MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022108	AGC	2	6	453834	453839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351737
10002	NC_022108	TGA	2	6	453843	453848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351737
10003	NC_022108	A	6	6	453866	453871	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
10004	NC_022108	ATCCGC	2	12	453894	453905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532351737
10005	NC_022108	AGC	2	6	453906	453911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351737
10006	NC_022108	TCT	2	6	453913	453918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351737
10007	NC_022108	AGG	2	6	453933	453938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351737
10008	NC_022108	A	6	6	453964	453969	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
10009	NC_022108	CAG	2	6	453992	453997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351737
10010	NC_022108	ACA	2	6	454019	454024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351737
10011	NC_022108	TTG	2	6	454046	454051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351737
10012	NC_022108	T	8	8	454122	454129	0 %	100 %	0 %	0 %	532351737
10013	NC_022108	A	6	6	454130	454135	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
10014	NC_022108	CT	3	6	454144	454149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10015	NC_022108	TCTT	2	8	454150	454157	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10016	NC_022108	TAAT	2	8	454163	454170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_022108	CAT	2	6	454244	454249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_022108	CTA	2	6	454265	454270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_022108	A	6	6	454390	454395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_022108	TGGA	2	8	454527	454534	25 %	25 %	50 %	0 %	532351738
10021	NC_022108	GGA	2	6	454571	454576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351738
10022	NC_022108	A	6	6	454578	454583	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
10023	NC_022108	TCAT	2	8	454593	454600	25 %	50 %	0 %	25 %	532351738
10024	NC_022108	TTCT	2	8	454605	454612	0 %	75 %	0 %	25 %	532351738
10025	NC_022108	TAG	2	6	454629	454634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351738
10026	NC_022108	TC	3	6	454644	454649	0 %	50 %	0 %	50 %	532351738
10027	NC_022108	TG	3	6	454676	454681	0 %	50 %	50 %	0 %	532351738
10028	NC_022108	GTT	2	6	454753	454758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351738
10029	NC_022108	TG	3	6	454771	454776	0 %	50 %	50 %	0 %	532351738
10030	NC_022108	ACC	2	6	454801	454806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351738
10031	NC_022108	TTA	2	6	454866	454871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351738
10032	NC_022108	AGA	2	6	454891	454896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
10033	NC_022108	GAC	2	6	455027	455032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351738
10034	NC_022108	GCT	2	6	455135	455140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351738
10035	NC_022108	TGC	2	6	455184	455189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351738
10036	NC_022108	CTGTAT	2	12	455244	455255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	532351738
10037	NC_022108	GTA	2	6	455316	455321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351738
10038	NC_022108	ATG	2	6	455337	455342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351738
10039	NC_022108	A	6	6	455363	455368	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
10040	NC_022108	T	6	6	455421	455426	0 %	100 %	0 %	0 %	532351738
10041	NC_022108	AAC	2	6	455439	455444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351738
10042	NC_022108	TTC	2	6	455463	455468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351738
10043	NC_022108	ACAA	2	8	455523	455530	75 %	0 %	0 %	25 %	532351738
10044	NC_022108	GCT	2	6	455534	455539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351738
10045	NC_022108	CA	3	6	455626	455631	50 %	0 %	0 %	50 %	532351738
10046	NC_022108	CCT	2	6	455636	455641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351738
10047	NC_022108	GAA	2	6	455645	455650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
10048	NC_022108	ACT	2	6	455856	455861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351738
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10050	NC_022108	CCG	2	6	455884	455889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351738
10051	NC_022108	CT	4	8	455928	455935	0 %	50 %	0 %	50 %	532351738
10052	NC_022108	AGA	3	9	455938	455946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
10053	NC_022108	AAG	2	6	456026	456031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
10054	NC_022108	CTT	2	6	456037	456042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351738
10055	NC_022108	A	6	6	456044	456049	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
