MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022109	GCTTC	2	10	364173	364182	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8002	NC_022109	TAGT	2	8	364211	364218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_022109	TA	3	6	364243	364248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_022109	AGTAG	2	10	364250	364259	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_022109	TTC	2	6	364293	364298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352588
8006	NC_022109	GC	3	6	364307	364312	0 %	0 %	50 %	50 %	532352588
8007	NC_022109	TTC	2	6	364323	364328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352588
8008	NC_022109	CCGC	2	8	364387	364394	0 %	0 %	25 %	75 %	532352588
8009	NC_022109	TAT	2	6	364602	364607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352588
8010	NC_022109	ACA	2	6	364683	364688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352588
8011	NC_022109	TTAT	2	8	364751	364758	25 %	75 %	0 %	0 %	532352588
8012	NC_022109	CTC	2	6	364763	364768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352588
8013	NC_022109	TAT	2	6	364782	364787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352588
8014	NC_022109	T	6	6	364794	364799	0 %	100 %	0 %	0 %	532352588
8015	NC_022109	AT	3	6	364857	364862	50 %	50 %	0 %	0 %	532352588
8016	NC_022109	CAT	2	6	364911	364916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352588
8017	NC_022109	CGC	2	6	364954	364959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352588
8018	NC_022109	GAA	2	6	365047	365052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352588
8019	NC_022109	AGT	2	6	365085	365090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352588
8020	NC_022109	GCTCA	2	10	365116	365125	20 %	20 %	20 %	40 %	532352588
8021	NC_022109	CTCTT	2	10	365236	365245	0 %	60 %	0 %	40 %	532352589
8022	NC_022109	ACAA	2	8	365275	365282	75 %	0 %	0 %	25 %	532352589
8023	NC_022109	T	8	8	365403	365410	0 %	100 %	0 %	0 %	532352589
8024	NC_022109	T	6	6	365511	365516	0 %	100 %	0 %	0 %	532352589
8025	NC_022109	GGA	2	6	365556	365561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352589
8026	NC_022109	TCC	2	6	365652	365657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_022109	ACT	2	6	365668	365673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_022109	CGA	2	6	365683	365688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_022109	GC	3	6	365772	365777	0 %	0 %	50 %	50 %	532353147
8030	NC_022109	TGT	2	6	365784	365789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353147
8031	NC_022109	GAA	2	6	365825	365830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353147
8032	NC_022109	TAT	2	6	365867	365872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353147
8033	NC_022109	ACG	2	6	365876	365881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353147
8034	NC_022109	TTG	2	6	365926	365931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353147
8035	NC_022109	GCA	2	6	366049	366054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353147
8036	NC_022109	TGT	2	6	366055	366060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353147
8037	NC_022109	TC	3	6	366076	366081	0 %	50 %	0 %	50 %	532353147
8038	NC_022109	ATC	2	6	366084	366089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353147
8039	NC_022109	TCT	2	6	366139	366144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353147
8040	NC_022109	TA	3	6	366146	366151	50 %	50 %	0 %	0 %	532353147
8041	NC_022109	AGGC	2	8	366200	366207	25 %	0 %	50 %	25 %	532353147
8042	NC_022109	TCCA	2	8	366256	366263	25 %	25 %	0 %	50 %	532353147
8043	NC_022109	A	7	7	366263	366269	100 %	0 %	0 %	0 %	532353147
8044	NC_022109	AGC	2	6	366307	366312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353147
8045	NC_022109	CTC	2	6	366353	366358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353147
8046	NC_022109	AAG	2	6	366365	366370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353147
8047	NC_022109	AGT	2	6	366465	366470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353147
8048	NC_022109	CAA	2	6	366471	366476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353147
8049	NC_022109	AGGGA	2	10	366501	366510	40 %	0 %	60 %	0 %	532353147
8050	NC_022109	GCT	2	6	366514	366519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353147
8051	NC_022109	AGA	2	6	366525	366530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353147
8052	NC_022109	TCT	2	6	366580	366585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353147
8053	NC_022109	TAC	2	6	366591	366596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353147
8054	NC_022109	TAG	2	6	366635	366640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353147
8055	NC_022109	GCAT	2	8	366711	366718	25 %	25 %	25 %	25 %	532353147
8056	NC_022109	TGAG	2	8	366744	366751	25 %	25 %	50 %	0 %	532353147
8057	NC_022109	AC	3	6	366772	366777	50 %	0 %	0 %	50 %	532353147
8058	NC_022109	A	6	6	366873	366878	100 %	0 %	0 %	0 %	532353147
8059	NC_022109	CAA	2	6	366893	366898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353147
8060	NC_022109	CT	4	8	366944	366951	0 %	50 %	0 %	50 %	532353147
8061	NC_022109	CAA	2	6	367032	367037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353147
8062	NC_022109	TGA	2	6	367054	367059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353147
8063	NC_022109	CCA	2	6	367120	367125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353147
8064	NC_022109	TGA	2	6	367150	367155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353147
