MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022108	CAT	2	6	565458	565463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828
12502	NC_022108	CA	3	6	565556	565561	50 %	0 %	0 %	50 %	532351828
12503	NC_022108	AAT	2	6	565590	565595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351828
12504	NC_022108	GAT	2	6	565607	565612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351828
12505	NC_022108	C	6	6	565632	565637	0 %	0 %	0 %	100 %	532351828
12506	NC_022108	TCA	2	6	565639	565644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828
12507	NC_022108	TGT	2	6	565664	565669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351828
12508	NC_022108	TAA	2	6	565705	565710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351828
12509	NC_022108	CGT	2	6	565742	565747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351828
12510	NC_022108	ATC	2	6	565806	565811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828
12511	NC_022108	TCT	2	6	565819	565824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351828
12512	NC_022108	T	6	6	565911	565916	0 %	100 %	0 %	0 %	532351828
12513	NC_022108	ATCA	2	8	565980	565987	50 %	25 %	0 %	25 %	532351828
12514	NC_022108	CTA	2	6	566093	566098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828
12515	NC_022108	A	6	6	566143	566148	100 %	0 %	0 %	0 %	532351828
12516	NC_022108	AGA	2	6	566176	566181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351828
12517	NC_022108	AGGTA	2	10	566318	566327	40 %	20 %	40 %	0 %	532351828
12518	NC_022108	CAA	2	6	566434	566439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351828
12519	NC_022108	CTC	2	6	566465	566470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351828
12520	NC_022108	CTT	2	6	566534	566539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351828
12521	NC_022108	CGTC	2	8	566541	566548	0 %	25 %	25 %	50 %	532351828
12522	NC_022108	CCA	2	6	566568	566573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351828
12523	NC_022108	A	6	6	566575	566580	100 %	0 %	0 %	0 %	532351828
12524	NC_022108	ATT	2	6	566596	566601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351828
12525	NC_022108	A	6	6	566602	566607	100 %	0 %	0 %	0 %	532351828
12526	NC_022108	ACAA	2	8	566613	566620	75 %	0 %	0 %	25 %	532351828
12527	NC_022108	ATT	2	6	566628	566633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351828
12528	NC_022108	A	6	6	566642	566647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_022108	ATTTT	2	10	566651	566660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_022108	AAAAAT	2	12	566671	566682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_022108	A	6	6	566697	566702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_022108	TTG	2	6	566766	566771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_022108	CCT	2	6	566807	566812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_022108	AAAG	2	8	566865	566872	75 %	0 %	25 %	0 %	532351829
12535	NC_022108	CTA	2	6	566913	566918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351829
12536	NC_022108	ATC	2	6	566970	566975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351829
12537	NC_022108	AAC	2	6	567118	567123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351830
12538	NC_022108	ACA	2	6	567152	567157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351830
12539	NC_022108	TTC	2	6	567159	567164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351830
12540	NC_022108	ATCA	2	8	567300	567307	50 %	25 %	0 %	25 %	532351830
12541	NC_022108	TCC	2	6	567333	567338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351830
12542	NC_022108	GAA	2	6	567363	567368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351830
12543	NC_022108	GTT	2	6	567560	567565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351830
12544	NC_022108	CGA	2	6	567581	567586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351830
12545	NC_022108	TCA	2	6	567634	567639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351830
12546	NC_022108	ATT	2	6	567669	567674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351830
12547	NC_022108	GAG	2	6	567725	567730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351830
12548	NC_022108	T	6	6	567978	567983	0 %	100 %	0 %	0 %	532351830
12549	NC_022108	ACG	2	6	567993	567998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351830
12550	NC_022108	TCT	2	6	568024	568029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351830
12551	NC_022108	GGAA	2	8	568032	568039	50 %	0 %	50 %	0 %	532351830
12552	NC_022108	TCA	2	6	568117	568122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351830
12553	NC_022108	TTTC	2	8	568280	568287	0 %	75 %	0 %	25 %	532351830
12554	NC_022108	TCT	2	6	568288	568293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351830
12555	NC_022108	CAA	2	6	568298	568303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351830
12556	NC_022108	CTT	2	6	568319	568324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351830
12557	NC_022108	CT	3	6	568390	568395	0 %	50 %	0 %	50 %	532351830
12558	NC_022108	CGA	2	6	568443	568448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351830
12559	NC_022108	TTC	2	6	568451	568456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351830
12560	NC_022108	ATT	2	6	568466	568471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351830
12561	NC_022108	T	6	6	568498	568503	0 %	100 %	0 %	0 %	532351831
12562	NC_022108	AGA	2	6	568511	568516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351831
