MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022108	ACA	2	6	410277	410282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352232
9002	NC_022108	CTT	2	6	410336	410341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352232
9003	NC_022108	TCA	2	6	410347	410352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_022108	TCT	2	6	410356	410361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_022108	ACA	2	6	410411	410416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351701
9006	NC_022108	TAT	2	6	410484	410489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351701
9007	NC_022108	TCTCT	2	10	410573	410582	0 %	60 %	0 %	40 %	532351701
9008	NC_022108	AGA	2	6	410681	410686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351701
9009	NC_022108	AGA	2	6	410735	410740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351701
9010	NC_022108	TC	3	6	410758	410763	0 %	50 %	0 %	50 %	532351701
9011	NC_022108	CAC	2	6	410764	410769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351701
9012	NC_022108	TC	3	6	410770	410775	0 %	50 %	0 %	50 %	532351701
9013	NC_022108	TA	3	6	410790	410795	50 %	50 %	0 %	0 %	532351701
9014	NC_022108	ATC	2	6	410797	410802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351701
9015	NC_022108	CT	3	6	410890	410895	0 %	50 %	0 %	50 %	532351701
9016	NC_022108	ATAA	2	8	410916	410923	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_022108	AG	3	6	411021	411026	50 %	0 %	50 %	0 %	532351702
9018	NC_022108	ATC	2	6	411108	411113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351702
9019	NC_022108	CAG	2	6	411205	411210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351702
9020	NC_022108	CA	3	6	411235	411240	50 %	0 %	0 %	50 %	532351702
9021	NC_022108	GAA	2	6	411260	411265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351702
9022	NC_022108	ACT	2	6	411288	411293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351702
9023	NC_022108	A	6	6	411608	411613	100 %	0 %	0 %	0 %	532352233
9024	NC_022108	CAC	2	6	411621	411626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352233
9025	NC_022108	CT	3	6	411687	411692	0 %	50 %	0 %	50 %	532352233
9026	NC_022108	T	6	6	411711	411716	0 %	100 %	0 %	0 %	532352233
9027	NC_022108	ATGC	2	8	411718	411725	25 %	25 %	25 %	25 %	532352233
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9029	NC_022108	CT	4	8	411755	411762	0 %	50 %	0 %	50 %	532352233
9030	NC_022108	AT	3	6	411777	411782	50 %	50 %	0 %	0 %	532352233
9031	NC_022108	TTCT	2	8	411803	411810	0 %	75 %	0 %	25 %	532352233
9032	NC_022108	TTC	2	6	411839	411844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352233
9033	NC_022108	CT	3	6	411857	411862	0 %	50 %	0 %	50 %	532352233
9034	NC_022108	TC	3	6	411884	411889	0 %	50 %	0 %	50 %	532351703
9035	NC_022108	A	6	6	411891	411896	100 %	0 %	0 %	0 %	532351703
9036	NC_022108	CTT	3	9	411904	411912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351703
9037	NC_022108	CACT	2	8	411969	411976	25 %	25 %	0 %	50 %	532351703
9038	NC_022108	CT	3	6	411987	411992	0 %	50 %	0 %	50 %	532351703
9039	NC_022108	A	6	6	412071	412076	100 %	0 %	0 %	0 %	532351703
9040	NC_022108	CAA	2	6	412093	412098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351703
9041	NC_022108	T	8	8	412102	412109	0 %	100 %	0 %	0 %	532351703
9042	NC_022108	AAT	2	6	412110	412115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351703
9043	NC_022108	TTCT	3	12	412211	412222	0 %	75 %	0 %	25 %	532351703
9044	NC_022108	CT	3	6	412221	412226	0 %	50 %	0 %	50 %	532351703
9045	NC_022108	CTG	2	6	412255	412260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351703
9046	NC_022108	AATG	2	8	412262	412269	50 %	25 %	25 %	0 %	532351703
9047	NC_022108	AGCA	2	8	412326	412333	50 %	0 %	25 %	25 %	532351703
9048	NC_022108	TTA	2	6	412417	412422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351703
9049	NC_022108	TAA	2	6	412439	412444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_022108	AGA	2	6	412467	412472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_022108	TTA	2	6	412506	412511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_022108	TGA	2	6	412517	412522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_022108	AAG	2	6	412552	412557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_022108	TCTCT	2	10	412604	412613	0 %	60 %	0 %	40 %	532351704
9055	NC_022108	TTC	2	6	412730	412735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351704
9056	NC_022108	GAC	2	6	412749	412754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351704