8065	NC_022109	CT	3	6	367177	367182	0 %	50 %	0 %	50 %	532353147
8066	NC_022109	CA	3	6	367186	367191	50 %	0 %	0 %	50 %	532353147
8067	NC_022109	CAA	2	6	367232	367237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_022109	GTC	3	9	367251	367259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_022109	ATC	3	9	367260	367268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_022109	GCA	2	6	367306	367311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_022109	C	8	8	367355	367362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8072	NC_022109	TCT	2	6	367433	367438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353148
8073	NC_022109	GAA	2	6	367442	367447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353148
8074	NC_022109	TCG	2	6	367478	367483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353148
8075	NC_022109	TATG	2	8	367485	367492	25 %	50 %	25 %	0 %	532353148
8076	NC_022109	GT	3	6	367503	367508	0 %	50 %	50 %	0 %	532353148
8077	NC_022109	TAT	2	6	367515	367520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353148
8078	NC_022109	TCT	2	6	367541	367546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353148
8079	NC_022109	C	6	6	367558	367563	0 %	0 %	0 %	100 %	532353148
8080	NC_022109	AAC	2	6	367580	367585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_022109	A	6	6	367630	367635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_022109	A	8	8	367650	367657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_022109	ATC	2	6	367695	367700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_022109	TCTCT	2	10	367717	367726	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8085	NC_022109	CCT	2	6	367733	367738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_022109	CAT	2	6	367786	367791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352590
8087	NC_022109	GA	3	6	367794	367799	50 %	0 %	50 %	0 %	532352590
8088	NC_022109	AAC	2	6	367801	367806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352590
8089	NC_022109	AACA	2	8	367830	367837	75 %	0 %	0 %	25 %	532352590
8090	NC_022109	CTG	3	9	367849	367857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352590
8091	NC_022109	GT	3	6	367902	367907	0 %	50 %	50 %	0 %	532352590
8092	NC_022109	AT	3	6	367910	367915	50 %	50 %	0 %	0 %	532352590
8093	NC_022109	AAT	2	6	367919	367924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352590
8094	NC_022109	CTT	2	6	367951	367956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_022109	CAA	2	6	368017	368022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_022109	AAG	2	6	368074	368079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_022109	AACAA	2	10	368100	368109	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8098	NC_022109	GAA	2	6	368110	368115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_022109	GCTT	2	8	368159	368166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8100	NC_022109	ACA	2	6	368278	368283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_022109	TGA	2	6	368303	368308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_022109	TCA	2	6	368357	368362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_022109	TAA	2	6	368363	368368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_022109	A	6	6	368371	368376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_022109	AAAAC	2	10	368422	368431	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8106	NC_022109	TAAA	2	8	368437	368444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_022109	CTT	2	6	368505	368510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_022109	A	7	7	368683	368689	100 %	0 %	0 %	0 %	532352591
8109	NC_022109	AGA	2	6	368724	368729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352591
8110	NC_022109	CTT	2	6	368765	368770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352591
8111	NC_022109	CTC	2	6	368789	368794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352591
8112	NC_022109	ATT	2	6	368808	368813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352591
8113	NC_022109	GA	3	6	368825	368830	50 %	0 %	50 %	0 %	532352591
8114	NC_022109	ACA	2	6	368881	368886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352591
8115	NC_022109	TGC	2	6	368913	368918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352591
8116	NC_022109	ACA	2	6	368947	368952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352591
8117	NC_022109	GAATA	2	10	368991	369000	60 %	20 %	20 %	0 %	532352591
8118	NC_022109	GTC	2	6	369034	369039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352591
8119	NC_022109	TCT	2	6	369058	369063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352591
8120	NC_022109	TCAC	2	8	369142	369149	25 %	25 %	0 %	50 %	532352591
8121	NC_022109	CAT	2	6	369218	369223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352591
8122	NC_022109	A	6	6	369300	369305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_022109	AAG	2	6	369313	369318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_022109	AAAT	2	8	369356	369363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_022109	CCTT	2	8	369378	369385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_022109	ATCT	2	8	369411	369418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_022109	TCC	2	6	369645	369650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352592
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8378	NC_022109	CT	4	8	381270	381277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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