MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022108	A	7	7	69806	69812	100 %	0 %	0 %	0 %	532351421
1502	NC_022108	CT	3	6	69814	69819	0 %	50 %	0 %	50 %	532351421
1503	NC_022108	AGA	2	6	69823	69828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351421
1504	NC_022108	GCGAT	2	10	69876	69885	20 %	20 %	40 %	20 %	532351421
1505	NC_022108	GTT	2	6	69898	69903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351421
1506	NC_022108	GCT	2	6	69920	69925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351421
1507	NC_022108	GCA	3	9	70022	70030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351421
1508	NC_022108	AAAG	2	8	70055	70062	75 %	0 %	25 %	0 %	532351421
1509	NC_022108	GCA	2	6	70069	70074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351421
1510	NC_022108	ATT	2	6	70083	70088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351421
1511	NC_022108	TAT	2	6	70191	70196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351421
1512	NC_022108	CTT	2	6	70215	70220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351421
1513	NC_022108	GA	3	6	70224	70229	50 %	0 %	50 %	0 %	532351421
1514	NC_022108	CTCTT	2	10	70230	70239	0 %	60 %	0 %	40 %	532351421
1515	NC_022108	AGAA	2	8	70242	70249	75 %	0 %	25 %	0 %	532351421
1516	NC_022108	TGA	2	6	70270	70275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351421
1517	NC_022108	TTG	2	6	70359	70364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351421
1518	NC_022108	TCT	2	6	70382	70387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351421
1519	NC_022108	GA	3	6	70423	70428	50 %	0 %	50 %	0 %	532351421
1520	NC_022108	AGCT	2	8	70464	70471	25 %	25 %	25 %	25 %	532351421
1521	NC_022108	TGA	2	6	70510	70515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351421
1522	NC_022108	GCAT	2	8	70525	70532	25 %	25 %	25 %	25 %	532351421
1523	NC_022108	AGA	2	6	70543	70548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351421
1524	NC_022108	TCAA	2	8	70669	70676	50 %	25 %	0 %	25 %	532351421
1525	NC_022108	GT	3	6	70699	70704	0 %	50 %	50 %	0 %	532351421
1526	NC_022108	CT	3	6	70780	70785	0 %	50 %	0 %	50 %	532351421
1527	NC_022108	GA	3	6	70801	70806	50 %	0 %	50 %	0 %	532351421
1528	NC_022108	AGT	2	6	70843	70848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351421
1529	NC_022108	AGGGG	2	10	70876	70885	20 %	0 %	80 %	0 %	532351421
1530	NC_022108	AAGAA	2	10	70918	70927	80 %	0 %	20 %	0 %	532351421
1531	NC_022108	AGA	2	6	70990	70995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351421
1532	NC_022108	TGA	2	6	71026	71031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351421
1533	NC_022108	TAT	2	6	71037	71042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351421
1534	NC_022108	T	6	6	71126	71131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_022108	T	8	8	71147	71154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_022108	CAT	2	6	71212	71217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351422
1537	NC_022108	GCTT	2	8	71270	71277	0 %	50 %	25 %	25 %	532351422
1538	NC_022108	A	6	6	71365	71370	100 %	0 %	0 %	0 %	532351422
1539	NC_022108	ATT	2	6	71415	71420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351422
1540	NC_022108	CAA	2	6	71562	71567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351422
1541	NC_022108	TCC	2	6	71586	71591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351422
1542	NC_022108	TTCT	2	8	71608	71615	0 %	75 %	0 %	25 %	532351422
1543	NC_022108	ATG	2	6	71620	71625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351422
1544	NC_022108	GCTT	2	8	71654	71661	0 %	50 %	25 %	25 %	532351422
1545	NC_022108	AGA	2	6	71663	71668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351422
1546	NC_022108	GAGC	2	8	71682	71689	25 %	0 %	50 %	25 %	532351422
1547	NC_022108	TCA	2	6	71707	71712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351422
1548	NC_022108	A	7	7	71714	71720	100 %	0 %	0 %	0 %	532351422
1549	NC_022108	CTATTT	2	12	71725	71736	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	532351422
1550	NC_022108	TGA	2	6	71759	71764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351422
1551	NC_022108	ATG	2	6	71797	71802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351422
1552	NC_022108	AGA	2	6	71927	71932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_022108	CGT	2	6	71975	71980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352201
1554	NC_022108	T	7	7	71980	71986	0 %	100 %	0 %	0 %	532352201
1555	NC_022108	CTTGC	2	10	72006	72015	0 %	40 %	20 %	40 %	532352201
1556	NC_022108	GATA	2	8	72030	72037	50 %	25 %	25 %	0 %	532352201
1557	NC_022108	TTC	2	6	72121	72126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351423
1558	NC_022108	CTT	2	6	72189	72194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351423
1559	NC_022108	ATTGG	2	10	72207	72216	20 %	40 %	40 %	0 %	532351423
1560	NC_022108	T	6	6	72223	72228	0 %	100 %	0 %	0 %	532351423
1561	NC_022108	AGC	2	6	72238	72243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351423
1562	NC_022108	TTG	2	6	72267	72272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351423
1563	NC_022108	ATA	2	6	72351	72356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351423
1564	NC_022108	GCT	2	6	72371	72376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351423
1565	NC_022108	GCTA	2	8	72380	72387	25 %	25 %	25 %	25 %	532351423
1566	NC_022108	AAT	2	6	72410	72415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351423
1567	NC_022108	TGG	2	6	72441	72446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351423
1568	NC_022108	T	6	6	72448	72453	0 %	100 %	0 %	0 %	532351423
1569	NC_022108	AGC	2	6	72510	72515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351423
1570	NC_022108	TTAT	2	8	72556	72563	25 %	75 %	0 %	0 %	532351423
