MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022108	AGA	2	6	498177	498182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351769
11002	NC_022108	AGC	2	6	498195	498200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351769
11003	NC_022108	ATACT	2	10	498237	498246	40 %	40 %	0 %	20 %	532351769
11004	NC_022108	TAT	2	6	498304	498309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351769
11005	NC_022108	CCTA	2	8	498362	498369	25 %	25 %	0 %	50 %	532351769
11006	NC_022108	TC	3	6	498431	498436	0 %	50 %	0 %	50 %	532351769
11007	NC_022108	TTG	2	6	498531	498536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352237
11008	NC_022108	CAA	2	6	498543	498548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352237
11009	NC_022108	AC	3	6	498614	498619	50 %	0 %	0 %	50 %	532352237
11010	NC_022108	ATA	2	6	498633	498638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352237
11011	NC_022108	CGTTT	2	10	498639	498648	0 %	60 %	20 %	20 %	532352237
11012	NC_022108	TATCC	2	10	498678	498687	20 %	40 %	0 %	40 %	532352237
11013	NC_022108	GGA	2	6	498728	498733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352237
11014	NC_022108	TTG	2	6	498810	498815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352237
11015	NC_022108	GAAA	2	8	498868	498875	75 %	0 %	25 %	0 %	532352237
11016	NC_022108	ACT	2	6	498955	498960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352237
11017	NC_022108	CTT	2	6	499035	499040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352237
11018	NC_022108	TTC	2	6	499060	499065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352237
11019	NC_022108	CTT	2	6	499079	499084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_022108	CGT	3	9	499085	499093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_022108	CTC	2	6	499095	499100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351770
11022	NC_022108	GAA	2	6	499104	499109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351770
11023	NC_022108	TC	3	6	499118	499123	0 %	50 %	0 %	50 %	532351770
11024	NC_022108	CTC	3	9	499217	499225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351770
11025	NC_022108	TTC	3	9	499242	499250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351770
11026	NC_022108	GAA	2	6	499279	499284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351770
11027	NC_022108	CGT	2	6	499315	499320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351770
11028	NC_022108	GCC	2	6	499321	499326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351770
11029	NC_022108	GTC	2	6	499360	499365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351770
11030	NC_022108	AGG	2	6	499392	499397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351770
11031	NC_022108	AAG	2	6	499461	499466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351770
11032	NC_022108	GTT	2	6	499523	499528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351770
11033	NC_022108	TCT	2	6	499555	499560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351770
11034	NC_022108	AAACTG	2	12	499569	499580	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532351770
11035	NC_022108	ATT	2	6	499581	499586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351770
11036	NC_022108	ATG	2	6	499600	499605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351770
11037	NC_022108	T	6	6	499748	499753	0 %	100 %	0 %	0 %	532351770
11038	NC_022108	TCT	2	6	499775	499780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351770
11039	NC_022108	TTC	2	6	499830	499835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351770
11040	NC_022108	TC	4	8	499924	499931	0 %	50 %	0 %	50 %	532351770
11041	NC_022108	TCA	2	6	499933	499938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351770
11042	NC_022108	TAA	2	6	499974	499979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351770
11043	NC_022108	GTC	2	6	500005	500010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351770
11044	NC_022108	CT	4	8	500049	500056	0 %	50 %	0 %	50 %	532351770
11045	NC_022108	ACC	2	6	500102	500107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11046	NC_022108	A	6	6	500171	500176	100 %	0 %	0 %	0 %	532351771
11047	NC_022108	CTA	2	6	500191	500196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351771
11048	NC_022108	AC	3	6	500202	500207	50 %	0 %	0 %	50 %	532351771
11049	NC_022108	AGC	2	6	500326	500331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351771
11050	NC_022108	ATC	2	6	500334	500339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351771
11051	NC_022108	CTT	2	6	500340	500345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351771
11052	NC_022108	AAGA	2	8	500401	500408	75 %	0 %	25 %	0 %	532351771
11053	NC_022108	CTTA	2	8	500430	500437	25 %	50 %	0 %	25 %	532351771
11054	NC_022108	A	6	6	500481	500486	100 %	0 %	0 %	0 %	532351771
11055	NC_022108	T	6	6	500535	500540	0 %	100 %	0 %	0 %	532351771
11056	NC_022108	AGA	2	6	500745	500750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351771
11057	NC_022108	AGAGA	2	10	500884	500893	60 %	0 %	40 %	0 %	532351771
11058	NC_022108	TCGA	2	8	500947	500954	25 %	25 %	25 %	25 %	532351771
11059	NC_022108	AAT	2	6	501007	501012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351772
11060	NC_022108	TCC	2	6	501079	501084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351772
11061	NC_022108	GC	3	6	501109	501114	0 %	0 %	50 %	50 %	532351772
11062	NC_022108	CA	3	6	501147	501152	50 %	0 %	0 %	50 %	532351772
11063	NC_022108	TGC	2	6	501175	501180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351772
11064	NC_022108	AAC	2	6	501190	501195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351772
11065	NC_022108	GCA	2	6	501341	501346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351772
11066	NC_022108	GAA	2	6	501370	501375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351772
11067	NC_022108	ACG	2	6	501379	501384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351772
11068	NC_022108	CAA	2	6	501391	501396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351772
11069	NC_022108	TCTA	2	8	501400	501407	25 %	50 %	0 %	25 %	532351772
11070	NC_022108	CAT	2	6	501427	501432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351772
11071	NC_022108	TAA	2	6	501507	501512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351772
11072	NC_022108	ATA	2	6	501628	501633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
11073	NC_022108	CTT	2	6	501641	501646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
11074	NC_022108	TCT	2	6	501781	501786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
11075	NC_022108	AAT	2	6	501822	501827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
11076	NC_022108	CCA	2	6	501847	501852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351773
11077	NC_022108	CTT	2	6	501950	501955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
