MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022108	GAA	2	6	655282	655287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351919
14502	NC_022108	GAT	2	6	655603	655608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351919
14503	NC_022108	GA	3	6	655817	655822	50 %	0 %	50 %	0 %	532351919
14504	NC_022108	TAT	2	6	655833	655838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351919
14505	NC_022108	TTTG	2	8	655851	655858	0 %	75 %	25 %	0 %	532351919
14506	NC_022108	ATT	2	6	655942	655947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351919
14507	NC_022108	GT	3	6	656153	656158	0 %	50 %	50 %	0 %	532351919
14508	NC_022108	TC	3	6	656183	656188	0 %	50 %	0 %	50 %	532351919
14509	NC_022108	TCCT	2	8	656226	656233	0 %	50 %	0 %	50 %	532351919
14510	NC_022108	ATT	2	6	656276	656281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351919
14511	NC_022108	CA	3	6	656288	656293	50 %	0 %	0 %	50 %	532351919
14512	NC_022108	A	6	6	656366	656371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_022108	CAGG	2	8	656390	656397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14514	NC_022108	TTC	2	6	656438	656443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_022108	AAT	2	6	656531	656536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_022108	TCC	2	6	656655	656660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14517	NC_022108	GGC	2	6	656719	656724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_022108	GTT	2	6	656869	656874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351920
14519	NC_022108	A	7	7	656885	656891	100 %	0 %	0 %	0 %	532351920
14520	NC_022108	AGA	2	6	656895	656900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351920
14521	NC_022108	TTGG	2	8	656952	656959	0 %	50 %	50 %	0 %	532351920
14522	NC_022108	GCT	2	6	656986	656991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351920
14523	NC_022108	ATT	2	6	657019	657024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351920
14524	NC_022108	AC	3	6	657065	657070	50 %	0 %	0 %	50 %	532351920
14525	NC_022108	CTT	2	6	657074	657079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351920
14526	NC_022108	GCT	2	6	657109	657114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351920
14527	NC_022108	A	6	6	657287	657292	100 %	0 %	0 %	0 %	532351920
14528	NC_022108	CTT	2	6	657307	657312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351920
14529	NC_022108	GAA	2	6	657424	657429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351920
14530	NC_022108	CT	3	6	657590	657595	0 %	50 %	0 %	50 %	532351921
14531	NC_022108	AGA	2	6	657628	657633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351921
14532	NC_022108	CAA	2	6	657671	657676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351921
14533	NC_022108	TCA	3	9	657709	657717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351921
14534	NC_022108	A	6	6	657746	657751	100 %	0 %	0 %	0 %	532351921
14535	NC_022108	ATT	2	6	657760	657765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351921
14536	NC_022108	TTA	2	6	657847	657852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351921
14537	NC_022108	A	6	6	657953	657958	100 %	0 %	0 %	0 %	532351921
14538	NC_022108	ATC	2	6	658054	658059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351921
14539	NC_022108	CAA	2	6	658067	658072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351921
14540	NC_022108	CTTTT	2	10	658075	658084	0 %	80 %	0 %	20 %	532351921
14541	NC_022108	T	7	7	658081	658087	0 %	100 %	0 %	0 %	532351921
14542	NC_022108	ATT	2	6	658102	658107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351921
14543	NC_022108	AAG	2	6	658131	658136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351921
14544	NC_022108	CTC	2	6	658139	658144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351921
14545	NC_022108	CTT	2	6	658190	658195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351921
14546	NC_022108	GAC	2	6	658220	658225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351921
14547	NC_022108	AAC	2	6	658251	658256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351921
14548	NC_022108	ACA	2	6	658361	658366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351922
14549	NC_022108	T	6	6	658379	658384	0 %	100 %	0 %	0 %	532351922
14550	NC_022108	GTT	2	6	658409	658414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351922
14551	NC_022108	ATG	2	6	658470	658475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351922
14552	NC_022108	TCA	2	6	658516	658521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351922
14553	NC_022108	CT	3	6	658578	658583	0 %	50 %	0 %	50 %	532351922
14554	NC_022108	A	7	7	658675	658681	100 %	0 %	0 %	0 %	532351922
14555	NC_022108	A	7	7	658693	658699	100 %	0 %	0 %	0 %	532351922
14556	NC_022108	AAG	2	6	658714	658719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351922
14557	NC_022108	GAA	2	6	658746	658751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351922
14558	NC_022108	ATC	2	6	658788	658793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351922
14559	NC_022108	GAT	2	6	658802	658807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351922
14560	NC_022108	T	6	6	658930	658935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_022108	A	9	9	658970	658978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_022108	GTC	2	6	659046	659051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_022108	TTC	2	6	659084	659089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351923
14564	NC_022108	ACT	2	6	659114	659119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351923
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14566	NC_022108	T	6	6	659262	659267	0 %	100 %	0 %	0 %	532351923
14567	NC_022108	GAA	2	6	659342	659347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351923
14568	NC_022108	A	6	6	659628	659633	100 %	0 %	0 %	0 %	532351923
14569	NC_022108	TTTA	2	8	659701	659708	25 %	75 %	0 %	0 %	532351923
14570	NC_022108	GAA	2	6	659738	659743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351923
14571	NC_022108	AGA	2	6	659746	659751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351923
14572	NC_022108	AGA	2	6	659812	659817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351923
14573	NC_022108	AATC	2	8	659818	659825	50 %	25 %	0 %	25 %	532351923
14574	NC_022108	CAA	2	6	659897	659902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351923
14575	NC_022108	A	6	6	659910	659915	100 %	0 %	0 %	0 %	532351923
14576	NC_022108	TAAA	2	8	660001	660008	75 %	25 %	0 %	0 %	532351923
14577	NC_022108	A	6	6	660006	660011	100 %	0 %	0 %	0 %	532351923
14578	NC_022108	AAC	2	6	660016	660021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351923
14579	NC_022108	TG	3	6	660029	660034	0 %	50 %	50 %	0 %	532351923
14580	NC_022108	GGA	3	9	660035	660043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351923
