MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022108	GTG	2	6	743308	743313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351975
16502	NC_022108	AGA	2	6	743349	743354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351975
16503	NC_022108	GA	3	6	743387	743392	50 %	0 %	50 %	0 %	532351975
16504	NC_022108	TTTC	2	8	743405	743412	0 %	75 %	0 %	25 %	532351975
16505	NC_022108	TAT	2	6	743450	743455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351975
16506	NC_022108	TCTT	2	8	743499	743506	0 %	75 %	0 %	25 %	532351975
16507	NC_022108	TCA	2	6	743530	743535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351975
16508	NC_022108	TG	3	6	743581	743586	0 %	50 %	50 %	0 %	532351975
16509	NC_022108	TC	4	8	743756	743763	0 %	50 %	0 %	50 %	532351976
16510	NC_022108	TACA	2	8	743789	743796	50 %	25 %	0 %	25 %	532351976
16511	NC_022108	GCA	2	6	743802	743807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351976
16512	NC_022108	ACG	2	6	743829	743834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351976
16513	NC_022108	AAT	2	6	743877	743882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351976
16514	NC_022108	GTT	2	6	743990	743995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351976
16515	NC_022108	AAC	2	6	744002	744007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351976
16516	NC_022108	GGAA	2	8	744109	744116	50 %	0 %	50 %	0 %	532351976
16517	NC_022108	GAA	2	6	744165	744170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351976
16518	NC_022108	AAAC	2	8	744186	744193	75 %	0 %	0 %	25 %	532351976
16519	NC_022108	TTG	2	6	744252	744257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351976
16520	NC_022108	AGA	3	9	744260	744268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351976
16521	NC_022108	GAA	2	6	744321	744326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351976
16522	NC_022108	TGA	2	6	744437	744442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351976
16523	NC_022108	TTG	2	6	744456	744461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351976
16524	NC_022108	GAA	2	6	744498	744503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351976
16525	NC_022108	TTA	2	6	744540	744545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351976
16526	NC_022108	GAC	2	6	744699	744704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351976
16527	NC_022108	CCGA	2	8	744728	744735	25 %	0 %	25 %	50 %	532351976
16528	NC_022108	AGG	2	6	744800	744805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351976
16529	NC_022108	AAAG	2	8	744812	744819	75 %	0 %	25 %	0 %	532351976
16530	NC_022108	GTT	2	6	744882	744887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351976
16531	NC_022108	CGA	2	6	744890	744895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351976
16532	NC_022108	AGC	2	6	744915	744920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351976
16533	NC_022108	AGC	2	6	744943	744948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351976
16534	NC_022108	TAT	2	6	744996	745001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351977
16535	NC_022108	CAAT	2	8	745038	745045	50 %	25 %	0 %	25 %	532351977
16536	NC_022108	CTC	2	6	745070	745075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351977
16537	NC_022108	AG	3	6	745132	745137	50 %	0 %	50 %	0 %	532351977
16538	NC_022108	CTA	2	6	745264	745269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351977
16539	NC_022108	T	6	6	745276	745281	0 %	100 %	0 %	0 %	532351977
16540	NC_022108	GCT	2	6	745327	745332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351977
16541	NC_022108	ATG	2	6	745359	745364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351977
16542	NC_022108	A	6	6	745411	745416	100 %	0 %	0 %	0 %	532351977
16543	NC_022108	CTC	2	6	745421	745426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351977
16544	NC_022108	T	7	7	745445	745451	0 %	100 %	0 %	0 %	532351977
16545	NC_022108	A	6	6	745453	745458	100 %	0 %	0 %	0 %	532351977
16546	NC_022108	TCTT	2	8	745465	745472	0 %	75 %	0 %	25 %	532351977
16547	NC_022108	AG	3	6	745485	745490	50 %	0 %	50 %	0 %	532351977
16548	NC_022108	A	7	7	745508	745514	100 %	0 %	0 %	0 %	532351977
16549	NC_022108	T	7	7	745523	745529	0 %	100 %	0 %	0 %	532351977
16550	NC_022108	TGT	2	6	745548	745553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_022108	TCT	2	6	745622	745627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352256
16552	NC_022108	CAA	2	6	745636	745641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352256
16553	NC_022108	CCGA	2	8	745662	745669	25 %	0 %	25 %	50 %	532352256
16554	NC_022108	TTC	2	6	745747	745752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352256
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16556	NC_022108	AAC	2	6	745870	745875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351978
16557	NC_022108	AGC	2	6	745921	745926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351978
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16559	NC_022108	TGTGAT	2	12	746071	746082	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	532351978
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16562	NC_022108	GGA	2	6	746285	746290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351978
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16564	NC_022108	TCG	2	6	746329	746334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351978
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16589	NC_022108	T	6	6	747410	747415	0 %	100 %	0 %	0 %	532351979
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16601	NC_022108	A	6	6	748034	748039	100 %	0 %	0 %	0 %	532351979
16602	NC_022108	T	6	6	748080	748085	0 %	100 %	0 %	0 %	532351979
16603	NC_022108	CTT	2	6	748155	748160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351979
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16606	NC_022108	GAG	2	6	748259	748264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351979
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16608	NC_022108	GAG	2	6	748335	748340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351979
16609	NC_022108	AGG	2	6	748344	748349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351979
16610	NC_022108	GCCT	2	8	748352	748359	0 %	25 %	25 %	50 %	532351979
16611	NC_022108	TAT	2	6	748380	748385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351979
16612	NC_022108	T	6	6	748495	748500	0 %	100 %	0 %	0 %	532351979
16613	NC_022108	CTAG	2	8	748526	748533	25 %	25 %	25 %	25 %	532351979
16614	NC_022108	T	6	6	748575	748580	0 %	100 %	0 %	0 %	532351979
16615	NC_022108	TGGC	2	8	748619	748626	0 %	25 %	50 %	25 %	532351979
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16620	NC_022108	TTC	2	6	748874	748879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351979
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16622	NC_022108	TGA	2	6	749004	749009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351980
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