11078	NC_022108	AGC	2	6	501972	501977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351773
11079	NC_022108	GCC	2	6	501996	502001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351773
11080	NC_022108	CAT	2	6	502002	502007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351773
11081	NC_022108	T	6	6	502044	502049	0 %	100 %	0 %	0 %	532351773
11082	NC_022108	CGT	3	9	502092	502100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351773
11083	NC_022108	TCT	2	6	502132	502137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
11084	NC_022108	AC	3	6	502145	502150	50 %	0 %	0 %	50 %	532351773
11085	NC_022108	TCT	2	6	502207	502212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
11086	NC_022108	TCA	2	6	502312	502317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351773
11087	NC_022108	AAT	2	6	502324	502329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
11088	NC_022108	TCT	2	6	502541	502546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
11089	NC_022108	TAA	2	6	502569	502574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
11090	NC_022108	AAT	2	6	502624	502629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
11091	NC_022108	ACA	2	6	502677	502682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351773
11092	NC_022108	GTAA	2	8	502726	502733	50 %	25 %	25 %	0 %	532351773
11093	NC_022108	AGA	2	6	502761	502766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351773
11094	NC_022108	GAT	2	6	502859	502864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351773
11095	NC_022108	ATG	2	6	502868	502873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351773
11096	NC_022108	CT	4	8	503016	503023	0 %	50 %	0 %	50 %	532351773
11097	NC_022108	AATCT	2	10	503037	503046	40 %	40 %	0 %	20 %	532351773
11098	NC_022108	TGA	2	6	503049	503054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351773
11099	NC_022108	ATTT	2	8	503084	503091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_022108	TAACTA	2	12	503092	503103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11101	NC_022108	AAGAAA	2	12	503105	503116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_022108	AAG	2	6	503225	503230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_022108	CTA	2	6	503235	503240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_022108	A	6	6	503243	503248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_022108	CTTCT	2	10	503250	503259	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11106	NC_022108	A	8	8	503264	503271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_022108	ATCC	2	8	503338	503345	25 %	25 %	0 %	50 %	532352238
11108	NC_022108	CTG	2	6	503362	503367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352238
11109	NC_022108	TAT	2	6	503378	503383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352238
11110	NC_022108	T	8	8	503489	503496	0 %	100 %	0 %	0 %	532351774
11111	NC_022108	CTT	2	6	503565	503570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351774
11112	NC_022108	TTC	2	6	503637	503642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351774
11113	NC_022108	CTTC	2	8	503657	503664	0 %	50 %	0 %	50 %	532351774
11114	NC_022108	CTC	2	6	503668	503673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351774
11115	NC_022108	CTCG	2	8	503696	503703	0 %	25 %	25 %	50 %	532351774
11116	NC_022108	CT	3	6	503716	503721	0 %	50 %	0 %	50 %	532351774
11117	NC_022108	TCC	2	6	503741	503746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351774
11118	NC_022108	TTC	2	6	503799	503804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351774
11119	NC_022108	TAT	2	6	503815	503820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351774
11120	NC_022108	TCGT	2	8	503838	503845	0 %	50 %	25 %	25 %	532351774
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11122	NC_022108	GCA	2	6	503909	503914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351774
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11243	NC_022108	TC	4	8	509947	509954	0 %	50 %	0 %	50 %	532351782
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11246	NC_022108	AGA	2	6	510037	510042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351782
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11248	NC_022108	TCT	2	6	510086	510091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351782
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11352	NC_022108	ACTA	2	8	514251	514258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11353	NC_022108	TGT	2	6	514263	514268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11354	NC_022108	ACC	2	6	514413	514418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351785
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11361	NC_022108	TAAAA	2	10	514667	514676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11362	NC_022108	T	6	6	514690	514695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_022108	TAA	2	6	514709	514714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11364	NC_022108	CAAA	2	8	514736	514743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11365	NC_022108	ATA	2	6	514749	514754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11366	NC_022108	ACAA	2	8	514787	514794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11367	NC_022108	AATA	2	8	514810	514817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11368	NC_022108	AACTAA	2	12	514818	514829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11369	NC_022108	ATCT	2	8	514831	514838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11370	NC_022108	AACA	2	8	514850	514857	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11371	NC_022108	ACTA	2	8	514859	514866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11372	NC_022108	TA	3	6	514865	514870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11373	NC_022108	A	6	6	514891	514896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11374	NC_022108	CTG	2	6	514927	514932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11491	NC_022108	CAT	2	6	519959	519964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351790
11492	NC_022108	TCT	2	6	520006	520011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351790
11493	NC_022108	AAT	2	6	520026	520031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351790
11494	NC_022108	TCA	2	6	520064	520069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351790
11495	NC_022108	TTGC	2	8	520079	520086	0 %	50 %	25 %	25 %	532351790
11496	NC_022108	AATC	2	8	520088	520095	50 %	25 %	0 %	25 %	532351790
11497	NC_022108	AGCAC	2	10	520129	520138	40 %	0 %	20 %	40 %	532351790
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11499	NC_022108	AAT	2	6	520240	520245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351790
11500	NC_022108	AGT	2	6	520332	520337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351790

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