10056	NC_022108	AGA	2	6	456055	456060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
10057	NC_022108	ATT	2	6	456089	456094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351738
10058	NC_022108	TCC	2	6	456123	456128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351738
10059	NC_022108	CAAA	2	8	456188	456195	75 %	0 %	0 %	25 %	532351738
10060	NC_022108	AGA	2	6	456205	456210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
10061	NC_022108	CA	3	6	456274	456279	50 %	0 %	0 %	50 %	532351738
10062	NC_022108	GTTG	2	8	456295	456302	0 %	50 %	50 %	0 %	532351738
10063	NC_022108	CTAAAG	2	12	456312	456323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532351738
10064	NC_022108	A	7	7	456344	456350	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
10065	NC_022108	AAAGA	2	10	456368	456377	80 %	0 %	20 %	0 %	532351738
10066	NC_022108	A	6	6	456398	456403	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
10067	NC_022108	GAA	2	6	456418	456423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
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10069	NC_022108	T	6	6	456469	456474	0 %	100 %	0 %	0 %	532351738
10070	NC_022108	CTT	2	6	456529	456534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_022108	T	6	6	456586	456591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_022108	CT	3	6	456597	456602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_022108	GGA	2	6	456646	456651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_022108	CATG	2	8	456697	456704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_022108	A	6	6	456770	456775	100 %	0 %	0 %	0 %	532351739
10076	NC_022108	GAA	2	6	456836	456841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351739
10077	NC_022108	AGATC	2	10	456868	456877	40 %	20 %	20 %	20 %	532351739
10078	NC_022108	GATCA	2	10	456911	456920	40 %	20 %	20 %	20 %	532351739
10079	NC_022108	GCT	2	6	456941	456946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351739
10080	NC_022108	A	8	8	456949	456956	100 %	0 %	0 %	0 %	532351739
10081	NC_022108	TAA	2	6	456997	457002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351739
10082	NC_022108	AAGC	2	8	457046	457053	50 %	0 %	25 %	25 %	532351739
10083	NC_022108	TCT	2	6	457066	457071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351739
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10085	NC_022108	GAAA	2	8	457081	457088	75 %	0 %	25 %	0 %	532351739
10086	NC_022108	TC	3	6	457090	457095	0 %	50 %	0 %	50 %	532351739
10087	NC_022108	TAG	2	6	457108	457113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351739
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10089	NC_022108	GA	3	6	457137	457142	50 %	0 %	50 %	0 %	532351739
10090	NC_022108	GAA	2	6	457160	457165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351739
10091	NC_022108	GAAA	2	8	457198	457205	75 %	0 %	25 %	0 %	532351739
10092	NC_022108	ATT	2	6	457219	457224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351739
10093	NC_022108	CAA	3	9	457246	457254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351739
10094	NC_022108	GTT	2	6	457265	457270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351739
10095	NC_022108	ATC	2	6	457350	457355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351739
10096	NC_022108	CAG	2	6	457413	457418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351739
10097	NC_022108	CGT	5	15	457436	457450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351739
10098	NC_022108	A	6	6	457507	457512	100 %	0 %	0 %	0 %	532351739
10099	NC_022108	GCT	2	6	457664	457669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_022108	AAC	2	6	457733	457738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_022108	GAG	2	6	457777	457782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_022108	GCAA	2	8	457817	457824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10103	NC_022108	T	7	7	457877	457883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_022108	TAA	2	6	457888	457893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_022108	GCAT	2	8	457910	457917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10106	NC_022108	GTA	2	6	457920	457925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_022108	CAA	2	6	457929	457934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_022108	GTT	3	9	457941	457949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_022108	CAT	2	6	457993	457998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351740
10110	NC_022108	TGT	2	6	458060	458065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351740
10111	NC_022108	TCC	2	6	458086	458091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351740
10112	NC_022108	TAA	2	6	458137	458142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351740
10113	NC_022108	TAC	2	6	458158	458163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351740
