MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_022109	GAT	2	6	431061	431066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352640
9503	NC_022109	ATA	2	6	431077	431082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352640
9504	NC_022109	TGA	2	6	431148	431153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352640
9505	NC_022109	A	6	6	431163	431168	100 %	0 %	0 %	0 %	532352640
9506	NC_022109	AAT	2	6	431201	431206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352640
9507	NC_022109	CCTTC	2	10	431230	431239	0 %	40 %	0 %	60 %	532352640
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9509	NC_022109	ATTCC	2	10	431263	431272	20 %	40 %	0 %	40 %	532352640
9510	NC_022109	TGT	2	6	431277	431282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352640
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9521	NC_022109	GCA	2	6	431751	431756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352640
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9533	NC_022109	A	6	6	432285	432290	100 %	0 %	0 %	0 %	532352640
9534	NC_022109	CAT	2	6	432299	432304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352640
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9599	NC_022109	ACTC	2	8	435376	435383	25 %	25 %	0 %	50 %	532352642
9600	NC_022109	A	8	8	435429	435436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9609	NC_022109	GCA	2	6	435805	435810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352643
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9614	NC_022109	T	7	7	436269	436275	0 %	100 %	0 %	0 %	532352643
9615	NC_022109	TCT	2	6	436300	436305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352643
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9617	NC_022109	AGAAA	2	10	436343	436352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9618	NC_022109	A	7	7	436371	436377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9619	NC_022109	CTCTT	2	10	436382	436391	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9620	NC_022109	GAAGA	2	10	436392	436401	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9621	NC_022109	ATG	2	6	436411	436416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9999	NC_022109	CTC	2	6	453120	453125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352657
10000	NC_022109	TGC	2	6	453196	453201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352657

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