MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022108	AAT	2	6	721855	721860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_022108	CATG	2	8	721875	721882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16003	NC_022108	TATCCA	2	12	721887	721898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_022108	A	6	6	721919	721924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_022108	AGAT	2	8	721927	721934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_022108	N	50	50	721985	722034	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_022108	TCT	2	6	722051	722056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_022108	T	6	6	722056	722061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_022108	GAA	2	6	722130	722135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_022108	N	7	7	722185	722191	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_022108	TGT	2	6	722219	722224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_022108	ACA	2	6	722291	722296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_022108	TTTCG	2	10	722301	722310	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16014	NC_022108	TGA	2	6	722324	722329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_022108	TG	3	6	722371	722376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_022108	GTCT	2	8	722418	722425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16017	NC_022108	TAA	2	6	722492	722497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_022108	TCT	2	6	722501	722506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_022108	GAA	2	6	722510	722515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_022108	A	6	6	722514	722519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_022108	TAA	2	6	722571	722576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_022108	GAG	2	6	722586	722591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_022108	N	41	41	722613	722653	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_022108	CTT	3	9	722731	722739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_022108	GTTT	2	8	722763	722770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_022108	N	54	54	722802	722855	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_022108	CAG	2	6	722856	722861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_022108	AAGG	2	8	722895	722902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_022108	N	72	72	722907	722978	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_022108	AAC	2	6	723007	723012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_022108	N	135	135	723030	723164	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_022108	T	6	6	723172	723177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_022108	ATT	2	6	723244	723249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_022108	T	6	6	723327	723332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_022108	GTC	2	6	723373	723378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_022108	AGG	2	6	723396	723401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_022108	AG	3	6	723424	723429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_022108	T	6	6	723453	723458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_022108	ATT	2	6	723466	723471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_022108	TAA	3	9	723501	723509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_022108	T	6	6	723521	723526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_022108	T	6	6	723544	723549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_022108	N	21	21	723564	723584	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_022108	ATC	2	6	723628	723633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_022108	N	18	18	723636	723653	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_022108	ATG	2	6	723673	723678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_022108	A	6	6	723712	723717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_022108	AAC	2	6	723781	723786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_022108	GAGAA	2	10	723796	723805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_022108	CT	4	8	723816	723823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16051	NC_022108	ACA	2	6	723840	723845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_022108	A	7	7	723884	723890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_022108	TGCTT	2	10	723977	723986	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16054	NC_022108	TCA	2	6	724016	724021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_022108	GGT	2	6	724023	724028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_022108	TTG	2	6	724078	724083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_022108	AAG	2	6	724172	724177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_022108	N	10	10	724206	724215	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_022108	AGC	2	6	724226	724231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_022108	TGG	2	6	724291	724296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_022108	GAA	2	6	724311	724316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_022108	TGG	2	6	724329	724334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_022108	A	6	6	724356	724361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_022108	TCT	2	6	724386	724391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_022108	N	48	48	724398	724445	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_022108	ATG	2	6	724465	724470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_022108	AAG	2	6	724476	724481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_022108	CTT	2	6	724486	724491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_022108	TCA	2	6	724552	724557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_022108	N	26	26	724570	724595	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_022108	TTG	2	6	724596	724601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_022108	TGT	2	6	724615	724620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_022108	CT	3	6	724677	724682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_022108	N	26	26	724701	724726	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_022108	AGA	2	6	724732	724737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_022108	CAA	2	6	724804	724809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_022108	N	32	32	724860	724891	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_022108	AGC	2	6	724903	724908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16079	NC_022108	TTTG	2	8	724929	724936	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_022108	AAG	2	6	724988	724993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_022108	TGCT	2	8	725010	725017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16082	