MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_022109	TCCTC	2	10	475661	475670	0 %	40 %	0 %	60 %	532352674
10503	NC_022109	GGT	2	6	475856	475861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352674
10504	NC_022109	GGA	2	6	475940	475945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352674
10505	NC_022109	ACA	2	6	475959	475964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352674
10506	NC_022109	AGA	2	6	476017	476022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352674
10507	NC_022109	TAAT	2	8	476091	476098	50 %	50 %	0 %	0 %	532352674
10508	NC_022109	TGG	3	9	476116	476124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352674
10509	NC_022109	TC	3	6	476145	476150	0 %	50 %	0 %	50 %	532352674
10510	NC_022109	AGG	2	6	476233	476238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352674
10511	NC_022109	TGG	2	6	476242	476247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352674
10512	NC_022109	GT	3	6	476252	476257	0 %	50 %	50 %	0 %	532352674
10513	NC_022109	TGG	3	9	476323	476331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352674
10514	NC_022109	CA	3	6	476336	476341	50 %	0 %	0 %	50 %	532352674
10515	NC_022109	CGG	2	6	476361	476366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352674
10516	NC_022109	GCA	2	6	476384	476389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352674
10517	NC_022109	TCT	2	6	476456	476461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352674
10518	NC_022109	AGC	2	6	476485	476490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352674
10519	NC_022109	TAA	2	6	476518	476523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352674
10520	NC_022109	A	6	6	476627	476632	100 %	0 %	0 %	0 %	532352674
10521	NC_022109	CTG	2	6	476701	476706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352674
10522	NC_022109	TTG	2	6	476760	476765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352674
10523	NC_022109	AAG	2	6	476769	476774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352674
10524	NC_022109	AAC	2	6	476837	476842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352674
10525	NC_022109	CTC	2	6	476851	476856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352674
10526	NC_022109	CAA	2	6	476871	476876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352674
10527	NC_022109	CTG	2	6	476889	476894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352674
10528	NC_022109	GCT	3	9	476897	476905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352674
10529	NC_022109	AGC	2	6	476914	476919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352674
10530	NC_022109	GCA	2	6	476921	476926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352674
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10532	NC_022109	GTA	2	6	476966	476971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352674
10533	NC_022109	GGA	2	6	476972	476977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352674
10534	NC_022109	CTAT	2	8	476979	476986	25 %	50 %	0 %	25 %	532352674
10535	NC_022109	TC	3	6	477003	477008	0 %	50 %	0 %	50 %	532352674
10536	NC_022109	TCCC	2	8	477058	477065	0 %	25 %	0 %	75 %	532352674
10537	NC_022109	ATC	2	6	477067	477072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352674
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10540	NC_022109	ACA	2	6	477188	477193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352674
10541	NC_022109	GAG	2	6	477207	477212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352674
10542	NC_022109	CTT	2	6	477291	477296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352674
10543	NC_022109	GGA	2	6	477338	477343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352674
10544	NC_022109	TC	3	6	477378	477383	0 %	50 %	0 %	50 %	532352674
10545	NC_022109	A	6	6	477483	477488	100 %	0 %	0 %	0 %	532352674
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10550	NC_022109	ATG	2	6	477612	477617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352674
10551	NC_022109	AAATAC	2	12	477727	477738	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	532352674
10552	NC_022109	CTT	2	6	477812	477817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352674
10553	NC_022109	CTT	2	6	477819	477824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352674
10554	NC_022109	CAA	2	6	477844	477849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352674
10555	NC_022109	GTA	2	6	477894	477899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352674
10556	NC_022109	CT	4	8	477917	477924	0 %	50 %	0 %	50 %	532352674
10557	NC_022109	TG	3	6	477962	477967	0 %	50 %	50 %	0 %	532352674
10558	NC_022109	A	7	7	477980	477986	100 %	0 %	0 %	0 %	532352674
10559	NC_022109	TAA	2	6	478024	478029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352674
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10563	NC_022109	ATTA	2	8	478195	478202	50 %	50 %	0 %	0 %	532352674
10564	NC_022109	CTC	2	6	478293	478298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352674
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10570	NC_022109	GCA	2	6	478412	478417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352674
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10580	NC_022109	TAC	2	6	478919	478924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352674
10581	NC_022109	TGG	2	6	478998	479003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352674
10582	NC_022109	A	7	7	479021	479027	100 %	0 %	0 %	0 %	532352674
10583	NC_022109	TTCCT	2	10	479130	479139	0 %	60 %	0 %	40 %	532352674
10584	NC_022109	ACA	3	9	479180	479188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352674
10585	NC_022109	GAAA	2	8	479207	479214	75 %	0 %	25 %	0 %	532352674
10586	NC_022109	TTC	2	6	479290	479295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352674
10587	NC_022109	GAT	2	6	479384	479389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352674
10588	NC_022109	TAA	2	6	479467	479472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352674
10589	NC_022109	TCTA	2	8	479495	479502	25 %	50 %	0 %	25 %	532352674
10590	NC_022109	CTGT	2	8	479514	479521	0 %	50 %	25 %	25 %	532352674
10591	NC_022109	CT	3	6	479634	479639	0 %	50 %	0 %	50 %	532352674
10592	NC_022109	ACTAT	2	10	479646	479655	40 %	40 %	0 %	20 %	532352674
10593	NC_022109	TCT	2	6	479709	479714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352674
10594	NC_022109	TC	3	6	479789	479794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10595	NC_022109	T	9	9	479826	479834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_022109	ATC	2	6	479858	479863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_022109	CTG	2	6	479912	479917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_022109	TGC	2	6	479922	479927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352675
10599	NC_022109	CTC	2	6	479934	479939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352675
10600	NC_022109	ATG	2	6	480034	480039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352675
10601	NC_022109	ACA	2	6	480047	480052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352675
10602	NC_022109	GCT	2	6	480064	480069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352675
10603	NC_022109	TAG	4	12	480126	480137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352675
10604	NC_022109	TCTTCA	2	12	480166	480177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532352675
10605	NC_022109	TGA	2	6	480189	480194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352675
10606	NC_022109	AGA	3	9	480201	480209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352675
10607	NC_022109	AG	3	6	480238	480243	50 %	0 %	50 %	0 %	532352675
10608	NC_022109	ACTA	2	8	480246	480253	50 %	25 %	0 %	25 %	532352675
10609	NC_022109	CT	5	10	480270	480279	0 %	50 %	0 %	50 %	532352675
10610	NC_022109	TTC	2	6	480313	480318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352675
10611	NC_022109	GGA	2	6	480364	480369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352675
10612	NC_022109	GA	3	6	480380	480385	50 %	0 %	50 %	0 %	532352675
10613	NC_022109	CTA	2	6	480415	480420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352675
10614	NC_022109	TCC	2	6	480508	480513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352675
10615	NC_022109	TGG	2	6	480516	480521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352675
10616	NC_022109	GGT	3	9	480529	480537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352675
10617	NC_022109	CAA	2	6	480576	480581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352675
10618	NC_022109	TGC	2	6	480600	480605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352675
10619	NC_022109	CAG	2	6	480614	480619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352675
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10621	NC_022109	AGA	2	6	480756	480761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352675
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10991	NC_022109	AGC	2	6	497656	497661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352689
10992	NC_022109	TTC	2	6	497716	497721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352689
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