MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_022109	ACTG	2	8	340740	340747	25 %	25 %	25 %	25 %	532353145
7503	NC_022109	CAT	2	6	340772	340777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353145
7504	NC_022109	CAG	2	6	340779	340784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353145
7505	NC_022109	TGA	2	6	340815	340820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353145
7506	NC_022109	CAGA	2	8	340829	340836	50 %	0 %	25 %	25 %	532353145
7507	NC_022109	AAT	2	6	340839	340844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353145
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7509	NC_022109	AT	3	6	340975	340980	50 %	50 %	0 %	0 %	532353145
7510	NC_022109	T	7	7	341004	341010	0 %	100 %	0 %	0 %	532353145
7511	NC_022109	A	7	7	341012	341018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_022109	T	6	6	341069	341074	0 %	100 %	0 %	0 %	532352570
7513	NC_022109	CCA	3	9	341094	341102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352570
7514	NC_022109	ATA	2	6	341199	341204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352570
7515	NC_022109	ATA	2	6	341414	341419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352570
7516	NC_022109	CCA	2	6	341422	341427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352570
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7518	NC_022109	ATAG	2	8	341486	341493	50 %	25 %	25 %	0 %	532352570
7519	NC_022109	AT	3	6	341502	341507	50 %	50 %	0 %	0 %	532352570
7520	NC_022109	AGA	2	6	341537	341542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352570
7521	NC_022109	TAC	2	6	341585	341590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352570
7522	NC_022109	AAC	2	6	341642	341647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352570
7523	NC_022109	TA	3	6	341653	341658	50 %	50 %	0 %	0 %	532352570
7524	NC_022109	CTA	2	6	341670	341675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352570
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7530	NC_022109	TGT	2	6	341864	341869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352570
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7533	NC_022109	A	7	7	341991	341997	100 %	0 %	0 %	0 %	532352570
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7537	NC_022109	CTTCA	2	10	342221	342230	20 %	40 %	0 %	40 %	532352570
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7542	NC_022109	CTC	3	9	342425	342433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352570
7543	NC_022109	TCT	2	6	342555	342560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352570
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7545	NC_022109	CTG	2	6	342802	342807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352570
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7548	NC_022109	AATA	2	8	342956	342963	75 %	25 %	0 %	0 %	532352570
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7557	NC_022109	AAGT	2	8	343284	343291	50 %	25 %	25 %	0 %	532352571
7558	NC_022109	AG	3	6	343389	343394	50 %	0 %	50 %	0 %	532352571
7559	NC_022109	CTTT	2	8	343506	343513	0 %	75 %	0 %	25 %	532352571
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7596	NC_022109	CA	3	6	345883	345888	50 %	0 %	0 %	50 %	532352573
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7621	NC_022109	A	7	7	347329	347335	100 %	0 %	0 %	0 %	532352574
7622	NC_022109	CGC	2	6	347336	347341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352574
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