MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_022108	TTA	2	6	1000365	1000370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352173
22002	NC_022108	GAG	2	6	1000422	1000427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352173
22003	NC_022108	TTC	2	6	1000472	1000477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352173
22004	NC_022108	TGA	2	6	1000484	1000489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352173
22005	NC_022108	A	6	6	1000557	1000562	100 %	0 %	0 %	0 %	532352173
22006	NC_022108	CTT	2	6	1000577	1000582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352173
22007	NC_022108	AGA	3	9	1000619	1000627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352173
22008	NC_022108	TAT	2	6	1000661	1000666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352173
22009	NC_022108	AGA	3	9	1000697	1000705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352173
22010	NC_022108	AGA	2	6	1000718	1000723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352173
22011	NC_022108	TGG	2	6	1000784	1000789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352173
22012	NC_022108	CTT	2	6	1000833	1000838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352173
22013	NC_022108	CAA	2	6	1000962	1000967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352174
22014	NC_022108	CAA	2	6	1000974	1000979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352174
22015	NC_022108	AGGTT	2	10	1001038	1001047	20 %	40 %	40 %	0 %	532352174
22016	NC_022108	AGC	2	6	1001061	1001066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352174
22017	NC_022108	CTTTT	2	10	1001096	1001105	0 %	80 %	0 %	20 %	532352174
22018	NC_022108	ATC	2	6	1001125	1001130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352174
22019	NC_022108	CAT	2	6	1001213	1001218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352174
22020	NC_022108	GA	4	8	1001333	1001340	50 %	0 %	50 %	0 %	532352174
22021	NC_022108	CAG	2	6	1001372	1001377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352174
22022	NC_022108	T	6	6	1001541	1001546	0 %	100 %	0 %	0 %	532352174
22023	NC_022108	AGA	2	6	1001631	1001636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352174
22024	NC_022108	ATA	2	6	1001652	1001657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352174
22025	NC_022108	CCA	2	6	1001702	1001707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352174
22026	NC_022108	AAT	2	6	1001728	1001733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352174
22027	NC_022108	AG	3	6	1001803	1001808	50 %	0 %	50 %	0 %	532352175
22028	NC_022108	CAAG	2	8	1001815	1001822	50 %	0 %	25 %	25 %	532352175
22029	NC_022108	TCC	2	6	1001863	1001868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352175
22030	NC_022108	GAA	2	6	1001928	1001933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352175
22031	NC_022108	GAAG	2	8	1001974	1001981	50 %	0 %	50 %	0 %	532352175
22032	NC_022108	TCA	2	6	1001987	1001992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352175
22033	NC_022108	CCT	2	6	1002022	1002027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352175
22034	NC_022108	TAG	2	6	1002093	1002098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352175
22035	NC_022108	ATG	2	6	1002133	1002138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352175
22036	NC_022108	T	6	6	1002147	1002152	0 %	100 %	0 %	0 %	532352175
22037	NC_022108	GAAA	2	8	1002153	1002160	75 %	0 %	25 %	0 %	532352175
22038	NC_022108	T	6	6	1002163	1002168	0 %	100 %	0 %	0 %	532352175
22039	NC_022108	AAT	2	6	1002169	1002174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352175
22040	NC_022108	AG	3	6	1002190	1002195	50 %	0 %	50 %	0 %	532352175
22041	NC_022108	A	6	6	1002218	1002223	100 %	0 %	0 %	0 %	532352175
22042	NC_022108	TGT	2	6	1002284	1002289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352175
22043	NC_022108	GAT	2	6	1002355	1002360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352175
22044	NC_022108	AGCC	2	8	1002369	1002376	25 %	0 %	25 %	50 %	532352175
22045	NC_022108	GAA	2	6	1002390	1002395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352175
22046	NC_022108	TCA	3	9	1002411	1002419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352175
22047	NC_022108	TGC	2	6	1002464	1002469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352176
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22050	NC_022108	ATA	2	6	1002687	1002692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352176
22051	NC_022108	AGC	2	6	1002746	1002751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352176
22052	NC_022108	CTT	2	6	1002758	1002763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352176
22053	NC_022108	CTG	2	6	1002816	1002821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352176
22054	NC_022108	AAAAT	2	10	1002825	1002834	80 %	20 %	0 %	0 %	532352176
22055	NC_022108	A	8	8	1002851	1002858	100 %	0 %	0 %	0 %	532352176
22056	NC_022108	TGG	2	6	1002890	1002895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352176
