MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 22946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022109	TACT	2	8	295705	295712	25 %	50 %	0 %	25 %	532352531
6502	NC_022109	CTTT	2	8	295829	295836	0 %	75 %	0 %	25 %	532352531
6503	NC_022109	AAAATA	2	12	295855	295866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	532352531
6504	NC_022109	AAAC	2	8	295876	295883	75 %	0 %	0 %	25 %	532352531
6505	NC_022109	ACT	2	6	295918	295923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352531
6506	NC_022109	ACT	2	6	296016	296021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352531
6507	NC_022109	AAG	2	6	296077	296082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352531
6508	NC_022109	AGC	2	6	296099	296104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352531
6509	NC_022109	AATT	2	8	296118	296125	50 %	50 %	0 %	0 %	532352531
6510	NC_022109	A	6	6	296142	296147	100 %	0 %	0 %	0 %	532352531
6511	NC_022109	GTT	2	6	296152	296157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352531
6512	NC_022109	CAA	2	6	296171	296176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352531
6513	NC_022109	CTA	2	6	296177	296182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352531
6514	NC_022109	AG	3	6	296226	296231	50 %	0 %	50 %	0 %	532352531
6515	NC_022109	CCT	2	6	296266	296271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352531
6516	NC_022109	CAA	2	6	296327	296332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352531
6517	NC_022109	TAT	2	6	296333	296338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352531
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6519	NC_022109	CTCC	2	8	296393	296400	0 %	25 %	0 %	75 %	532352531
6520	NC_022109	AGA	2	6	296413	296418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352531
6521	NC_022109	A	6	6	296456	296461	100 %	0 %	0 %	0 %	532352531
6522	NC_022109	CTT	2	6	296529	296534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352531
6523	NC_022109	AGA	2	6	296554	296559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352531
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6527	NC_022109	ACA	2	6	296873	296878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352532
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6530	NC_022109	ATGC	2	8	297136	297143	25 %	25 %	25 %	25 %	532352532
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6533	NC_022109	ATCT	2	8	297375	297382	25 %	50 %	0 %	25 %	532352532
6534	NC_022109	GAA	3	9	297410	297418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352532
6535	NC_022109	T	7	7	297437	297443	0 %	100 %	0 %	0 %	532352532
6536	NC_022109	T	6	6	297462	297467	0 %	100 %	0 %	0 %	532352532
6537	NC_022109	AGT	2	6	297497	297502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352532
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6540	NC_022109	ACAA	2	8	297548	297555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_022109	AAC	2	6	297564	297569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_022109	TG	3	6	297674	297679	0 %	50 %	50 %	0 %	532352533
6543	NC_022109	A	6	6	297695	297700	100 %	0 %	0 %	0 %	532352533
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6552	NC_022109	ACCACT	2	12	298210	298221	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	532352533
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6574	NC_022109	AAAGC	2	10	298911	298920	60 %	0 %	20 %	20 %	532352533
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6592	NC_022109	GAAA	2	8	299612	299619	75 %	0 %	25 %	0 %	532352535
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6598	NC_022109	CTTA	2	8	299884	299891	25 %	50 %	0 %	25 %	532352535
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6623	NC_022109	GTTA	2	8	301010	301017	25 %	50 %	25 %	0 %	532352536
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6642	NC_022109	TAAA	2	8	301917	301924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6643	NC_022109	ATTCC	2	10	301938	301947	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6738	NC_022109	TAT	2	6	306370	306375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6739	NC_022109	TAA	2	6	306383	306388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6740	NC_022109	CTT	2	6	306426	306431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6742	NC_022109	AGG	3	9	306505	306513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6743	NC_022109	GCA	2	6	306578	306583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352542
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6746	NC_022109	A	6	6	306680	306685	100 %	0 %	0 %	0 %	532352542
6747	NC_022109	A	6	6	306739	306744	100 %	0 %	0 %	0 %	532352542
6748	NC_022109	GTT	2	6	306799	306804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352542
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