10114	NC_022108	AC	3	6	458168	458173	50 %	0 %	0 %	50 %	532351740
10115	NC_022108	GAA	2	6	458186	458191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351740
10116	NC_022108	AGT	2	6	458215	458220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351740
10117	NC_022108	AAT	2	6	458259	458264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351740
10118	NC_022108	AGA	2	6	458366	458371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351740
10119	NC_022108	A	6	6	458376	458381	100 %	0 %	0 %	0 %	532351740
10120	NC_022108	ACA	3	9	458450	458458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351740
10121	NC_022108	GCA	2	6	458492	458497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351740
10122	NC_022108	CAA	2	6	458505	458510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351740
10123	NC_022108	TTC	2	6	458525	458530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351740
10124	NC_022108	TC	3	6	458553	458558	0 %	50 %	0 %	50 %	532351740
10125	NC_022108	CAC	2	6	458565	458570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351740
10126	NC_022108	AAC	2	6	458605	458610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351740
10127	NC_022108	TCG	2	6	458673	458678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351740
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10129	NC_022108	TGA	2	6	458738	458743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351740
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10131	NC_022108	TGA	2	6	458765	458770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351740
10132	NC_022108	GTAC	2	8	458862	458869	25 %	25 %	25 %	25 %	532351740
10133	NC_022108	A	7	7	458890	458896	100 %	0 %	0 %	0 %	532351740
10134	NC_022108	TCT	2	6	458899	458904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351740
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10148	NC_022108	C	6	6	459666	459671	0 %	0 %	0 %	100 %	532351741
10149	NC_022108	CT	3	6	459761	459766	0 %	50 %	0 %	50 %	532351741
10150	NC_022108	TTCTC	2	10	459780	459789	0 %	60 %	0 %	40 %	532351741
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10154	NC_022108	TCAA	2	8	459960	459967	50 %	25 %	0 %	25 %	532351741
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10158	NC_022108	TAA	2	6	460175	460180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_022108	T	6	6	460240	460245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10160	NC_022108	AG	3	6	460285	460290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10161	NC_022108	AGGA	2	8	460327	460334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_022108	AGA	2	6	460354	460359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_022108	AT	3	6	460385	460390	50 %	50 %	0 %	0 %	532351742
10164	NC_022108	CAA	2	6	460395	460400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351742
10165	NC_022108	TC	3	6	460439	460444	0 %	50 %	0 %	50 %	532351742
10166	NC_022108	CGAT	2	8	460448	460455	25 %	25 %	25 %	25 %	532351742
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10171	NC_022108	GAA	2	6	460715	460720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351742
10172	NC_022108	T	6	6	460730	460735	0 %	100 %	0 %	0 %	532351742
10173	NC_022108	ACT	2	6	460771	460776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351742
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10210	NC_022108	AGA	3	9	462882	462890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10228	NC_022108	TC	3	6	463864	463869	0 %	50 %	0 %	50 %	532351745
10229	NC_022108	TAGG	2	8	463887	463894	25 %	25 %	50 %	0 %	532351745
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10236	NC_022108	T	7	7	464013	464019	0 %	100 %	0 %	0 %	532351745
10237	NC_022108	GCT	2	6	464034	464039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351745
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10241	NC_022108	CAG	2	6	464314	464319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351745
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10243	NC_022108	AGA	2	6	464369	464374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351745
10244	NC_022108	AAC	2	6	464430	464435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351745
10245	NC_022108	CAT	2	6	464444	464449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351745
10246	NC_022108	TCA	2	6	464505	464510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351745
10247	NC_022108	CACC	2	8	464535	464542	25 %	0 %	0 %	75 %	532351746
10248	NC_022108	GC	3	6	464563	464568	0 %	0 %	50 %	50 %	532351746
10249	NC_022108	AACT	2	8	464586	464593	50 %	25 %	0 %	25 %	532351746
10250	NC_022108	A	6	6	464695	464700	100 %	0 %	0 %	0 %	532351746
10251	NC_022108	AAT	2	6	464722	464727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351746
10252	NC_022108	TCC	2	6	464764	464769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351746
