MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022108	CGC	2	6	813282	813287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352034
18002	NC_022108	CAA	2	6	813300	813305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352034
18003	NC_022108	TG	3	6	813326	813331	0 %	50 %	50 %	0 %	532352034
18004	NC_022108	AGAAA	2	10	813389	813398	80 %	0 %	20 %	0 %	532352034
18005	NC_022108	ATG	2	6	813435	813440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352034
18006	NC_022108	AAG	2	6	813493	813498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_022108	AAC	2	6	813500	813505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_022108	T	6	6	813515	813520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18009	NC_022108	CAA	2	6	813571	813576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18010	NC_022108	AACT	2	8	813578	813585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18011	NC_022108	ATC	2	6	813591	813596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_022108	CATC	2	8	813649	813656	25 %	25 %	0 %	50 %	532352035
18013	NC_022108	AT	3	6	813657	813662	50 %	50 %	0 %	0 %	532352035
18014	NC_022108	TTC	2	6	813668	813673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18015	NC_022108	CCTT	2	8	813736	813743	0 %	50 %	0 %	50 %	532352035
18016	NC_022108	CTT	2	6	813757	813762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18017	NC_022108	AG	3	6	813842	813847	50 %	0 %	50 %	0 %	532352035
18018	NC_022108	TTC	2	6	813851	813856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18019	NC_022108	CT	3	6	813873	813878	0 %	50 %	0 %	50 %	532352035
18020	NC_022108	CTT	2	6	813946	813951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18021	NC_022108	TTC	2	6	813983	813988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18022	NC_022108	AAG	2	6	814081	814086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352035
18023	NC_022108	AGGA	2	8	814097	814104	50 %	0 %	50 %	0 %	532352035
18024	NC_022108	ATTT	2	8	814212	814219	25 %	75 %	0 %	0 %	532352035
18025	NC_022108	TCA	2	6	814247	814252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352035
18026	NC_022108	A	6	6	814330	814335	100 %	0 %	0 %	0 %	532352035
18027	NC_022108	T	6	6	814346	814351	0 %	100 %	0 %	0 %	532352035
18028	NC_022108	TCT	2	6	814367	814372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18029	NC_022108	GAAA	2	8	814459	814466	75 %	0 %	25 %	0 %	532352035
18030	NC_022108	GAG	2	6	814505	814510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352035
18031	NC_022108	CA	3	6	814542	814547	50 %	0 %	0 %	50 %	532352035
18032	NC_022108	CAA	2	6	814626	814631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352035
18033	NC_022108	TAT	2	6	814632	814637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352035
18034	NC_022108	ACA	2	6	814670	814675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352035
18035	NC_022108	T	8	8	814676	814683	0 %	100 %	0 %	0 %	532352035
18036	NC_022108	CTT	2	6	814698	814703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18037	NC_022108	TG	3	6	814715	814720	0 %	50 %	50 %	0 %	532352035
18038	NC_022108	ACACA	2	10	814749	814758	60 %	0 %	0 %	40 %	532352035
18039	NC_022108	TCT	2	6	814769	814774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
18040	NC_022108	TGA	2	6	814859	814864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352035
18041	NC_022108	GAA	2	6	814927	814932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352035
18042	NC_022108	A	8	8	814988	814995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18043	NC_022108	T	6	6	815009	815014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18044	NC_022108	GGT	2	6	815028	815033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_022108	A	7	7	815034	815040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_022108	GAA	2	6	815085	815090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352260
18047	NC_022108	AAG	2	6	815196	815201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352260
18048	NC_022108	GT	3	6	815296	815301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_022108	TCTT	2	8	815496	815503	0 %	75 %	0 %	25 %	532352036
18050	NC_022108	GAG	2	6	815509	815514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352036
18051	NC_022108	GAG	2	6	815560	815565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352036
18052	NC_022108	TGC	2	6	815616	815621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352036
18053	NC_022108	CTT	3	9	815643	815651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18054	NC_022108	TGTTT	2	10	815691	815700	0 %	80 %	20 %	0 %	532352036
18055	NC_022108	A	7	7	815708	815714	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
18056	NC_022108	TCT	2	6	815726	815731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18057	NC_022108	GAA	2	6	815857	815862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18058	NC_022108	ATT	2	6	815963	815968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
18059	NC_022108	GAT	2	6	816002	816007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
18060	NC_022108	GA	5	10	816061	816070	50 %	0 %	50 %	0 %	532352036
18061	NC_022108	AGA	2	6	816101	816106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18062	NC_022108	CTTTG	2	10	816109	816118	0 %	60 %	20 %	20 %	532352036
18063	NC_022108	TTA	2	6	816180	816185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
18064	NC_022108	TTG	2	6	816199	816204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
18065	NC_022108	AGCA	2	8	816229	816236	50 %	0 %	25 %	25 %	532352036