12563	NC_022108	T	7	7	568561	568567	0 %	100 %	0 %	0 %	532351831
12564	NC_022108	ACA	2	6	568648	568653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351831
12565	NC_022108	CAA	2	6	568717	568722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351831
12566	NC_022108	AC	3	6	568727	568732	50 %	0 %	0 %	50 %	532351831
12567	NC_022108	TCT	2	6	568749	568754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351831
12568	NC_022108	CTA	2	6	568806	568811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351831
12569	NC_022108	T	6	6	569018	569023	0 %	100 %	0 %	0 %	532351831
12570	NC_022108	ACAG	2	8	569051	569058	50 %	0 %	25 %	25 %	532351831
12571	NC_022108	TTC	2	6	569110	569115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
12572	NC_022108	ATA	2	6	569130	569135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
12573	NC_022108	TAA	3	9	569152	569160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
12574	NC_022108	TTAA	2	8	569216	569223	50 %	50 %	0 %	0 %	532351832
12575	NC_022108	GCA	2	6	569228	569233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351832
12576	NC_022108	CT	3	6	569317	569322	0 %	50 %	0 %	50 %	532351832
12577	NC_022108	TAA	2	6	569376	569381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
12578	NC_022108	CTG	2	6	569385	569390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
12579	NC_022108	CTG	2	6	569476	569481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
12580	NC_022108	GCT	3	9	569523	569531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
12581	NC_022108	CT	3	6	569607	569612	0 %	50 %	0 %	50 %	532351832
12582	NC_022108	AAT	2	6	569664	569669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
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12586	NC_022108	ACA	2	6	569874	569879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351832
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12588	NC_022108	TCT	2	6	569930	569935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
12589	NC_022108	TTC	2	6	570079	570084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
12590	NC_022108	TCT	2	6	570218	570223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
12591	NC_022108	AAAT	2	8	570232	570239	75 %	25 %	0 %	0 %	532351832
12592	NC_022108	C	6	6	570327	570332	0 %	0 %	0 %	100 %	532351832
12593	NC_022108	A	7	7	570342	570348	100 %	0 %	0 %	0 %	532351832
12594	NC_022108	CTT	2	6	570354	570359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
12595	NC_022108	GAAA	2	8	570391	570398	75 %	0 %	25 %	0 %	532351832
12596	NC_022108	CACT	2	8	570411	570418	25 %	25 %	0 %	50 %	532351832
12597	NC_022108	CTG	2	6	570441	570446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
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12599	NC_022108	A	6	6	570532	570537	100 %	0 %	0 %	0 %	532351832
12600	NC_022108	AAGCA	2	10	570544	570553	60 %	0 %	20 %	20 %	532351832
12601	NC_022108	TA	3	6	570577	570582	50 %	50 %	0 %	0 %	532351832
12602	NC_022108	AAG	2	6	570627	570632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351832
12603	NC_022108	C	6	6	570674	570679	0 %	0 %	0 %	100 %	532351832
12604	NC_022108	TGC	2	6	570785	570790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
12605	NC_022108	CTC	2	6	570844	570849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351832
12606	NC_022108	GTC	2	6	570851	570856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
12607	NC_022108	TCT	2	6	570923	570928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
12608	NC_022108	AACT	2	8	570970	570977	50 %	25 %	0 %	25 %	532351832
12609	NC_022108	GAA	2	6	571055	571060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351832
12610	NC_022108	GCT	2	6	571174	571179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
12611	NC_022108	AC	3	6	571216	571221	50 %	0 %	0 %	50 %	532351832
12612	NC_022108	T	6	6	571243	571248	0 %	100 %	0 %	0 %	532351832
12613	NC_022108	CAT	2	6	571266	571271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351832
12614	NC_022108	TTC	2	6	571288	571293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
12615	NC_022108	TTA	2	6	571415	571420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351832
12616	NC_022108	GA	3	6	571455	571460	50 %	0 %	50 %	0 %	532351832
12617	NC_022108	T	6	6	571594	571599	0 %	100 %	0 %	0 %	532351832
12618	NC_022108	TTG	2	6	571643	571648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351832
12619	NC_022108	A	6	6	571725	571730	100 %	0 %	0 %	0 %	532351833
12620	NC_022108	AACCC	2	10	571738	571747	40 %	0 %	0 %	60 %	532351833
12621	NC_022108	TTC	2	6	571790	571795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351833
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12992	NC_022108	ATG	2	6	586857	586862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351849
12993	NC_022108	AGT	2	6	586889	586894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351849
12994	NC_022108	TCTT	2	8	586948	586955	0 %	75 %	0 %	25 %	532351849
12995	NC_022108	ACA	2	6	587116	587121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351850
12996	NC_022108	GGTT	2	8	587181	587188	0 %	50 %	50 %	0 %	532351850
12997	NC_022108	TTC	2	6	587224	587229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351850
12998	NC_022108	ATA	2	6	587290	587295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351850
12999	NC_022108	A	6	6	587306	587311	100 %	0 %	0 %	0 %	532351850
13000	NC_022108	AAG	2	6	587363	587368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351850

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