MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022108	A	6	6	835739	835744	100 %	0 %	0 %	0 %	532352050
18502	NC_022108	TCG	2	6	835905	835910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352050
18503	NC_022108	TTAGA	2	10	835912	835921	40 %	40 %	20 %	0 %	532352050
18504	NC_022108	T	8	8	835969	835976	0 %	100 %	0 %	0 %	532352050
18505	NC_022108	T	6	6	836038	836043	0 %	100 %	0 %	0 %	532352050
18506	NC_022108	AGG	2	6	836066	836071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_022108	A	7	7	836154	836160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_022108	AGA	2	6	836212	836217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352051
18509	NC_022108	T	6	6	836315	836320	0 %	100 %	0 %	0 %	532352051
18510	NC_022108	GAA	2	6	836393	836398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352051
18511	NC_022108	GAAA	2	8	836586	836593	75 %	0 %	25 %	0 %	532352051
18512	NC_022108	TAT	2	6	836596	836601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352051
18513	NC_022108	CTTT	2	8	836647	836654	0 %	75 %	0 %	25 %	532352051
18514	NC_022108	CGG	2	6	836699	836704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352051
18515	NC_022108	AAT	2	6	836782	836787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352052
18516	NC_022108	AAG	2	6	836858	836863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352052
18517	NC_022108	ACG	2	6	836882	836887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352052
18518	NC_022108	A	6	6	836902	836907	100 %	0 %	0 %	0 %	532352052
18519	NC_022108	TG	3	6	836921	836926	0 %	50 %	50 %	0 %	532352052
18520	NC_022108	GT	3	6	836952	836957	0 %	50 %	50 %	0 %	532352052
18521	NC_022108	ATT	2	6	836959	836964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352052
18522	NC_022108	TGA	2	6	836994	836999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352052
18523	NC_022108	TC	3	6	837028	837033	0 %	50 %	0 %	50 %	532352052
18524	NC_022108	GAA	2	6	837064	837069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352052
18525	NC_022108	GAAA	2	8	837087	837094	75 %	0 %	25 %	0 %	532352052
18526	NC_022108	TAGT	2	8	837142	837149	25 %	50 %	25 %	0 %	532352052
18527	NC_022108	AAG	2	6	837192	837197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352052
18528	NC_022108	TAG	2	6	837201	837206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352052
18529	NC_022108	AGA	2	6	837214	837219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352052
18530	NC_022108	TCA	2	6	837273	837278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352052
18531	NC_022108	CTC	2	6	837321	837326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352053
18532	NC_022108	ATC	2	6	837346	837351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352053
18533	NC_022108	ATA	2	6	837405	837410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352053
18534	NC_022108	TTC	2	6	837436	837441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352053
18535	NC_022108	AGCC	2	8	837482	837489	25 %	0 %	25 %	50 %	532352053
18536	NC_022108	CCT	2	6	837533	837538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352053
18537	NC_022108	AG	3	6	837554	837559	50 %	0 %	50 %	0 %	532352053
18538	NC_022108	AGA	2	6	837660	837665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352053
18539	NC_022108	TAG	2	6	837667	837672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352053
18540	NC_022108	AG	3	6	837671	837676	50 %	0 %	50 %	0 %	532352053
18541	NC_022108	GGA	2	6	837722	837727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352053
18542	NC_022108	A	6	6	837744	837749	100 %	0 %	0 %	0 %	532352053
18543	NC_022108	AAT	2	6	837829	837834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352053
18544	NC_022108	AGA	2	6	837859	837864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352053
18545	NC_022108	TAA	2	6	837951	837956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352053
18546	NC_022108	TACA	2	8	838075	838082	50 %	25 %	0 %	25 %	532352053
18547	NC_022108	T	6	6	838129	838134	0 %	100 %	0 %	0 %	532352053
18548	NC_022108	AGA	2	6	838177	838182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352053
18549	NC_022108	ATCACA	2	12	838199	838210	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352053
18550	NC_022108	ATG	2	6	838229	838234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352053
18551	NC_022108	T	7	7	838275	838281	0 %	100 %	0 %	0 %	532352053
18552	NC_022108	GAAG	2	8	838318	838325	50 %	0 %	50 %	0 %	532352053
18553	NC_022108	T	6	6	838383	838388	0 %	100 %	0 %	0 %	532352053
18554	NC_022108	AAAT	2	8	838486	838493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_022108	AAT	2	6	838496	838501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18556	NC_022108	CGA	2	6	838536	838541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
18557	NC_022108	GA	3	6	838571	838576	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
18558	NC_022108	CAC	2	6	838598	838603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352054
18559	NC_022108	ATC	2	6	838701	838706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352054
18560	NC_022108	CATA	2	8	838838	838845	50 %	25 %	0 %	25 %	532352054
18561	NC_022108	GCA	2	6	838884	838889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
18562	NC_022108	CGTGG	2	10	838891	838900	0 %	20 %	60 %	20 %	532352054
18563	NC_022108	AAGC	2	8	838938	838945	50 %	0 %	25 %	25 %	532352054
18564	NC_022108	CGC	2	6	838960	838965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352054
18565	NC_022108	TTC	2	6	839009	839014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352054
18566	NC_022108	AACGT	2	10	839018	839027	40 %	20 %	20 %	20 %	532352054
18567	NC_022108	GAC	2	6	839181	839186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
18568	NC_022108	GTA	2	6	839268	839273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352054
18569	NC_022108	CGC	2	6	839332	839337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352054