18066	NC_022108	TTC	2	6	816238	816243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18067	NC_022108	ATT	2	6	816264	816269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
18068	NC_022108	TGGA	2	8	816499	816506	25 %	25 %	50 %	0 %	532352036
18069	NC_022108	ACG	2	6	816535	816540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352036
18070	NC_022108	CTT	2	6	816559	816564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18071	NC_022108	AAG	2	6	816580	816585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18072	NC_022108	AG	3	6	816635	816640	50 %	0 %	50 %	0 %	532352036
18073	NC_022108	AGA	2	6	816650	816655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18074	NC_022108	GAA	2	6	816713	816718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18075	NC_022108	TAA	2	6	816749	816754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352036
18076	NC_022108	GCATC	2	10	816758	816767	20 %	20 %	20 %	40 %	532352036
18077	NC_022108	TTTA	2	8	816801	816808	25 %	75 %	0 %	0 %	532352036
18078	NC_022108	TGA	2	6	816809	816814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
18079	NC_022108	ACT	2	6	816856	816861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352036
18080	NC_022108	ACTT	2	8	816910	816917	25 %	50 %	0 %	25 %	532352036
18081	NC_022108	GAA	2	6	816935	816940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18082	NC_022108	CTT	2	6	816944	816949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18083	NC_022108	A	6	6	816978	816983	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
18084	NC_022108	GCG	2	6	816986	816991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352036
18085	NC_022108	A	6	6	817042	817047	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
18086	NC_022108	GAT	2	6	817095	817100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
18087	NC_022108	TTG	2	6	817102	817107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
18088	NC_022108	AGA	2	6	817184	817189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18089	NC_022108	AGAA	2	8	817282	817289	75 %	0 %	25 %	0 %	532352036
18090	NC_022108	ATT	2	6	817377	817382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
18091	NC_022108	GGC	2	6	817410	817415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352036
18092	NC_022108	AGA	2	6	817463	817468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18093	NC_022108	AGA	2	6	817550	817555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18094	NC_022108	ATG	2	6	817558	817563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
18095	NC_022108	CTT	2	6	817573	817578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18096	NC_022108	GTT	2	6	817632	817637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
18097	NC_022108	AGC	2	6	817797	817802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352036
18098	NC_022108	AAG	2	6	817877	817882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18099	NC_022108	TTC	2	6	817900	817905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18100	NC_022108	AGA	2	6	817928	817933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18101	NC_022108	CCT	2	6	817938	817943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352036
18102	NC_022108	AAG	2	6	818047	818052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18103	NC_022108	GA	3	6	818058	818063	50 %	0 %	50 %	0 %	532352036
18104	NC_022108	TGT	2	6	818109	818114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
18105	NC_022108	TAT	2	6	818252	818257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
18106	NC_022108	CCA	2	6	818308	818313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352036
18107	NC_022108	TCT	2	6	818357	818362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
18108	NC_022108	GGA	2	6	818388	818393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352036
18109	NC_022108	TTGG	2	8	818406	818413	0 %	50 %	50 %	0 %	532352036
18110	NC_022108	TGG	2	6	818442	818447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352036
18111	NC_022108	CTG	2	6	818452	818457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352036
18112	NC_022108	GAA	2	6	818544	818549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18113	NC_022108	A	6	6	818548	818553	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
18114	NC_022108	AAAG	2	8	818588	818595	75 %	0 %	25 %	0 %	532352036
18115	NC_022108	TGA	3	9	818606	818614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
18116	NC_022108	GAA	2	6	818637	818642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
18117	NC_022108	TA	3	6	818690	818695	50 %	50 %	0 %	0 %	532352036
18118	NC_022108	T	8	8	818760	818767	0 %	100 %	0 %	0 %	532352036
18119	NC_022108	GTA	2	6	819032	819037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352037
18120	NC_022108	GCA	2	6	819160	819165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352037
18121	NC_022108	GCA	2	6	819199	819204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352037
18122	NC_022108	ATT	2	6	819211	819216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352037
18123	NC_022108	ACA	2	6	819232	819237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352037
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18244	NC_022108	AGC	3	9	824709	824717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352040
18245	NC_022108	ATT	2	6	824726	824731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352040
18246	NC_022108	AAT	2	6	824747	824752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352040
18247	NC_022108	TCT	2	6	824918	824923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352040
