MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022108	CTG	2	6	136416	136421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_022108	CAAT	2	8	136444	136451	50 %	25 %	0 %	25 %	532351474
3003	NC_022108	AAGC	2	8	136498	136505	50 %	0 %	25 %	25 %	532351474
3004	NC_022108	TTTG	2	8	136524	136531	0 %	75 %	25 %	0 %	532351474
3005	NC_022108	GCG	2	6	136567	136572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351474
3006	NC_022108	TGC	2	6	136590	136595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351474
3007	NC_022108	TTC	2	6	136598	136603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351474
3008	NC_022108	CTG	2	6	136609	136614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351474
3009	NC_022108	CAG	2	6	136622	136627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351474
3010	NC_022108	TTTG	2	8	136639	136646	0 %	75 %	25 %	0 %	532351474
3011	NC_022108	CAG	2	6	136676	136681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351474
3012	NC_022108	GAA	2	6	136711	136716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351474
3013	NC_022108	GCT	2	6	136726	136731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351474
3014	NC_022108	CAG	2	6	136744	136749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351474
3015	NC_022108	AGG	2	6	136755	136760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351474
3016	NC_022108	GAG	2	6	136771	136776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351474
3017	NC_022108	CAC	2	6	136784	136789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351474
3018	NC_022108	GAT	2	6	136867	136872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351474
3019	NC_022108	ATAA	2	8	136873	136880	75 %	25 %	0 %	0 %	532351474
3020	NC_022108	ACA	2	6	136883	136888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351474
3021	NC_022108	AGG	2	6	136944	136949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_022108	CCT	2	6	136954	136959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_022108	T	9	9	136961	136969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_022108	TTGCA	2	10	137057	137066	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_022108	GAG	2	6	137121	137126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351475
3026	NC_022108	TC	3	6	137131	137136	0 %	50 %	0 %	50 %	532351475
3027	NC_022108	CT	3	6	137160	137165	0 %	50 %	0 %	50 %	532351475
3028	NC_022108	TTC	2	6	137258	137263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351475
3029	NC_022108	CTT	2	6	137308	137313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351475
3030	NC_022108	CT	3	6	137342	137347	0 %	50 %	0 %	50 %	532351475
3031	NC_022108	A	6	6	137392	137397	100 %	0 %	0 %	0 %	532351475
3032	NC_022108	TCT	2	6	137409	137414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351475
3033	NC_022108	CAG	2	6	137503	137508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351475
3034	NC_022108	AG	3	6	137507	137512	50 %	0 %	50 %	0 %	532351475
3035	NC_022108	GAA	2	6	137548	137553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351475
3036	NC_022108	T	6	6	137555	137560	0 %	100 %	0 %	0 %	532351475
3037	NC_022108	AATT	2	8	137581	137588	50 %	50 %	0 %	0 %	532351475
3038	NC_022108	AAG	2	6	137693	137698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351475
3039	NC_022108	CAA	2	6	137731	137736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351475
3040	NC_022108	TGT	2	6	137762	137767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351475
3041	NC_022108	GCT	2	6	137793	137798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351475
3042	NC_022108	AAG	2	6	137821	137826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351475
3043	NC_022108	GGA	2	6	137871	137876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351475
3044	NC_022108	TTG	2	6	138011	138016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352209
3045	NC_022108	ATGT	2	8	138161	138168	25 %	50 %	25 %	0 %	532352209
3046	NC_022108	AGG	2	6	138178	138183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352209
3047	NC_022108	AAT	2	6	138211	138216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352209
3048	NC_022108	CTT	2	6	138234	138239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352209
3049	NC_022108	AG	3	6	138245	138250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_022108	GA	3	6	138308	138313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_022108	A	6	6	138324	138329	100 %	0 %	0 %	0 %	532351476
3052	NC_022108	TAT	2	6	138353	138358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351476
3053	NC_022108	AGA	2	6	138401	138406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351476
3054	NC_022108	ATGG	2	8	138438	138445	25 %	25 %	50 %	0 %	532351476
3055	NC_022108	GTT	2	6	138480	138485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351476
3056	NC_022108	TC	3	6	138673	138678	0 %	50 %	0 %	50 %	532351476
3057	NC_022108	AGAA	2	8	138788	138795	75 %	0 %	25 %	0 %	532351476
3058	NC_022108	GAAG	2	8	138834	138841	50 %	0 %	50 %	0 %	532351476
3059	NC_022108	TTGA	2	8	138846	138853	25 %	50 %	25 %	0 %	532351476
3060	NC_022108	GGT	2	6	138861	138866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351476
3061	NC_022108	CCT	2	6	138925	138930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351476
3062	NC_022108	T	7	7	138932	138938	0 %	100 %	0 %	0 %	532351476
3063	NC_022108	GAAA	2	8	138959	138966	75 %	0 %	25 %	0 %	532351476
3064	NC_022108	GAA	2	6	138987	138992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351476
3065	NC_022108	AGT	2	6	139056	139061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351477
3066	NC_022108	TTA	2	6	139100	139105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351477
3067	NC_022108	GA	3	6	139144	139149	50 %	0 %	50 %	0 %	532351477
3068	NC_022108	AAG	2	6	139175	139180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351477
3069	NC_022108	T	6	6	139352	139357	0 %	100 %	0 %	0 %	532351477
3070	NC_022108	AGG	2	6	139431	139436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351477
3071	NC_022108	A	6	6	139441	139446	100 %	0 %	0 %	0 %	532351477
3072	NC_022108	TTA	2	6	139505	139510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351477
3073	NC_022108	TAA	2	6	139608	139613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351478
3074	NC_022108	GAGTTA	2	12	139648	139659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351478
3075	NC_022108	AAGA	2	8	139730	139737	75 %	0 %	25 %	0 %	532351478
