MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022108	ATT	2	6	543165	543170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351808
12002	NC_022108	GAA	2	6	543369	543374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351808
12003	NC_022108	ACA	2	6	543386	543391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351808
12004	NC_022108	TCC	2	6	543420	543425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351808
12005	NC_022108	AT	3	6	543508	543513	50 %	50 %	0 %	0 %	532351808
12006	NC_022108	GAAAA	2	10	543538	543547	80 %	0 %	20 %	0 %	532351808
12007	NC_022108	T	6	6	543555	543560	0 %	100 %	0 %	0 %	532351808
12008	NC_022108	CTA	2	6	543583	543588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351808
12009	NC_022108	TGC	2	6	543611	543616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351808
12010	NC_022108	GAA	2	6	543686	543691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351808
12011	NC_022108	CCA	2	6	543713	543718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351808
12012	NC_022108	ACAAGA	2	12	543788	543799	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532351808
12013	NC_022108	GGA	2	6	543813	543818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351808
12014	NC_022108	CCCT	2	8	543826	543833	0 %	25 %	0 %	75 %	532351808
12015	NC_022108	CTA	2	6	543911	543916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351808
12016	NC_022108	TCCC	2	8	543943	543950	0 %	25 %	0 %	75 %	532351808
12017	NC_022108	AGA	2	6	543965	543970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351808
12018	NC_022108	TCC	2	6	543973	543978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351808
12019	NC_022108	TAC	2	6	543990	543995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351808
12020	NC_022108	AAT	2	6	544017	544022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351808
12021	NC_022108	ATT	2	6	544069	544074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351808
12022	NC_022108	CT	3	6	544098	544103	0 %	50 %	0 %	50 %	532351808
12023	NC_022108	CGAA	2	8	544112	544119	50 %	0 %	25 %	25 %	532351808
12024	NC_022108	GCTC	2	8	544160	544167	0 %	25 %	25 %	50 %	532351808
12025	NC_022108	TCCT	2	8	544230	544237	0 %	50 %	0 %	50 %	532351808
12026	NC_022108	GGT	2	6	544283	544288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_022108	CTT	2	6	544327	544332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12028	NC_022108	T	7	7	544338	544344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12029	NC_022108	CCT	2	6	544410	544415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12030	NC_022108	TCCC	2	8	544459	544466	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12031	NC_022108	GAG	2	6	544473	544478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_022108	CAA	2	6	544530	544535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351809
12033	NC_022108	A	7	7	544596	544602	100 %	0 %	0 %	0 %	532351809
12034	NC_022108	CTC	2	6	544637	544642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351809
12035	NC_022108	CTA	2	6	544692	544697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351809
12036	NC_022108	CT	5	10	544727	544736	0 %	50 %	0 %	50 %	532351809
12037	NC_022108	T	6	6	544817	544822	0 %	100 %	0 %	0 %	532351809
12038	NC_022108	TGA	2	6	544879	544884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351809
12039	NC_022108	GTT	2	6	544928	544933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351809
12040	NC_022108	ACA	2	6	544957	544962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351809
12041	NC_022108	CAG	2	6	544986	544991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351809
12042	NC_022108	CTT	2	6	544994	544999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351809
12043	NC_022108	A	6	6	545011	545016	100 %	0 %	0 %	0 %	532351809
12044	NC_022108	CAA	2	6	545084	545089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351810
12045	NC_022108	TCC	2	6	545092	545097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351810
12046	NC_022108	CTTC	2	8	545257	545264	0 %	50 %	0 %	50 %	532351810
12047	NC_022108	T	8	8	545293	545300	0 %	100 %	0 %	0 %	532351810
12048	NC_022108	CTA	2	6	545312	545317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351810
12049	NC_022108	ACA	2	6	545326	545331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351810
12050	NC_022108	GAA	2	6	545441	545446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351810
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12052	NC_022108	A	7	7	545500	545506	100 %	0 %	0 %	0 %	532351810
12053	NC_022108	TCC	2	6	545573	545578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351810
12054	NC_022108	CTT	2	6	545601	545606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351810
12055	NC_022108	TA	3	6	545610	545615	50 %	50 %	0 %	0 %	532351810