1571	NC_022108	TGC	2	6	72564	72569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351423
1572	NC_022108	TGT	2	6	72607	72612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351423
1573	NC_022108	GGAG	2	8	72623	72630	25 %	0 %	75 %	0 %	532351423
1574	NC_022108	GATT	2	8	72658	72665	25 %	50 %	25 %	0 %	532351423
1575	NC_022108	GAA	2	6	72733	72738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351423
1576	NC_022108	CTGG	2	8	72766	72773	0 %	25 %	50 %	25 %	532351423
1577	NC_022108	CTC	2	6	72786	72791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351423
1578	NC_022108	ACTCTT	2	12	72854	72865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532351423
1579	NC_022108	GAA	2	6	72875	72880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351423
1580	NC_022108	TGA	2	6	72892	72897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351423
1581	NC_022108	GAA	2	6	72925	72930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351423
1582	NC_022108	T	6	6	73007	73012	0 %	100 %	0 %	0 %	532351423
1583	NC_022108	TAG	2	6	73047	73052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351423
1584	NC_022108	TAG	2	6	73056	73061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351423
1585	NC_022108	AGA	2	6	73163	73168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351423
1586	NC_022108	ATCA	2	8	73193	73200	50 %	25 %	0 %	25 %	532351423
1587	NC_022108	TGT	2	6	73266	73271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351423
1588	NC_022108	GAAAA	2	10	73279	73288	80 %	0 %	20 %	0 %	532351423
1589	NC_022108	A	7	7	73285	73291	100 %	0 %	0 %	0 %	532351423
1590	NC_022108	AGG	2	6	73311	73316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351423
1591	NC_022108	TGG	2	6	73389	73394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351424
1592	NC_022108	TTTCTG	2	12	73404	73415	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	532351424
1593	NC_022108	AGA	2	6	73441	73446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351424
1594	NC_022108	GA	3	6	73464	73469	50 %	0 %	50 %	0 %	532351424
1595	NC_022108	TAC	2	6	73489	73494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351424
1596	NC_022108	GATCAT	2	12	73534	73545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532351424
1597	NC_022108	TGA	2	6	73567	73572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351424
1598	NC_022108	G	6	6	73625	73630	0 %	0 %	100 %	0 %	532351424
1599	NC_022108	TAT	2	6	73637	73642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351424
1600	NC_022108	A	6	6	73673	73678	100 %	0 %	0 %	0 %	532351424
1601	NC_022108	TGGGA	2	10	73696	73705	20 %	20 %	60 %	0 %	532351424
1602	NC_022108	GCT	2	6	73805	73810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351424
1603	NC_022108	TGGA	2	8	73815	73822	25 %	25 %	50 %	0 %	532351424
1604	NC_022108	AGG	2	6	73849	73854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351424
1605	NC_022108	TC	3	6	73951	73956	0 %	50 %	0 %	50 %	532351424
1606	NC_022108	T	6	6	73979	73984	0 %	100 %	0 %	0 %	532351424
1607	NC_022108	AGC	3	9	74023	74031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351424
1608	NC_022108	AGGC	2	8	74139	74146	25 %	0 %	50 %	25 %	532351424
1609	NC_022108	ATT	2	6	74162	74167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351424
1610	NC_022108	AAG	2	6	74202	74207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351424
1611	NC_022108	AAG	2	6	74265	74270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351424
1612	NC_022108	TGC	2	6	74343	74348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351424
1613	NC_022108	TC	3	6	74358	74363	0 %	50 %	0 %	50 %	532351424
1614	NC_022108	TCA	2	6	74452	74457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351424
1615	NC_022108	ATT	2	6	74502	74507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351424
1616	NC_022108	TCT	2	6	74594	74599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351424
1617	NC_022108	ATG	2	6	74613	74618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351424
1618	NC_022108	AAG	2	6	74768	74773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351424
1619	NC_022108	ACT	2	6	74783	74788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_022108	T	6	6	74794	74799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_022108	AGT	2	6	74819	74824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_022108	CAA	2	6	74845	74850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351425
1623	NC_022108	T	6	6	74903	74908	0 %	100 %	0 %	0 %	532351425
1624	NC_022108	CCA	2	6	74946	74951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351425
1625	NC_022108	TC	3	6	74992	74997	0 %	50 %	0 %	50 %	532351425
1626	NC_022108	AAT	2	6	75002	75007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351425
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1628	NC_022108	GAG	2	6	75049	75054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351425
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1835	NC_022108	CTA	2	6	83862	83867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351431
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1862	NC_022108	CTT	2	6	84905	84910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351432
1863	NC_022108	T	6	6	84931	84936	0 %	100 %	0 %	0 %	532351432
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1869	NC_022108	TTTGT	2	10	85191	85200	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1872	NC_022108	AAT	2	6	85312	85317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1873	NC_022108	AT	3	6	85316	85321	50 %	50 %	0 %	0 %	532351433
1874	NC_022108	AGC	2	6	85384	85389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351433
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1876	NC_022108	GAAA	2	8	85449	85456	75 %	0 %	25 %	0 %	532351433
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