MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_022108	GAA	2	6	954539	954544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
21002	NC_022108	TGTCT	2	10	954550	954559	0 %	60 %	20 %	20 %	532352134
21003	NC_022108	ATT	2	6	954615	954620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352134
21004	NC_022108	TG	3	6	954628	954633	0 %	50 %	50 %	0 %	532352134
21005	NC_022108	TGG	2	6	954646	954651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352134
21006	NC_022108	CTG	2	6	954720	954725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352134
21007	NC_022108	GCT	2	6	954773	954778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352134
21008	NC_022108	GTT	2	6	954833	954838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352134
21009	NC_022108	TA	3	6	954846	954851	50 %	50 %	0 %	0 %	532352134
21010	NC_022108	TTC	2	6	954875	954880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
21011	NC_022108	CTT	2	6	954954	954959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
21012	NC_022108	GAG	2	6	954969	954974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
21013	NC_022108	AGG	2	6	955258	955263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
21014	NC_022108	GGGA	2	8	955296	955303	25 %	0 %	75 %	0 %	532352134
21015	NC_022108	ATA	2	6	955350	955355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352134
21016	NC_022108	GGA	2	6	955406	955411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
21017	NC_022108	T	8	8	955534	955541	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
21018	NC_022108	T	8	8	955577	955584	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
21019	NC_022108	GAG	2	6	955604	955609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
21020	NC_022108	T	8	8	955627	955634	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
21021	NC_022108	CAA	2	6	955642	955647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21022	NC_022108	T	6	6	955676	955681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21023	NC_022108	ACT	2	6	955721	955726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21024	NC_022108	AAT	2	6	955733	955738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21025	NC_022108	TGT	2	6	955858	955863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352278
21026	NC_022108	CTT	2	6	955880	955885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352278
21027	NC_022108	AGG	2	6	955897	955902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352135
21028	NC_022108	GGATTA	2	12	955919	955930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352135
21029	NC_022108	TGC	2	6	955945	955950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352135
21030	NC_022108	TGC	2	6	955973	955978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352135
21031	NC_022108	TGG	2	6	956018	956023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352135
21032	NC_022108	GAT	2	6	956144	956149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352135
21033	NC_022108	GTT	2	6	956189	956194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352135
21034	NC_022108	GAA	2	6	956195	956200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352135
21035	NC_022108	A	6	6	956253	956258	100 %	0 %	0 %	0 %	532352135
21036	NC_022108	A	6	6	956276	956281	100 %	0 %	0 %	0 %	532352135
21037	NC_022108	AAC	2	6	956320	956325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352135
21038	NC_022108	GCA	2	6	956342	956347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352135
21039	NC_022108	ACA	2	6	956350	956355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352135
21040	NC_022108	AGA	2	6	956359	956364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352135
21041	NC_022108	GAA	2	6	956405	956410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352135
21042	NC_022108	TGA	2	6	956434	956439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352135
21043	NC_022108	GAAAAA	2	12	956465	956476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532352135
21044	NC_022108	AGA	3	9	956511	956519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352135
21045	NC_022108	GTT	2	6	956534	956539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352135
21046	NC_022108	T	7	7	956538	956544	0 %	100 %	0 %	0 %	532352135
21047	NC_022108	GTA	2	6	956561	956566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352135
21048	NC_022108	T	7	7	956580	956586	0 %	100 %	0 %	0 %	532352135
21049	NC_022108	CGA	2	6	956601	956606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352135
21050	NC_022108	TCA	2	6	956610	956615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352135
21051	NC_022108	CAG	2	6	956663	956668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352135
21052	NC_022108	GT	3	6	956692	956697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_022108	TTC	2	6	956730	956735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21054	NC_022108	T	6	6	956763	956768	0 %	100 %	0 %	0 %	532352136
21055	NC_022108	GGA	2	6	956791	956796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352136
21056	NC_022108	AGTA	2	8	956804	956811	50 %	25 %	25 %	0 %	532352136
21057	NC_022108	ATTT	2	8	956860	956867	25 %	75 %	0 %	0 %	532352136
21058	NC_022108	T	8	8	956865	956872	0 %	100 %	0 %	0 %	532352136
21059	NC_022108	T	7	7	956920	956926	0 %	100 %	0 %	0 %	532352136
21060	NC_022108	GGC	2	6	956982	956987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352136
21061	NC_022108	TGC	2	6	956988	956993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352136
21062	NC_022108	CTT	2	6	957061	957066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352136
21063	NC_022108	T	6	6	957088	957093	0 %	100 %	0 %	0 %	532352136
21064	NC_022108	CAAT	2	8	957096	957103	50 %	25 %	0 %	25 %	532352136
21065	NC_022108	AGA	2	6	957139	957144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352137