18248	NC_022108	GGAAG	2	10	824950	824959	40 %	0 %	60 %	0 %	532352040
18249	NC_022108	CTT	2	6	825016	825021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352040
18250	NC_022108	CT	3	6	825133	825138	0 %	50 %	0 %	50 %	532352040
18251	NC_022108	TA	3	6	825156	825161	50 %	50 %	0 %	0 %	532352040
18252	NC_022108	CTAG	2	8	825174	825181	25 %	25 %	25 %	25 %	532352040
18253	NC_022108	TCT	2	6	825195	825200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352040
18254	NC_022108	AAGAG	2	10	825226	825235	60 %	0 %	40 %	0 %	532352040
18255	NC_022108	G	6	6	825241	825246	0 %	0 %	100 %	0 %	532352040
18256	NC_022108	TCC	2	6	825259	825264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352040
18257	NC_022108	GC	3	6	825278	825283	0 %	0 %	50 %	50 %	532352040
18258	NC_022108	CTTC	2	8	825296	825303	0 %	50 %	0 %	50 %	532352040
18259	NC_022108	AGA	2	6	825312	825317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352040
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18261	NC_022108	T	6	6	825421	825426	0 %	100 %	0 %	0 %	532352041
18262	NC_022108	GTC	2	6	825433	825438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352041
18263	NC_022108	TAAG	2	8	825475	825482	50 %	25 %	25 %	0 %	532352041
18264	NC_022108	GAA	2	6	825483	825488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352041
18265	NC_022108	GTA	2	6	825506	825511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352041
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18270	NC_022108	CAAA	2	8	825698	825705	75 %	0 %	0 %	25 %	532352041
18271	NC_022108	ATC	2	6	825728	825733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352041
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18273	NC_022108	GTA	2	6	825805	825810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352041
18274	NC_022108	TCC	2	6	825820	825825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352041
18275	NC_022108	TGT	2	6	825991	825996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352041
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18279	NC_022108	CAT	2	6	826098	826103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352041
18280	NC_022108	A	6	6	826220	826225	100 %	0 %	0 %	0 %	532352041
18281	NC_022108	CTTT	2	8	826282	826289	0 %	75 %	0 %	25 %	532352041
18282	NC_022108	A	6	6	826327	826332	100 %	0 %	0 %	0 %	532352041
18283	NC_022108	TC	3	6	826354	826359	0 %	50 %	0 %	50 %	532352041
18284	NC_022108	GAA	3	9	826392	826400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352041
18285	NC_022108	TTC	2	6	826412	826417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18286	NC_022108	TGG	2	6	826492	826497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18287	NC_022108	GT	3	6	826520	826525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18288	NC_022108	TGA	2	6	826533	826538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18289	NC_022108	AG	4	8	826541	826548	50 %	0 %	50 %	0 %	532352042
18290	NC_022108	ACC	2	6	826566	826571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352042
18291	NC_022108	GGT	2	6	826661	826666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352042
18292	NC_022108	ATG	2	6	826719	826724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352042
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18309	NC_022108	CAG	2	6	827535	827540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352042
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18313	NC_022108	AAGAGG	2	12	827764	827775	50 %	0 %	50 %	0 %	532352043
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18315	NC_022108	TAG	2	6	827880	827885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352043
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18318	NC_022108	TCT	2	6	827948	827953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352043
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18326	NC_022108	TAG	2	6	828270	828275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352043
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18342	NC_022108	TTGT	2	8	828987	828994	0 %	75 %	25 %	0 %	532352044
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18346	NC_022108	GTT	2	6	829167	829172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352044
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18355	NC_022108	GA	3	6	829448	829453	50 %	0 %	50 %	0 %	532352045
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18359	NC_022108	GCA	2	6	829604	829609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352045
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18362	NC_022108	CTT	2	6	829650	829655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352045
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18482	NC_022108	ATTTTT	2	12	835067	835078	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18483	NC_022108	AG	3	6	835092	835097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18484	NC_022108	GTT	2	6	835106	835111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18485	NC_022108	GA	3	6	835115	835120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18486	NC_022108	TTA	2	6	835140	835145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18487	NC_022108	TGGCA	2	10	835186	835195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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18490	NC_022108	TGA	2	6	835252	835257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18491	NC_022108	TGA	2	6	835321	835326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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