NC_022108	A	6	6	725072	725077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_022108	GTT	2	6	725111	725116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_022108	GTTT	2	8	725158	725165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_022108	TAT	2	6	725166	725171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_022108	AAG	2	6	725215	725220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_022108	CAGC	2	8	725237	725244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16088	NC_022108	AGA	2	6	725263	725268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_022108	GAA	2	6	725270	725275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_022108	ACT	2	6	725288	725293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16091	NC_022108	AAAC	2	8	725317	725324	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16092	NC_022108	AGA	2	6	725371	725376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_022108	AG	3	6	725428	725433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_022108	AATC	2	8	725476	725483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_022108	ACTGT	2	10	725678	725687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16096	NC_022108	AAG	2	6	725696	725701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_022108	TCT	2	6	725720	725725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_022108	CAA	2	6	725776	725781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_022108	TTG	2	6	725787	725792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_022108	N	25	25	725802	725826	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_022108	ACA	2	6	725858	725863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_022108	A	7	7	725881	725887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_022108	AGC	2	6	725895	725900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_022108	CCTT	2	8	725946	725953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16105	NC_022108	ATTCT	2	10	725962	725971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16106	NC_022108	TTA	2	6	726021	726026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_022108	TGG	2	6	726059	726064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_022108	T	8	8	726094	726101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_022108	AGA	2	6	726155	726160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_022108	GT	3	6	726285	726290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_022108	T	6	6	726325	726330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_022108	TCA	2	6	726332	726337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_022108	TAT	2	6	726354	726359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_022108	TTG	2	6	726452	726457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_022108	ATT	2	6	726516	726521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_022108	CTTT	2	8	726541	726548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16117	NC_022108	AGA	3	9	726581	726589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_022108	TCG	2	6	726590	726595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_022108	TAC	2	6	726626	726631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_022108	T	6	6	726687	726692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_022108	AGA	2	6	726743	726748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_022108	CTTA	2	8	726820	726827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16123	NC_022108	TTGAA	2	10	726844	726853	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_022108	TTCG	2	8	726880	726887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16125	NC_022108	T	6	6	726954	726959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_022108	AGA	2	6	727001	727006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_022108	TTG	2	6	727154	727159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_022108	ATT	2	6	727168	727173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_022108	TTCG	2	8	727222	727229	0 %	50 %	25 %	25 %	532351968
16130	NC_022108	GT	3	6	727231	727236	0 %	50 %	50 %	0 %	532351968
16131	NC_022108	TTC	2	6	727244	727249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351968
16132	NC_022108	TTG	2	6	727280	727285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351968
16133	NC_022108	GAAA	2	8	727308	727315	75 %	0 %	25 %	0 %	532351968
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16135	NC_022108	TTCT	2	8	727340	727347	0 %	75 %	0 %	25 %	532351968
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16155	NC_022108	A	6	6	728380	728385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16166	NC_022108	AGA	2	6	728740	728745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16174	NC_022108	AATA	2	8	728992	728999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16175	NC_022108	T	6	6	729004	729009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16265	NC_022108	GATG	2	8	732906	732913	25 %	25 %	50 %	0 %	532351969
16266	NC_022108	GA	3	6	733007	733012	50 %	0 %	50 %	0 %	532351969
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16294	NC_022108	N	14	14	734386	734399	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16295	NC_022108	T	6	6	734401	734406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16296	NC_022108	TTG	2	6	734422	734427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16297	NC_022108	ATT	2	6	734472	734477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16304	NC_022108	TGG	2	6	734722	734727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16305	NC_022108	TCT	2	6	734787	734792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16321	NC_022108	ATT	2	6	735355	735360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16322	NC_022108	TA	3	6	735399	735404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16332	NC_022108	CTT	2	6	735657	735662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16333	NC_022108	TG	3	6	735677	735682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16372	NC_022108	TCA	2	6	737284	737289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16374	NC_022108	TTC	2	6	737428	737433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16375	NC_022108	TGC	2	6	737442	737447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16379	NC_022108	T	13	13	737588	737600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16385	NC_022108	TTG	2	6	737751	737756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16386	NC_022108	TATTGA	2	12	737779	737790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532351971
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16388	NC_022108	A	6	6	737864	737869	100 %	0 %	0 %	0 %	532351971
16389	NC_022108	TGT	2	6	737875	737880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351971
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