18570	NC_022108	AG	3	6	839493	839498	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
18571	NC_022108	CCT	2	6	839499	839504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352054
18572	NC_022108	TGA	2	6	839549	839554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352054
18573	NC_022108	GTT	2	6	839569	839574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352054
18574	NC_022108	AAC	2	6	839603	839608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352054
18575	NC_022108	TGA	2	6	839614	839619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352054
18576	NC_022108	GGA	2	6	839650	839655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352054
18577	NC_022108	AGA	2	6	839762	839767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352054
18578	NC_022108	AAT	2	6	839777	839782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352054
18579	NC_022108	AAC	2	6	839798	839803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352054
18580	NC_022108	A	6	6	840123	840128	100 %	0 %	0 %	0 %	532352054
18581	NC_022108	GA	3	6	840150	840155	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
18582	NC_022108	AAG	2	6	840179	840184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352054
18583	NC_022108	ACG	2	6	840245	840250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
18584	NC_022108	T	7	7	840252	840258	0 %	100 %	0 %	0 %	532352054
18585	NC_022108	GA	3	6	840259	840264	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
18586	NC_022108	A	7	7	840299	840305	100 %	0 %	0 %	0 %	532352054
18587	NC_022108	A	6	6	840337	840342	100 %	0 %	0 %	0 %	532352054
18588	NC_022108	CTA	2	6	840363	840368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352054
18589	NC_022108	AAT	2	6	840383	840388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352054
18590	NC_022108	AGC	2	6	840399	840404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
18591	NC_022108	TAA	2	6	840420	840425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352054
18592	NC_022108	T	6	6	840464	840469	0 %	100 %	0 %	0 %	532352054
18593	NC_022108	GAAG	2	8	840508	840515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_022108	CTTG	2	8	840606	840613	0 %	50 %	25 %	25 %	532352055
18595	NC_022108	TCT	2	6	840629	840634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352055
18596	NC_022108	AAGAG	2	10	840671	840680	60 %	0 %	40 %	0 %	532352055
18597	NC_022108	AC	3	6	840691	840696	50 %	0 %	0 %	50 %	532352055
18598	NC_022108	TCTT	2	8	840794	840801	0 %	75 %	0 %	25 %	532352055
18599	NC_022108	TGC	2	6	840844	840849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352055
18600	NC_022108	A	6	6	840873	840878	100 %	0 %	0 %	0 %	532352055
18601	NC_022108	AGAA	2	8	840941	840948	75 %	0 %	25 %	0 %	532352055
18602	NC_022108	A	6	6	840961	840966	100 %	0 %	0 %	0 %	532352055
18603	NC_022108	CAAT	2	8	840980	840987	50 %	25 %	0 %	25 %	532352055
18604	NC_022108	T	7	7	841018	841024	0 %	100 %	0 %	0 %	532352055
18605	NC_022108	TGA	2	6	841028	841033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352055
18606	NC_022108	CTT	2	6	841068	841073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352055
18607	NC_022108	TCC	2	6	841082	841087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352055
18608	NC_022108	CTC	2	6	841133	841138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352055
18609	NC_022108	GAA	2	6	841212	841217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352055
18610	NC_022108	GAC	2	6	841228	841233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352055
18611	NC_022108	CAA	2	6	841273	841278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18612	NC_022108	TCG	2	6	841360	841365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352056
18613	NC_022108	ATCG	2	8	841441	841448	25 %	25 %	25 %	25 %	532352056
18614	NC_022108	CAGA	2	8	841515	841522	50 %	0 %	25 %	25 %	532352056
18615	NC_022108	TTC	2	6	841525	841530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352056
18616	NC_022108	T	6	6	841545	841550	0 %	100 %	0 %	0 %	532352056
18617	NC_022108	CTT	3	9	841560	841568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352056
18618	NC_022108	AGT	2	6	841576	841581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352056
18619	NC_022108	TGG	2	6	841610	841615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352056
18620	NC_022108	TCGT	2	8	841630	841637	0 %	50 %	25 %	25 %	532352056
18621	NC_022108	CTC	2	6	841641	841646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352056
18622	NC_022108	CT	3	6	841657	841662	0 %	50 %	0 %	50 %	532352056
18623	NC_022108	GCA	2	6	841682	841687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352056
18624	NC_022108	AG	3	6	841692	841697	50 %	0 %	50 %	0 %	532352056
18625	NC_022108	GAC	2	6	841744	841749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352056
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18628	NC_022108	TGCT	2	8	841891	841898	0 %	50 %	25 %	25 %	532352056
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18642	NC_022108	TGGG	2	8	842580	842587	0 %	25 %	75 %	0 %	532352056
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18644	NC_022108	TG	3	6	842610	842615	0 %	50 %	50 %	0 %	532352057
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18726	NC_022108	AG	3	6	847099	847104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18728	NC_022108	TAA	2	6	847172	847177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18729	NC_022108	TAC	2	6	847192	847197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18731	NC_022108	CT	3	6	847259	847264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18999	NC_022108	ATT	2	6	861129	861134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352067
19000	NC_022108	TAA	2	6	861161	861166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352067

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