	566300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352746
12516	NC_022109	A	6	6	566302	566307	100 %	0 %	0 %	0 %	532352746
12517	NC_022109	A	6	6	566315	566320	100 %	0 %	0 %	0 %	532352746
12518	NC_022109	ATT	2	6	566324	566329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352746
12519	NC_022109	A	6	6	566330	566335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_022109	ACAA	2	8	566341	566348	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12521	NC_022109	ATT	2	6	566356	566361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_022109	AAT	2	6	566367	566372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_022109	ATTTT	2	10	566379	566388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_022109	AAAAAT	2	12	566399	566410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_022109	A	6	6	566425	566430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_022109	TTG	2	6	566494	566499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_022109	CCT	2	6	566535	566540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352747
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12529	NC_022109	CTA	2	6	566643	566648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352747
12530	NC_022109	ATC	2	6	566700	566705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352747
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12534	NC_022109	ATCA	2	8	567030	567037	50 %	25 %	0 %	25 %	532352748
12535	NC_022109	TCC	2	6	567063	567068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352748
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12541	NC_022109	GAG	2	6	567455	567460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352748
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12543	NC_022109	ACG	2	6	567723	567728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352748
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12546	NC_022109	TCA	2	6	567847	567852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352748
12547	NC_022109	TTTC	2	8	568010	568017	0 %	75 %	0 %	25 %	532352748
12548	NC_022109	TCT	2	6	568018	568023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352748
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12551	NC_022109	CGA	2	6	568173	568178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352748
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12553	NC_022109	ATT	2	6	568196	568201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352749
12554	NC_022109	T	6	6	568228	568233	0 %	100 %	0 %	0 %	532352749
12555	NC_022109	AGA	2	6	568241	568246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352749
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12559	NC_022109	AC	3	6	568457	568462	50 %	0 %	0 %	50 %	532352749
12560	NC_022109	TCT	2	6	568479	568484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352749
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12563	NC_022109	ACAG	2	8	568781	568788	50 %	0 %	25 %	25 %	532352750
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12570	NC_022109	TAA	2	6	569106	569111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352750
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12594	NC_022109	TTGG	2	8	570319	570326	0 %	50 %	50 %	0 %	532352750
12595	NC_022109	AAG	2	6	570357	570362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352750
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12605	NC_022109	T	6	6	570973	570978	0 %	100 %	0 %	0 %	532352750
12606	NC_022109	CAT	2	6	570996	571001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352750
12607	NC_022109	TTC	2	6	571018	571023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352750
12608	NC_022109	TTA	2	6	571145	571150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352750
12609	NC_022109	GA	3	6	571185	571190	50 %	0 %	50 %	0 %	532352750
12610	NC_022109	T	6	6	571324	571329	0 %	100 %	0 %	0 %	532352750
12611	NC_022109	TTG	2	6	571373	571378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352750
12612	NC_022109	A	6	6	571455	571460	100 %	0 %	0 %	0 %	532352751
12613	NC_022109	AACCC	2	10	571468	571477	40 %	0 %	0 %	60 %	532352751
12614	NC_022109	TTC	2	6	571520	571525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352751
12615	NC_022109	TGAT	2	8	571545	571552	25 %	50 %	25 %	0 %	532352751
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12618	NC_022109	GCTT	2	8	571578	571585	0 %	50 %	25 %	25 %	532352751
12619	NC_022109	AATA	2	8	571589	571596	75 %	25 %	0 %	0 %	532352751
12620	NC_022109	AAC	2	6	571652	571657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352751
12621	NC_022109	GAA	2	6	571728	571733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352751
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12991	NC_022109	CCT	2	6	587206	587211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352768
12992	NC_022109	CT	3	6	587217	587222	0 %	50 %	0 %	50 %	532352768
12993	NC_022109	AAT	2	6	587229	587234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352768
12994	NC_022109	AAT	2	6	587274	587279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352768
12995	NC_022109	GGAA	2	8	587400	587407	50 %	0 %	50 %	0 %	532352768
12996	NC_022109	AAATA	2	10	587530	587539	80 %	20 %	0 %	0 %	532352768
12997	NC_022109	ACA	2	6	587567	587572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352768
12998	NC_022109	AAC	2	6	587595	587600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352768
12999	NC_022109	ATTC	2	8	587604	587611	25 %	50 %	0 %	25 %	532352768
13000	NC_022109	GAC	2	6	587745	587750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352768

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