MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022108	TTA	2	6	700009	700014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351956
15502	NC_022108	AGG	2	6	700024	700029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351956
15503	NC_022108	AGC	2	6	700044	700049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351956
15504	NC_022108	TTG	2	6	700054	700059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351956
15505	NC_022108	CTT	2	6	700067	700072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
15506	NC_022108	AAG	2	6	700190	700195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
15507	NC_022108	AAG	2	6	700220	700225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
15508	NC_022108	TTG	2	6	700275	700280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351956
15509	NC_022108	CAG	3	9	700346	700354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351956
15510	NC_022108	T	6	6	700364	700369	0 %	100 %	0 %	0 %	532351956
15511	NC_022108	TTG	2	6	700417	700422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351956
15512	NC_022108	TAGT	2	8	700435	700442	25 %	50 %	25 %	0 %	532351956
15513	NC_022108	ATC	2	6	700455	700460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
15514	NC_022108	A	6	6	700479	700484	100 %	0 %	0 %	0 %	532351956
15515	NC_022108	T	6	6	700491	700496	0 %	100 %	0 %	0 %	532351956
15516	NC_022108	GTTC	2	8	700499	700506	0 %	50 %	25 %	25 %	532351956
15517	NC_022108	CT	3	6	700813	700818	0 %	50 %	0 %	50 %	532351956
15518	NC_022108	TGCTTG	2	12	700824	700835	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532351956
15519	NC_022108	AAG	2	6	700837	700842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
15520	NC_022108	ACC	2	6	700933	700938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351956
15521	NC_022108	TG	3	6	701011	701016	0 %	50 %	50 %	0 %	532351956
15522	NC_022108	TAC	2	6	701021	701026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
15523	NC_022108	TCC	2	6	701032	701037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351956
15524	NC_022108	CTT	2	6	701096	701101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
15525	NC_022108	ATT	2	6	701136	701141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351956
15526	NC_022108	TCCA	2	8	701149	701156	25 %	25 %	0 %	50 %	532351956
15527	NC_022108	TGCT	2	8	701273	701280	0 %	50 %	25 %	25 %	532351956
15528	NC_022108	TG	3	6	701308	701313	0 %	50 %	50 %	0 %	532351956
15529	NC_022108	TCA	2	6	701323	701328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
15530	NC_022108	ATA	2	6	701331	701336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351956
15531	NC_022108	AGCTG	2	10	701395	701404	20 %	20 %	40 %	20 %	532351956
15532	NC_022108	CTT	2	6	701420	701425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
15533	NC_022108	TTCT	2	8	701442	701449	0 %	75 %	0 %	25 %	532351956
15534	NC_022108	CTG	2	6	701535	701540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
15535	NC_022108	TGC	2	6	701562	701567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
15536	NC_022108	TCT	2	6	701608	701613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
15537	NC_022108	TAC	2	6	701686	701691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
15538	NC_022108	CTG	2	6	701704	701709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
15539	NC_022108	TGC	2	6	701716	701721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
15540	NC_022108	CTT	2	6	701733	701738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
15541	NC_022108	C	6	6	701740	701745	0 %	0 %	0 %	100 %	532351956
15542	NC_022108	TCC	2	6	701750	701755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351956
15543	NC_022108	CTC	2	6	701858	701863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351956
15544	NC_022108	TGGC	2	8	701872	701879	0 %	25 %	50 %	25 %	532351956
15545	NC_022108	TAAA	2	8	701926	701933	75 %	25 %	0 %	0 %	532351956
15546	NC_022108	AGT	2	6	701948	701953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351956
15547	NC_022108	AAG	2	6	701974	701979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
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15549	NC_022108	A	6	6	702026	702031	100 %	0 %	0 %	0 %	532351956
15550	NC_022108	T	7	7	702033	702039	0 %	100 %	0 %	0 %	532351956
15551	NC_022108	TGTT	2	8	702043	702050	0 %	75 %	25 %	0 %	532351956
15552	NC_022108	TAA	2	6	702119	702124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_022108	AGA	2	6	702158	702163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_022108	ATT	2	6	702164	702169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_022108	A	6	6	702222	702227	100 %	0 %	0 %	0 %	532351957
15556	NC_022108	ATG	2	6	702282	702287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
15557	NC_022108	AGTT	2	8	702306	702313	25 %	50 %	25 %	0 %	532351957
15558	NC_022108	TCT	2	6	702323	702328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351957
15559	NC_022108	TTGG	2	8	702443	702450	0 %	50 %	50 %	0 %	532351957
15560	NC_022108	TC	3	6	702454	702459	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
15561	NC_022108	CAA	2	6	702503	702508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351957
15562	NC_022108	TCC	2	6	702511	702516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351957
15563	NC_022108	TTTG	2	8	702544	702551	0 %	75 %	25 %	0 %	532351957
15564	NC_022108	ACT	2	6	702560	702565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351957
15565	NC_022108	TAG	2	6	702567	702572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