12056	NC_022108	CTC	2	6	545654	545659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351810
12057	NC_022108	TTC	2	6	545728	545733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351810
12058	NC_022108	CT	3	6	545747	545752	0 %	50 %	0 %	50 %	532351811
12059	NC_022108	ACT	2	6	545773	545778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351811
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12062	NC_022108	AAGA	2	8	545927	545934	75 %	0 %	25 %	0 %	532351811
12063	NC_022108	AGA	2	6	545940	545945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351811
12064	NC_022108	GCA	2	6	545978	545983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351811
12065	NC_022108	T	7	7	546054	546060	0 %	100 %	0 %	0 %	532351811
12066	NC_022108	AAAC	2	8	546110	546117	75 %	0 %	0 %	25 %	532351811
12067	NC_022108	CTT	2	6	546137	546142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351811
12068	NC_022108	GC	3	6	546155	546160	0 %	0 %	50 %	50 %	532351811
12069	NC_022108	CAA	2	6	546195	546200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351811
12070	NC_022108	CT	3	6	546227	546232	0 %	50 %	0 %	50 %	532351811
12071	NC_022108	CAT	2	6	546237	546242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351811
12072	NC_022108	GAAA	2	8	546243	546250	75 %	0 %	25 %	0 %	532351811
12073	NC_022108	GCAA	2	8	546280	546287	50 %	0 %	25 %	25 %	532351811
12074	NC_022108	ACC	2	6	546410	546415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12075	NC_022108	A	6	6	546452	546457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_022108	TAC	2	6	546496	546501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12077	NC_022108	A	6	6	546506	546511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_022108	CTAT	2	8	546531	546538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12079	NC_022108	A	6	6	546546	546551	100 %	0 %	0 %	0 %	532352243
12080	NC_022108	CT	3	6	546582	546587	0 %	50 %	0 %	50 %	532352243
12081	NC_022108	CAAA	2	8	546609	546616	75 %	0 %	0 %	25 %	532352243
12082	NC_022108	TCT	2	6	546760	546765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12083	NC_022108	GCT	2	6	546842	546847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351812
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12086	NC_022108	GAA	2	6	546896	546901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351812
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12088	NC_022108	GAA	2	6	547094	547099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351812
12089	NC_022108	A	8	8	547189	547196	100 %	0 %	0 %	0 %	532351812
12090	NC_022108	TGA	2	6	547249	547254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351812
12091	NC_022108	TCT	2	6	547263	547268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351812
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12093	NC_022108	ACT	2	6	547468	547473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351812
12094	NC_022108	CAT	2	6	547489	547494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351812
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12096	NC_022108	TTG	2	6	547622	547627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12097	NC_022108	AGG	2	6	547704	547709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12098	NC_022108	GAC	2	6	547780	547785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_022108	CA	3	6	547796	547801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12100	NC_022108	CTT	2	6	547811	547816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12101	NC_022108	CT	3	6	547829	547834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12102	NC_022108	AAGAG	2	10	547911	547920	60 %	0 %	40 %	0 %	532351813
12103	NC_022108	TGA	2	6	547971	547976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351813
12104	NC_022108	ACA	2	6	548006	548011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351813
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12106	NC_022108	CCT	2	6	548034	548039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351813
12107	NC_022108	AGC	2	6	548072	548077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351813
12108	NC_022108	GA	3	6	548099	548104	50 %	0 %	50 %	0 %	532351813
12109	NC_022108	CCA	2	6	548158	548163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351813
12110	NC_022108	ATA	2	6	548187	548192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351813
12111	NC_022108	A	7	7	548195	548201	100 %	0 %	0 %	0 %	532351813
12112	NC_022108	CT	3	6	548223	548228	0 %	50 %	0 %	50 %	532351813
12113	NC_022108	TAA	2	6	548311	548316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351813
12114	NC_022108	ATGG	2	8	548395	548402	25 %	25 %	50 %	0 %	532351813
12115	NC_022108	TC	3	6	548414	548419	0 %	50 %	0 %	50 %	532351813
12116	NC_022108	CAA	2	6	548426	548431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351813