9057	NC_022108	GTC	2	6	412852	412857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351704
9058	NC_022108	A	6	6	412888	412893	100 %	0 %	0 %	0 %	532351704
9059	NC_022108	AATC	2	8	413136	413143	50 %	25 %	0 %	25 %	532351704
9060	NC_022108	AAAC	2	8	413214	413221	75 %	0 %	0 %	25 %	532351704
9061	NC_022108	AAATA	2	10	413278	413287	80 %	20 %	0 %	0 %	532351704
9062	NC_022108	CGAA	2	8	413311	413318	50 %	0 %	25 %	25 %	532351704
9063	NC_022108	CT	3	6	413324	413329	0 %	50 %	0 %	50 %	532351704
9064	NC_022108	AGC	2	6	413332	413337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351704
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9066	NC_022108	TTA	2	6	413456	413461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351704
9067	NC_022108	AATTA	2	10	413464	413473	60 %	40 %	0 %	0 %	532351705
9068	NC_022108	AGCT	2	8	413551	413558	25 %	25 %	25 %	25 %	532351705
9069	NC_022108	CTT	2	6	413862	413867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351705
9070	NC_022108	CT	3	6	414070	414075	0 %	50 %	0 %	50 %	532351705
9071	NC_022108	AG	3	6	414098	414103	50 %	0 %	50 %	0 %	532351705
9072	NC_022108	C	6	6	414118	414123	0 %	0 %	0 %	100 %	532351705
9073	NC_022108	TCT	2	6	414191	414196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351705
9074	NC_022108	CCGC	2	8	414246	414253	0 %	0 %	25 %	75 %	532351705
9075	NC_022108	CAG	2	6	414320	414325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351705
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9077	NC_022108	CT	3	6	414513	414518	0 %	50 %	0 %	50 %	532351705
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9083	NC_022108	CT	3	6	414708	414713	0 %	50 %	0 %	50 %	532351705
9084	NC_022108	TGA	2	6	414714	414719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351705
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9091	NC_022108	TC	3	6	415090	415095	0 %	50 %	0 %	50 %	532351706
9092	NC_022108	TCT	2	6	415102	415107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351706
9093	NC_022108	ACATGC	2	12	415203	415214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532351706
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9096	NC_022108	TAA	2	6	415282	415287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351706
9097	NC_022108	A	6	6	415296	415301	100 %	0 %	0 %	0 %	532351706
9098	NC_022108	TTC	2	6	415307	415312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351706
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9101	NC_022108	GAAG	2	8	415449	415456	50 %	0 %	50 %	0 %	532351706
9102	NC_022108	ACA	2	6	415464	415469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351706
9103	NC_022108	AACGC	2	10	415567	415576	40 %	0 %	20 %	40 %	532351706
9104	NC_022108	AGA	2	6	415586	415591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351706
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9107	NC_022108	TCT	2	6	415789	415794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351707
9108	NC_022108	A	6	6	415819	415824	100 %	0 %	0 %	0 %	532351707
9109	NC_022108	GGCTCT	2	12	415938	415949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351707
9110	NC_022108	CT	3	6	415959	415964	0 %	50 %	0 %	50 %	532351707
9111	NC_022108	CAT	2	6	416056	416061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351707
9112	NC_022108	AAG	2	6	416062	416067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351707
9113	NC_022108	GCA	2	6	416082	416087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351707
9114	NC_022108	GCT	2	6	416091	416096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351707
9115	NC_022108	ACA	3	9	416139	416147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351707
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9117	NC_022108	AGC	2	6	416256	416261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351707
9118	NC_022108	AAC	2	6	416309	416314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351707
9119	NC_022108	TCT	2	6	416336	416341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351707
9120	NC_022108	A	6	6	416358	416363	100 %	0 %	0 %	0 %	532351707
9121	NC_022108	GAC	2	6	416371	416376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351707
9122	NC_022108	T	7	7	416437	416443	0 %	100 %	0 %	0 %	532351707
9123	NC_022108	ATA	2	6	416445	416450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351707
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9125	NC_022108	GCA	2	6	416522	416527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351707
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