22057	NC_022108	TA	3	6	1002897	1002902	50 %	50 %	0 %	0 %	532352176
22058	NC_022108	AAG	2	6	1002907	1002912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352176
22059	NC_022108	CA	3	6	1002955	1002960	50 %	0 %	0 %	50 %	532352176
22060	NC_022108	TAA	2	6	1002994	1002999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352176
22061	NC_022108	GAA	2	6	1003069	1003074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22062	NC_022108	CAA	2	6	1003215	1003220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22063	NC_022108	T	6	6	1003395	1003400	0 %	100 %	0 %	0 %	532352177
22064	NC_022108	AGAA	2	8	1003446	1003453	75 %	0 %	25 %	0 %	532352177
22065	NC_022108	AAC	2	6	1003454	1003459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352177
22066	NC_022108	ATG	2	6	1003593	1003598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
22067	NC_022108	T	6	6	1003699	1003704	0 %	100 %	0 %	0 %	532352177
22068	NC_022108	CTGC	2	8	1003741	1003748	0 %	25 %	25 %	50 %	532352177
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22073	NC_022108	A	6	6	1003896	1003901	100 %	0 %	0 %	0 %	532352177
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22075	NC_022108	GAGTA	2	10	1003959	1003968	40 %	20 %	40 %	0 %	532352177
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22078	NC_022108	T	6	6	1004090	1004095	0 %	100 %	0 %	0 %	532352177
22079	NC_022108	A	8	8	1004107	1004114	100 %	0 %	0 %	0 %	532352177
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22091	NC_022108	TAA	2	6	1004819	1004824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352177
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22093	NC_022108	A	6	6	1004843	1004848	100 %	0 %	0 %	0 %	532352177
22094	NC_022108	GAAG	2	8	1004858	1004865	50 %	0 %	50 %	0 %	532352177
22095	NC_022108	AG	3	6	1004878	1004883	50 %	0 %	50 %	0 %	532352177
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22100	NC_022108	TGA	2	6	1005132	1005137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
22101	NC_022108	ATG	2	6	1005299	1005304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
22102	NC_022108	A	7	7	1005378	1005384	100 %	0 %	0 %	0 %	532352282
22103	NC_022108	GAA	2	6	1005431	1005436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352282
22104	NC_022108	GATG	2	8	1005444	1005451	25 %	25 %	50 %	0 %	532352282
22105	NC_022108	GAG	2	6	1005625	1005630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352282
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22108	NC_022108	ATG	2	6	1005687	1005692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
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22110	NC_022108	TTTC	2	8	1005802	1005809	0 %	75 %	0 %	25 %	532352282
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22113	NC_022108	T	6	6	1005918	1005923	0 %	100 %	0 %	0 %	532352282
22114	NC_022108	CAGT	2	8	1005986	1005993	25 %	25 %	25 %	25 %	532352282
22115	NC_022108	TTA	2	6	1005998	1006003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352282
22116	NC_022108	ATT	2	6	1006029	1006034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352282
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22118	NC_022108	AAG	2	6	1006182	1006187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352282
22119	NC_022108	TGA	2	6	1006225	1006230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
22120	NC_022108	CGCC	2	8	1006295	1006302	0 %	0 %	25 %	75 %	532352282
22121	NC_022108	CGGGG	2	10	1006318	1006327	0 %	0 %	80 %	20 %	532352282
22122	NC_022108	CT	3	6	1006373	1006378	0 %	50 %	0 %	50 %	532352282
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22472	NC_022108	ATC	2	6	1021336	1021341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352187
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22475	NC_022108	TCA	2	6	1021424	1021429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352187
22476	NC_022108	TGTT	2	8	1021603	1021610	0 %	75 %	25 %	0 %	532352187
22477	NC_022108	CAG	2	6	1021621	1021626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352187
22478	NC_022108	T	6	6	1021698	1021703	0 %	100 %	0 %	0 %	532352187
22479	NC_022108	TCC	3	9	1021706	1021714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352187
22480	NC_022108	GTT	2	6	1021728	1021733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352187
22481	NC_022108	GAT	2	6	1021737	1021742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352187
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22483	NC_022108	AGGA	2	8	1021843	1021850	50 %	0 %	50 %	0 %	532352187
22484	NC_022108	AG	3	6	1021866	1021871	50 %	0 %	50 %	0 %	532352187
22485	NC_022108	AGCT	2	8	1021882	1021889	25 %	25 %	25 %	25 %	532352187
22486	NC_022108	CT	3	6	1021888	1021893	0 %	50 %	0 %	50 %	532352187
22487	NC_022108	TGAA	2	8	1021951	1021958	50 %	25 %	25 %	0 %	532352187
22488	NC_022108	AAC	2	6	1021973	1021978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352187
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