10253	NC_022108	TTC	2	6	464854	464859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351746
10254	NC_022108	A	6	6	464869	464874	100 %	0 %	0 %	0 %	532351746
10255	NC_022108	CTT	2	6	465021	465026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351746
10256	NC_022108	AAT	2	6	465028	465033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351746
10257	NC_022108	ACA	2	6	465075	465080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351746
10258	NC_022108	A	6	6	465166	465171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_022108	AAG	2	6	465211	465216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_022108	TAAAA	2	10	465254	465263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_022108	A	8	8	465307	465314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_022108	CAC	2	6	465316	465321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10263	NC_022108	CTTT	2	8	465366	465373	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10264	NC_022108	GTA	2	6	465393	465398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_022108	AGG	2	6	465424	465429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_022108	AGC	2	6	465647	465652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351747
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10277	NC_022108	GAA	2	6	466156	466161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351748
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10300	NC_022108	T	6	6	466918	466923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10301	NC_022108	CATA	2	8	466950	466957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10302	NC_022108	AAG	2	6	467064	467069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351750
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10338	NC_022108	TAT	2	6	468385	468390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10339	NC_022108	GA	3	6	468407	468412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10340	NC_022108	CTT	2	6	468424	468429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10341	NC_022108	TCC	2	6	468445	468450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10342	NC_022108	ATG	2	6	468478	468483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10343	NC_022108	CTT	2	6	468499	468504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10344	NC_022108	A	6	6	468637	468642	100 %	0 %	0 %	0 %	532351751
10345	NC_022108	TGT	2	6	468686	468691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351751
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10351	NC_022108	ATC	2	6	468966	468971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351751
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10353	NC_022108	TCCTT	2	10	469028	469037	0 %	60 %	0 %	40 %	532351751
10354	NC_022108	TGC	2	6	469063	469068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351751
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10356	NC_022108	ATC	2	6	469185	469190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351751
10357	NC_022108	T	7	7	469219	469225	0 %	100 %	0 %	0 %	532351751
10358	NC_022108	AGCT	2	8	469228	469235	25 %	25 %	25 %	25 %	532351751
10359	NC_022108	TAAG	2	8	469291	469298	50 %	25 %	25 %	0 %	532351751
10360	NC_022108	GCTT	2	8	469320	469327	0 %	50 %	25 %	25 %	532351751
10361	NC_022108	CTG	2	6	469383	469388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351751
10362	NC_022108	TAT	2	6	469396	469401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351751
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10364	NC_022108	GTT	2	6	469522	469527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351751
10365	NC_022108	GAA	2	6	469598	469603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351751
10366	NC_022108	A	8	8	469606	469613	100 %	0 %	0 %	0 %	532351751
10367	NC_022108	TCTT	2	8	469614	469621	0 %	75 %	0 %	25 %	532351751
10368	NC_022108	AGA	2	6	469626	469631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351751
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10491	NC_022108	CTA	2	6	475682	475687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351754
10492	NC_022108	GGA	2	6	475693	475698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
10493	NC_022108	TTTC	2	8	475721	475728	0 %	75 %	0 %	25 %	532351754
10494	NC_022108	CAT	2	6	475739	475744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351754
10495	NC_022108	GAA	2	6	475768	475773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351754
10496	NC_022108	GAG	2	6	475778	475783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
10497	NC_022108	CTAT	2	8	475784	475791	25 %	50 %	0 %	25 %	532351754
10498	NC_022108	TCAAT	2	10	475807	475816	40 %	40 %	0 %	20 %	532351754
10499	NC_022108	G	7	7	475861	475867	0 %	0 %	100 %	0 %	532351754
10500	NC_022108	AGG	2	6	475881	475886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754

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