MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022108	GC	3	6	790609	790614	0 %	0 %	50 %	50 %	532352016
17502	NC_022108	TGT	2	6	790645	790650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352016
17503	NC_022108	TGA	2	6	790669	790674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352016
17504	NC_022108	GCA	2	6	790679	790684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352016
17505	NC_022108	TAAACC	2	12	790716	790727	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352016
17506	NC_022108	TTG	2	6	790761	790766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352016
17507	NC_022108	A	6	6	790796	790801	100 %	0 %	0 %	0 %	532352016
17508	NC_022108	GAA	2	6	790807	790812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352016
17509	NC_022108	TC	3	6	790845	790850	0 %	50 %	0 %	50 %	532352016
17510	NC_022108	A	6	6	790869	790874	100 %	0 %	0 %	0 %	532352016
17511	NC_022108	GA	3	6	790884	790889	50 %	0 %	50 %	0 %	532352016
17512	NC_022108	CTT	2	6	791031	791036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
17513	NC_022108	AAG	2	6	791040	791045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352016
17514	NC_022108	TTC	2	6	791050	791055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
17515	NC_022108	CTT	2	6	791061	791066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
17516	NC_022108	CAA	2	6	791097	791102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352016
17517	NC_022108	T	6	6	791156	791161	0 %	100 %	0 %	0 %	532352016
17518	NC_022108	TCT	3	9	791210	791218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
17519	NC_022108	CTTAA	2	10	791227	791236	40 %	40 %	0 %	20 %	532352016
17520	NC_022108	CGG	2	6	791253	791258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352016
17521	NC_022108	AGC	2	6	791289	791294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352016
17522	NC_022108	GT	3	6	791299	791304	0 %	50 %	50 %	0 %	532352016
17523	NC_022108	TGC	2	6	791310	791315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352016
17524	NC_022108	TCT	2	6	791331	791336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
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17527	NC_022108	TTG	2	6	791444	791449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352017
17528	NC_022108	ATAG	2	8	791487	791494	50 %	25 %	25 %	0 %	532352017
17529	NC_022108	TCA	2	6	791514	791519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352017
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17531	NC_022108	CCA	2	6	791629	791634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352017
17532	NC_022108	TTC	2	6	791666	791671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352017
17533	NC_022108	GAT	2	6	791686	791691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352017
17534	NC_022108	CCTT	2	8	791792	791799	0 %	50 %	0 %	50 %	532352017
17535	NC_022108	T	6	6	791798	791803	0 %	100 %	0 %	0 %	532352017
17536	NC_022108	AAT	2	6	791921	791926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352017
17537	NC_022108	T	6	6	791978	791983	0 %	100 %	0 %	0 %	532352017
17538	NC_022108	TAA	2	6	792009	792014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352017
17539	NC_022108	GCTT	2	8	792029	792036	0 %	50 %	25 %	25 %	532352017
17540	NC_022108	ATT	2	6	792050	792055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352017
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17542	NC_022108	GAG	2	6	792146	792151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352017
17543	NC_022108	CTG	2	6	792216	792221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352018
17544	NC_022108	TCT	2	6	792253	792258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352018
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17546	NC_022108	ACAAA	2	10	792326	792335	80 %	0 %	0 %	20 %	532352018
17547	NC_022108	T	9	9	792401	792409	0 %	100 %	0 %	0 %	532352018
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17550	NC_022108	GT	3	6	792651	792656	0 %	50 %	50 %	0 %	532352018
17551	NC_022108	TTG	2	6	792675	792680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352018
17552	NC_022108	GAG	2	6	792780	792785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352018
17553	NC_022108	TTA	2	6	792793	792798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352018
17554	NC_022108	CCCTGA	2	12	792873	792884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532352018
17555	NC_022108	AAT	2	6	792891	792896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352018
17556	NC_022108	CA	3	6	793010	793015	50 %	0 %	0 %	50 %	532352018
17557	NC_022108	CTA	2	6	793030	793035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352018
17558	NC_022108	A	7	7	793069	793075	100 %	0 %	0 %	0 %	532352018
17559	NC_022108	A	6	6	793077	793082	100 %	0 %	0 %	0 %	532352018
17560	NC_022108	AT	5	10	793113	793122	50 %	50 %	0 %	0 %	532352018
17561	NC_022108	AGG	2	6	793125	793130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352018
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17563	NC_022108	TTC	2	6	793245	793250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17564	NC_022108	AAG	2	6	793289	793294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17565	NC_022108	TTC	2	6	793332	793337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352019
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17569	NC_022108	TTG	2	6	793483	793488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352019
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17573	NC_022108	TCT	2	6	793612	793617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352019
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17575	NC_022108	TTC	2	6	793717	793722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352019
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17604	NC_022108	TGAT	2	8	794848	794855	25 %	50 %	25 %	0 %	532352020
17605	NC_022108	A	7	7	794865	794871	100 %	0 %	0 %	0 %	532352020
17606	NC_022108	TCC	2	6	794940	794945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352020
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17609	NC_022108	TTA	2	6	795064	795069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352020
17610	NC_022108	CTG	2	6	795076	795081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352020
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17612	NC_022108	T	8	8	795102	795109	0 %	100 %	0 %	0 %	532352020
17613	NC_022108	GC	3	6	795116	795121	0 %	0 %	50 %	50 %	532352020
17614	NC_022108	CT	3	6	795141	795146	0 %	50 %	0 %	50 %	532352020
17615	NC_022108	TTC	2	6	795179	795184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352020
17616	NC_022108	GAT	2	6	795358	795363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17620	NC_022108	TTC	2	6	795596	795601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352021
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17991	NC_022108	T	6	6	812881	812886	0 %	100 %	0 %	0 %	532352034
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