MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_022108	A	8	8	475950	475957	100 %	0 %	0 %	0 %	532351754
10503	NC_022108	CTT	2	6	475967	475972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351754
10504	NC_022108	TCCTC	2	10	476017	476026	0 %	40 %	0 %	60 %	532351754
10505	NC_022108	GGT	2	6	476212	476217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351754
10506	NC_022108	GGA	2	6	476296	476301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
10507	NC_022108	ACA	2	6	476315	476320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351754
10508	NC_022108	AGA	2	6	476373	476378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351754
10509	NC_022108	TAAT	2	8	476447	476454	50 %	50 %	0 %	0 %	532351754
10510	NC_022108	TGG	3	9	476472	476480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351754
10511	NC_022108	TC	3	6	476501	476506	0 %	50 %	0 %	50 %	532351754
10512	NC_022108	AGG	2	6	476589	476594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
10513	NC_022108	TGG	2	6	476598	476603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351754
10514	NC_022108	GT	3	6	476608	476613	0 %	50 %	50 %	0 %	532351754
10515	NC_022108	GCA	2	6	476668	476673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10516	NC_022108	TGG	3	9	476679	476687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351754
10517	NC_022108	CA	3	6	476692	476697	50 %	0 %	0 %	50 %	532351754
10518	NC_022108	CGG	2	6	476717	476722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351754
10519	NC_022108	GCA	2	6	476740	476745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10520	NC_022108	TCT	2	6	476809	476814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351754
10521	NC_022108	AGC	2	6	476838	476843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10522	NC_022108	TAA	2	6	476871	476876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351754
10523	NC_022108	A	6	6	476980	476985	100 %	0 %	0 %	0 %	532351754
10524	NC_022108	CTG	2	6	477054	477059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10525	NC_022108	TTG	2	6	477113	477118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351754
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10529	NC_022108	CAA	2	6	477224	477229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351754
10530	NC_022108	CTG	2	6	477242	477247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10531	NC_022108	GCT	3	9	477250	477258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10532	NC_022108	AGC	2	6	477267	477272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10533	NC_022108	GCA	2	6	477274	477279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
10534	NC_022108	CAT	2	6	477287	477292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351754
10535	NC_022108	GTA	2	6	477319	477324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351754
10536	NC_022108	GGA	2	6	477325	477330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
10537	NC_022108	CTAT	2	8	477332	477339	25 %	50 %	0 %	25 %	532351754
10538	NC_022108	TC	3	6	477356	477361	0 %	50 %	0 %	50 %	532351754
10539	NC_022108	TCCC	2	8	477411	477418	0 %	25 %	0 %	75 %	532351754
10540	NC_022108	ATC	2	6	477420	477425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351754
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10543	NC_022108	ACA	2	6	477541	477546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351754
10544	NC_022108	GAG	2	6	477560	477565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
10545	NC_022108	CTT	2	6	477644	477649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351754
10546	NC_022108	GGA	2	6	477691	477696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
10547	NC_022108	TC	3	6	477731	477736	0 %	50 %	0 %	50 %	532351754
10548	NC_022108	A	6	6	477836	477841	100 %	0 %	0 %	0 %	532351754
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10553	NC_022108	ATG	2	6	477965	477970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351754
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10556	NC_022108	CTT	2	6	478172	478177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351754
10557	NC_022108	CAA	2	6	478197	478202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351754
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10560	NC_022108	TG	3	6	478315	478320	0 %	50 %	50 %	0 %	532351754
10561	NC_022108	A	7	7	478333	478339	100 %	0 %	0 %	0 %	532351754
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10566	NC_022108	ATTA	2	8	478548	478555	50 %	50 %	0 %	0 %	532351754
10567	NC_022108	CTC	2	6	478646	478651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351754
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10569	NC_022108	CTC	2	6	478670	478675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351754
10570	NC_022108	GGA	2	6	478714	478719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
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10573	NC_022108	GCA	2	6	478765	478770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
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10585	NC_022108	TTCCT	2	10	479482	479491	0 %	60 %	0 %	40 %	532351754
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10588	NC_022108	TTC	2	6	479642	479647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351754
10589	NC_022108	GAT	2	6	479736	479741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351754
10590	NC_022108	TAA	2	6	479819	479824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351754
10591	NC_022108	TCTA	2	8	479847	479854	25 %	50 %	0 %	25 %	532351754
10592	NC_022108	CTGT	2	8	479866	479873	0 %	50 %	25 %	25 %	532351754
10593	NC_022108	CT	3	6	479986	479991	0 %	50 %	0 %	50 %	532351754
10594	NC_022108	ACTAT	2	10	479998	480007	40 %	40 %	0 %	20 %	532351754
10595	NC_022108	TCT	2	6	480061	480066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351754
10596	NC_022108	T	9	9	480178	480186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_022108	CAT	2	6	480209	480214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_022108	GTT	2	6	480220	480225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_022108	CTG	2	6	480264	480269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10600	NC_022108	TGC	2	6	480274	480279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_022108	CTC	2	6	480286	480291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10602	NC_022108	ATG	2	6	480386	480391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351755
10603	NC_022108	GCT	2	6	480416	480421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351755
10604	NC_022108	TAG	4	12	480478	480489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351755
10605	NC_022108	TCTTCA	2	12	480518	480529	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532351755
10606	NC_022108	TGA	2	6	480583	480588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351755
10607	NC_022108	AGA	3	9	480595	480603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351755
10608	NC_022108	AG	3	6	480632	480637	50 %	0 %	50 %	0 %	532351755
10609	NC_022108	ACTA	2	8	480640	480647	50 %	25 %	0 %	25 %	532351755
10610	NC_022108	CT	5	10	480664	480673	0 %	50 %	0 %	50 %	532351755
10611	NC_022108	TTC	2	6	480707	480712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351755
10612	NC_022108	GGA	2	6	480758	480763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351755
10613	NC_022108	GA	3	6	480774	480779	50 %	0 %	50 %	0 %	532351755
10614	NC_022108	CTA	2	6	480809	480814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351755
10615	NC_022108	TCC	2	6	480902	480907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351755
10616	NC_022108	TGG	2	6	480910	480915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351755
10617	NC_022108	GGT	3	9	480923	480931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351755
10618	NC_022108	CAA	2	6	480970	480975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351755
10619	NC_022108	TGC	2	6	480994	480999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351755
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