3076	NC_022108	AG	3	6	139779	139784	50 %	0 %	50 %	0 %	532351478
3077	NC_022108	GAA	2	6	139791	139796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351478
3078	NC_022108	TTA	2	6	139886	139891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351478
3079	NC_022108	GTT	2	6	139921	139926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351478
3080	NC_022108	AGA	2	6	139986	139991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351478
3081	NC_022108	TCCAG	2	10	140013	140022	20 %	20 %	20 %	40 %	532351478
3082	NC_022108	GAA	2	6	140064	140069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351478
3083	NC_022108	ATTG	2	8	140073	140080	25 %	50 %	25 %	0 %	532351478
3084	NC_022108	ATT	2	6	140107	140112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351479
3085	NC_022108	AAG	2	6	140168	140173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351479
3086	NC_022108	CTT	2	6	140185	140190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351479
3087	NC_022108	GCA	2	6	140224	140229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351479
3088	NC_022108	CCTA	2	8	140234	140241	25 %	25 %	0 %	50 %	532351479
3089	NC_022108	GCT	2	6	140260	140265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351479
3090	NC_022108	TCA	2	6	140525	140530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351479
3091	NC_022108	TAA	2	6	140634	140639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351479
3092	NC_022108	GTACA	2	10	140744	140753	40 %	20 %	20 %	20 %	532351479
3093	NC_022108	AGA	2	6	140775	140780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351479
3094	NC_022108	GAA	2	6	140959	140964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351479
3095	NC_022108	TAA	2	6	141093	141098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351479
3096	NC_022108	TAGAT	2	10	141117	141126	40 %	40 %	20 %	0 %	532351479
3097	NC_022108	TAT	2	6	141127	141132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351479
3098	NC_022108	CTCC	2	8	141133	141140	0 %	25 %	0 %	75 %	532351479
3099	NC_022108	CTG	2	6	141149	141154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351479
3100	NC_022108	CCT	2	6	141193	141198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351479
3101	NC_022108	TAT	2	6	141199	141204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351479
3102	NC_022108	TGG	2	6	141294	141299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351479
3103	NC_022108	TCA	2	6	141321	141326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351479
3104	NC_022108	TCT	2	6	141351	141356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351479
3105	NC_022108	ATTA	2	8	141370	141377	50 %	50 %	0 %	0 %	532351479
3106	NC_022108	T	8	8	141439	141446	0 %	100 %	0 %	0 %	532351479
3107	NC_022108	T	6	6	141484	141489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_022108	AAG	2	6	141493	141498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352210
3109	NC_022108	AAAAG	2	10	141529	141538	80 %	0 %	20 %	0 %	532352210
3110	NC_022108	T	6	6	141553	141558	0 %	100 %	0 %	0 %	532352210
3111	NC_022108	GCT	2	6	141589	141594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352210
3112	NC_022108	A	6	6	141605	141610	100 %	0 %	0 %	0 %	532352210
3113	NC_022108	ATC	2	6	141613	141618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_022108	A	6	6	141662	141667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_022108	CTC	2	6	141812	141817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351480
3116	NC_022108	AAAAC	2	10	142009	142018	80 %	0 %	0 %	20 %	532351480
3117	NC_022108	AGA	2	6	142163	142168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351481
3118	NC_022108	GGA	2	6	142337	142342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351481
3119	NC_022108	AGAA	2	8	142401	142408	75 %	0 %	25 %	0 %	532351481
3120	NC_022108	CTT	2	6	142438	142443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351481
3121	NC_022108	AAGA	2	8	142460	142467	75 %	0 %	25 %	0 %	532351481
3122	NC_022108	A	6	6	142472	142477	100 %	0 %	0 %	0 %	532351481
3123	NC_022108	AT	3	6	142540	142545	50 %	50 %	0 %	0 %	532351481
3124	NC_022108	CTT	2	6	142567	142572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_022108	AAG	2	6	142577	142582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_022108	AAAG	2	8	142657	142664	75 %	0 %	25 %	0 %	532351482
3127	NC_022108	T	6	6	142701	142706	0 %	100 %	0 %	0 %	532351482
3128	NC_022108	GCA	2	6	142709	142714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351482
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3130	NC_022108	TCA	2	6	142740	142745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351482
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3132	NC_022108	TCC	2	6	142792	142797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351482
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3134	NC_022108	AGT	2	6	142889	142894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351482
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3154	NC_022108	TTG	2	6	143610	143615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351483
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3170	NC_022108	T	7	7	144390	144396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3246	NC_022108	AG	3	6	148356	148361	50 %	0 %	50 %	0 %	532351486
3247	NC_022108	AGA	2	6	148395	148400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351486
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3250	NC_022108	TGA	2	6	148510	148515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351486
3251	NC_022108	TGA	2	6	148532	148537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351486
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3253	NC_022108	AGT	2	6	148705	148710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351486
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3255	NC_022108	AGAA	2	8	148821	148828	75 %	0 %	25 %	0 %	532351486
3256	NC_022108	GA	4	8	148870	148877	50 %	0 %	50 %	0 %	532351486
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3259	NC_022108	GAACC	2	10	149035	149044	40 %	0 %	20 %	40 %	532351486
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3279	NC_022108	GA	3	6	149794	149799	50 %	0 %	50 %	0 %	532351487
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3282	NC_022108	TGG	2	6	149851	149856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351487
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