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12118	NC_022108	GCTT	2	8	548619	548626	0 %	50 %	25 %	25 %	532351813
12119	NC_022108	T	7	7	548641	548647	0 %	100 %	0 %	0 %	532351813
12120	NC_022108	CTTC	2	8	548670	548677	0 %	50 %	0 %	50 %	532351813
12121	NC_022108	TCCCTC	2	12	548700	548711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351813
12122	NC_022108	CTA	2	6	548722	548727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351813
12123	NC_022108	A	8	8	548753	548760	100 %	0 %	0 %	0 %	532351813
12124	NC_022108	TTC	2	6	548804	548809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351813
12125	NC_022108	TCT	2	6	548810	548815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351813
12126	NC_022108	CT	4	8	548817	548824	0 %	50 %	0 %	50 %	532351813
12127	NC_022108	TGT	2	6	548905	548910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351814
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12170	NC_022108	CTTT	2	8	550793	550800	0 %	75 %	0 %	25 %	532351814
12171	NC_022108	A	6	6	550819	550824	100 %	0 %	0 %	0 %	532351814
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12197	NC_022108	GCA	2	6	551985	551990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351815
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12240	NC_022108	GAA	2	6	553916	553921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351817
12241	NC_022108	GTT	2	6	553936	553941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351817
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12243	NC_022108	TAAAA	2	10	554106	554115	80 %	20 %	0 %	0 %	532351817
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12245	NC_022108	A	6	6	554142	554147	100 %	0 %	0 %	0 %	532351817
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12331	NC_022108	AGA	2	6	558244	558249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12332	NC_022108	CTT	2	6	558252	558257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352244
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12351	NC_022108	GAA	2	6	559062	559067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351820
12352	NC_022108	TG	3	6	559079	559084	0 %	50 %	50 %	0 %	532351820
12353	NC_022108	AG	3	6	559178	559183	50 %	0 %	50 %	0 %	532351820
12354	NC_022108	TCT	2	6	559291	559296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351820
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12360	NC_022108	AAG	2	6	559635	559640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351821
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12364	NC_022108	ACC	2	6	559845	559850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351821
12365	NC_022108	GCATAG	2	12	559871	559882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532351821
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12368	NC_022108	GAAA	2	8	559999	560006	75 %	0 %	25 %	0 %	532351821
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12376	NC_022108	GTT	2	6	560248	560253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12379	NC_022108	GCTT	2	8	560313	560320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12380	NC_022108	ACC	2	6	560339	560344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12382	NC_022108	CTTT	2	8	560399	560406	0 %	75 %	0 %	25 %	532352246
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12442	NC_022108	TCC	2	6	562887	562892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351824
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12460	NC_022108	C	6	6	563892	563897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12466	NC_022108	GAAC	2	8	564109	564116	50 %	0 %	25 %	25 %	532351826
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12473	NC_022108	CAAA	2	8	564523	564530	75 %	0 %	0 %	25 %	532351827
12474	NC_022108	GA	3	6	564535	564540	50 %	0 %	50 %	0 %	532351827
12475	NC_022108	CCAT	2	8	564546	564553	25 %	25 %	0 %	50 %	532351827
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12489	NC_022108	ATC	2	6	565007	565012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351827
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12491	NC_022108	T	6	6	565045	565050	0 %	100 %	0 %	0 %	532351827
12492	NC_022108	CCCA	2	8	565059	565066	25 %	0 %	0 %	75 %	532351827
12493	NC_022108	CTTG	2	8	565152	565159	0 %	50 %	25 %	25 %	532351827
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12496	NC_022108	CT	3	6	565229	565234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12497	NC_022108	GAT	2	6	565275	565280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12498	NC_022108	AAC	2	6	565293	565298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12499	NC_022108	CAG	2	6	565369	565374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351828
12500	NC_022108	TCA	2	6	565378	565383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828

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