21066	NC_022108	AAAG	2	8	957224	957231	75 %	0 %	25 %	0 %	532352137
21067	NC_022108	A	8	8	957283	957290	100 %	0 %	0 %	0 %	532352137
21068	NC_022108	ATT	2	6	957312	957317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352137
21069	NC_022108	CTT	2	6	957324	957329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352137
21070	NC_022108	TTTG	2	8	957358	957365	0 %	75 %	25 %	0 %	532352137
21071	NC_022108	AAG	2	6	957418	957423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352137
21072	NC_022108	AGTT	2	8	957482	957489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21073	NC_022108	TTA	2	6	957636	957641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21074	NC_022108	GTT	2	6	957669	957674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21075	NC_022108	CT	3	6	957690	957695	0 %	50 %	0 %	50 %	532352138
21076	NC_022108	AT	3	6	957698	957703	50 %	50 %	0 %	0 %	532352138
21077	NC_022108	TTA	2	6	957790	957795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352138
21078	NC_022108	GGAT	2	8	957881	957888	25 %	25 %	50 %	0 %	532352138
21079	NC_022108	TGA	2	6	957959	957964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352138
21080	NC_022108	AT	3	6	958010	958015	50 %	50 %	0 %	0 %	532352138
21081	NC_022108	GAA	2	6	958122	958127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352138
21082	NC_022108	TGA	2	6	958289	958294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352138
21083	NC_022108	ACG	2	6	958352	958357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352138
21084	NC_022108	TGA	2	6	958393	958398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352138
21085	NC_022108	GCA	2	6	958478	958483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352138
21086	NC_022108	GGA	2	6	958509	958514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352138
21087	NC_022108	TACAA	2	10	958545	958554	60 %	20 %	0 %	20 %	532352138
21088	NC_022108	GGGAT	2	10	958558	958567	20 %	20 %	60 %	0 %	532352138
21089	NC_022108	TAT	2	6	958592	958597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352138
21090	NC_022108	AAG	2	6	958726	958731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352138
21091	NC_022108	TTG	2	6	958852	958857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352138
21092	NC_022108	TGT	2	6	958859	958864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352138
21093	NC_022108	TG	3	6	958910	958915	0 %	50 %	50 %	0 %	532352138
21094	NC_022108	TTGT	2	8	959032	959039	0 %	75 %	25 %	0 %	532352138
21095	NC_022108	CTG	2	6	959075	959080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352139
21096	NC_022108	TCT	2	6	959083	959088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352139
21097	NC_022108	AC	3	6	959131	959136	50 %	0 %	0 %	50 %	532352139
21098	NC_022108	ATT	2	6	959209	959214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352139
21099	NC_022108	AGA	2	6	959235	959240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352139
21100	NC_022108	GTA	2	6	959257	959262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352139
21101	NC_022108	TCA	2	6	959266	959271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352139
21102	NC_022108	ATC	2	6	959402	959407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352139
21103	NC_022108	TAT	2	6	959417	959422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352139
21104	NC_022108	TGC	2	6	959424	959429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352139
21105	NC_022108	TCT	2	6	959479	959484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352139
21106	NC_022108	T	6	6	959496	959501	0 %	100 %	0 %	0 %	532352139
21107	NC_022108	AGA	2	6	959631	959636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352139
21108	NC_022108	A	6	6	959647	959652	100 %	0 %	0 %	0 %	532352139
21109	NC_022108	ATT	2	6	959660	959665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352139
21110	NC_022108	T	6	6	959751	959756	0 %	100 %	0 %	0 %	532352139
21111	NC_022108	CTT	2	6	959810	959815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352139
21112	NC_022108	AT	3	6	959910	959915	50 %	50 %	0 %	0 %	532352139
21113	NC_022108	GCTA	2	8	959928	959935	25 %	25 %	25 %	25 %	532352139
21114	NC_022108	TCA	2	6	959939	959944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352139
21115	NC_022108	GTCA	2	8	959945	959952	25 %	25 %	25 %	25 %	532352139
21116	NC_022108	CAGCT	2	10	960122	960131	20 %	20 %	20 %	40 %	532352139
21117	NC_022108	GCAA	2	8	960159	960166	50 %	0 %	25 %	25 %	532352139
21118	NC_022108	GCAA	2	8	960201	960208	50 %	0 %	25 %	25 %	532352139
21119	NC_022108	GAG	2	6	960289	960294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352139
21120	NC_022108	AGC	2	6	960345	960350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352139
21121	NC_022108	TTAAAA	2	12	960352	960363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352139
21122	NC_022108	TTA	2	6	960428	960433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352139
21123	NC_022108	GA	3	6	960434	960439	50 %	0 %	50 %	0 %	532352139
21124	NC_022108	GCT	2	6	960565	960570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352139
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21131	NC_022108	TGA	2	6	960751	960756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352139
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21239	NC_022108	TAG	2	6	965485	965490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352144
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21241	NC_022108	AGG	2	6	965567	965572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352144
21242	NC_022108	AGC	2	6	965599	965604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352144
21243	NC_022108	GCT	2	6	965612	965617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352144
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