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15568	NC_022108	GAT	2	6	702838	702843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
15569	NC_022108	ATCT	2	8	702918	702925	25 %	50 %	0 %	25 %	532351957
15570	NC_022108	ATC	2	6	702932	702937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351957
15571	NC_022108	TTC	2	6	702940	702945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351957
15572	NC_022108	TC	4	8	702944	702951	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
15573	NC_022108	TATC	2	8	703011	703018	25 %	50 %	0 %	25 %	532351957
15574	NC_022108	TA	3	6	703052	703057	50 %	50 %	0 %	0 %	532351957
15575	NC_022108	CT	3	6	703072	703077	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
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15579	NC_022108	GC	3	6	703194	703199	0 %	0 %	50 %	50 %	532351957
15580	NC_022108	AACT	2	8	703220	703227	50 %	25 %	0 %	25 %	532351957
15581	NC_022108	TGA	2	6	703269	703274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
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15588	NC_022108	CTT	2	6	703718	703723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351957
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15591	NC_022108	CT	3	6	703793	703798	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
15592	NC_022108	CTTC	2	8	703803	703810	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
15593	NC_022108	GATT	2	8	703853	703860	25 %	50 %	25 %	0 %	532351957
15594	NC_022108	CTAC	2	8	703957	703964	25 %	25 %	0 %	50 %	532351957
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15604	NC_022108	CAA	2	6	704463	704468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351957
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15606	NC_022108	GCA	2	6	704528	704533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351957
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15608	NC_022108	CTAG	2	8	704600	704607	25 %	25 %	25 %	25 %	532351957
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15612	NC_022108	AAAT	2	8	704703	704710	75 %	25 %	0 %	0 %	532351957
15613	NC_022108	ACC	2	6	704739	704744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15614	NC_022108	CTG	2	6	704819	704824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351958
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15869	NC_022108	TCC	2	6	716204	716209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351965
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15874	NC_022108	CAA	2	6	716524	716529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351965
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15876	NC_022108	T	7	7	716630	716636	0 %	100 %	0 %	0 %	532351965
15877	NC_022108	TCGA	2	8	716643	716650	25 %	25 %	25 %	25 %	532351965
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15880	NC_022108	TCA	2	6	716695	716700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351965
15881	NC_022108	TTTG	2	8	716704	716711	0 %	75 %	25 %	0 %	532351965
15882	NC_022108	GTT	2	6	716718	716723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351965
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15884	NC_022108	CTC	2	6	716812	716817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15885	NC_022108	ATG	2	6	716870	716875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351966
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15900	NC_022108	CAT	2	6	717437	717442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351966
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15902	NC_022108	AAG	2	6	717576	717581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15903	NC_022108	TAA	2	6	717611	717616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15913	NC_022108	A	8	8	718147	718154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15914	NC_022108	T	7	7	718170	718176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15915	NC_022108	GA	3	6	718250	718255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15916	NC_022108	N	59	59	718277	718335	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15922	NC_022108	TTG	2	6	718714	718719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15977	NC_022108	ATG	2	6	721093	721098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15988	NC_022108	TAA	2	6	721474	721479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15989	NC_022108	TTA	2	6	721488	721493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15990	NC_022108	AG	3	6	721501	721506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15991	NC_022108	GCTA	2	8	721556	721563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15992	NC_022108	GA	3	6	721581	721586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15993	NC_022108	GAA	2	6	721597	721602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15994	NC_022108	GCA	2	6	721609	721614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15995	NC_022108	GAG	2	6	721628	721633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15996	NC_022108	GCGTA	2	10	721652	721661	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15997	NC_022108	N	17	17	721712	721728	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15998	NC_022108	TCT	2	6	721730	721735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15999	NC_022108	CTT	2	6	721767	721772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16000	NC_022108	TAA	3	9	721797	721805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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