MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_022108	CAA	2	6	432058	432063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351719
9503	NC_022108	ATCT	2	8	432080	432087	25 %	50 %	0 %	25 %	532351719
9504	NC_022108	GCA	2	6	432102	432107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351719
9505	NC_022108	A	6	6	432131	432136	100 %	0 %	0 %	0 %	532351719
9506	NC_022108	TA	3	6	432247	432252	50 %	50 %	0 %	0 %	532351719
9507	NC_022108	TCC	2	6	432278	432283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351719
9508	NC_022108	GCA	2	6	432302	432307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351719
9509	NC_022108	CTT	2	6	432309	432314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351719
9510	NC_022108	ATG	2	6	432401	432406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351719
9511	NC_022108	TTG	2	6	432412	432417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351719
9512	NC_022108	CT	3	6	432446	432451	0 %	50 %	0 %	50 %	532351719
9513	NC_022108	AGC	2	6	432477	432482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351719
9514	NC_022108	ATC	2	6	432484	432489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351719
9515	NC_022108	ATCA	2	8	432583	432590	50 %	25 %	0 %	25 %	532351719
9516	NC_022108	A	6	6	432635	432640	100 %	0 %	0 %	0 %	532351719
9517	NC_022108	CAT	2	6	432649	432654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351719
9518	NC_022108	GA	3	6	432682	432687	50 %	0 %	50 %	0 %	532351719
9519	NC_022108	CTT	2	6	432689	432694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351719
9520	NC_022108	ATA	2	6	432845	432850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351720
9521	NC_022108	CA	3	6	432874	432879	50 %	0 %	0 %	50 %	532351720
9522	NC_022108	CTC	2	6	432935	432940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351720
9523	NC_022108	TCC	2	6	432951	432956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351720
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9525	NC_022108	CTA	2	6	433171	433176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351720
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9527	NC_022108	CTG	2	6	433363	433368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351720
9528	NC_022108	CAAT	2	8	433414	433421	50 %	25 %	0 %	25 %	532351720
9529	NC_022108	T	6	6	433445	433450	0 %	100 %	0 %	0 %	532351720
9530	NC_022108	ACG	2	6	433457	433462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351720
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9533	NC_022108	TC	3	6	433552	433557	0 %	50 %	0 %	50 %	532351720
9534	NC_022108	CCA	2	6	433578	433583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351720
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9536	NC_022108	TAA	2	6	433637	433642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351720
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9539	NC_022108	ACA	3	9	433737	433745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351720
9540	NC_022108	GGGA	2	8	433774	433781	25 %	0 %	75 %	0 %	532351720
9541	NC_022108	TCA	2	6	433791	433796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351720
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9545	NC_022108	GAA	3	9	433875	433883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351720
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9549	NC_022108	TTC	2	6	434082	434087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351720
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9551	NC_022108	TTTCT	2	10	434110	434119	0 %	80 %	0 %	20 %	532351720
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9554	NC_022108	TTA	2	6	434539	434544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351721
9555	NC_022108	ATAG	2	8	434582	434589	50 %	25 %	25 %	0 %	532351721
9556	NC_022108	ATG	2	6	434600	434605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351721
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9558	NC_022108	ATC	2	6	434655	434660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351721
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9563	NC_022108	A	7	7	434887	434893	100 %	0 %	0 %	0 %	532351721
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9571	NC_022108	TC	3	6	435333	435338	0 %	50 %	0 %	50 %	532351722
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9581	NC_022108	A	6	6	435689	435694	100 %	0 %	0 %	0 %	532351722
9582	NC_022108	T	8	8	435705	435712	0 %	100 %	0 %	0 %	532351722
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9602	NC_022108	A	7	7	436721	436727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9603	NC_022108	CTCTT	2	10	436732	436741	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9604	NC_022108	GAAGA	2	10	436742	436751	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9605	NC_022108	ATG	2	6	436761	436766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9606	NC_022108	ATG	2	6	436769	436774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_022108	CGT	2	6	436826	436831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9608	NC_022108	TCA	2	6	436854	436859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352235
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9614	NC_022108	AATTT	2	10	437050	437059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_022108	T	6	6	437105	437110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9616	NC_022108	ACA	2	6	437180	437185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9617	NC_022108	TG	3	6	437225	437230	0 %	50 %	50 %	0 %	532351724
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