14581	NC_022108	TCC	2	6	660078	660083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351923
14582	NC_022108	ATA	2	6	660240	660245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351924
14583	NC_022108	CTT	2	6	660283	660288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351924
14584	NC_022108	CTA	2	6	660319	660324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351924
14585	NC_022108	TAC	2	6	660329	660334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351924
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14587	NC_022108	CTT	2	6	660383	660388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351924
14588	NC_022108	ATG	2	6	660393	660398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351924
14589	NC_022108	ACT	2	6	660504	660509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351924
14590	NC_022108	CT	3	6	660560	660565	0 %	50 %	0 %	50 %	532351924
14591	NC_022108	CCT	2	6	660594	660599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351924
14592	NC_022108	TCT	2	6	660648	660653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351924
14593	NC_022108	ACC	2	6	660752	660757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351924
14594	NC_022108	CT	3	6	660768	660773	0 %	50 %	0 %	50 %	532351924
14595	NC_022108	GAA	2	6	660836	660841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
14596	NC_022108	T	8	8	660858	660865	0 %	100 %	0 %	0 %	532351924
14597	NC_022108	GAA	2	6	660866	660871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
14598	NC_022108	ATT	2	6	660960	660965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351924
14599	NC_022108	GCC	2	6	660997	661002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351924
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14601	NC_022108	GAT	2	6	661028	661033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351924
14602	NC_022108	GAG	2	6	661092	661097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351924
14603	NC_022108	TAG	2	6	661119	661124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351924
14604	NC_022108	GAA	2	6	661175	661180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
14605	NC_022108	TCG	2	6	661183	661188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351924
14606	NC_022108	ATC	2	6	661259	661264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351924
14607	NC_022108	GAT	2	6	661334	661339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351924
14608	NC_022108	AGA	2	6	661345	661350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
14609	NC_022108	A	6	6	661380	661385	100 %	0 %	0 %	0 %	532351924
14610	NC_022108	A	7	7	661405	661411	100 %	0 %	0 %	0 %	532351924
14611	NC_022108	TGC	3	9	661453	661461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351924
14612	NC_022108	CAG	2	6	661485	661490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351924
14613	NC_022108	ATTG	2	8	661537	661544	25 %	50 %	25 %	0 %	532351924
14614	NC_022108	TCT	2	6	661552	661557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351924
14615	NC_022108	AAG	2	6	661614	661619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
14616	NC_022108	GTA	2	6	661629	661634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351924
14617	NC_022108	CT	3	6	661639	661644	0 %	50 %	0 %	50 %	532351924
14618	NC_022108	ACG	2	6	661747	661752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351924
14619	NC_022108	CAA	2	6	661778	661783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351924
14620	NC_022108	TAT	2	6	661804	661809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351924
14621	NC_022108	AAG	2	6	661839	661844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
14622	NC_022108	AAG	2	6	661851	661856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
14623	NC_022108	AGC	2	6	661930	661935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351924
14624	NC_022108	TGA	2	6	661977	661982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351924
14625	NC_022108	GCA	2	6	661985	661990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351924
14626	NC_022108	A	7	7	661990	661996	100 %	0 %	0 %	0 %	532351924
14627	NC_022108	CTC	2	6	662000	662005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351924
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14629	NC_022108	CTA	2	6	662080	662085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351924
14630	NC_022108	GGA	2	6	662138	662143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14631	NC_022108	GTC	2	6	662209	662214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14632	NC_022108	GA	3	6	662232	662237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14633	NC_022108	TCA	2	6	662279	662284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14634	NC_022108	GCGT	2	8	662308	662315	0 %	25 %	50 %	25 %	532351925
14635	NC_022108	TGAT	2	8	662486	662493	25 %	50 %	25 %	0 %	532351925
14636	NC_022108	GCT	2	6	662566	662571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351925
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14639	NC_022108	TCA	2	6	662651	662656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351925
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14641	NC_022108	A	8	8	662772	662779	100 %	0 %	0 %	0 %	532351925
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14650	NC_022108	TCA	2	6	663197	663202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351925
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14653	NC_022108	AGA	2	6	663303	663308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351925
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14658	NC_022108	CTC	2	6	663578	663583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14659	NC_022108	A	7	7	663589	663595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14660	NC_022108	AATA	2	8	663622	663629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14661	NC_022108	CACG	2	8	663647	663654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14662	NC_022108	TG	3	6	663679	663684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14663	NC_022108	TAT	2	6	663690	663695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14664	NC_022108	CTC	2	6	663753	663758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351926
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14720	NC_022108	ATT	2	6	665795	665800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351927
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14726	NC_022108	AACA	2	8	666250	666257	75 %	0 %	0 %	25 %	532351927
14727	NC_022108	TCT	2	6	666270	666275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351927
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14730	NC_022108	CTT	2	6	666386	666391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351927
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14739	NC_022108	TC	3	6	666886	666891	0 %	50 %	0 %	50 %	532351927
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